MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Puno135 chromosome

Total Repeats: 1143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017379	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	385229318
2	NC_017379	TTGCT	2	10	6187	6196	0 %	60 %	20 %	20 %	385229322
3	NC_017379	TTGAA	2	10	11651	11660	40 %	40 %	20 %	0 %	385229327
4	NC_017379	TTTTG	2	10	11667	11676	0 %	80 %	20 %	0 %	385229327
5	NC_017379	TGGTG	2	10	12505	12514	0 %	40 %	60 %	0 %	385229329
6	NC_017379	CAAAA	2	10	18380	18389	80 %	0 %	0 %	20 %	385229334
7	NC_017379	TGAAA	2	10	20724	20733	60 %	20 %	20 %	0 %	385229336
8	NC_017379	CCATG	2	10	22899	22908	20 %	20 %	20 %	40 %	385229338
9	NC_017379	CTCTT	2	10	22929	22938	0 %	60 %	0 %	40 %	385229338
10	NC_017379	ATAGA	2	10	26219	26228	60 %	20 %	20 %	0 %	385229340
11	NC_017379	CAAGC	2	10	27529	27538	40 %	0 %	20 %	40 %	385229341
12	NC_017379	TTTTA	2	10	28459	28468	20 %	80 %	0 %	0 %	385229342
13	NC_017379	TAGCG	2	10	29121	29130	20 %	20 %	40 %	20 %	385229343
14	NC_017379	GATAA	2	10	30528	30537	60 %	20 %	20 %	0 %	385229346
15	NC_017379	GTGGG	2	10	31987	31996	0 %	20 %	80 %	0 %	385229347
16	NC_017379	TGGGG	2	10	33238	33247	0 %	20 %	80 %	0 %	385229349
17	NC_017379	AAGCC	2	10	39002	39011	40 %	0 %	20 %	40 %	385229356
18	NC_017379	AGAAA	2	10	40302	40311	80 %	0 %	20 %	0 %	385229357
19	NC_017379	AAAGT	2	10	40499	40508	60 %	20 %	20 %	0 %	385229357
20	NC_017379	TACTC	2	10	41155	41164	20 %	40 %	0 %	40 %	385229358
21	NC_017379	TAAAA	2	10	43015	43024	80 %	20 %	0 %	0 %	385229360
22	NC_017379	TCCCA	2	10	44027	44036	20 %	20 %	0 %	60 %	385229361
23	NC_017379	GCTCC	2	10	44348	44357	0 %	20 %	20 %	60 %	385229361
24	NC_017379	TCGCA	2	10	44885	44894	20 %	20 %	20 %	40 %	385229361
25	NC_017379	TGCCT	2	10	47139	47148	0 %	40 %	20 %	40 %	385229363
26	NC_017379	CGTTT	2	10	49015	49024	0 %	60 %	20 %	20 %	385229365
27	NC_017379	GCTTT	2	10	49428	49437	0 %	60 %	20 %	20 %	385229365
28	NC_017379	TAAAA	2	10	50616	50625	80 %	20 %	0 %	0 %	385229366
29	NC_017379	ATTTC	2	10	50691	50700	20 %	60 %	0 %	20 %	385229366
30	NC_017379	TGAAA	2	10	52374	52383	60 %	20 %	20 %	0 %	385229370
31	NC_017379	TCAAA	2	10	52628	52637	60 %	20 %	0 %	20 %	385229370
32	NC_017379	TCGTT	2	10	53438	53447	0 %	60 %	20 %	20 %	385229370
33	NC_017379	TCGCC	2	10	55371	55380	0 %	20 %	20 %	60 %	385229371
34	NC_017379	TAAAA	2	10	55667	55676	80 %	20 %	0 %	0 %	385229371
35	NC_017379	TCAAA	2	10	56383	56392	60 %	20 %	0 %	20 %	385229371
36	NC_017379	GGATG	2	10	60326	60335	20 %	20 %	60 %	0 %	385229375
37	NC_017379	TATCC	2	10	60702	60711	20 %	40 %	0 %	40 %	385229375
38	NC_017379	ATTGG	2	10	63286	63295	20 %	40 %	40 %	0 %	385229378
39	NC_017379	GGTGG	2	10	66066	66075	0 %	20 %	80 %	0 %	385229382
40	NC_017379	GCGTT	2	10	68399	68408	0 %	40 %	40 %	20 %	385229384
41	NC_017379	TCAAT	2	10	69253	69262	40 %	40 %	0 %	20 %	385229385
42	NC_017379	TCCAA	2	10	70589	70598	40 %	20 %	0 %	40 %	385229387
43	NC_017379	ATGTT	2	10	71912	71921	20 %	60 %	20 %	0 %	385229388
44	NC_017379	TTTTG	2	10	73886	73895	0 %	80 %	20 %	0 %	385229390
45	NC_017379	ACGCC	2	10	74192	74201	20 %	0 %	20 %	60 %	385229390
46	NC_017379	AAAGC	2	10	74958	74967	60 %	0 %	20 %	20 %	385229391
47	NC_017379	TATGG	2	10	81869	81878	20 %	40 %	40 %	0 %	385229398
48	NC_017379	ATCTT	2	10	82260	82269	20 %	60 %	0 %	20 %	385229398
49	NC_017379	TGGCT	2	10	82801	82810	0 %	40 %	40 %	20 %	385229398
50	NC_017379	ATGCC	2	10	83221	83230	20 %	20 %	20 %	40 %	385229399
51	NC_017379	TTGAT	2	10	84248	84257	20 %	60 %	20 %	0 %	385229401
52	NC_017379	GGCGT	2	10	86062	86071	0 %	20 %	60 %	20 %	385229403
53	NC_017379	CTTTC	2	10	89598	89607	0 %	60 %	0 %	40 %	385229405
54	NC_017379	TTTGC	2	10	90306	90315	0 %	60 %	20 %	20 %	385229406
55	NC_017379	TTTGA	2	10	92388	92397	20 %	60 %	20 %	0 %	385229408
56	NC_017379	TCTTT	2	10	92599	92608	0 %	80 %	0 %	20 %	385229408
57	NC_017379	ACGAT	2	10	98836	98845	40 %	20 %	20 %	20 %	385229413
58	NC_017379	TTTTC	2	10	99031	99040	0 %	80 %	0 %	20 %	385229413
59	NC_017379	AATTG	2	10	100678	100687	40 %	40 %	20 %	0 %	385229414
60	NC_017379	TCGTT	2	10	102478	102487	0 %	60 %	20 %	20 %	385229415
61	NC_017379	TCTTT	2	10	105764	105773	0 %	80 %	0 %	20 %	385229418
62	NC_017379	AAAGC	2	10	108526	108535	60 %	0 %	20 %	20 %	385229420
63	NC_017379	TGTCT	2	10	110165	110174	0 %	60 %	20 %	20 %	385229423
64	NC_017379	CAAAT	2	10	110558	110567	60 %	20 %	0 %	20 %	385229423
65	NC_017379	ACCCT	2	10	111987	111996	20 %	20 %	0 %	60 %	385229424
66	NC_017379	ATGCC	2	10	112119	112128	20 %	20 %	20 %	40 %	385229424
67	NC_017379	TGATT	2	10	114123	114132	20 %	60 %	20 %	0 %	385229426
68	NC_017379	CTAAA	2	10	114594	114603	60 %	20 %	0 %	20 %	385229428
69	NC_017379	GATCG	2	10	118620	118629	20 %	20 %	40 %	20 %	385229430
70	NC_017379	AGCTC	2	10	118639	118648	20 %	20 %	20 %	40 %	385229430
71	NC_017379	AAGCC	2	10	120527	120536	40 %	0 %	20 %	40 %	385229431
72	NC_017379	CGCTG	2	10	123343	123352	0 %	20 %	40 %	40 %	385229433
73	NC_017379	TTTGA	2	10	123490	123499	20 %	60 %	20 %	0 %	385229433
74	NC_017379	GACTT	2	10	124024	124033	20 %	40 %	20 %	20 %	385229433
75	NC_017379	ATCTC	2	10	124775	124784	20 %	40 %	0 %	40 %	385229433
76	NC_017379	CGCTT	2	10	124933	124942	0 %	40 %	20 %	40 %	385229433
77	NC_017379	TTTGT	2	10	125290	125299	0 %	80 %	20 %	0 %	385229434
78	NC_017379	TGCGT	2	10	127323	127332	0 %	40 %	40 %	20 %	385229436
79	NC_017379	GAAAA	2	10	127484	127493	80 %	0 %	20 %	0 %	385229436
80	NC_017379	GAAAA	2	10	127802	127811	80 %	0 %	20 %	0 %	385229436
81	NC_017379	ATTTT	2	10	130762	130771	20 %	80 %	0 %	0 %	385229441
82	NC_017379	ATGTT	2	10	130844	130853	20 %	60 %	20 %	0 %	385229441
83	NC_017379	AAAAG	2	10	131256	131265	80 %	0 %	20 %	0 %	385229441
84	NC_017379	AAATC	2	10	133270	133279	60 %	20 %	0 %	20 %	385229442
85	NC_017379	AAAAT	2	10	134742	134751	80 %	20 %	0 %	0 %	385229443
86	NC_017379	TTTTC	2	10	137098	137107	0 %	80 %	0 %	20 %	385229448
87	NC_017379	GTAAA	2	10	137650	137659	60 %	20 %	20 %	0 %	385229449
88	NC_017379	TTCTT	2	10	139054	139063	0 %	80 %	0 %	20 %	385229450
89	NC_017379	TCTTT	2	10	139548	139557	0 %	80 %	0 %	20 %	385229451
90	NC_017379	ACTTG	2	10	139761	139770	20 %	40 %	20 %	20 %	385229451
91	NC_017379	TTTTG	2	10	140711	140720	0 %	80 %	20 %	0 %	385229452
92	NC_017379	AATTC	2	10	141345	141354	40 %	40 %	0 %	20 %	385229452
93	NC_017379	GCGAT	2	10	141504	141513	20 %	20 %	40 %	20 %	385229452
94	NC_017379	GCTTG	2	10	141760	141769	0 %	40 %	40 %	20 %	385229452
95	NC_017379	TTTTG	2	10	142420	142429	0 %	80 %	20 %	0 %	385229453
96	NC_017379	CCAAA	2	10	144260	144269	60 %	0 %	0 %	40 %	385229454
97	NC_017379	ACGCC	2	10	147782	147791	20 %	0 %	20 %	60 %	385229456
98	NC_017379	TTATT	2	10	149678	149687	20 %	80 %	0 %	0 %	385229460
99	NC_017379	GCGTT	2	10	150036	150045	0 %	40 %	40 %	20 %	385229462
100	NC_017379	ATTTG	2	10	151011	151020	20 %	60 %	20 %	0 %	385229463
101	NC_017379	AAAAC	2	10	153631	153640	80 %	0 %	0 %	20 %	385229466
102	NC_017379	GGGGA	2	10	153731	153740	20 %	0 %	80 %	0 %	385229466
103	NC_017379	AAGCC	2	10	156867	156876	40 %	0 %	20 %	40 %	385229471
104	NC_017379	GGGTG	2	10	159275	159284	0 %	20 %	80 %	0 %	385229473
105	NC_017379	ATTCA	2	10	160657	160666	40 %	40 %	0 %	20 %	385229474
106	NC_017379	CACTT	2	10	160861	160870	20 %	40 %	0 %	40 %	385229474
107	NC_017379	AAAAC	2	10	162994	163003	80 %	0 %	0 %	20 %	385229476
108	NC_017379	ATCTT	2	10	164059	164068	20 %	60 %	0 %	20 %	385229477
109	NC_017379	TATCA	2	10	172314	172323	40 %	40 %	0 %	20 %	385229486
110	NC_017379	ATTTG	2	10	173322	173331	20 %	60 %	20 %	0 %	385229487
111	NC_017379	AAATG	2	10	174880	174889	60 %	20 %	20 %	0 %	385229490
112	NC_017379	TGTAA	2	10	175670	175679	40 %	40 %	20 %	0 %	385229491
113	NC_017379	AGCTT	2	10	176708	176717	20 %	40 %	20 %	20 %	385229492
114	NC_017379	ATAAA	2	10	177166	177175	80 %	20 %	0 %	0 %	385229492
115	NC_017379	GAATA	2	10	177463	177472	60 %	20 %	20 %	0 %	385229492
116	NC_017379	AAAAG	2	10	178335	178344	80 %	0 %	20 %	0 %	385229494
117	NC_017379	ACCCT	2	10	178400	178409	20 %	20 %	0 %	60 %	385229494
118	NC_017379	TGAAT	2	10	178716	178725	40 %	40 %	20 %	0 %	385229495
119	NC_017379	AAAAG	2	10	179739	179748	80 %	0 %	20 %	0 %	385229495
120	NC_017379	ATTCA	2	10	185841	185850	40 %	40 %	0 %	20 %	385229501
121	NC_017379	GAGAG	2	10	186599	186608	40 %	0 %	60 %	0 %	385229501
122	NC_017379	GCGAA	2	10	188415	188424	40 %	0 %	40 %	20 %	385229503
123	NC_017379	TAAAA	2	10	190282	190291	80 %	20 %	0 %	0 %	385229504
124	NC_017379	TCATT	2	10	191453	191462	20 %	60 %	0 %	20 %	385229505
125	NC_017379	CATAA	2	10	192013	192022	60 %	20 %	0 %	20 %	385229506
126	NC_017379	TCATG	2	10	192228	192237	20 %	40 %	20 %	20 %	385229506
127	NC_017379	CTATT	2	10	192342	192351	20 %	60 %	0 %	20 %	385229507
128	NC_017379	TTTTC	2	10	193402	193411	0 %	80 %	0 %	20 %	385229508
129	NC_017379	ATTAG	2	10	195380	195389	40 %	40 %	20 %	0 %	385229510
130	NC_017379	TATTT	2	10	197153	197162	20 %	80 %	0 %	0 %	385229513
131	NC_017379	TGGGG	2	10	204377	204386	0 %	20 %	80 %	0 %	385229519
132	NC_017379	GATCA	2	10	206284	206293	40 %	20 %	20 %	20 %	385229520
133	NC_017379	ATTCT	2	10	206811	206820	20 %	60 %	0 %	20 %	385229520
134	NC_017379	TTGGT	2	10	208781	208790	0 %	60 %	40 %	0 %	385229523
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