MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Puno120 chromosome

Total Repeats: 799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017378	TTGCAA	2	12	867	878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385227775
2	NC_017378	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	385227777
3	NC_017378	GAAACC	2	12	7491	7502	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385227782
4	NC_017378	CAATAT	2	12	17164	17175	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385227791
5	NC_017378	AAACAC	2	12	18090	18101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017378	AGAAAA	2	12	18440	18451	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385227792
7	NC_017378	GATAAA	2	12	21996	22007	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385227795
8	NC_017378	TTATTG	2	12	24229	24240	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385227797
9	NC_017378	GCGTGG	2	12	30876	30887	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385227805
10	NC_017378	TTGGAT	2	12	30986	30997	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385227805
11	NC_017378	TTGAAT	2	12	32069	32080	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385227805
12	NC_017378	TAAGGA	2	12	32368	32379	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385227805
13	NC_017378	TAGGGG	2	12	33889	33900	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385227808
14	NC_017378	TCACTA	2	12	34270	34281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385227808
15	NC_017378	CAGCGC	2	12	34647	34658	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385227809
16	NC_017378	GTTGTG	2	12	35044	35055	0 %	50 %	50 %	0 %	385227809
17	NC_017378	TTCTAC	2	12	35373	35384	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385227809
18	NC_017378	AAAGAA	2	12	35401	35412	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385227809
19	NC_017378	AAAGAA	2	12	36974	36985	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385227811
20	NC_017378	GGGTAG	2	12	42292	42303	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017378	GCCTTA	2	12	42320	42331	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385227816
22	NC_017378	CGCAAA	2	12	43111	43122	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385227816
23	NC_017378	GGCTAG	2	12	47354	47365	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385227820
24	NC_017378	TCTTTG	2	12	48587	48598	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017378	TGAAAT	2	12	49087	49098	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017378	AGATAA	2	12	55885	55896	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017378	AAAATC	2	12	55971	55982	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017378	AGAAAA	2	12	56347	56358	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385227826
29	NC_017378	AGAAAA	2	12	57029	57040	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385227827
30	NC_017378	AGAAAA	2	12	57359	57370	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385227827
31	NC_017378	GATGTG	2	12	58001	58012	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017378	CTAAAG	2	12	58143	58154	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017378	CCAACA	2	12	59970	59981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017378	TTTTGT	2	12	60302	60313	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385227828
35	NC_017378	GAAAAA	2	12	61604	61615	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385227830
36	NC_017378	AGCGGG	2	12	63778	63789	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385227833
37	NC_017378	TAAGGG	2	12	74259	74270	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385227845
38	NC_017378	GCGCAT	2	12	76574	76585	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385227848
39	NC_017378	GGCATG	2	12	76877	76888	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385227848
40	NC_017378	ATACCG	2	12	77844	77855	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385227848
41	NC_017378	ATACCG	2	12	77859	77870	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385227848
42	NC_017378	GCAACG	2	12	77940	77951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385227848
43	NC_017378	ATATTG	2	12	78572	78583	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385227849
44	NC_017378	AACAGG	2	12	86506	86517	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385227857
45	NC_017378	GAAAAA	2	12	89068	89079	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385227860
46	NC_017378	AGAGAA	2	12	89859	89870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385227860
47	NC_017378	GATTTT	2	12	92584	92595	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385227863
48	NC_017378	AAACTC	2	12	92701	92712	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385227863
49	NC_017378	TCAAAA	2	12	94168	94179	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385227864
50	NC_017378	GCGGTG	2	12	94867	94878	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385227865
51	NC_017378	AATATC	2	12	98074	98085	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385227866
52	NC_017378	TAAGAT	2	12	102207	102218	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385227870
53	NC_017378	GTGCCA	2	12	103669	103680	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385227871
54	NC_017378	ATAAAA	2	12	106420	106431	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017378	AGCGTT	2	12	108141	108152	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385227873
56	NC_017378	GATAAC	2	12	110913	110924	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017378	TTTTCT	2	12	113553	113564	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385227879
58	NC_017378	GCAAGC	2	12	113960	113971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385227879
59	NC_017378	CGCTCG	2	12	118565	118576	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385227884
60	NC_017378	GGGAAG	2	12	119959	119970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385227885
61	NC_017378	AGGGAG	2	12	120237	120248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385227885
62	NC_017378	TAGGCA	2	12	121102	121113	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385227885
63	NC_017378	CTTCTA	2	12	123446	123457	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385227887
64	NC_017378	CTTCTA	2	12	124794	124805	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385227888
65	NC_017378	GTTCTA	2	12	125076	125087	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385227888
66	NC_017378	ATTAAA	2	12	125481	125492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017378	CTAAGG	2	12	126377	126388	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385227889
68	NC_017378	TGAATT	2	12	126911	126922	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385227889
69	NC_017378	TTTCAA	2	12	127070	127081	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385227889
70	NC_017378	AGCAAA	2	12	130417	130428	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385227892
71	NC_017378	GTTTTA	2	12	131428	131439	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017378	TCATGA	2	12	133192	133203	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385227896
73	NC_017378	AAAAAT	2	12	139735	139746	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385227904
74	NC_017378	ATCCTT	2	12	140411	140422	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385227905
75	NC_017378	TAGCGA	2	12	141859	141870	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385227907
76	NC_017378	TTAGCG	2	12	144762	144773	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385227909
77	NC_017378	TATCGC	2	12	144974	144985	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385227909
78	NC_017378	TTCAAA	2	12	145291	145302	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385227910
79	NC_017378	ATCGCT	2	12	146689	146700	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385227910
80	NC_017378	CCTAAA	2	12	148912	148923	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385227912
81	NC_017378	TTCTAT	2	12	150072	150083	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385227913
82	NC_017378	TTGTTT	2	12	153060	153071	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385227918
83	NC_017378	CTTGGG	2	12	153721	153732	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385227920
84	NC_017378	TTGGGT	2	12	158499	158510	0 %	50 %	50 %	0 %	385227925
85	NC_017378	GATTTT	2	12	159011	159022	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385227926
86	NC_017378	GATGGC	2	12	162222	162233	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385227930
87	NC_017378	GATGGC	2	12	162330	162341	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385227930
88	NC_017378	CTTTCT	2	12	162474	162485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227930
89	NC_017378	CCGCTC	2	12	164476	164487	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385227932
90	NC_017378	GCTCTC	2	12	166903	166914	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385227934
91	NC_017378	TAAAAA	2	12	167561	167572	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017378	TTCTAA	2	12	169222	169233	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385227937
93	NC_017378	TCAATA	2	12	170904	170915	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385227939
94	NC_017378	ATCGTT	2	12	171326	171337	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385227939
95	NC_017378	AATTTC	2	12	171679	171690	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385227940
96	NC_017378	TTCTTT	2	12	173613	173624	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385227941
97	NC_017378	ATTTTG	2	12	174916	174927	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385227943
98	NC_017378	CGCTTT	2	12	175394	175405	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385227943
99	NC_017378	GTTTAA	2	12	176178	176189	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385227944
100	NC_017378	GAAAAA	2	12	182463	182474	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385227951
101	NC_017378	AGGCAT	2	12	182552	182563	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385227951
102	NC_017378	GCATTT	2	12	184265	184276	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385227953
103	NC_017378	TCAAAC	2	12	184832	184843	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385227954
104	NC_017378	ATAAAG	2	12	184999	185010	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385227954
105	NC_017378	GGTATT	2	12	188887	188898	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385227956
106	NC_017378	TCTAAA	2	12	189117	189128	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385227956
107	NC_017378	TGGGCA	2	12	190185	190196	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385227957
108	NC_017378	TTCTAA	2	12	190664	190675	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385227958
109	NC_017378	ATTTTC	2	12	192609	192620	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385227958
110	NC_017378	AAATCC	2	12	201453	201464	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385227970
111	NC_017378	AACATC	2	12	201519	201530	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385227970
112	NC_017378	AATTTT	2	12	204167	204178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385227971
113	NC_017378	ATTCTA	2	12	211814	211825	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385227979
114	NC_017378	CATAGC	2	12	213555	213566	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385227980
115	NC_017378	GTTTTG	2	12	214060	214071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385227980
116	NC_017378	TTATTT	2	12	215692	215703	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385227981
117	NC_017378	TAATTA	2	12	218563	218574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017378	GCTAAA	2	12	222074	222085	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385227987
119	NC_017378	ATTAAA	2	12	224892	224903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017378	AATGCC	2	12	226557	226568	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385227991
121	NC_017378	TGGTTT	2	12	228999	229010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385227992
122	NC_017378	GGTGAT	2	12	230808	230819	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385227993
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130	NC_017378	ATTGTC	2	12	249472	249483	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385228013
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233	NC_017378	CTAAAA	2	12	455205	455216	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385228208
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237	NC_017378	ACTTTA	2	12	462161	462172	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385228212
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354	NC_017378	AATGGT	2	12	698172	698183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385228423
355	NC_017378	TCTTTT	2	12	698338	698349	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385228423
356	NC_017378	AGGGTT	2	12	702212	702223	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385228425
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359	NC_017378	AACGCT	2	12	704478	704489	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385228429
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455	NC_017378	TAAAAT	2	12	913367	913378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_017378	TAGAGC	2	12	916195	916206	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385228637
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464	NC_017378	ATATTA	2	12	929042	929053	50 %	50 %	0 %	0 %	385228641
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