MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori SNT49 plasmid pHPSNT

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017380	CTA	2	6	238	243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385227769
2	NC_017380	CTA	2	6	596	601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017380	CAA	2	6	672	677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017380	GTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017380	TTA	2	6	807	812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017380	AAC	2	6	821	826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017380	TGT	2	6	829	834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017380	CTT	2	6	945	950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017380	CTT	2	6	967	972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227770
10	NC_017380	CTT	2	6	989	994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227770
11	NC_017380	CTT	2	6	1011	1016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227770
12	NC_017380	CTT	2	6	1038	1043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227770
13	NC_017380	CTT	2	6	1064	1069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227770
14	NC_017380	CTT	2	6	1091	1096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227770
15	NC_017380	CTT	2	6	1118	1123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227770
16	NC_017380	CTT	2	6	1145	1150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227770
17	NC_017380	GGA	2	6	1280	1285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017380	AGG	2	6	1307	1312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017380	TTA	2	6	1328	1333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017380	TTA	2	6	1384	1389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017380	TAA	2	6	1424	1429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017380	TAT	2	6	1451	1456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017380	GAA	2	6	1567	1572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385227771
24	NC_017380	GAA	2	6	1600	1605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385227771
25	NC_017380	ACC	2	6	1654	1659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385227771
26	NC_017380	TAG	2	6	1679	1684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385227771
27	NC_017380	ACC	2	6	1711	1716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385227771
28	NC_017380	CAA	2	6	1722	1727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385227771
29	NC_017380	TCA	2	6	1895	1900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385227771
30	NC_017380	CAA	2	6	2073	2078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385227771
31	NC_017380	CTT	2	6	2099	2104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227771
32	NC_017380	CAA	2	6	2122	2127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385227771
33	NC_017380	AAC	2	6	2476	2481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385227771
34	NC_017380	ACA	2	6	2564	2569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385227771
35	NC_017380	ACA	2	6	2591	2596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385227771
36	NC_017380	AGA	2	6	2742	2747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385227771
37	NC_017380	CCA	2	6	2755	2760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385227771
38	NC_017380	GAA	2	6	2991	2996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385227771
39	NC_017380	ACC	2	6	3088	3093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.