MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Puno120 chromosome

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017378	AAACAC	2	12	18090	18101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017378	GGGTAG	2	12	42292	42303	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017378	TCTTTG	2	12	48587	48598	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017378	TGAAAT	2	12	49087	49098	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017378	AGATAA	2	12	55885	55896	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017378	AAAATC	2	12	55971	55982	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017378	GATGTG	2	12	58001	58012	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017378	CTAAAG	2	12	58143	58154	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017378	CCAACA	2	12	59970	59981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017378	ATAAAA	2	12	106420	106431	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017378	GATAAC	2	12	110913	110924	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017378	ATTAAA	2	12	125481	125492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017378	GTTTTA	2	12	131428	131439	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017378	TAAAAA	2	12	167561	167572	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017378	TAATTA	2	12	218563	218574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017378	ATTAAA	2	12	224892	224903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017378	ATTTTA	2	12	247772	247783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017378	ATCAAT	2	12	289209	289220	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017378	TTTTAA	2	12	289541	289552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017378	ACTTTT	2	12	289647	289658	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017378	TATGGA	2	12	291779	291790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017378	ATTTGA	2	12	292666	292677	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017378	TCAATT	2	12	292798	292809	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017378	TAACAT	2	12	295091	295102	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017378	CTACAA	2	12	296817	296828	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017378	GATTTA	2	12	320175	320186	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017378	TGGCTA	2	12	339470	339481	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017378	GATTTT	2	12	361260	361271	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017378	TTCTTT	2	12	361284	361295	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017378	GCTAAA	2	12	361563	361574	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017378	AAAAGC	2	12	362899	362910	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017378	TTATTT	2	12	371644	371655	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017378	AGCAAG	2	12	397274	397285	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017378	AAAATA	2	12	429219	429230	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017378	TAAAAA	2	12	443308	443319	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017378	ATTTTT	2	12	454723	454734	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017378	TATTTT	2	12	468259	468270	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017378	AAATCA	2	12	505655	505666	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017378	ATAGTA	2	12	506892	506903	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017378	TTGTAA	2	12	516158	516169	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017378	TTTAAA	2	12	541503	541514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017378	TTAAAG	2	12	545657	545668	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017378	ATTTTA	2	12	574229	574240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017378	TCAAGA	2	12	578857	578868	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017378	AAAATC	2	12	581317	581328	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017378	TCTTAA	2	12	590697	590708	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017378	TGATTT	2	12	627286	627297	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017378	CTCATT	2	12	671578	671589	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017378	CGGCTT	2	12	746634	746645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017378	ATTTTT	2	12	868869	868880	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017378	TTTCAT	2	12	896191	896202	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017378	TTAAAC	2	12	899327	899338	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017378	ATTATA	2	12	913342	913353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017378	TAAAAT	2	12	913367	913378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017378	TGAAAT	2	12	920735	920746	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017378	AAATTA	2	12	941816	941827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017378	TATCCT	2	12	958533	958544	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017378	GTCAAA	2	12	964803	964814	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017378	TTTTTC	2	12	967765	967776	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017378	GCTGAA	2	12	978389	978400	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017378	CTAGCC	2	12	991581	991592	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017378	TAGGCT	2	12	1004612	1004623	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017378	AAACCA	2	12	1008313	1008324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017378	TACCTT	2	12	1010297	1010308	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017378	CAAAGT	2	12	1010547	1010558	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017378	CTTTAA	2	12	1011962	1011973	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017378	TTATAC	2	12	1012083	1012094	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017378	CCTATA	2	12	1030359	1030370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017378	ACAAAA	2	12	1046644	1046655	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017378	AATTAA	2	12	1056315	1056326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017378	ATAAAG	2	12	1157990	1158001	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017378	TTGTAT	2	12	1194490	1194501	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017378	ACTTAA	2	12	1211697	1211708	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017378	AAACTT	2	12	1233984	1233995	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017378	TAACGC	2	12	1246388	1246399	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017378	TCGCCC	2	12	1247722	1247733	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017378	CAAAAA	2	12	1249038	1249049	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017378	ATTTTT	2	12	1264935	1264946	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017378	TAAAAA	2	12	1293001	1293012	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017378	GTTTTA	2	12	1380743	1380754	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017378	CTTTAA	2	12	1383693	1383704	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017378	TTATAC	2	12	1383814	1383825	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017378	AAAGAG	2	12	1390548	1390559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017378	AGCGGG	2	12	1392129	1392140	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017378	TGTTTA	2	12	1394393	1394404	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017378	AAAGAC	2	12	1395450	1395461	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017378	GTTTTA	2	12	1402234	1402245	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017378	AAACAA	2	12	1414985	1414996	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017378	TGTTTA	2	12	1420901	1420912	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017378	ATCGCA	2	12	1440576	1440587	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017378	TTGCAA	2	12	1440980	1440991	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017378	AATCCC	2	12	1441482	1441493	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017378	ATTTAA	2	12	1506785	1506796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017378	ATCAGC	2	12	1522270	1522281	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017378	GCAAGA	2	12	1525959	1525970	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017378	GCAAGA	2	12	1526103	1526114	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017378	AAACCA	2	12	1548263	1548274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017378	TACCTT	2	12	1549879	1549890	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017378	CAAAGT	2	12	1550129	1550140	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017378	TAAAAA	2	12	1562741	1562752	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017378	GCGAGC	2	12	1589791	1589802	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017378	GTGTGA	2	12	1604218	1604229	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.