MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori 2018 chromosome

Total Repeats: 1064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017381	GATTA	2	10	2292	2301	40 %	40 %	20 %	0 %	385230893
2	NC_017381	CAAAA	2	10	5233	5242	80 %	0 %	0 %	20 %	385230899
3	NC_017381	TTGAT	2	10	6354	6363	20 %	60 %	20 %	0 %	385230901
4	NC_017381	TTGCT	2	10	6471	6480	0 %	60 %	20 %	20 %	385230901
5	NC_017381	TTTTA	2	10	7634	7643	20 %	80 %	0 %	0 %	385230902
6	NC_017381	TTTCT	2	10	8561	8570	0 %	80 %	0 %	20 %	385230903
7	NC_017381	AATTT	2	10	9400	9409	40 %	60 %	0 %	0 %	385230903
8	NC_017381	AAAGG	2	10	11035	11044	60 %	0 %	40 %	0 %	385230905
9	NC_017381	TTTTG	2	10	12091	12100	0 %	80 %	20 %	0 %	385230906
10	NC_017381	TGGTG	2	10	12930	12939	0 %	40 %	60 %	0 %	385230907
11	NC_017381	CTGTA	2	10	23437	23446	20 %	40 %	20 %	20 %	385230917
12	NC_017381	CCATG	2	10	23507	23516	20 %	20 %	20 %	40 %	385230917
13	NC_017381	CTCTT	2	10	23537	23546	0 %	60 %	0 %	40 %	385230917
14	NC_017381	TTGAT	2	10	25006	25015	20 %	60 %	20 %	0 %	385230918
15	NC_017381	CAAGC	2	10	28211	28220	40 %	0 %	20 %	40 %	385230921
16	NC_017381	TTTTA	2	10	29140	29149	20 %	80 %	0 %	0 %	385230922
17	NC_017381	TAGCG	2	10	29802	29811	20 %	20 %	40 %	20 %	385230923
18	NC_017381	TGATT	2	10	32159	32168	20 %	60 %	20 %	0 %	385230925
19	NC_017381	GTGGG	2	10	34042	34051	0 %	20 %	80 %	0 %	385230927
20	NC_017381	ATCAA	2	10	36174	36183	60 %	20 %	0 %	20 %	385230930
21	NC_017381	TTTTG	2	10	38670	38679	0 %	80 %	20 %	0 %	385230934
22	NC_017381	TGAGT	2	10	40690	40699	20 %	40 %	40 %	0 %	385230936
23	NC_017381	CAAAA	2	10	40793	40802	80 %	0 %	0 %	20 %	385230936
24	NC_017381	AAGCC	2	10	41075	41084	40 %	0 %	20 %	40 %	385230936
25	NC_017381	CAAAC	2	10	41716	41725	60 %	0 %	0 %	40 %	385230936
26	NC_017381	AGAAA	2	10	42401	42410	80 %	0 %	20 %	0 %	385230937
27	NC_017381	TCGCT	2	10	44224	44233	0 %	40 %	20 %	40 %	385230939
28	NC_017381	TAAAA	2	10	45665	45674	80 %	20 %	0 %	0 %	385230942
29	NC_017381	GCGAT	2	10	46196	46205	20 %	20 %	40 %	20 %	385230943
30	NC_017381	GCTCC	2	10	46998	47007	0 %	20 %	20 %	60 %	385230943
31	NC_017381	ATGAA	2	10	47180	47189	60 %	20 %	20 %	0 %	385230943
32	NC_017381	TCGCA	2	10	47535	47544	20 %	20 %	20 %	40 %	385230943
33	NC_017381	CAATA	2	10	49103	49112	60 %	20 %	0 %	20 %	385230944
34	NC_017381	AGGCT	2	10	49415	49424	20 %	20 %	40 %	20 %	385230945
35	NC_017381	TGCCT	2	10	49790	49799	0 %	40 %	20 %	40 %	385230945
36	NC_017381	GATTG	2	10	50274	50283	20 %	40 %	40 %	0 %	385230946
37	NC_017381	GCTTT	2	10	50330	50339	0 %	60 %	20 %	20 %	385230946
38	NC_017381	AAATA	2	10	51576	51585	80 %	20 %	0 %	0 %	385230947
39	NC_017381	ATATT	2	10	51742	51751	40 %	60 %	0 %	0 %	385230947
40	NC_017381	CCAAA	2	10	51909	51918	60 %	0 %	0 %	40 %	385230948
41	NC_017381	TAAAA	2	10	53960	53969	80 %	20 %	0 %	0 %	385230948
42	NC_017381	ATCAA	2	10	53991	54000	60 %	20 %	0 %	20 %	385230948
43	NC_017381	TGAAA	2	10	54722	54731	60 %	20 %	20 %	0 %	385230949
44	NC_017381	TCAAA	2	10	54976	54985	60 %	20 %	0 %	20 %	385230949
45	NC_017381	TCGTT	2	10	55786	55795	0 %	60 %	20 %	20 %	385230949
46	NC_017381	TAAAA	2	10	58015	58024	80 %	20 %	0 %	0 %	385230950
47	NC_017381	TCAAA	2	10	58731	58740	60 %	20 %	0 %	20 %	385230950
48	NC_017381	GGTGG	2	10	67569	67578	0 %	20 %	80 %	0 %	385230963
49	NC_017381	CTTGG	2	10	71565	71574	0 %	40 %	40 %	20 %	385230968
50	NC_017381	TGCCT	2	10	71696	71705	0 %	40 %	20 %	40 %	385230968
51	NC_017381	TCCAA	2	10	72108	72117	40 %	20 %	0 %	40 %	385230969
52	NC_017381	TTTTG	2	10	75436	75445	0 %	80 %	20 %	0 %	385230972
53	NC_017381	ACGCC	2	10	75742	75751	20 %	0 %	20 %	60 %	385230972
54	NC_017381	AAAGC	2	10	76508	76517	60 %	0 %	20 %	20 %	385230973
55	NC_017381	TTTTG	2	10	81250	81259	0 %	80 %	20 %	0 %	385230980
56	NC_017381	GATTT	2	10	81261	81270	20 %	60 %	20 %	0 %	385230980
57	NC_017381	TTTTC	2	10	84727	84736	0 %	80 %	0 %	20 %	385230984
58	NC_017381	CCATA	2	10	85055	85064	40 %	20 %	0 %	40 %	385230984
59	NC_017381	TGGCT	2	10	85421	85430	0 %	40 %	40 %	20 %	385230984
60	NC_017381	ATGCC	2	10	85863	85872	20 %	20 %	20 %	40 %	385230985
61	NC_017381	TTGAT	2	10	86949	86958	20 %	60 %	20 %	0 %	385230987
62	NC_017381	GGCGT	2	10	88763	88772	0 %	20 %	60 %	20 %	385230989
63	NC_017381	CTTTC	2	10	92355	92364	0 %	60 %	0 %	40 %	385230991
64	NC_017381	CGAGA	2	10	94375	94384	40 %	0 %	40 %	20 %	385230993
65	NC_017381	TGATT	2	10	95319	95328	20 %	60 %	20 %	0 %	385230994
66	NC_017381	GGCTT	2	10	96641	96650	0 %	40 %	40 %	20 %	385230995
67	NC_017381	ACGAT	2	10	101601	101610	40 %	20 %	20 %	20 %	385231000
68	NC_017381	TTTTC	2	10	101796	101805	0 %	80 %	0 %	20 %	385231000
69	NC_017381	AATTG	2	10	103329	103338	40 %	40 %	20 %	0 %	385231001
70	NC_017381	TCGTT	2	10	105231	105240	0 %	60 %	20 %	20 %	385231002
71	NC_017381	GTGGG	2	10	105553	105562	0 %	20 %	80 %	0 %	385231003
72	NC_017381	TTAGA	2	10	106244	106253	40 %	40 %	20 %	0 %	385231004
73	NC_017381	CAAGC	2	10	107349	107358	40 %	0 %	20 %	40 %	385231004
74	NC_017381	AAAGC	2	10	111322	111331	60 %	0 %	20 %	20 %	385231008
75	NC_017381	CAAAT	2	10	113879	113888	60 %	20 %	0 %	20 %	385231011
76	NC_017381	CGTTT	2	10	114512	114521	0 %	60 %	20 %	20 %	385231011
77	NC_017381	ACCCT	2	10	115307	115316	20 %	20 %	0 %	60 %	385231012
78	NC_017381	ATGCC	2	10	115439	115448	20 %	20 %	20 %	40 %	385231012
79	NC_017381	TGATT	2	10	117433	117442	20 %	60 %	20 %	0 %	385231014
80	NC_017381	GATCG	2	10	121947	121956	20 %	20 %	40 %	20 %	385231020
81	NC_017381	AGCTC	2	10	121966	121975	20 %	20 %	20 %	40 %	385231020
82	NC_017381	AAGCC	2	10	123854	123863	40 %	0 %	20 %	40 %	385231021
83	NC_017381	TTGAT	2	10	124919	124928	20 %	60 %	20 %	0 %	385231022
84	NC_017381	TTTGA	2	10	126157	126166	20 %	60 %	20 %	0 %	385231023
85	NC_017381	ATCTC	2	10	127442	127451	20 %	40 %	0 %	40 %	385231023
86	NC_017381	TTTGT	2	10	127952	127961	0 %	80 %	20 %	0 %	385231024
87	NC_017381	TGCGT	2	10	129984	129993	0 %	40 %	40 %	20 %	385231026
88	NC_017381	ATTTT	2	10	133469	133478	20 %	80 %	0 %	0 %	385231032
89	NC_017381	ATGTT	2	10	133551	133560	20 %	60 %	20 %	0 %	385231033
90	NC_017381	AAAAG	2	10	133963	133972	80 %	0 %	20 %	0 %	385231033
91	NC_017381	AAATC	2	10	135978	135987	60 %	20 %	0 %	20 %	385231034
92	NC_017381	AAAAT	2	10	137450	137459	80 %	20 %	0 %	0 %	385231035
93	NC_017381	TTTTC	2	10	140006	140015	0 %	80 %	0 %	20 %	385231038
94	NC_017381	TTCTT	2	10	141962	141971	0 %	80 %	0 %	20 %	385231040
95	NC_017381	TCTTT	2	10	142456	142465	0 %	80 %	0 %	20 %	385231041
96	NC_017381	GTTTT	2	10	143618	143627	0 %	80 %	20 %	0 %	385231042
97	NC_017381	AATTC	2	10	144253	144262	40 %	40 %	0 %	20 %	385231042
98	NC_017381	GCGAT	2	10	144412	144421	20 %	20 %	40 %	20 %	385231042
99	NC_017381	GCTTG	2	10	144668	144677	0 %	40 %	40 %	20 %	385231042
100	NC_017381	TTTTG	2	10	145320	145329	0 %	80 %	20 %	0 %	385231043
101	NC_017381	ACGCC	2	10	150679	150688	20 %	0 %	20 %	60 %	385231046
102	NC_017381	GCGTT	2	10	152942	152951	0 %	40 %	40 %	20 %	385231051
103	NC_017381	ATTTG	2	10	153919	153928	20 %	60 %	20 %	0 %	385231052
104	NC_017381	GGATT	2	10	156501	156510	20 %	40 %	40 %	0 %	385231055
105	NC_017381	AGATT	2	10	158960	158969	40 %	40 %	20 %	0 %	385231057
106	NC_017381	AAGCC	2	10	160297	160306	40 %	0 %	20 %	40 %	385231060
107	NC_017381	TGGCG	2	10	160971	160980	0 %	20 %	60 %	20 %	385231060
108	NC_017381	GTTTT	2	10	162053	162062	0 %	80 %	20 %	0 %	385231061
109	NC_017381	ATTTT	2	10	162338	162347	20 %	80 %	0 %	0 %	385231062
110	NC_017381	ATTCA	2	10	163970	163979	40 %	40 %	0 %	20 %	385231064
111	NC_017381	CACTT	2	10	164174	164183	20 %	40 %	0 %	40 %	385231064
112	NC_017381	ATCTT	2	10	167366	167375	20 %	60 %	0 %	20 %	385231067
113	NC_017381	TTTAA	2	10	172033	172042	40 %	60 %	0 %	0 %	385231073
114	NC_017381	CCGCA	2	10	175221	175230	20 %	0 %	20 %	60 %	385231076
115	NC_017381	TGGGG	2	10	175930	175939	0 %	20 %	80 %	0 %	385231077
116	NC_017381	ATTTG	2	10	176707	176716	20 %	60 %	20 %	0 %	385231077
117	NC_017381	AATTG	2	10	176863	176872	40 %	40 %	20 %	0 %	385231078
118	NC_017381	AAATG	2	10	178456	178465	60 %	20 %	20 %	0 %	385231080
119	NC_017381	TGTAA	2	10	179246	179255	40 %	40 %	20 %	0 %	385231081
120	NC_017381	AAAAT	2	10	180026	180035	80 %	20 %	0 %	0 %	385231082
121	NC_017381	ATAAA	2	10	180742	180751	80 %	20 %	0 %	0 %	385231082
122	NC_017381	AAAAG	2	10	181897	181906	80 %	0 %	20 %	0 %	385231084
123	NC_017381	GCATT	2	10	186594	186603	20 %	40 %	20 %	20 %	385231089
124	NC_017381	AGAGG	2	10	187637	187646	40 %	0 %	60 %	0 %	385231090
125	NC_017381	TTCAA	2	10	189417	189426	40 %	40 %	0 %	20 %	385231092
126	NC_017381	TCATT	2	10	195018	195027	20 %	60 %	0 %	20 %	385231096
127	NC_017381	TCATG	2	10	195793	195802	20 %	40 %	20 %	20 %	385231097
128	NC_017381	CTATT	2	10	195903	195912	20 %	60 %	0 %	20 %	385231098
129	NC_017381	TTTTC	2	10	196964	196973	0 %	80 %	0 %	20 %	385231099
130	NC_017381	TATTT	2	10	200724	200733	20 %	80 %	0 %	0 %	385231104
131	NC_017381	TTTCA	2	10	201387	201396	20 %	60 %	0 %	20 %	385231105
132	NC_017381	CTTTT	2	10	202382	202391	0 %	80 %	0 %	20 %	385231106
133	NC_017381	TGGGG	2	10	208528	208537	0 %	20 %	80 %	0 %	385231112
134	NC_017381	GATCA	2	10	210434	210443	40 %	20 %	20 %	20 %	385231113
135	NC_017381	ATTCT	2	10	210961	210970	20 %	60 %	0 %	20 %	385231113
136	NC_017381	GCAAA	2	10	213918	213927	60 %	0 %	20 %	20 %	385231116
137	NC_017381	TGCTT	2	10	213957	213966	0 %	60 %	20 %	20 %	385231116
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150	NC_017381	GGCGT	2	10	229756	229765	0 %	20 %	60 %	20 %	385231134
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174	NC_017381	GTCAT	2	10	277346	277355	20 %	40 %	20 %	20 %	385231185
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250	NC_017381	CTTGT	2	10	378524	378533	0 %	60 %	20 %	20 %	385231285
251	NC_017381	TTTGA	2	10	378638	378647	20 %	60 %	20 %	0 %	385231285
252	NC_017381	GCCTT	2	10	379078	379087	0 %	40 %	20 %	40 %	385231285
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254	NC_017381	CTTGG	2	10	381074	381083	0 %	40 %	40 %	20 %	385231287
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258	NC_017381	AAAAC	2	10	385979	385988	80 %	0 %	0 %	20 %	385231292
259	NC_017381	CCCGC	2	10	386628	386637	0 %	0 %	20 %	80 %	385231294
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262	NC_017381	AAAGA	2	10	392891	392900	80 %	0 %	20 %	0 %	385231302
263	NC_017381	AACTT	2	10	392977	392986	40 %	40 %	0 %	20 %	385231302
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