MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 2018 chromosome

Total Repeats: 473

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017381	GTTT	2	8	4967	4974	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017381	GTTT	2	8	7601	7608	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017381	ATAA	2	8	9823	9830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017381	TATT	2	8	10022	10029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017381	TTAA	2	8	13855	13862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017381	AATC	2	8	22914	22921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017381	TTTA	2	8	23179	23186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017381	TTTG	2	8	23243	23250	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017381	TAAG	2	8	25512	25519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017381	GGTT	2	8	31885	31892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017381	GCTT	2	8	44337	44344	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017381	CTGT	2	8	44451	44458	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017381	TAGC	2	8	50609	50616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017381	TTTA	2	8	59483	59490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017381	ACTG	2	8	60479	60486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017381	TTTA	2	8	75407	75414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017381	TAGA	2	8	77269	77276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017381	TTTC	2	8	81143	81150	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017381	TTTG	2	8	86634	86641	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017381	TATT	2	8	86814	86821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017381	TCAA	2	8	91950	91957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017381	AAAC	2	8	92134	92141	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017381	ATTT	2	8	93875	93882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017381	GGTG	2	8	93914	93921	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017381	TCCC	2	8	93984	93991	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_017381	TTCA	2	8	99497	99504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017381	TTTA	2	8	99524	99531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017381	GATC	2	8	101132	101139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017381	ATCA	2	8	107745	107752	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017381	CCAT	2	8	112764	112771	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017381	GCTT	2	8	112853	112860	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017381	AAGC	2	8	113321	113328	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017381	CGCT	2	8	113345	113352	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017381	CTTT	2	8	115246	115253	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017381	AAAT	2	8	115256	115263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017381	ATTT	2	8	116787	116794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017381	TCAT	2	8	121480	121487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017381	GTTA	2	8	125152	125159	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017381	GTTA	2	8	127895	127902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017381	AAAG	2	8	128073	128080	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017381	AAAG	2	8	130800	130807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017381	ATTT	2	8	131261	131268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017381	AAAG	2	8	131294	131301	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017381	GAAG	2	8	131351	131358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017381	GTCA	2	8	132357	132364	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017381	CTAT	2	8	133184	133191	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017381	CTTT	2	8	134356	134363	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017381	CAAT	2	8	134632	134639	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017381	TAAA	2	8	134782	134789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017381	ATCT	2	8	139315	139322	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017381	TAAG	2	8	143213	143220	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017381	ACAA	2	8	154262	154269	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017381	ATTT	2	8	162207	162214	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017381	CCCT	2	8	163475	163482	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_017381	AAAT	2	8	174627	174634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017381	ATAC	2	8	174671	174678	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017381	TCAA	2	8	177795	177802	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017381	TCAA	2	8	178100	178107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017381	GATT	2	8	181123	181130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017381	CATT	2	8	186353	186360	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017381	TTTG	2	8	186372	186379	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017381	TTGC	2	8	186420	186427	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017381	TCCT	2	8	188209	188216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017381	TTCA	2	8	188243	188250	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017381	TGCA	2	8	188263	188270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017381	TAAG	2	8	198606	198613	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017381	CAAC	2	8	201974	201981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017381	AAAC	2	8	202175	202182	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017381	GTTT	2	8	212750	212757	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017381	TTGA	2	8	212765	212772	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017381	TTGC	2	8	219713	219720	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017381	ATCA	2	8	220910	220917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017381	ACAA	2	8	220966	220973	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017381	TATT	2	8	221641	221648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017381	ATTT	2	8	227614	227621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017381	CTTT	2	8	229375	229382	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017381	GAAA	2	8	229619	229626	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017381	TTTA	2	8	232509	232516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017381	ATCT	2	8	236937	236944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017381	ATTT	2	8	247819	247826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017381	TAAT	2	8	253820	253827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017381	ATCA	2	8	253859	253866	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017381	TACC	2	8	254101	254108	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017381	GCCA	2	8	263186	263193	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017381	ATTT	2	8	270647	270654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017381	ATTG	2	8	281270	281277	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017381	CATT	2	8	303404	303411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017381	TTAA	2	8	308179	308186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017381	TCAG	2	8	315865	315872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017381	TTTA	2	8	324629	324636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017381	GACA	2	8	324693	324700	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017381	CGAT	2	8	324919	324926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017381	GCTT	2	8	325005	325012	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017381	TTGG	2	8	328067	328074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017381	GGTT	2	8	330315	330322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017381	AAGT	2	8	331657	331664	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017381	ACTT	2	8	331700	331707	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017381	AAAT	2	8	336462	336469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017381	TTTA	2	8	341246	341253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017381	TGAA	2	8	345612	345619	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017381	GCGG	2	8	357209	357216	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017381	TAAA	2	8	367462	367469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017381	TTAT	2	8	371971	371978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017381	TCAG	2	8	372536	372543	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017381	GTTT	2	8	384766	384773	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017381	TTTC	2	8	389109	389116	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017381	GAAA	2	8	391057	391064	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017381	AACA	2	8	391070	391077	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017381	CAAA	2	8	403008	403015	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017381	CCAA	2	8	403126	403133	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017381	AAAT	2	8	404204	404211	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017381	CAAT	2	8	404594	404601	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017381	AAAT	2	8	409955	409962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017381	AAGG	2	8	417295	417302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017381	TCAA	2	8	418916	418923	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017381	TCAA	2	8	421449	421456	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017381	CAAT	2	8	422827	422834	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017381	ACCC	2	8	426298	426305	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_017381	TTTG	2	8	436753	436760	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017381	CACC	2	8	436844	436851	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_017381	GTGG	2	8	437116	437123	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017381	TCTT	2	8	437339	437346	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017381	AATC	2	8	447231	447238	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017381	AAAC	2	8	451020	451027	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017381	CAAC	2	8	463731	463738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017381	AGCG	2	8	468262	468269	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017381	ATTG	2	8	468585	468592	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017381	AAAT	2	8	469837	469844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017381	CTTA	2	8	474248	474255	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017381	GAAT	2	8	483548	483555	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017381	TTGA	2	8	483711	483718	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017381	CTAA	2	8	489218	489225	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017381	TTAG	2	8	489242	489249	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017381	TCAA	2	8	489403	489410	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017381	CATT	2	8	489972	489979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017381	TTTA	2	8	490026	490033	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017381	ATTT	2	8	490176	490183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017381	TGAT	2	8	491824	491831	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017381	TTAC	2	8	494042	494049	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017381	CTAG	2	8	499267	499274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017381	AACT	2	8	502674	502681	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017381	ATAA	2	8	511702	511709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017381	GTTG	2	8	514210	514217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017381	GAAA	2	8	516097	516104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017381	GTTA	2	8	516240	516247	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017381	AGAA	2	8	517505	517512	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017381	CAAA	2	8	517766	517773	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017381	TAGT	2	8	518029	518036	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017381	TGTT	2	8	518387	518394	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017381	TTTA	2	8	518616	518623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017381	CAAA	2	8	518628	518635	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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471	NC_017381	TATT	2	8	1558860	1558867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.