MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori 51 chromosome

Total Repeats: 1061

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017382	TAAAA	2	10	1641	1650	80 %	20 %	0 %	0 %	387781701
2	NC_017382	CCATG	2	10	5199	5208	20 %	20 %	20 %	40 %	387781705
3	NC_017382	TTGCT	2	10	6206	6215	0 %	60 %	20 %	20 %	387781705
4	NC_017382	TTTCT	2	10	8266	8275	0 %	80 %	0 %	20 %	387781706
5	NC_017382	TTGAA	2	10	11767	11776	40 %	40 %	20 %	0 %	387781709
6	NC_017382	TTTTG	2	10	11783	11792	0 %	80 %	20 %	0 %	387781709
7	NC_017382	TGGTG	2	10	12618	12627	0 %	40 %	60 %	0 %	387781710
8	NC_017382	CAAAA	2	10	18500	18509	80 %	0 %	0 %	20 %	387781715
9	NC_017382	CATCA	2	10	19876	19885	40 %	20 %	0 %	40 %	387781716
10	NC_017382	TGAAA	2	10	20844	20853	60 %	20 %	20 %	0 %	387781717
11	NC_017382	GCTGT	2	10	20866	20875	0 %	40 %	40 %	20 %	387781717
12	NC_017382	CCATG	2	10	22999	23008	20 %	20 %	20 %	40 %	387781719
13	NC_017382	CTCTT	2	10	23029	23038	0 %	60 %	0 %	40 %	387781719
14	NC_017382	ATTTT	2	10	27252	27261	20 %	80 %	0 %	0 %	387781722
15	NC_017382	GATTT	2	10	28512	28521	20 %	60 %	20 %	0 %	387781722
16	NC_017382	ATTTG	2	10	29360	29369	20 %	60 %	20 %	0 %	387781723
17	NC_017382	TTTTA	2	10	32049	32058	20 %	80 %	0 %	0 %	387781726
18	NC_017382	GGCGT	2	10	32071	32080	0 %	20 %	60 %	20 %	387781726
19	NC_017382	GATTT	2	10	33248	33257	20 %	60 %	20 %	0 %	387781727
20	NC_017382	AGGGC	2	10	33598	33607	20 %	0 %	60 %	20 %	387781728
21	NC_017382	ATTGA	2	10	34262	34271	40 %	40 %	20 %	0 %	387781728
22	NC_017382	TGGTG	2	10	34384	34393	0 %	40 %	60 %	0 %	387781728
23	NC_017382	TTTTA	2	10	34568	34577	20 %	80 %	0 %	0 %	387781729
24	NC_017382	GCGCT	2	10	35020	35029	0 %	20 %	40 %	40 %	387781729
25	NC_017382	ACCTT	2	10	35491	35500	20 %	40 %	0 %	40 %	387781730
26	NC_017382	CTTTA	2	10	35769	35778	20 %	60 %	0 %	20 %	387781730
27	NC_017382	TAAAA	2	10	36231	36240	80 %	20 %	0 %	0 %	387781730
28	NC_017382	AAAAT	2	10	36665	36674	80 %	20 %	0 %	0 %	387781730
29	NC_017382	ATTTT	2	10	41963	41972	20 %	80 %	0 %	0 %	387781733
30	NC_017382	GATTT	2	10	42251	42260	20 %	60 %	20 %	0 %	387781733
31	NC_017382	AAAAT	2	10	42428	42437	80 %	20 %	0 %	0 %	387781734
32	NC_017382	ATTTC	2	10	45146	45155	20 %	60 %	0 %	20 %	387781736
33	NC_017382	AAGAT	2	10	45272	45281	60 %	20 %	20 %	0 %	387781736
34	NC_017382	ATTTA	2	10	45515	45524	40 %	60 %	0 %	0 %	387781737
35	NC_017382	TGAAA	2	10	45692	45701	60 %	20 %	20 %	0 %	387781737
36	NC_017382	GCGGG	2	10	46192	46201	0 %	0 %	80 %	20 %	387781737
37	NC_017382	TGGCT	2	10	47199	47208	0 %	40 %	40 %	20 %	387781738
38	NC_017382	TTTAG	2	10	47554	47563	20 %	60 %	20 %	0 %	387781738
39	NC_017382	TTTTC	2	10	48905	48914	0 %	80 %	0 %	20 %	387781739
40	NC_017382	ATCAA	2	10	49691	49700	60 %	20 %	0 %	20 %	387781740
41	NC_017382	TTTGT	2	10	50357	50366	0 %	80 %	20 %	0 %	387781740
42	NC_017382	AGATG	2	10	53302	53311	40 %	20 %	40 %	0 %	387781744
43	NC_017382	TTTAT	2	10	54043	54052	20 %	80 %	0 %	0 %	387781745
44	NC_017382	GCAAG	2	10	58477	58486	40 %	0 %	40 %	20 %	387781746
45	NC_017382	AAATG	2	10	62684	62693	60 %	20 %	20 %	0 %	387781748
46	NC_017382	TTGGC	2	10	63522	63531	0 %	40 %	40 %	20 %	387781750
47	NC_017382	AAAGA	2	10	64349	64358	80 %	0 %	20 %	0 %	387781751
48	NC_017382	ATTCA	2	10	64578	64587	40 %	40 %	0 %	20 %	387781751
49	NC_017382	AAAAT	2	10	67280	67289	80 %	20 %	0 %	0 %	387781753
50	NC_017382	TCTTT	2	10	67907	67916	0 %	80 %	0 %	20 %	387781754
51	NC_017382	AGAAA	2	10	68187	68196	80 %	0 %	20 %	0 %	387781754
52	NC_017382	TGCCT	2	10	69078	69087	0 %	40 %	20 %	40 %	387781755
53	NC_017382	TAAAA	2	10	72557	72566	80 %	20 %	0 %	0 %	387781758
54	NC_017382	ATTTC	2	10	72632	72641	20 %	60 %	0 %	20 %	387781758
55	NC_017382	TGAAA	2	10	74682	74691	60 %	20 %	20 %	0 %	387781760
56	NC_017382	TCAAA	2	10	74936	74945	60 %	20 %	0 %	20 %	387781760
57	NC_017382	TCGCC	2	10	77679	77688	0 %	20 %	20 %	60 %	387781761
58	NC_017382	TAAAA	2	10	77975	77984	80 %	20 %	0 %	0 %	387781761
59	NC_017382	TCAAA	2	10	78691	78700	60 %	20 %	0 %	20 %	387781761
60	NC_017382	TATCC	2	10	82634	82643	20 %	40 %	0 %	40 %	387781765
61	NC_017382	TCAAT	2	10	84836	84845	40 %	40 %	0 %	20 %	387781768
62	NC_017382	CTTCT	2	10	85678	85687	0 %	60 %	0 %	40 %	387781769
63	NC_017382	TCCAA	2	10	86167	86176	40 %	20 %	0 %	40 %	387781770
64	NC_017382	TTTTG	2	10	89453	89462	0 %	80 %	20 %	0 %	387781773
65	NC_017382	ACGCC	2	10	89759	89768	20 %	0 %	20 %	60 %	387781773
66	NC_017382	AAAGC	2	10	90525	90534	60 %	0 %	20 %	20 %	387781774
67	NC_017382	CAAGC	2	10	94706	94715	40 %	0 %	20 %	40 %	387781779
68	NC_017382	ATGCC	2	10	100044	100053	20 %	20 %	20 %	40 %	387781781
69	NC_017382	TTGAT	2	10	100962	100971	20 %	60 %	20 %	0 %	387781783
70	NC_017382	GGCGT	2	10	102776	102785	0 %	20 %	60 %	20 %	387781785
71	NC_017382	CTTTC	2	10	106321	106330	0 %	60 %	0 %	40 %	387781787
72	NC_017382	GAAAT	2	10	108269	108278	60 %	20 %	20 %	0 %	387781789
73	NC_017382	TCTTT	2	10	108639	108648	0 %	80 %	0 %	20 %	387781789
74	NC_017382	CGGCA	2	10	113114	113123	20 %	0 %	40 %	40 %	387781793
75	NC_017382	ACGAT	2	10	115597	115606	40 %	20 %	20 %	20 %	387781795
76	NC_017382	TTTTC	2	10	115792	115801	0 %	80 %	0 %	20 %	387781795
77	NC_017382	AATTG	2	10	117439	117448	40 %	40 %	20 %	0 %	387781796
78	NC_017382	TCGTT	2	10	119250	119259	0 %	60 %	20 %	20 %	387781797
79	NC_017382	TCTTT	2	10	122544	122553	0 %	80 %	0 %	20 %	387781800
80	NC_017382	AAAGC	2	10	125313	125322	60 %	0 %	20 %	20 %	387781802
81	NC_017382	TGTCT	2	10	126782	126791	0 %	60 %	20 %	20 %	387781804
82	NC_017382	CAAAT	2	10	127175	127184	60 %	20 %	0 %	20 %	387781804
83	NC_017382	ACCCT	2	10	128604	128613	20 %	20 %	0 %	60 %	387781805
84	NC_017382	ATGCC	2	10	128736	128745	20 %	20 %	20 %	40 %	387781805
85	NC_017382	TGATT	2	10	130725	130734	20 %	60 %	20 %	0 %	387781807
86	NC_017382	GAATT	2	10	131358	131367	40 %	40 %	20 %	0 %	387781809
87	NC_017382	GGATC	2	10	135234	135243	20 %	20 %	40 %	20 %	387781811
88	NC_017382	AGCTC	2	10	135254	135263	20 %	20 %	20 %	40 %	387781811
89	NC_017382	AAGCC	2	10	137142	137151	40 %	0 %	20 %	40 %	387781812
90	NC_017382	GTTTG	2	10	138443	138452	0 %	60 %	40 %	0 %	387781813
91	NC_017382	TTGAT	2	10	138962	138971	20 %	60 %	20 %	0 %	387781813
92	NC_017382	CGCTG	2	10	140062	140071	0 %	20 %	40 %	40 %	387781814
93	NC_017382	TTTGA	2	10	140209	140218	20 %	60 %	20 %	0 %	387781814
94	NC_017382	GACTT	2	10	140743	140752	20 %	40 %	20 %	20 %	387781814
95	NC_017382	ATCTC	2	10	141494	141503	20 %	40 %	0 %	40 %	387781814
96	NC_017382	CGCTT	2	10	141652	141661	0 %	40 %	20 %	40 %	387781814
97	NC_017382	TTTGT	2	10	142006	142015	0 %	80 %	20 %	0 %	387781815
98	NC_017382	TGCGT	2	10	144039	144048	0 %	40 %	40 %	20 %	387781817
99	NC_017382	GAAAA	2	10	144200	144209	80 %	0 %	20 %	0 %	387781817
100	NC_017382	GAAAA	2	10	144518	144527	80 %	0 %	20 %	0 %	387781817
101	NC_017382	CACAA	2	10	145081	145090	60 %	0 %	0 %	40 %	387781819
102	NC_017382	ATTTT	2	10	147475	147484	20 %	80 %	0 %	0 %	387781823
103	NC_017382	ATGTT	2	10	147557	147566	20 %	60 %	20 %	0 %	387781823
104	NC_017382	AAAAG	2	10	147969	147978	80 %	0 %	20 %	0 %	387781823
105	NC_017382	CGCTG	2	10	149575	149584	0 %	20 %	40 %	40 %	387781824
106	NC_017382	AAATC	2	10	150204	150213	60 %	20 %	0 %	20 %	387781824
107	NC_017382	AAAAT	2	10	151676	151685	80 %	20 %	0 %	0 %	387781825
108	NC_017382	TTTTC	2	10	154026	154035	0 %	80 %	0 %	20 %	387781828
109	NC_017382	GTAAA	2	10	154578	154587	60 %	20 %	20 %	0 %	387781829
110	NC_017382	TTCTT	2	10	155982	155991	0 %	80 %	0 %	20 %	387781830
111	NC_017382	TCTTT	2	10	156476	156485	0 %	80 %	0 %	20 %	387781831
112	NC_017382	TTTTG	2	10	157639	157648	0 %	80 %	20 %	0 %	387781832
113	NC_017382	GCGAT	2	10	158432	158441	20 %	20 %	40 %	20 %	387781832
114	NC_017382	GCTTG	2	10	158688	158697	0 %	40 %	40 %	20 %	387781832
115	NC_017382	TTTTG	2	10	159340	159349	0 %	80 %	20 %	0 %	387781833
116	NC_017382	ACGCC	2	10	164702	164711	20 %	0 %	20 %	60 %	387781836
117	NC_017382	TTATT	2	10	166598	166607	20 %	80 %	0 %	0 %	387781840
118	NC_017382	GCGTT	2	10	166956	166965	0 %	40 %	40 %	20 %	387781841
119	NC_017382	GATTT	2	10	167930	167939	20 %	60 %	20 %	0 %	387781842
120	NC_017382	GGGGA	2	10	170654	170663	20 %	0 %	80 %	0 %	387781845
121	NC_017382	AGATT	2	10	172453	172462	40 %	40 %	20 %	0 %	387781847
122	NC_017382	CTTTT	2	10	174556	174565	0 %	80 %	0 %	20 %	387781851
123	NC_017382	ATTTT	2	10	175886	175895	20 %	80 %	0 %	0 %	387781852
124	NC_017382	ATTCA	2	10	177622	177631	40 %	40 %	0 %	20 %	387781853
125	NC_017382	AAAAC	2	10	179960	179969	80 %	0 %	0 %	20 %	387781855
126	NC_017382	AGGCT	2	10	186549	186558	20 %	20 %	40 %	20 %	387781862
127	NC_017382	TGGGG	2	10	189444	189453	0 %	20 %	80 %	0 %	387781865
128	NC_017382	ATTTG	2	10	190221	190230	20 %	60 %	20 %	0 %	387781865
129	NC_017382	TATCT	2	10	191616	191625	20 %	60 %	0 %	20 %	387781867
130	NC_017382	TAAAA	2	10	191712	191721	80 %	20 %	0 %	0 %	387781867
131	NC_017382	AAATG	2	10	194444	194453	60 %	20 %	20 %	0 %	387781869
132	NC_017382	TGTAA	2	10	195234	195243	40 %	40 %	20 %	0 %	387781870
133	NC_017382	AGCTT	2	10	196272	196281	20 %	40 %	20 %	20 %	387781871
134	NC_017382	TCAAT	2	10	196444	196453	40 %	40 %	0 %	20 %	387781871
135	NC_017382	ATAAA	2	10	196730	196739	80 %	20 %	0 %	0 %	387781871
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