MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori 2018 chromosome

Total Repeats: 763

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017381	CCGCAG	2	12	1087	1098	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385230892
2	NC_017381	ATTATA	2	12	1839	1850	50 %	50 %	0 %	0 %	385230893
3	NC_017381	CAAAAA	2	12	5345	5356	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017381	GCTTGC	2	12	6384	6395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385230901
5	NC_017381	CCCATT	2	12	6896	6907	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385230901
6	NC_017381	TGCCAT	2	12	7072	7083	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385230901
7	NC_017381	GAAACC	2	12	7897	7908	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385230903
8	NC_017381	ATTATA	2	12	9917	9928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017381	ATTTGA	2	12	13109	13120	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385230907
10	NC_017381	AAACAC	2	12	18487	18498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017381	AGAAAA	2	12	18837	18848	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385230913
12	NC_017381	AGCTTT	2	12	20538	20549	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385230914
13	NC_017381	GTTTGG	2	12	21444	21455	0 %	50 %	50 %	0 %	385230916
14	NC_017381	GAATGG	2	12	22236	22247	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385230916
15	NC_017381	GATAAA	2	12	22412	22423	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385230916
16	NC_017381	TATCAA	2	12	30192	30203	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385230924
17	NC_017381	ACTTTT	2	12	30493	30504	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385230924
18	NC_017381	AAGGCT	2	12	32079	32090	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385230925
19	NC_017381	GCGTGG	2	12	32881	32892	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385230927
20	NC_017381	TAATGA	2	12	33017	33028	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385230927
21	NC_017381	TTGAAT	2	12	34080	34091	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385230927
22	NC_017381	TAAGGA	2	12	34379	34390	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385230927
23	NC_017381	TAGGGG	2	12	35895	35906	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385230930
24	NC_017381	TTCTAC	2	12	37379	37390	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385230931
25	NC_017381	AAAGAA	2	12	38995	39006	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385230934
26	NC_017381	CAAAAT	2	12	41335	41346	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385230936
27	NC_017381	CACTAC	2	12	44744	44755	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385230940
28	NC_017381	ACTTAG	2	12	44880	44891	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017381	CGCAAA	2	12	45730	45741	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385230942
30	NC_017381	TTTTCA	2	12	49498	49509	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385230945
31	NC_017381	GGCTAG	2	12	49972	49983	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385230946
32	NC_017381	CTTTTT	2	12	52081	52092	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385230948
33	NC_017381	CCACGC	2	12	57558	57569	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385230950
34	NC_017381	CTAAAG	2	12	58845	58856	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385230950
35	NC_017381	AGAAAA	2	12	60446	60457	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017381	GATGTG	2	12	62008	62019	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385230955
37	NC_017381	AGCCAA	2	12	62086	62097	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385230955
38	NC_017381	CCAACA	2	12	63958	63969	50 %	0 %	0 %	50 %	385230957
39	NC_017381	TTTTGT	2	12	64296	64307	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385230958
40	NC_017381	AAAGAG	2	12	64575	64586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385230958
41	NC_017381	ACAGAA	2	12	65852	65863	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385230959
42	NC_017381	AGCGGG	2	12	67648	67659	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385230963
43	NC_017381	ACGCCC	2	12	75480	75491	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385230972
44	NC_017381	AAGGGC	2	12	78210	78221	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385230976
45	NC_017381	CGCTAA	2	12	78572	78583	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385230976
46	NC_017381	CGCTCA	2	12	78746	78757	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385230976
47	NC_017381	AGTGGC	2	12	79842	79853	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385230979
48	NC_017381	GTGAGC	2	12	80055	80066	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385230979
49	NC_017381	CAACGA	2	12	80401	80412	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385230979
50	NC_017381	GGGGGT	2	12	81180	81191	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	385230980
51	NC_017381	GGCATG	2	12	81922	81933	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385230981
52	NC_017381	ACACCG	2	12	82856	82867	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385230981
53	NC_017381	ATATTG	2	12	83735	83746	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385230983
54	NC_017381	AACAGG	2	12	91724	91735	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385230990
55	NC_017381	TTGTTT	2	12	91806	91817	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385230990
56	NC_017381	GGCTTT	2	12	93059	93070	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385230992
57	NC_017381	TACAAA	2	12	94096	94107	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017381	CAAGCA	2	12	95673	95684	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385230994
59	NC_017381	ATTAGA	2	12	95973	95984	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385230994
60	NC_017381	CAAGAT	2	12	96311	96322	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385230995
61	NC_017381	GATTTT	2	12	97732	97743	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385230997
62	NC_017381	AAACTC	2	12	97849	97860	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385230997
63	NC_017381	TCAAAA	2	12	99164	99175	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385230998
64	NC_017381	TATCGT	2	12	99743	99754	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385230999
65	NC_017381	GCGGTG	2	12	99862	99873	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385230999
66	NC_017381	TTAATT	2	12	100397	100408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385230999
67	NC_017381	AATATT	2	12	102947	102958	50 %	50 %	0 %	0 %	385231000
68	NC_017381	TAAAAT	2	12	107835	107846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385231005
69	NC_017381	GATAAC	2	12	112442	112453	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017381	TTTTCT	2	12	115358	115369	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385231012
71	NC_017381	TTGTCT	2	12	118549	118560	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385231017
72	NC_017381	ATTGCC	2	12	119460	119471	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385231017
73	NC_017381	CGCTCG	2	12	120380	120391	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385231018
74	NC_017381	TAGGCA	2	12	122917	122928	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385231020
75	NC_017381	TGAATT	2	12	126672	126683	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385231023
76	NC_017381	TTTCAA	2	12	126831	126842	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385231023
77	NC_017381	ATGATA	2	12	127791	127802	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017381	TCGCTA	2	12	128431	128442	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385231025
79	NC_017381	AGCAAA	2	12	130173	130184	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385231026
80	NC_017381	GTTTTA	2	12	131184	131195	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017381	TGGTTT	2	12	131697	131708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385231029
82	NC_017381	TCATGA	2	12	132993	133004	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385231031
83	NC_017381	AAAAAT	2	12	139506	139517	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385231037
84	NC_017381	TTGGCT	2	12	140794	140805	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385231039
85	NC_017381	TAGCGA	2	12	141642	141653	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385231040
86	NC_017381	ACGATT	2	12	144165	144176	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385231042
87	NC_017381	TTAGCG	2	12	144534	144545	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385231042
88	NC_017381	TATCGC	2	12	144746	144757	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385231042
89	NC_017381	TTTTAG	2	12	145858	145869	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385231043
90	NC_017381	ATCGCT	2	12	146451	146462	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385231043
91	NC_017381	TTCTAT	2	12	149834	149845	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385231046
92	NC_017381	TTGTTT	2	12	152822	152833	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017381	TTGGGT	2	12	158791	158802	0 %	50 %	50 %	0 %	385231057
94	NC_017381	GATTTT	2	12	159304	159315	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385231058
95	NC_017381	CATGCT	2	12	160284	160295	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385231060
96	NC_017381	CTTTCT	2	12	162770	162781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385231062
97	NC_017381	TTTCAC	2	12	163834	163845	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017381	CCGCTC	2	12	164662	164673	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385231065
99	NC_017381	TAAAAA	2	12	167741	167752	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017381	ATCGTT	2	12	171480	171491	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385231072
101	NC_017381	AATTTC	2	12	171831	171842	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385231073
102	NC_017381	TAAAAT	2	12	173355	173366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385231074
103	NC_017381	TTCTTT	2	12	173765	173776	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385231074
104	NC_017381	ATTTTG	2	12	175163	175174	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385231076
105	NC_017381	CGCTTT	2	12	175641	175652	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385231076
106	NC_017381	ACTTAT	2	12	175738	175749	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385231076
107	NC_017381	GTTTAA	2	12	176425	176436	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385231077
108	NC_017381	TGGTTA	2	12	179088	179099	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385231080
109	NC_017381	CCGCTC	2	12	179670	179681	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385231081
110	NC_017381	GAGATA	2	12	181254	181265	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385231083
111	NC_017381	TGGTAG	2	12	181320	181331	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385231084
112	NC_017381	TAAAAA	2	12	181825	181836	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385231084
113	NC_017381	GAAAAA	2	12	183308	183319	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385231085
114	NC_017381	AGGCAT	2	12	183397	183408	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385231085
115	NC_017381	GCATTT	2	12	185110	185121	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385231087
116	NC_017381	GGGCGA	2	12	185149	185160	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385231087
117	NC_017381	ATAAAG	2	12	185823	185834	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385231088
118	NC_017381	ATAAAG	2	12	185841	185852	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385231088
119	NC_017381	TTAAAG	2	12	188717	188728	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385231091
120	NC_017381	GGTATT	2	12	189619	189630	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385231092
121	NC_017381	TCTAAA	2	12	189849	189860	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385231092
122	NC_017381	TGGGCA	2	12	190913	190924	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385231093
123	NC_017381	ATTTTC	2	12	193337	193348	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385231094
124	NC_017381	TCGCTT	2	12	197386	197397	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385231099
125	NC_017381	TGGGGC	2	12	200739	200750	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385231104
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127	NC_017381	CTGTAT	2	12	204512	204523	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385231107
128	NC_017381	TTGTTT	2	12	205045	205056	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385231107
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132	NC_017381	GGCGTT	2	12	212945	212956	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017381	AAAAAC	2	12	212957	212968	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017381	CATAGC	2	12	215024	215035	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385231117
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156	NC_017381	AAATGG	2	12	266185	266196	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385231172
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204	NC_017381	GTTTTT	2	12	357120	357131	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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225	NC_017381	TTGAAT	2	12	391711	391722	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385231300
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228	NC_017381	TTGAAA	2	12	394989	395000	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385231304
229	NC_017381	GCGTTT	2	12	397299	397310	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385231307
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232	NC_017381	GAATTT	2	12	399275	399286	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385231309
233	NC_017381	AATTTA	2	12	403300	403311	50 %	50 %	0 %	0 %	385231313
234	NC_017381	AAAATC	2	12	405021	405032	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385231315
235	NC_017381	TGTTTT	2	12	405608	405619	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385231315
236	NC_017381	TTCAAA	2	12	405670	405681	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385231315
237	NC_017381	TTATGG	2	12	411352	411363	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385231320
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338	NC_017381	ATGCAA	2	12	624869	624880	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385231533
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340	NC_017381	GTTTTT	2	12	629610	629621	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385231538
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342	NC_017381	AGCCAT	2	12	633383	633394	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385231542
343	NC_017381	AGAAAA	3	18	637949	637966	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385231548
344	NC_017381	TATCGC	2	12	639600	639611	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385231550
345	NC_017381	TTTAAA	2	12	642858	642869	50 %	50 %	0 %	0 %	385231553
346	NC_017381	GAACAT	2	12	643815	643826	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385231554
347	NC_017381	GCATTG	2	12	644720	644731	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385231554
348	NC_017381	CATAGC	2	12	645980	645991	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385231556
349	NC_017381	TCAAAA	2	12	647351	647362	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385231557
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352	NC_017381	GCAATG	2	12	652009	652020	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385231560
353	NC_017381	AAAAGA	2	12	652299	652310	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385231561
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448	NC_017381	CTTTGG	2	12	871291	871302	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385231784
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453	NC_017381	AACGCT	2	12	880603	880614	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385231790
454	NC_017381	AAAATA	2	12	882150	882161	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_017381	CAAACT	2	12	883277	883288	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385231793
456	NC_017381	GCTCAA	2	12	883298	883309	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385231793
457	NC_017381	ATCGCC	2	12	883626	883637	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385231793
458	NC_017381	GCTTGC	2	12	888496	888507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385231802
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460	NC_017381	TGCATT	2	12	889711	889722	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
461	NC_017381	TTTGAG	2	12	891176	891187	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385231804
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463	NC_017381	CGGCTT	2	12	903018	903029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385231816
464	NC_017381	GCGTTA	2	12	904109	904120	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385231816
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466	NC_017381	AAAGTG	2	12	910234	910245	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385231822
467	NC_017381	AACCTT	2	12	910873	910884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385231822
468	NC_017381	TTGACT	2	12	911260	911271	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385231822
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470	NC_017381	AAATTT	2	12	912585	912596	50 %	50 %	0 %	0 %	385231824
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