MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori 51 chromosome

Total Repeats: 789

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017382	AAAGCA	2	12	328	339	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387781699
2	NC_017382	TTGCAA	2	12	907	918	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387781700
3	NC_017382	ATTATA	2	12	1835	1846	50 %	50 %	0 %	0 %	387781702
4	NC_017382	CCGTTC	2	12	6803	6814	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387781705
5	NC_017382	GAAACC	2	12	7602	7613	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387781706
6	NC_017382	AAACAC	2	12	18185	18196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017382	AGAAAA	2	12	18535	18546	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387781715
8	NC_017382	GATAAA	2	12	22091	22102	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387781718
9	NC_017382	TTTCTT	2	12	22742	22753	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017382	TTGTTA	5	30	24300	24329	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387781719
11	NC_017382	ATGCAA	2	12	26975	26986	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387781722
12	NC_017382	CCAAAA	2	12	31109	31120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387781725
13	NC_017382	GCTGAA	2	12	31267	31278	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387781725
14	NC_017382	GATTTG	2	12	34520	34531	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387781728
15	NC_017382	ACCTTA	2	12	37006	37017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387781730
16	NC_017382	TCTTTA	2	12	37021	37032	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387781730
17	NC_017382	AGTGGG	2	12	41500	41511	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	387781732
18	NC_017382	CCCTAA	2	12	42094	42105	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387781733
19	NC_017382	AGTGGC	2	12	42272	42283	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387781733
20	NC_017382	CATGGA	2	12	44409	44420	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387781736
21	NC_017382	TTCTTT	2	12	48689	48700	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387781739
22	NC_017382	TTGGTG	2	12	51104	51115	0 %	50 %	50 %	0 %	387781742
23	NC_017382	ACAAAA	2	12	52028	52039	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387781743
24	NC_017382	ATTGAA	2	12	53911	53922	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387781745
25	NC_017382	GGCACA	2	12	58580	58591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387781746
26	NC_017382	TGAGCA	2	12	60700	60711	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387781747
27	NC_017382	GTGCCT	2	12	63837	63848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387781750
28	NC_017382	GATTTT	2	12	64173	64184	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387781750
29	NC_017382	ATGAAA	2	12	66767	66778	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387781753
30	NC_017382	GTTTTT	2	12	68088	68099	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387781754
31	NC_017382	TAAAAA	2	12	69984	69995	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387781756
32	NC_017382	TCTTTG	2	12	70494	70505	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387781757
33	NC_017382	TGAAAT	2	12	70999	71010	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387781757
34	NC_017382	ATTTGC	2	12	74158	74169	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017382	TAAAAA	2	12	75763	75774	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387781760
36	NC_017382	AGATAA	2	12	80384	80395	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017382	AATTTT	2	12	80598	80609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387781763
38	NC_017382	GACTTT	2	12	82888	82899	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387781765
39	NC_017382	AAAAGA	2	12	83040	83051	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387781765
40	NC_017382	ACGCCC	2	12	89497	89508	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	387781773
41	NC_017382	TAAGGG	2	12	92218	92229	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387781776
42	NC_017382	CGCTAA	2	12	92581	92592	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387781776
43	NC_017382	CGCCCA	2	12	92755	92766	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	387781776
44	NC_017382	GGCATG	2	12	96098	96109	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387781780
45	NC_017382	GCAACG	2	12	97146	97157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387781780
46	NC_017382	ATATTG	2	12	97927	97938	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017382	AACAGG	2	12	105741	105752	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387781786
48	NC_017382	AAGCAT	2	12	109467	109478	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387781790
49	NC_017382	ATTAGA	2	12	109766	109777	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387781790
50	NC_017382	GATTTT	2	12	111526	111537	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387781792
51	NC_017382	AAACTC	2	12	111643	111654	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387781792
52	NC_017382	TCAAAA	2	12	113148	113159	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387781793
53	NC_017382	GCGGTG	2	12	113849	113860	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	387781794
54	NC_017382	AATATT	2	12	117057	117068	50 %	50 %	0 %	0 %	387781795
55	NC_017382	TTCCAC	2	12	120159	120170	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387781799
56	NC_017382	ATAAAA	2	12	121933	121944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017382	CATATT	2	12	122791	122802	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387781800
58	NC_017382	AGCGTT	2	12	123654	123665	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387781800
59	NC_017382	GGAGCG	2	12	127155	127166	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	387781804
60	NC_017382	TTTTCT	2	12	128655	128666	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387781805
61	NC_017382	CGCTCG	2	12	133668	133679	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	387781810
62	NC_017382	TAGGCA	2	12	136205	136216	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387781811
63	NC_017382	TTCTAT	2	12	138484	138495	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387781813
64	NC_017382	GTTCTA	2	12	138870	138881	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387781813
65	NC_017382	CTAAGG	2	12	140190	140201	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387781814
66	NC_017382	TGAATT	2	12	140724	140735	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387781814
67	NC_017382	TTTCAA	2	12	140883	140894	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387781814
68	NC_017382	AGCAAA	2	12	144228	144239	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387781817
69	NC_017382	GTTTTA	2	12	145239	145250	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017382	TGGTTT	2	12	145753	145764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387781820
71	NC_017382	AAAAAT	2	12	153520	153531	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387781827
72	NC_017382	ATTCAA	2	12	154606	154617	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387781829
73	NC_017382	TAGCGA	2	12	155662	155673	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387781830
74	NC_017382	TATCGC	2	12	158766	158777	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387781832
75	NC_017382	ATCGCT	2	12	160474	160485	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387781833
76	NC_017382	CCTAAA	2	12	162697	162708	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387781835
77	NC_017382	TTCTAT	2	12	163857	163868	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387781836
78	NC_017382	TTGTTT	2	12	166845	166856	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017382	CTTGGG	2	12	167506	167517	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387781842
80	NC_017382	TTGGGT	2	12	172284	172295	0 %	50 %	50 %	0 %	387781847
81	NC_017382	GATTTT	2	12	172798	172809	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387781848
82	NC_017382	GATGGC	2	12	176066	176077	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387781852
83	NC_017382	CTTTCT	2	12	176318	176329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387781852
84	NC_017382	CCGCTC	2	12	178314	178325	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	387781854
85	NC_017382	GCTCTC	2	12	180742	180753	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387781856
86	NC_017382	TAAAAA	2	12	181400	181411	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017382	TTCTAA	2	12	183058	183069	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387781859
88	NC_017382	TCAATA	2	12	184740	184751	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387781861
89	NC_017382	ATCGTT	2	12	185162	185173	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387781861
90	NC_017382	AATTTC	2	12	185508	185519	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017382	TAAAAT	2	12	186880	186891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387781862
92	NC_017382	TTCTTT	2	12	187290	187301	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387781862
93	NC_017382	TTCAAT	2	12	187411	187422	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387781863
94	NC_017382	GAATAG	2	12	187828	187839	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387781863
95	NC_017382	ATTTTG	2	12	188677	188688	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387781864
96	NC_017382	CGCTTT	2	12	189155	189166	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387781864
97	NC_017382	GTTTAA	2	12	189939	189950	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387781865
98	NC_017382	AATGAA	2	12	193268	193279	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387781868
99	NC_017382	CCGCTC	2	12	195658	195669	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	387781870
100	NC_017382	GGTTTG	2	12	197265	197276	0 %	50 %	50 %	0 %	387781872
101	NC_017382	AGGCAT	2	12	199370	199381	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387781873
102	NC_017382	GCATTT	2	12	201083	201094	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387781875
103	NC_017382	TCAAAC	2	12	201650	201661	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387781876
104	NC_017382	ATAAAG	2	12	201817	201828	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387781876
105	NC_017382	GGTATT	2	12	205595	205606	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387781880
106	NC_017382	TCTAAA	2	12	205825	205836	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387781880
107	NC_017382	TGGGCA	2	12	206894	206905	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387781881
108	NC_017382	TTCTAA	2	12	207373	207384	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387781882
109	NC_017382	ATTTTC	2	12	209318	209329	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387781882
110	NC_017382	TGGGGC	2	12	216730	216741	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	387781892
111	NC_017382	CTGTAT	2	12	220181	220192	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387781896
112	NC_017382	ACTCAA	2	12	221444	221455	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387781897
113	NC_017382	TTAATG	2	12	225175	225186	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387781898
114	NC_017382	TATAAT	2	12	228260	228271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017382	ATTCTA	2	12	229160	229171	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387781902
116	NC_017382	CATAGC	2	12	230916	230927	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387781903
117	NC_017382	GTTTTG	2	12	231421	231432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387781903
118	NC_017382	TTATTT	2	12	233053	233064	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387781904
119	NC_017382	TAATTA	2	12	235932	235943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017382	GCTAAA	2	12	239442	239453	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387781910
121	NC_017382	ATTAAA	2	12	242250	242261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017382	AATGCC	2	12	244100	244111	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387781914
123	NC_017382	TGGTTT	2	12	246472	246483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387781915
124	NC_017382	GGGCCA	2	12	246679	246690	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387781915
125	NC_017382	GGTGAT	2	12	248292	248303	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387781916
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128	NC_017382	TGGAGG	2	12	252362	252373	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	387781920
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131	NC_017382	ATTTTA	2	12	265256	265267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017382	TCCCGC	2	12	269147	269158	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	387781938
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135	NC_017382	GGGGCT	2	12	283405	283416	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	387781951
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145	NC_017382	GCGTTA	2	12	297301	297312	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387781966
146	NC_017382	AGCTCA	2	12	305015	305026	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387781972
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149	NC_017382	TTTAGA	2	12	310258	310269	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387781976
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172	NC_017382	TGGCTA	2	12	349789	349800	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387782019
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225	NC_017382	TAAAAA	2	12	454453	454464	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
226	NC_017382	TTCTTT	2	12	456681	456692	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387782115
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350	NC_017382	TTTTGC	2	12	696958	696969	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387782339
351	NC_017382	TCCAAA	2	12	697131	697142	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387782339
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464	NC_017382	CAAACT	2	12	900173	900184	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387782513
465	NC_017382	GCTCAA	2	12	900194	900205	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387782513
466	NC_017382	ATCGCC	2	12	900522	900533	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387782513
467	NC_017382	ATCAAT	2	12	901503	901514	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387782514
468	NC_017382	TTTGAG	2	12	907507	907518	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387782519
469	NC_017382	TAGCGT	2	12	917711	917722	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387782528
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499	NC_017382	TAAAAA	2	12	979695	979706	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387782578
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