MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori v225d plasmid pHPv225d

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017383	GAAT	2	8	455	462	50 %	25 %	25 %	0 %	384888494
2	NC_017383	TCAT	2	8	541	548	25 %	50 %	0 %	25 %	384888494
3	NC_017383	ACAA	2	8	563	570	75 %	0 %	0 %	25 %	384888494
4	NC_017383	TTTG	2	8	924	931	0 %	75 %	25 %	0 %	384888494
5	NC_017383	CATT	2	8	1768	1775	25 %	50 %	0 %	25 %	384888495
6	NC_017383	ACAA	2	8	2101	2108	75 %	0 %	0 %	25 %	384888495
7	NC_017383	TACA	2	8	2306	2313	50 %	25 %	0 %	25 %	384888495
8	NC_017383	CAAT	2	8	2592	2599	50 %	25 %	0 %	25 %	384888496
9	NC_017383	TTAG	2	8	2862	2869	25 %	50 %	25 %	0 %	384888496
10	NC_017383	CTTG	2	8	2932	2939	0 %	50 %	25 %	25 %	384888496
11	NC_017383	TTTC	2	8	3059	3066	0 %	75 %	0 %	25 %	384888496
12	NC_017383	ACTC	2	8	3215	3222	25 %	25 %	0 %	50 %	384888496
13	NC_017383	GATT	2	8	3291	3298	25 %	50 %	25 %	0 %	384888496
14	NC_017383	AAAT	2	8	3404	3411	75 %	25 %	0 %	0 %	384888496
15	NC_017383	GGTC	2	8	3470	3477	0 %	25 %	50 %	25 %	384888496
16	NC_017383	CATT	2	8	3589	3596	25 %	50 %	0 %	25 %	384888496
17	NC_017383	TCTT	2	8	4808	4815	0 %	75 %	0 %	25 %	384888499
18	NC_017383	CAAA	3	12	5133	5144	75 %	0 %	0 %	25 %	384888500
19	NC_017383	CAAT	2	8	5426	5433	50 %	25 %	0 %	25 %	384888500
20	NC_017383	GTTA	2	8	5457	5464	25 %	50 %	25 %	0 %	384888500
21	NC_017383	GAAC	2	8	6714	6721	50 %	0 %	25 %	25 %	384888502
22	NC_017383	CAAG	2	8	7092	7099	50 %	0 %	25 %	25 %	384888502

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.