MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Puno120 chromosome

Total Repeats: 697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017378	TTGCAA	2	12	867	878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385227775
2	NC_017378	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	385227777
3	NC_017378	GAAACC	2	12	7491	7502	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385227782
4	NC_017378	CAATAT	2	12	17164	17175	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385227791
5	NC_017378	AGAAAA	2	12	18440	18451	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385227792
6	NC_017378	GATAAA	2	12	21996	22007	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385227795
7	NC_017378	TTATTG	2	12	24229	24240	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385227797
8	NC_017378	GCGTGG	2	12	30876	30887	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385227805
9	NC_017378	TTGGAT	2	12	30986	30997	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385227805
10	NC_017378	TTGAAT	2	12	32069	32080	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385227805
11	NC_017378	TAAGGA	2	12	32368	32379	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385227805
12	NC_017378	TAGGGG	2	12	33889	33900	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385227808
13	NC_017378	TCACTA	2	12	34270	34281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385227808
14	NC_017378	CAGCGC	2	12	34647	34658	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385227809
15	NC_017378	GTTGTG	2	12	35044	35055	0 %	50 %	50 %	0 %	385227809
16	NC_017378	TTCTAC	2	12	35373	35384	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385227809
17	NC_017378	AAAGAA	2	12	35401	35412	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385227809
18	NC_017378	AAAGAA	2	12	36974	36985	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385227811
19	NC_017378	GCCTTA	2	12	42320	42331	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385227816
20	NC_017378	CGCAAA	2	12	43111	43122	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385227816
21	NC_017378	GGCTAG	2	12	47354	47365	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385227820
22	NC_017378	AGAAAA	2	12	56347	56358	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385227826
23	NC_017378	AGAAAA	2	12	57029	57040	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385227827
24	NC_017378	AGAAAA	2	12	57359	57370	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385227827
25	NC_017378	TTTTGT	2	12	60302	60313	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385227828
26	NC_017378	GAAAAA	2	12	61604	61615	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385227830
27	NC_017378	AGCGGG	2	12	63778	63789	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385227833
28	NC_017378	TAAGGG	2	12	74259	74270	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385227845
29	NC_017378	GCGCAT	2	12	76574	76585	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385227848
30	NC_017378	GGCATG	2	12	76877	76888	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385227848
31	NC_017378	ATACCG	2	12	77844	77855	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385227848
32	NC_017378	ATACCG	2	12	77859	77870	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385227848
33	NC_017378	GCAACG	2	12	77940	77951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385227848
34	NC_017378	ATATTG	2	12	78572	78583	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385227849
35	NC_017378	AACAGG	2	12	86506	86517	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385227857
36	NC_017378	GAAAAA	2	12	89068	89079	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385227860
37	NC_017378	AGAGAA	2	12	89859	89870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385227860
38	NC_017378	GATTTT	2	12	92584	92595	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385227863
39	NC_017378	AAACTC	2	12	92701	92712	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385227863
40	NC_017378	TCAAAA	2	12	94168	94179	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385227864
41	NC_017378	GCGGTG	2	12	94867	94878	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385227865
42	NC_017378	AATATC	2	12	98074	98085	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385227866
43	NC_017378	TAAGAT	2	12	102207	102218	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385227870
44	NC_017378	GTGCCA	2	12	103669	103680	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385227871
45	NC_017378	AGCGTT	2	12	108141	108152	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385227873
46	NC_017378	TTTTCT	2	12	113553	113564	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385227879
47	NC_017378	GCAAGC	2	12	113960	113971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385227879
48	NC_017378	CGCTCG	2	12	118565	118576	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385227884
49	NC_017378	GGGAAG	2	12	119959	119970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385227885
50	NC_017378	AGGGAG	2	12	120237	120248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385227885
51	NC_017378	TAGGCA	2	12	121102	121113	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385227885
52	NC_017378	CTTCTA	2	12	123446	123457	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385227887
53	NC_017378	CTTCTA	2	12	124794	124805	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385227888
54	NC_017378	GTTCTA	2	12	125076	125087	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385227888
55	NC_017378	CTAAGG	2	12	126377	126388	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385227889
56	NC_017378	TGAATT	2	12	126911	126922	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385227889
57	NC_017378	TTTCAA	2	12	127070	127081	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385227889
58	NC_017378	AGCAAA	2	12	130417	130428	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385227892
59	NC_017378	TCATGA	2	12	133192	133203	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385227896
60	NC_017378	AAAAAT	2	12	139735	139746	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385227904
61	NC_017378	ATCCTT	2	12	140411	140422	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385227905
62	NC_017378	TAGCGA	2	12	141859	141870	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385227907
63	NC_017378	TTAGCG	2	12	144762	144773	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385227909
64	NC_017378	TATCGC	2	12	144974	144985	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385227909
65	NC_017378	TTCAAA	2	12	145291	145302	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385227910
66	NC_017378	ATCGCT	2	12	146689	146700	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385227910
67	NC_017378	CCTAAA	2	12	148912	148923	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385227912
68	NC_017378	TTCTAT	2	12	150072	150083	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385227913
69	NC_017378	TTGTTT	2	12	153060	153071	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385227918
70	NC_017378	CTTGGG	2	12	153721	153732	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385227920
71	NC_017378	TTGGGT	2	12	158499	158510	0 %	50 %	50 %	0 %	385227925
72	NC_017378	GATTTT	2	12	159011	159022	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385227926
73	NC_017378	GATGGC	2	12	162222	162233	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385227930
74	NC_017378	GATGGC	2	12	162330	162341	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385227930
75	NC_017378	CTTTCT	2	12	162474	162485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385227930
76	NC_017378	CCGCTC	2	12	164476	164487	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385227932
77	NC_017378	GCTCTC	2	12	166903	166914	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385227934
78	NC_017378	TTCTAA	2	12	169222	169233	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385227937
79	NC_017378	TCAATA	2	12	170904	170915	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385227939
80	NC_017378	ATCGTT	2	12	171326	171337	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385227939
81	NC_017378	AATTTC	2	12	171679	171690	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385227940
82	NC_017378	TTCTTT	2	12	173613	173624	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385227941
83	NC_017378	ATTTTG	2	12	174916	174927	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385227943
84	NC_017378	CGCTTT	2	12	175394	175405	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385227943
85	NC_017378	GTTTAA	2	12	176178	176189	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385227944
86	NC_017378	GAAAAA	2	12	182463	182474	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385227951
87	NC_017378	AGGCAT	2	12	182552	182563	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385227951
88	NC_017378	GCATTT	2	12	184265	184276	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385227953
89	NC_017378	TCAAAC	2	12	184832	184843	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385227954
90	NC_017378	ATAAAG	2	12	184999	185010	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385227954
91	NC_017378	GGTATT	2	12	188887	188898	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385227956
92	NC_017378	TCTAAA	2	12	189117	189128	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385227956
93	NC_017378	TGGGCA	2	12	190185	190196	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385227957
94	NC_017378	TTCTAA	2	12	190664	190675	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385227958
95	NC_017378	ATTTTC	2	12	192609	192620	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385227958
96	NC_017378	AAATCC	2	12	201453	201464	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385227970
97	NC_017378	AACATC	2	12	201519	201530	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385227970
98	NC_017378	AATTTT	2	12	204167	204178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385227971
99	NC_017378	ATTCTA	2	12	211814	211825	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385227979
100	NC_017378	CATAGC	2	12	213555	213566	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385227980
101	NC_017378	GTTTTG	2	12	214060	214071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385227980
102	NC_017378	TTATTT	2	12	215692	215703	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385227981
103	NC_017378	GCTAAA	2	12	222074	222085	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385227987
104	NC_017378	AATGCC	2	12	226557	226568	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385227991
105	NC_017378	TGGTTT	2	12	228999	229010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385227992
106	NC_017378	GGTGAT	2	12	230808	230819	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385227993
107	NC_017378	TCAATA	2	12	231231	231242	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385227994
108	NC_017378	CACGCC	2	12	231711	231722	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385227994
109	NC_017378	GCTTTG	2	12	232955	232966	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385227995
110	NC_017378	GCTAGG	2	12	234336	234347	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385227996
111	NC_017378	TCTTTA	2	12	240676	240687	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385228003
112	NC_017378	GTTTTT	2	12	246312	246323	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385228010
113	NC_017378	ATTGTC	2	12	249472	249483	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385228013
114	NC_017378	TCCCGC	2	12	251668	251679	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385228015
115	NC_017378	TCCCGC	2	12	252481	252492	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385228015
116	NC_017378	CAAAGC	2	12	253945	253956	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385228017
117	NC_017378	TTTAGC	2	12	255700	255711	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385228019
118	NC_017378	AAAAAG	2	12	258803	258814	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385228022
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234	NC_017378	CAGAGC	2	12	547581	547592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385228289
235	NC_017378	CATTCC	2	12	547879	547890	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385228289
236	NC_017378	ATTTTT	2	12	549781	549792	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385228294
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238	NC_017378	AGAAAT	2	12	554884	554895	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385228300
239	NC_017378	CAATGT	2	12	556461	556472	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385228302
240	NC_017378	CGCCTT	2	12	557697	557708	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385228302
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242	NC_017378	ACGGGT	2	12	560377	560388	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385228307
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245	NC_017378	AGCATG	2	12	561840	561851	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385228309
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344	NC_017378	ACTGCC	2	12	773669	773680	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385228500
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461	NC_017378	GTTTTT	2	12	1066079	1066090	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385228753
462	NC_017378	AGCGTT	2	12	1066181	1066192	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385228753
463	NC_017378	TTAAAG	2	12	1068520	1068531	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385228754
464	NC_017378	GCCGTT	2	12	1074410	1074421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385228759
465	NC_017378	CGCATG	2	12	1077223	1077234	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385228762
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468	NC_017378	CGCCAT	2	12	1088927	1088938	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385228774
469	NC_017378	CCATCG	2	12	1089076	1089087	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385228774
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486	NC_017378	TACTGC	2	12	1133707	1133718	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385228821
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