MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 51 chromosome

Total Repeats: 235

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017382	TTTTA	2	10	4948	4957	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017382	GCTTT	2	10	13445	13454	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017382	GCATG	2	10	22678	22687	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017382	AAAAG	2	10	22810	22819	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017382	AAATC	2	10	25669	25678	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017382	AAATT	2	10	29868	29877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017382	AGTTT	2	10	30162	30171	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017382	AATTG	2	10	54632	54641	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017382	GCCAA	2	10	57552	57561	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017382	AAAAC	2	10	59129	59138	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017382	TGCCT	2	10	59994	60003	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017382	TTAAA	2	10	79713	79722	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017382	ACAAA	2	10	79730	79739	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017382	CAAAA	2	10	86484	86493	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017382	TTACA	2	10	91307	91316	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017382	ATCTT	2	10	99082	99091	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017382	TGGCT	2	10	99623	99632	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017382	TAAGA	2	10	105966	105975	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017382	TAAAA	2	10	106037	106046	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017382	TTTGA	2	10	109110	109119	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017382	GGCTT	2	10	110431	110440	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017382	AATTT	2	10	115149	115158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017382	CAAAA	2	10	121826	121835	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017382	TTAAT	2	10	130116	130125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017382	CAAAT	2	10	169830	169839	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017382	CAAAA	2	10	177132	177141	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017382	AAATC	2	10	194049	194058	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017382	CAAAA	2	10	194067	194076	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017382	TTTAA	2	10	197093	197102	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017382	TGCTA	2	10	228361	228370	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017382	TTGGT	2	10	228808	228817	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017382	AAACC	2	10	240747	240756	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017382	TAAAA	2	10	254426	254435	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017382	AAATT	2	10	265296	265305	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017382	TAAAA	2	10	279081	279090	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017382	CATTT	2	10	280948	280957	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017382	GAAAT	2	10	293061	293070	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017382	GTTTT	2	10	298675	298684	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017382	CGGTT	2	10	308563	308572	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017382	TATAT	2	10	333076	333085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017382	GGGGT	2	10	341591	341600	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017382	AGTTC	2	10	341814	341823	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017382	AATCA	2	10	341924	341933	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017382	TGTGT	2	10	347900	347909	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017382	TTATA	2	10	348490	348499	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017382	TCAAA	2	10	350189	350198	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017382	GATTT	2	10	365995	366004	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017382	AATCA	2	10	366212	366221	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017382	TAAAA	2	10	377819	377828	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017382	GTTAA	2	10	378954	378963	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017382	AAAGG	2	10	428707	428716	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017382	TTAAT	2	10	430318	430327	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017382	GTTTT	2	10	448565	448574	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017382	TCTTT	2	10	452535	452544	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017382	AATAA	2	10	453388	453397	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017382	AAAGC	2	10	453646	453655	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017382	TAACA	2	10	461229	461238	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017382	TACAA	2	10	461241	461250	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017382	AATAA	2	10	462618	462627	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017382	TAAAA	2	10	462712	462721	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017382	AAAAT	2	10	467361	467370	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017382	AAAAT	2	10	486000	486009	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017382	TTAAA	2	10	490698	490707	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017382	TAAAA	2	10	513694	513703	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017382	TTTAA	2	10	522088	522097	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017382	ATTTT	2	10	522166	522175	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017382	AAATA	2	10	522371	522380	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017382	GATTT	2	10	554970	554979	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017382	ATAAA	2	10	570218	570227	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017382	AATTT	2	10	574800	574809	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017382	TAAAA	2	10	579454	579463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017382	AAAGA	2	10	597386	597395	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017382	TACTA	2	10	631847	631856	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017382	TAAAT	2	10	633695	633704	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017382	TTTAA	2	10	639471	639480	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017382	TTGAT	2	10	641910	641919	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017382	ATCTT	2	10	644875	644884	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017382	AGTTA	2	10	654835	654844	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017382	GTTTT	2	10	665170	665179	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017382	TTAAT	2	10	670990	670999	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017382	AAACA	2	10	675680	675689	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017382	AAACA	2	10	676961	676970	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017382	CTTTT	2	10	678088	678097	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017382	GCTTT	2	10	689884	689893	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017382	TTTTG	2	10	691029	691038	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017382	TTTTC	2	10	691220	691229	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017382	ATAGA	2	10	691334	691343	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017382	ACGCA	2	10	691576	691585	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017382	TTGCA	2	10	692275	692284	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017382	TTGTG	2	10	718764	718773	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017382	ATTAA	2	10	722661	722670	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017382	TATAT	2	10	761235	761244	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017382	ATTAT	2	10	761246	761255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017382	AAGCG	2	10	778381	778390	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017382	CCTTA	2	10	778493	778502	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_017382	TCGTT	2	10	800092	800101	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017382	TTAAT	2	10	810959	810968	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017382	TACAA	2	10	814156	814165	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017382	ATTAA	2	10	819901	819910	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017382	GTGTT	2	10	820757	820766	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017382	AATGG	2	10	821099	821108	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017382	TTGTT	2	10	840866	840875	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017382	TTAAA	2	10	840975	840984	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017382	TTTTA	2	10	865964	865973	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017382	ATTTT	2	10	866148	866157	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017382	TTGAA	2	10	866169	866178	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017382	AGCCT	2	10	871697	871706	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_017382	AGTTA	2	10	881035	881044	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017382	AAACT	2	10	885367	885376	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017382	CTAAA	2	10	889543	889552	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017382	TATAA	2	10	892000	892009	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017382	TTTGT	2	10	903272	903281	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017382	GATTT	2	10	903398	903407	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017382	TTTTA	2	10	903433	903442	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017382	AAGAA	2	10	903826	903835	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017382	TCGTA	2	10	909408	909417	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017382	TAAAA	2	10	910325	910334	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017382	TCAAG	2	10	941971	941980	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017382	CTTAA	2	10	954355	954364	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017382	ATTCA	2	10	955072	955081	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017382	ATTTT	2	10	977300	977309	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017382	TTAGT	2	10	985287	985296	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017382	TTCAA	2	10	997382	997391	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017382	CTCAT	2	10	997612	997621	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017382	TCACT	2	10	999090	999099	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017382	TACTT	2	10	999388	999397	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017382	TAAAT	2	10	999785	999794	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017382	ATTTA	2	10	1003967	1003976	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017382	TGTAG	2	10	1004045	1004054	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017382	TTAAA	2	10	1004110	1004119	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017382	ACTAA	2	10	1006252	1006261	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017382	TGAAA	2	10	1006479	1006488	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017382	TAAAC	2	10	1009968	1009977	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017382	TTGTT	2	10	1010134	1010143	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017382	CATAG	2	10	1011258	1011267	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017382	TTGCT	2	10	1012699	1012708	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017382	TTTTC	2	10	1013166	1013175	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017382	CAATT	2	10	1016874	1016883	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017382	TAAAA	2	10	1016979	1016988	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017382	CTTTC	2	10	1022885	1022894	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_017382	TTGTA	2	10	1027883	1027892	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017382	TCACT	2	10	1029669	1029678	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_017382	TTTTG	2	10	1033294	1033303	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017382	TAAAA	2	10	1034372	1034381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017382	AAAAT	2	10	1055870	1055879	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017382	ATAAA	2	10	1077330	1077339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017382	TAAAA	2	10	1088352	1088361	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_017382	GATTT	2	10	1340076	1340085	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_017382	AATTA	2	10	1369246	1369255	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_017382	CTCAT	2	10	1373590	1373599	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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197	NC_017382	TTACC	2	10	1406956	1406965	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
198	NC_017382	TTTTA	2	10	1407287	1407296	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.