MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori 2018 chromosome

Total Repeats: 14364

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017381	GAT	3	9	166	174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385230890
2	NC_017381	GTT	2	6	349	354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230890
3	NC_017381	TTC	2	6	400	405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230890
4	NC_017381	ACA	2	6	426	431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385230890
5	NC_017381	AAT	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385230891
6	NC_017381	TAA	2	6	694	699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385230891
7	NC_017381	CTT	2	6	844	849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230891
8	NC_017381	TGA	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385230891
9	NC_017381	AAC	2	6	1068	1073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385230892
10	NC_017381	CCA	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385230892
11	NC_017381	GCT	2	6	1256	1261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385230892
12	NC_017381	GGC	2	6	1447	1452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385230892
13	NC_017381	GTT	2	6	1667	1672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230892
14	NC_017381	TAG	2	6	1690	1695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385230892
15	NC_017381	CTT	2	6	1701	1706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230892
16	NC_017381	TTC	2	6	1806	1811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230893
17	NC_017381	TCA	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385230893
18	NC_017381	GTT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230893
19	NC_017381	TTC	2	6	2028	2033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230893
20	NC_017381	TGG	2	6	2087	2092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385230893
21	NC_017381	TCA	2	6	2095	2100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385230893
22	NC_017381	AGG	2	6	2232	2237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385230893
23	NC_017381	TGA	2	6	2707	2712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385230894
24	NC_017381	AGC	2	6	2822	2827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385230894
25	NC_017381	GTG	2	6	3011	3016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385230894
26	NC_017381	AGA	2	6	3109	3114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385230894
27	NC_017381	GTG	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385230894
28	NC_017381	GCC	2	6	3177	3182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385230894
29	NC_017381	GTT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230895
30	NC_017381	ATC	2	6	3707	3712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385230895
31	NC_017381	CAG	2	6	3869	3874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385230895
32	NC_017381	ATT	2	6	3951	3956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385230895
33	NC_017381	TGT	2	6	3962	3967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230895
34	NC_017381	GGC	2	6	4024	4029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385230895
35	NC_017381	TAA	2	6	4852	4857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385230897
36	NC_017381	TTA	2	6	4861	4866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385230897
37	NC_017381	AAG	2	6	5062	5067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385230898
38	NC_017381	ATT	2	6	5625	5630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385230900
39	NC_017381	TGA	2	6	5738	5743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385230900
40	NC_017381	CTT	2	6	5820	5825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230901
41	NC_017381	GTT	2	6	5882	5887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230901
42	NC_017381	TAA	2	6	5951	5956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385230901
43	NC_017381	TTA	2	6	6009	6014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385230901
44	NC_017381	GTG	2	6	6078	6083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385230901
45	NC_017381	TGT	2	6	6199	6204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230901
46	NC_017381	GTT	2	6	6254	6259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230901
47	NC_017381	GCT	2	6	6303	6308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385230901
48	NC_017381	AGT	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385230901
49	NC_017381	GCG	2	6	6457	6462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385230901
50	NC_017381	CGA	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385230901
51	NC_017381	TCA	2	6	6627	6632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385230901
52	NC_017381	TGT	2	6	6742	6747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230901
53	NC_017381	CTG	2	6	6774	6779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385230901
54	NC_017381	CAC	2	6	6805	6810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385230901
55	NC_017381	TAT	3	9	6820	6828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385230901
56	NC_017381	ATT	2	6	7037	7042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385230901
57	NC_017381	CCG	2	6	7126	7131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385230901
58	NC_017381	GCT	2	6	7241	7246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385230901
59	NC_017381	GTT	2	6	7271	7276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230901
60	NC_017381	AAG	2	6	7737	7742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385230902
61	NC_017381	CAT	2	6	7782	7787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385230903
62	NC_017381	GCC	2	6	7788	7793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385230903
63	NC_017381	TCT	2	6	7849	7854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230903
64	NC_017381	AAT	2	6	7947	7952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385230903
65	NC_017381	CTT	2	6	7955	7960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230903
66	NC_017381	CAT	2	6	8045	8050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385230903
67	NC_017381	ATG	2	6	8098	8103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385230903
68	NC_017381	TCA	2	6	8122	8127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385230903
69	NC_017381	CTT	2	6	8195	8200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230903
70	NC_017381	CCG	2	6	8204	8209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385230903
71	NC_017381	GTG	2	6	8431	8436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385230903
72	NC_017381	TTC	2	6	8511	8516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230903
73	NC_017381	CCG	2	6	8530	8535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385230903
74	NC_017381	CAC	2	6	8631	8636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385230903
75	NC_017381	GAT	2	6	8673	8678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385230903
76	NC_017381	GGA	2	6	8720	8725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385230903
77	NC_017381	CTT	2	6	8885	8890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230903
78	NC_017381	TCT	2	6	8995	9000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230903
79	NC_017381	CTT	2	6	9116	9121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230903
80	NC_017381	GCA	2	6	9169	9174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385230903
81	NC_017381	CTT	2	6	9194	9199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230903
82	NC_017381	TCT	2	6	9552	9557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230904
83	NC_017381	GAT	3	9	9722	9730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385230904
84	NC_017381	TCT	2	6	9750	9755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230904
85	NC_017381	CTA	2	6	9766	9771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385230904
86	NC_017381	TTG	2	6	10193	10198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230905
87	NC_017381	GAA	2	6	10209	10214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385230905
88	NC_017381	TTA	2	6	10388	10393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385230905
89	NC_017381	AGA	2	6	10403	10408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385230905
90	NC_017381	ACC	2	6	10411	10416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385230905
91	NC_017381	AAG	2	6	10444	10449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385230905
92	NC_017381	ATT	2	6	10477	10482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385230905
93	NC_017381	CAT	2	6	10658	10663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385230905
94	NC_017381	GTG	2	6	10692	10697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385230905
95	NC_017381	ATG	2	6	10972	10977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385230905
96	NC_017381	GGC	2	6	10997	11002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385230905
97	NC_017381	AAC	2	6	11064	11069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385230905
98	NC_017381	ATC	2	6	11095	11100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385230905
99	NC_017381	AGA	2	6	11450	11455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385230905
100	NC_017381	GAC	2	6	11550	11555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385230905
101	NC_017381	TTA	3	9	11571	11579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385230905
102	NC_017381	TTG	2	6	11628	11633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230905
103	NC_017381	TGT	2	6	11814	11819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230906
104	NC_017381	TGT	2	6	11982	11987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230906
105	NC_017381	AAG	2	6	12141	12146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385230906
106	NC_017381	TTG	2	6	12318	12323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230906
107	NC_017381	TGG	3	9	12552	12560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385230906
108	NC_017381	GAA	3	9	12569	12577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385230906
109	NC_017381	TGG	2	6	12651	12656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385230906
110	NC_017381	AGA	2	6	12673	12678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385230906
111	NC_017381	TTA	2	6	12986	12991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385230907
112	NC_017381	GAA	2	6	13003	13008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385230907
113	NC_017381	GTT	2	6	13070	13075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230907
114	NC_017381	TAA	2	6	13080	13085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385230907
115	NC_017381	ATT	2	6	13093	13098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385230907
116	NC_017381	ACG	2	6	13220	13225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385230907
117	NC_017381	TAA	2	6	13341	13346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385230907
118	NC_017381	ACC	2	6	13469	13474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385230907
119	NC_017381	CTA	2	6	13532	13537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385230907
120	NC_017381	GGT	2	6	13611	13616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385230907
121	NC_017381	AGA	2	6	13671	13676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385230907
122	NC_017381	AGT	2	6	13733	13738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385230907
123	NC_017381	GTG	2	6	14096	14101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385230908
124	NC_017381	GAA	2	6	14187	14192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385230909
125	NC_017381	ATT	2	6	14374	14379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385230909
126	NC_017381	ATT	2	6	14472	14477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385230910
127	NC_017381	GAA	2	6	14513	14518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385230910
128	NC_017381	AAC	2	6	14519	14524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385230910
129	NC_017381	ATG	2	6	14538	14543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385230910
130	NC_017381	AAG	2	6	14784	14789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385230910
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