MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori 2018 chromosome

Total Repeats: 1266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017381	GATTA	2	10	2292	2301	40 %	40 %	20 %	0 %	385230893
2	NC_017381	TCATT	2	10	4955	4964	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017381	CAAAA	2	10	5233	5242	80 %	0 %	0 %	20 %	385230899
4	NC_017381	TTGAT	2	10	6354	6363	20 %	60 %	20 %	0 %	385230901
5	NC_017381	TTGCT	2	10	6471	6480	0 %	60 %	20 %	20 %	385230901
6	NC_017381	TTTTA	2	10	7634	7643	20 %	80 %	0 %	0 %	385230902
7	NC_017381	TTTCT	2	10	8561	8570	0 %	80 %	0 %	20 %	385230903
8	NC_017381	AATTT	2	10	9400	9409	40 %	60 %	0 %	0 %	385230903
9	NC_017381	AAAGG	2	10	11035	11044	60 %	0 %	40 %	0 %	385230905
10	NC_017381	TTTTG	2	10	12091	12100	0 %	80 %	20 %	0 %	385230906
11	NC_017381	TGGTG	2	10	12930	12939	0 %	40 %	60 %	0 %	385230907
12	NC_017381	GCTTT	2	10	13757	13766	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017381	CTGTA	2	10	23437	23446	20 %	40 %	20 %	20 %	385230917
14	NC_017381	CCATG	2	10	23507	23516	20 %	20 %	20 %	40 %	385230917
15	NC_017381	CTCTT	2	10	23537	23546	0 %	60 %	0 %	40 %	385230917
16	NC_017381	TTGAT	2	10	25006	25015	20 %	60 %	20 %	0 %	385230918
17	NC_017381	CTTTA	2	10	25455	25464	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017381	AGCCT	2	10	26029	26038	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017381	CAAGC	2	10	28211	28220	40 %	0 %	20 %	40 %	385230921
20	NC_017381	TTTTA	2	10	29140	29149	20 %	80 %	0 %	0 %	385230922
21	NC_017381	TAGCG	2	10	29802	29811	20 %	20 %	40 %	20 %	385230923
22	NC_017381	TGATT	2	10	32159	32168	20 %	60 %	20 %	0 %	385230925
23	NC_017381	GTGGG	2	10	34042	34051	0 %	20 %	80 %	0 %	385230927
24	NC_017381	ATCAA	2	10	36174	36183	60 %	20 %	0 %	20 %	385230930
25	NC_017381	TTTTG	2	10	38670	38679	0 %	80 %	20 %	0 %	385230934
26	NC_017381	TGAGT	2	10	40690	40699	20 %	40 %	40 %	0 %	385230936
27	NC_017381	CAAAA	2	10	40793	40802	80 %	0 %	0 %	20 %	385230936
28	NC_017381	AAGCC	2	10	41075	41084	40 %	0 %	20 %	40 %	385230936
29	NC_017381	CAAAC	2	10	41716	41725	60 %	0 %	0 %	40 %	385230936
30	NC_017381	AGAAA	2	10	42401	42410	80 %	0 %	20 %	0 %	385230937
31	NC_017381	TCGCT	2	10	44224	44233	0 %	40 %	20 %	40 %	385230939
32	NC_017381	TAAAA	2	10	45665	45674	80 %	20 %	0 %	0 %	385230942
33	NC_017381	GCGAT	2	10	46196	46205	20 %	20 %	40 %	20 %	385230943
34	NC_017381	GCTCC	2	10	46998	47007	0 %	20 %	20 %	60 %	385230943
35	NC_017381	ATGAA	2	10	47180	47189	60 %	20 %	20 %	0 %	385230943
36	NC_017381	TCGCA	2	10	47535	47544	20 %	20 %	20 %	40 %	385230943
37	NC_017381	CAATA	2	10	49103	49112	60 %	20 %	0 %	20 %	385230944
38	NC_017381	AGGCT	2	10	49415	49424	20 %	20 %	40 %	20 %	385230945
39	NC_017381	TGCCT	2	10	49790	49799	0 %	40 %	20 %	40 %	385230945
40	NC_017381	GATTG	2	10	50274	50283	20 %	40 %	40 %	0 %	385230946
41	NC_017381	GCTTT	2	10	50330	50339	0 %	60 %	20 %	20 %	385230946
42	NC_017381	GATAA	2	10	50582	50591	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017381	AAATA	2	10	51576	51585	80 %	20 %	0 %	0 %	385230947
44	NC_017381	ATATT	2	10	51742	51751	40 %	60 %	0 %	0 %	385230947
45	NC_017381	CCAAA	2	10	51909	51918	60 %	0 %	0 %	40 %	385230948
46	NC_017381	TAAAA	2	10	53960	53969	80 %	20 %	0 %	0 %	385230948
47	NC_017381	ATCAA	2	10	53991	54000	60 %	20 %	0 %	20 %	385230948
48	NC_017381	TGAAA	2	10	54722	54731	60 %	20 %	20 %	0 %	385230949
49	NC_017381	TCAAA	2	10	54976	54985	60 %	20 %	0 %	20 %	385230949
50	NC_017381	TCGTT	2	10	55786	55795	0 %	60 %	20 %	20 %	385230949
51	NC_017381	TAAAA	2	10	58015	58024	80 %	20 %	0 %	0 %	385230950
52	NC_017381	TCAAA	2	10	58731	58740	60 %	20 %	0 %	20 %	385230950
53	NC_017381	AACGA	2	10	59734	59743	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017381	TTAAA	2	10	59746	59755	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017381	ACAAA	2	10	59774	59783	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017381	TGATA	2	10	60088	60097	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017381	AAGCC	2	10	60548	60557	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_017381	GGTGG	2	10	67569	67578	0 %	20 %	80 %	0 %	385230963
59	NC_017381	CTTGG	2	10	71565	71574	0 %	40 %	40 %	20 %	385230968
60	NC_017381	TGCCT	2	10	71696	71705	0 %	40 %	20 %	40 %	385230968
61	NC_017381	TCCAA	2	10	72108	72117	40 %	20 %	0 %	40 %	385230969
62	NC_017381	CAAAA	2	10	72425	72434	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017381	TTTTG	2	10	75436	75445	0 %	80 %	20 %	0 %	385230972
64	NC_017381	ACGCC	2	10	75742	75751	20 %	0 %	20 %	60 %	385230972
65	NC_017381	AAAGC	2	10	76508	76517	60 %	0 %	20 %	20 %	385230973
66	NC_017381	TTACA	2	10	77290	77299	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017381	TAAAA	2	10	78973	78982	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017381	TTTTG	2	10	81250	81259	0 %	80 %	20 %	0 %	385230980
69	NC_017381	GATTT	2	10	81261	81270	20 %	60 %	20 %	0 %	385230980
70	NC_017381	TTTTC	2	10	84727	84736	0 %	80 %	0 %	20 %	385230984
71	NC_017381	CCATA	2	10	85055	85064	40 %	20 %	0 %	40 %	385230984
72	NC_017381	TGGCT	2	10	85421	85430	0 %	40 %	40 %	20 %	385230984
73	NC_017381	ATGCC	2	10	85863	85872	20 %	20 %	20 %	40 %	385230985
74	NC_017381	TTGAT	2	10	86949	86958	20 %	60 %	20 %	0 %	385230987
75	NC_017381	GGCGT	2	10	88763	88772	0 %	20 %	60 %	20 %	385230989
76	NC_017381	TAAGA	2	10	91970	91979	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017381	ATTAT	2	10	92026	92035	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017381	CTTTC	2	10	92355	92364	0 %	60 %	0 %	40 %	385230991
79	NC_017381	CGAGA	2	10	94375	94384	40 %	0 %	40 %	20 %	385230993
80	NC_017381	TGATT	2	10	95319	95328	20 %	60 %	20 %	0 %	385230994
81	NC_017381	GGCTT	2	10	96641	96650	0 %	40 %	40 %	20 %	385230995
82	NC_017381	ATAAA	2	10	98643	98652	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017381	ACGAT	2	10	101601	101610	40 %	20 %	20 %	20 %	385231000
84	NC_017381	TTTTC	2	10	101796	101805	0 %	80 %	0 %	20 %	385231000
85	NC_017381	AATTG	2	10	103329	103338	40 %	40 %	20 %	0 %	385231001
86	NC_017381	TCGTT	2	10	105231	105240	0 %	60 %	20 %	20 %	385231002
87	NC_017381	GTGGG	2	10	105553	105562	0 %	20 %	80 %	0 %	385231003
88	NC_017381	TTAGA	2	10	106244	106253	40 %	40 %	20 %	0 %	385231004
89	NC_017381	CAAGC	2	10	107349	107358	40 %	0 %	20 %	40 %	385231004
90	NC_017381	AAAGC	2	10	111322	111331	60 %	0 %	20 %	20 %	385231008
91	NC_017381	GAATG	2	10	112554	112563	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017381	CAAAT	2	10	113879	113888	60 %	20 %	0 %	20 %	385231011
93	NC_017381	CGTTT	2	10	114512	114521	0 %	60 %	20 %	20 %	385231011
94	NC_017381	ACCCT	2	10	115307	115316	20 %	20 %	0 %	60 %	385231012
95	NC_017381	ATGCC	2	10	115439	115448	20 %	20 %	20 %	40 %	385231012
96	NC_017381	GATTT	2	10	116822	116831	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017381	TGATT	2	10	117433	117442	20 %	60 %	20 %	0 %	385231014
98	NC_017381	GATCG	2	10	121947	121956	20 %	20 %	40 %	20 %	385231020
99	NC_017381	AGCTC	2	10	121966	121975	20 %	20 %	20 %	40 %	385231020
100	NC_017381	AAGCC	2	10	123854	123863	40 %	0 %	20 %	40 %	385231021
101	NC_017381	CCATA	2	10	124732	124741	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017381	TTGAT	2	10	124919	124928	20 %	60 %	20 %	0 %	385231022
103	NC_017381	TTTGA	2	10	126157	126166	20 %	60 %	20 %	0 %	385231023
104	NC_017381	ATCTC	2	10	127442	127451	20 %	40 %	0 %	40 %	385231023
105	NC_017381	TTTGT	2	10	127952	127961	0 %	80 %	20 %	0 %	385231024
106	NC_017381	TGCGT	2	10	129984	129993	0 %	40 %	40 %	20 %	385231026
107	NC_017381	ATTTT	2	10	132592	132601	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017381	ATTTT	2	10	133469	133478	20 %	80 %	0 %	0 %	385231032
109	NC_017381	ATGTT	2	10	133551	133560	20 %	60 %	20 %	0 %	385231033
110	NC_017381	AAAAG	2	10	133963	133972	80 %	0 %	20 %	0 %	385231033
111	NC_017381	AATAA	2	10	134818	134827	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017381	AAATC	2	10	135978	135987	60 %	20 %	0 %	20 %	385231034
113	NC_017381	AAAAT	2	10	137450	137459	80 %	20 %	0 %	0 %	385231035
114	NC_017381	ATAAA	2	10	139228	139237	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017381	AGAGC	2	10	139691	139700	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017381	TTTTC	2	10	140006	140015	0 %	80 %	0 %	20 %	385231038
117	NC_017381	TTCTT	2	10	141962	141971	0 %	80 %	0 %	20 %	385231040
118	NC_017381	TCTTT	2	10	142456	142465	0 %	80 %	0 %	20 %	385231041
119	NC_017381	GTTTT	2	10	143618	143627	0 %	80 %	20 %	0 %	385231042
120	NC_017381	AATTC	2	10	144253	144262	40 %	40 %	0 %	20 %	385231042
121	NC_017381	GCGAT	2	10	144412	144421	20 %	20 %	40 %	20 %	385231042
122	NC_017381	GCTTG	2	10	144668	144677	0 %	40 %	40 %	20 %	385231042
123	NC_017381	TTTTG	2	10	145320	145329	0 %	80 %	20 %	0 %	385231043
124	NC_017381	ACGCC	2	10	150679	150688	20 %	0 %	20 %	60 %	385231046
125	NC_017381	GCGTT	2	10	152942	152951	0 %	40 %	40 %	20 %	385231051
126	NC_017381	ATTTG	2	10	153919	153928	20 %	60 %	20 %	0 %	385231052
127	NC_017381	CAAAT	2	10	156338	156347	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017381	GGATT	2	10	156501	156510	20 %	40 %	40 %	0 %	385231055
129	NC_017381	AGATT	2	10	158960	158969	40 %	40 %	20 %	0 %	385231057
130	NC_017381	AAGCC	2	10	160297	160306	40 %	0 %	20 %	40 %	385231060
131	NC_017381	TGGCG	2	10	160971	160980	0 %	20 %	60 %	20 %	385231060
132	NC_017381	GTTTT	2	10	162053	162062	0 %	80 %	20 %	0 %	385231061
133	NC_017381	ATTTT	2	10	162338	162347	20 %	80 %	0 %	0 %	385231062
134	NC_017381	TTGAA	2	10	163609	163618	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017381	ATTCA	2	10	163970	163979	40 %	40 %	0 %	20 %	385231064
136	NC_017381	CACTT	2	10	164174	164183	20 %	40 %	0 %	40 %	385231064
137	NC_017381	ATCTT	2	10	167366	167375	20 %	60 %	0 %	20 %	385231067
138	NC_017381	TTTAA	2	10	172033	172042	40 %	60 %	0 %	0 %	385231073
139	NC_017381	AATAT	2	10	174692	174701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017381	TTTCC	2	10	174744	174753	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_017381	GAATG	2	10	174830	174839	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017381	CCGCA	2	10	175221	175230	20 %	0 %	20 %	60 %	385231076
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146	NC_017381	TTTCT	2	10	177710	177719	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017381	AAATC	2	10	178054	178063	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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151	NC_017381	ATAAA	2	10	180742	180751	80 %	20 %	0 %	0 %	385231082
152	NC_017381	TTTAA	2	10	181105	181114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017381	TCATT	2	10	195018	195027	20 %	60 %	0 %	20 %	385231096
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161	NC_017381	TTTTC	2	10	196964	196973	0 %	80 %	0 %	20 %	385231099
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166	NC_017381	TGGGG	2	10	208528	208537	0 %	20 %	80 %	0 %	385231112
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172	NC_017381	CTAAG	2	10	214298	214307	40 %	20 %	20 %	20 %	385231117
173	NC_017381	ATTTT	2	10	216055	216064	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017381	CCACC	2	10	217638	217647	20 %	0 %	0 %	80 %	385231118
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177	NC_017381	CCACA	2	10	221771	221780	40 %	0 %	0 %	60 %	385231123
178	NC_017381	GTGGG	2	10	222961	222970	0 %	20 %	80 %	0 %	385231124
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181	NC_017381	TTTAG	2	10	224883	224892	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017381	AAAAC	2	10	224911	224920	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
183	NC_017381	TGGGG	2	10	225270	225279	0 %	20 %	80 %	0 %	385231127
184	NC_017381	GATTG	2	10	225389	225398	20 %	40 %	40 %	0 %	385231127
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188	NC_017381	GGCGT	2	10	229756	229765	0 %	20 %	60 %	20 %	385231134
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190	NC_017381	TTTTA	2	10	230790	230799	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_017381	AAGAT	2	10	234132	234141	60 %	20 %	20 %	0 %	385231137
192	NC_017381	ATTTA	2	10	234967	234976	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_017381	TCCAA	2	10	235804	235813	40 %	20 %	0 %	40 %	385231139
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195	NC_017381	GTCTT	2	10	243460	243469	0 %	60 %	20 %	20 %	385231146
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215	NC_017381	GTCAT	2	10	277346	277355	20 %	40 %	20 %	20 %	385231185
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233	NC_017381	ACGGG	2	10	303206	303215	20 %	0 %	60 %	20 %	385231202
234	NC_017381	AACAT	2	10	303486	303495	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
235	NC_017381	GCTTG	2	10	305213	305222	0 %	40 %	40 %	20 %	385231205
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237	NC_017381	CATCA	2	10	306707	306716	40 %	20 %	0 %	40 %	385231205
238	NC_017381	ATTTT	2	10	307257	307266	20 %	80 %	0 %	0 %	385231205
239	NC_017381	CAAAA	2	10	313061	313070	80 %	0 %	0 %	20 %	385231212
240	NC_017381	GTGGG	2	10	314648	314657	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
241	NC_017381	ACACT	2	10	314945	314954	40 %	20 %	0 %	40 %	385231214
242	NC_017381	GCTAA	2	10	316102	316111	40 %	20 %	20 %	20 %	385231215
243	NC_017381	TGGCG	2	10	321126	321135	0 %	20 %	60 %	20 %	385231222
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247	NC_017381	AAAAT	2	10	326667	326676	80 %	20 %	0 %	0 %	385231229
248	NC_017381	GCGTA	2	10	327703	327712	20 %	20 %	40 %	20 %	385231229
249	NC_017381	CCGCT	2	10	328691	328700	0 %	20 %	20 %	60 %	385231231
250	NC_017381	GTTTT	2	10	328778	328787	0 %	80 %	20 %	0 %	385231232
251	NC_017381	TTTTA	2	10	331665	331674	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_017381	ATCCA	2	10	332377	332386	40 %	20 %	0 %	40 %	385231235
253	NC_017381	GGGGT	2	10	333553	333562	0 %	20 %	80 %	0 %	385231237
254	NC_017381	AGTTC	2	10	333776	333785	20 %	40 %	20 %	20 %	385231237
255	NC_017381	AATCA	2	10	333886	333895	60 %	20 %	0 %	20 %	385231237
256	NC_017381	TCAAA	2	10	334728	334737	60 %	20 %	0 %	20 %	385231239
257	NC_017381	GATTT	2	10	336491	336500	20 %	60 %	20 %	0 %	385231241
258	NC_017381	ATTAA	2	10	337496	337505	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_017381	TTGGC	2	10	337589	337598	0 %	40 %	40 %	20 %	385231242
260	NC_017381	TGAAA	2	10	339218	339227	60 %	20 %	20 %	0 %	385231244
261	NC_017381	TCAAG	2	10	340326	340335	40 %	20 %	20 %	20 %	385231247
262	NC_017381	GTGGC	2	10	340736	340745	0 %	20 %	60 %	20 %	385231248
263	NC_017381	AATAA	2	10	341292	341301	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017381	AATAA	2	10	341304	341313	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_017381	GTTTT	2	10	342105	342114	0 %	80 %	20 %	0 %	385231249
266	NC_017381	TTTAA	2	10	342519	342528	40 %	60 %	0 %	0 %	385231250
267	NC_017381	GGCTT	2	10	342760	342769	0 %	40 %	40 %	20 %	385231250
268	NC_017381	TTTGA	2	10	343754	343763	20 %	60 %	20 %	0 %	385231250
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