MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Puno135 chromosome

Total Repeats: 1340

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017379	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	385229318
2	NC_017379	TTTTA	2	10	4899	4908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017379	TTGCT	2	10	6187	6196	0 %	60 %	20 %	20 %	385229322
4	NC_017379	TTGAA	2	10	11651	11660	40 %	40 %	20 %	0 %	385229327
5	NC_017379	TTTTG	2	10	11667	11676	0 %	80 %	20 %	0 %	385229327
6	NC_017379	TGGTG	2	10	12505	12514	0 %	40 %	60 %	0 %	385229329
7	NC_017379	GCTTT	2	10	13332	13341	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017379	CAAAA	2	10	18380	18389	80 %	0 %	0 %	20 %	385229334
9	NC_017379	TGAAA	2	10	20724	20733	60 %	20 %	20 %	0 %	385229336
10	NC_017379	CCATG	2	10	22899	22908	20 %	20 %	20 %	40 %	385229338
11	NC_017379	CTCTT	2	10	22929	22938	0 %	60 %	0 %	40 %	385229338
12	NC_017379	ATGAA	2	10	24857	24866	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017379	ATAGA	2	10	26219	26228	60 %	20 %	20 %	0 %	385229340
14	NC_017379	CAAGC	2	10	27529	27538	40 %	0 %	20 %	40 %	385229341
15	NC_017379	TTTTA	2	10	28459	28468	20 %	80 %	0 %	0 %	385229342
16	NC_017379	TAGCG	2	10	29121	29130	20 %	20 %	40 %	20 %	385229343
17	NC_017379	GATAA	2	10	30528	30537	60 %	20 %	20 %	0 %	385229346
18	NC_017379	GTGGG	2	10	31987	31996	0 %	20 %	80 %	0 %	385229347
19	NC_017379	TGGGG	2	10	33238	33247	0 %	20 %	80 %	0 %	385229349
20	NC_017379	AAGCC	2	10	39002	39011	40 %	0 %	20 %	40 %	385229356
21	NC_017379	AGAAA	2	10	40302	40311	80 %	0 %	20 %	0 %	385229357
22	NC_017379	AAAGT	2	10	40499	40508	60 %	20 %	20 %	0 %	385229357
23	NC_017379	TACTC	2	10	41155	41164	20 %	40 %	0 %	40 %	385229358
24	NC_017379	TAAAA	2	10	43015	43024	80 %	20 %	0 %	0 %	385229360
25	NC_017379	TCCCA	2	10	44027	44036	20 %	20 %	0 %	60 %	385229361
26	NC_017379	GCTCC	2	10	44348	44357	0 %	20 %	20 %	60 %	385229361
27	NC_017379	TCGCA	2	10	44885	44894	20 %	20 %	20 %	40 %	385229361
28	NC_017379	TGCCT	2	10	47139	47148	0 %	40 %	20 %	40 %	385229363
29	NC_017379	CGTTT	2	10	49015	49024	0 %	60 %	20 %	20 %	385229365
30	NC_017379	GCTTT	2	10	49428	49437	0 %	60 %	20 %	20 %	385229365
31	NC_017379	TAAAA	2	10	50616	50625	80 %	20 %	0 %	0 %	385229366
32	NC_017379	ATTTC	2	10	50691	50700	20 %	60 %	0 %	20 %	385229366
33	NC_017379	TGAAA	2	10	52374	52383	60 %	20 %	20 %	0 %	385229370
34	NC_017379	TCAAA	2	10	52628	52637	60 %	20 %	0 %	20 %	385229370
35	NC_017379	TCGTT	2	10	53438	53447	0 %	60 %	20 %	20 %	385229370
36	NC_017379	TCGCC	2	10	55371	55380	0 %	20 %	20 %	60 %	385229371
37	NC_017379	TAAAA	2	10	55667	55676	80 %	20 %	0 %	0 %	385229371
38	NC_017379	TCAAA	2	10	56383	56392	60 %	20 %	0 %	20 %	385229371
39	NC_017379	TTAAA	2	10	57404	57413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017379	ACAAA	2	10	57433	57442	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017379	GGATG	2	10	60326	60335	20 %	20 %	60 %	0 %	385229375
42	NC_017379	TATCC	2	10	60702	60711	20 %	40 %	0 %	40 %	385229375
43	NC_017379	ATTGG	2	10	63286	63295	20 %	40 %	40 %	0 %	385229378
44	NC_017379	GGTGG	2	10	66066	66075	0 %	20 %	80 %	0 %	385229382
45	NC_017379	GCGTT	2	10	68399	68408	0 %	40 %	40 %	20 %	385229384
46	NC_017379	TCAAT	2	10	69253	69262	40 %	40 %	0 %	20 %	385229385
47	NC_017379	TATCT	2	10	69769	69778	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017379	TCCAA	2	10	70589	70598	40 %	20 %	0 %	40 %	385229387
49	NC_017379	CAAAA	2	10	70906	70915	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017379	ATGTT	2	10	71912	71921	20 %	60 %	20 %	0 %	385229388
51	NC_017379	TTTTA	2	10	73855	73864	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017379	TTTTG	2	10	73886	73895	0 %	80 %	20 %	0 %	385229390
53	NC_017379	ACGCC	2	10	74192	74201	20 %	0 %	20 %	60 %	385229390
54	NC_017379	AAAGC	2	10	74958	74967	60 %	0 %	20 %	20 %	385229391
55	NC_017379	TTACA	2	10	75740	75749	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017379	TTTGT	2	10	78517	78526	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017379	TATGG	2	10	81869	81878	20 %	40 %	40 %	0 %	385229398
58	NC_017379	ATCTT	2	10	82260	82269	20 %	60 %	0 %	20 %	385229398
59	NC_017379	TGGCT	2	10	82801	82810	0 %	40 %	40 %	20 %	385229398
60	NC_017379	ATGCC	2	10	83221	83230	20 %	20 %	20 %	40 %	385229399
61	NC_017379	TTGAT	2	10	84248	84257	20 %	60 %	20 %	0 %	385229401
62	NC_017379	GGCGT	2	10	86062	86071	0 %	20 %	60 %	20 %	385229403
63	NC_017379	TAAGA	2	10	89243	89252	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017379	TAAAA	2	10	89314	89323	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017379	CTTTC	2	10	89598	89607	0 %	60 %	0 %	40 %	385229405
66	NC_017379	TTTGC	2	10	90306	90315	0 %	60 %	20 %	20 %	385229406
67	NC_017379	TTTGA	2	10	92388	92397	20 %	60 %	20 %	0 %	385229408
68	NC_017379	TCTTT	2	10	92599	92608	0 %	80 %	0 %	20 %	385229408
69	NC_017379	GGCTT	2	10	93707	93716	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017379	AATTT	2	10	98389	98398	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017379	ACGAT	2	10	98836	98845	40 %	20 %	20 %	20 %	385229413
72	NC_017379	TTTTC	2	10	99031	99040	0 %	80 %	0 %	20 %	385229413
73	NC_017379	AATTG	2	10	100678	100687	40 %	40 %	20 %	0 %	385229414
74	NC_017379	TCGTT	2	10	102478	102487	0 %	60 %	20 %	20 %	385229415
75	NC_017379	AAAAT	2	10	105046	105055	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017379	TCTTT	2	10	105764	105773	0 %	80 %	0 %	20 %	385229418
77	NC_017379	AAAGC	2	10	108526	108535	60 %	0 %	20 %	20 %	385229420
78	NC_017379	TGTCT	2	10	110165	110174	0 %	60 %	20 %	20 %	385229423
79	NC_017379	CAAAT	2	10	110558	110567	60 %	20 %	0 %	20 %	385229423
80	NC_017379	ACCCT	2	10	111987	111996	20 %	20 %	0 %	60 %	385229424
81	NC_017379	ATGCC	2	10	112119	112128	20 %	20 %	20 %	40 %	385229424
82	NC_017379	TTAAT	2	10	113505	113514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017379	TGATT	2	10	114123	114132	20 %	60 %	20 %	0 %	385229426
84	NC_017379	CTAAA	2	10	114594	114603	60 %	20 %	0 %	20 %	385229428
85	NC_017379	GATCG	2	10	118620	118629	20 %	20 %	40 %	20 %	385229430
86	NC_017379	AGCTC	2	10	118639	118648	20 %	20 %	20 %	40 %	385229430
87	NC_017379	AAGCC	2	10	120527	120536	40 %	0 %	20 %	40 %	385229431
88	NC_017379	CGCTG	2	10	123343	123352	0 %	20 %	40 %	40 %	385229433
89	NC_017379	TTTGA	2	10	123490	123499	20 %	60 %	20 %	0 %	385229433
90	NC_017379	GACTT	2	10	124024	124033	20 %	40 %	20 %	20 %	385229433
91	NC_017379	ATCTC	2	10	124775	124784	20 %	40 %	0 %	40 %	385229433
92	NC_017379	CGCTT	2	10	124933	124942	0 %	40 %	20 %	40 %	385229433
93	NC_017379	TTTAG	2	10	125148	125157	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017379	TTTGT	2	10	125290	125299	0 %	80 %	20 %	0 %	385229434
95	NC_017379	TGCGT	2	10	127323	127332	0 %	40 %	40 %	20 %	385229436
96	NC_017379	GAAAA	2	10	127484	127493	80 %	0 %	20 %	0 %	385229436
97	NC_017379	GAAAA	2	10	127802	127811	80 %	0 %	20 %	0 %	385229436
98	NC_017379	ATTTT	2	10	130762	130771	20 %	80 %	0 %	0 %	385229441
99	NC_017379	ATGTT	2	10	130844	130853	20 %	60 %	20 %	0 %	385229441
100	NC_017379	AAAAG	2	10	131256	131265	80 %	0 %	20 %	0 %	385229441
101	NC_017379	AAATC	2	10	133270	133279	60 %	20 %	0 %	20 %	385229442
102	NC_017379	AAAAT	2	10	134742	134751	80 %	20 %	0 %	0 %	385229443
103	NC_017379	TTTTC	2	10	137098	137107	0 %	80 %	0 %	20 %	385229448
104	NC_017379	GTAAA	2	10	137650	137659	60 %	20 %	20 %	0 %	385229449
105	NC_017379	TTCTT	2	10	139054	139063	0 %	80 %	0 %	20 %	385229450
106	NC_017379	TCTTT	2	10	139548	139557	0 %	80 %	0 %	20 %	385229451
107	NC_017379	ACTTG	2	10	139761	139770	20 %	40 %	20 %	20 %	385229451
108	NC_017379	TTTTG	2	10	140711	140720	0 %	80 %	20 %	0 %	385229452
109	NC_017379	AATTC	2	10	141345	141354	40 %	40 %	0 %	20 %	385229452
110	NC_017379	GCGAT	2	10	141504	141513	20 %	20 %	40 %	20 %	385229452
111	NC_017379	GCTTG	2	10	141760	141769	0 %	40 %	40 %	20 %	385229452
112	NC_017379	TTTTG	2	10	142420	142429	0 %	80 %	20 %	0 %	385229453
113	NC_017379	CCAAA	2	10	144260	144269	60 %	0 %	0 %	40 %	385229454
114	NC_017379	ACGCC	2	10	147782	147791	20 %	0 %	20 %	60 %	385229456
115	NC_017379	TTATT	2	10	149678	149687	20 %	80 %	0 %	0 %	385229460
116	NC_017379	GCGTT	2	10	150036	150045	0 %	40 %	40 %	20 %	385229462
117	NC_017379	ATTTG	2	10	151011	151020	20 %	60 %	20 %	0 %	385229463
118	NC_017379	CAAAT	2	10	152907	152916	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017379	AAAAC	2	10	153631	153640	80 %	0 %	0 %	20 %	385229466
120	NC_017379	GGGGA	2	10	153731	153740	20 %	0 %	80 %	0 %	385229466
121	NC_017379	AAGCC	2	10	156867	156876	40 %	0 %	20 %	40 %	385229471
122	NC_017379	GGGTG	2	10	159275	159284	0 %	20 %	80 %	0 %	385229473
123	NC_017379	AACAA	2	10	160165	160174	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017379	ATTCA	2	10	160657	160666	40 %	40 %	0 %	20 %	385229474
125	NC_017379	CACTT	2	10	160861	160870	20 %	40 %	0 %	40 %	385229474
126	NC_017379	AAAAC	2	10	162994	163003	80 %	0 %	0 %	20 %	385229476
127	NC_017379	ATCTT	2	10	164059	164068	20 %	60 %	0 %	20 %	385229477
128	NC_017379	TATCA	2	10	172314	172323	40 %	40 %	0 %	20 %	385229486
129	NC_017379	ATTTG	2	10	173322	173331	20 %	60 %	20 %	0 %	385229487
130	NC_017379	AAATC	2	10	174484	174493	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017379	AAATG	2	10	174880	174889	60 %	20 %	20 %	0 %	385229490
132	NC_017379	TGTAA	2	10	175670	175679	40 %	40 %	20 %	0 %	385229491
133	NC_017379	AGCTT	2	10	176708	176717	20 %	40 %	20 %	20 %	385229492
134	NC_017379	ATAAA	2	10	177166	177175	80 %	20 %	0 %	0 %	385229492
135	NC_017379	GAATA	2	10	177463	177472	60 %	20 %	20 %	0 %	385229492
136	NC_017379	TTTAA	2	10	177529	177538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017379	AAAAG	2	10	178335	178344	80 %	0 %	20 %	0 %	385229494
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266	NC_017379	TCAAA	2	10	339570	339579	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
267	NC_017379	TTTTA	2	10	340695	340704	20 %	80 %	0 %	0 %	385229653
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