MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Puno120 chromosome

Total Repeats: 1281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017378	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	385227776
2	NC_017378	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	385227777
3	NC_017378	GTTTT	2	10	2427	2436	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017378	GAAAC	2	10	4649	4658	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017378	TTTTA	2	10	4922	4931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017378	TTGAA	2	10	11655	11664	40 %	40 %	20 %	0 %	385227785
7	NC_017378	TGGTG	2	10	12509	12518	0 %	40 %	60 %	0 %	385227787
8	NC_017378	GCTTT	2	10	13336	13345	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017378	TCGAT	2	10	17490	17499	20 %	40 %	20 %	20 %	385227791
10	NC_017378	CAAAA	2	10	18405	18414	80 %	0 %	0 %	20 %	385227792
11	NC_017378	CATCA	2	10	19781	19790	40 %	20 %	0 %	40 %	385227793
12	NC_017378	TGAAA	2	10	20749	20758	60 %	20 %	20 %	0 %	385227794
13	NC_017378	CCATG	2	10	22940	22949	20 %	20 %	20 %	40 %	385227797
14	NC_017378	CTCTT	2	10	22970	22979	0 %	60 %	0 %	40 %	385227797
15	NC_017378	ATGAA	2	10	24910	24919	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017378	ATAGA	2	10	26263	26272	60 %	20 %	20 %	0 %	385227798
17	NC_017378	CAAGC	2	10	27573	27582	40 %	0 %	20 %	40 %	385227799
18	NC_017378	TTTTA	2	10	28503	28512	20 %	80 %	0 %	0 %	385227800
19	NC_017378	GATAA	2	10	30572	30581	60 %	20 %	20 %	0 %	385227804
20	NC_017378	GTGGG	2	10	32031	32040	0 %	20 %	80 %	0 %	385227805
21	NC_017378	TGGGG	2	10	33282	33291	0 %	20 %	80 %	0 %	385227807
22	NC_017378	AAGCC	2	10	39060	39069	40 %	0 %	20 %	40 %	385227813
23	NC_017378	AGAAA	2	10	40360	40369	80 %	0 %	20 %	0 %	385227814
24	NC_017378	AAAGT	2	10	40557	40566	60 %	20 %	20 %	0 %	385227814
25	NC_017378	TACTC	2	10	41213	41222	20 %	40 %	0 %	40 %	385227815
26	NC_017378	TAAAA	2	10	43046	43055	80 %	20 %	0 %	0 %	385227816
27	NC_017378	TCCCA	2	10	44058	44067	20 %	20 %	0 %	60 %	385227817
28	NC_017378	GCTCC	2	10	44379	44388	0 %	20 %	20 %	60 %	385227817
29	NC_017378	TCGCA	2	10	44916	44925	20 %	20 %	20 %	40 %	385227817
30	NC_017378	TGCCT	2	10	47171	47180	0 %	40 %	20 %	40 %	385227819
31	NC_017378	CGTTT	2	10	49042	49051	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017378	TAAAA	2	10	49355	49364	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017378	TGCTT	2	10	49454	49463	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017378	TGAAA	2	10	50156	50165	60 %	20 %	20 %	0 %	385227822
35	NC_017378	TCAAA	2	10	50410	50419	60 %	20 %	0 %	20 %	385227822
36	NC_017378	TCGTT	2	10	51220	51229	0 %	60 %	20 %	20 %	385227822
37	NC_017378	CAGCA	2	10	51357	51366	40 %	0 %	20 %	40 %	385227823
38	NC_017378	TCGCC	2	10	53153	53162	0 %	20 %	20 %	60 %	385227823
39	NC_017378	TCAAA	2	10	54165	54174	60 %	20 %	0 %	20 %	385227823
40	NC_017378	TTAAA	2	10	55186	55195	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017378	ACAAA	2	10	55215	55224	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017378	AAAGA	2	10	55809	55818	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017378	TATCC	2	10	58712	58721	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017378	ATTGG	2	10	60917	60926	20 %	40 %	40 %	0 %	385227830
45	NC_017378	TCTAC	2	10	60999	61008	20 %	40 %	0 %	40 %	385227830
46	NC_017378	GACAG	2	10	63496	63505	40 %	0 %	40 %	20 %	385227833
47	NC_017378	GGTGG	2	10	63699	63708	0 %	20 %	80 %	0 %	385227833
48	NC_017378	TCAAT	2	10	66872	66881	40 %	40 %	0 %	20 %	385227836
49	NC_017378	CTTCT	2	10	67714	67723	0 %	60 %	0 %	40 %	385227837
50	NC_017378	TCCAA	2	10	68203	68212	40 %	20 %	0 %	40 %	385227838
51	NC_017378	TTTTA	2	10	71466	71475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017378	TTTTG	2	10	71497	71506	0 %	80 %	20 %	0 %	385227842
53	NC_017378	ACGCC	2	10	71803	71812	20 %	0 %	20 %	60 %	385227842
54	NC_017378	AAAGC	2	10	72569	72578	60 %	0 %	20 %	20 %	385227843
55	NC_017378	AAAAC	2	10	76192	76201	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017378	ATCTT	2	10	79727	79736	20 %	60 %	0 %	20 %	385227849
57	NC_017378	TGGCT	2	10	80268	80277	0 %	40 %	40 %	20 %	385227849
58	NC_017378	ATTTT	2	10	80437	80446	20 %	80 %	0 %	0 %	385227850
59	NC_017378	ATGCC	2	10	80702	80711	20 %	20 %	20 %	40 %	385227851
60	NC_017378	TTGAT	2	10	81728	81737	20 %	60 %	20 %	0 %	385227854
61	NC_017378	GGCGT	2	10	83541	83550	0 %	20 %	60 %	20 %	385227856
62	NC_017378	ATTTT	2	10	86585	86594	20 %	80 %	0 %	0 %	385227857
63	NC_017378	ATAAA	2	10	86699	86708	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017378	TAAGA	2	10	86736	86745	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017378	CTTTC	2	10	87091	87100	0 %	60 %	0 %	40 %	385227858
66	NC_017378	ATGGG	2	10	89040	89049	20 %	20 %	60 %	0 %	385227860
67	NC_017378	TTTGA	2	10	90168	90177	20 %	60 %	20 %	0 %	385227861
68	NC_017378	TCTTT	2	10	90379	90388	0 %	80 %	0 %	20 %	385227861
69	NC_017378	GGCTT	2	10	91488	91497	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017378	CGGCA	2	10	94134	94143	20 %	0 %	40 %	40 %	385227864
71	NC_017378	AATTT	2	10	96167	96176	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017378	ACGAT	2	10	96614	96623	40 %	20 %	20 %	20 %	385227866
73	NC_017378	TTTTC	2	10	96809	96818	0 %	80 %	0 %	20 %	385227866
74	NC_017378	AATTG	2	10	98456	98465	40 %	40 %	20 %	0 %	385227867
75	NC_017378	TCGTT	2	10	100257	100266	0 %	60 %	20 %	20 %	385227868
76	NC_017378	GCCAT	2	10	101378	101387	20 %	20 %	20 %	40 %	385227870
77	NC_017378	ATAAG	2	10	103441	103450	60 %	20 %	20 %	0 %	385227871
78	NC_017378	ATTGA	2	10	104209	104218	40 %	40 %	20 %	0 %	385227871
79	NC_017378	AAAAT	2	10	104467	104476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017378	ATTTT	2	10	104495	104504	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017378	AAAAT	2	10	106313	106322	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017378	TCTTT	2	10	107031	107040	0 %	80 %	0 %	20 %	385227873
83	NC_017378	TTTAT	2	10	108792	108801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017378	AAAGC	2	10	109793	109802	60 %	0 %	20 %	20 %	385227875
85	NC_017378	GAATG	2	10	111026	111035	40 %	20 %	40 %	0 %	385227877
86	NC_017378	CAAAT	2	10	112073	112082	60 %	20 %	0 %	20 %	385227878
87	NC_017378	ACCCT	2	10	113502	113511	20 %	20 %	0 %	60 %	385227879
88	NC_017378	ATGCC	2	10	113634	113643	20 %	20 %	20 %	40 %	385227879
89	NC_017378	TTAAT	2	10	115020	115029	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017378	TGATT	2	10	115639	115648	20 %	60 %	20 %	0 %	385227881
91	NC_017378	CTAAA	2	10	116109	116118	60 %	20 %	0 %	20 %	385227883
92	NC_017378	GAATT	2	10	116258	116267	40 %	40 %	20 %	0 %	385227883
93	NC_017378	GGATC	2	10	120131	120140	20 %	20 %	40 %	20 %	385227885
94	NC_017378	AGCTC	2	10	120151	120160	20 %	20 %	20 %	40 %	385227885
95	NC_017378	GCAAT	2	10	122001	122010	40 %	20 %	20 %	20 %	385227886
96	NC_017378	AAGCC	2	10	122039	122048	40 %	0 %	20 %	40 %	385227886
97	NC_017378	CAATC	2	10	124169	124178	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_017378	CGCTG	2	10	126249	126258	0 %	20 %	40 %	40 %	385227889
99	NC_017378	TTTGA	2	10	126396	126405	20 %	60 %	20 %	0 %	385227889
100	NC_017378	GACTT	2	10	126930	126939	20 %	40 %	20 %	20 %	385227889
101	NC_017378	ATCTC	2	10	127681	127690	20 %	40 %	0 %	40 %	385227889
102	NC_017378	CGCTT	2	10	127839	127848	0 %	40 %	20 %	40 %	385227889
103	NC_017378	TTTAG	2	10	128053	128062	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017378	TTTGT	2	10	128195	128204	0 %	80 %	20 %	0 %	385227890
105	NC_017378	TGCGT	2	10	130228	130237	0 %	40 %	40 %	20 %	385227892
106	NC_017378	GAAAA	2	10	130389	130398	80 %	0 %	20 %	0 %	385227892
107	NC_017378	GAAAA	2	10	130707	130716	80 %	0 %	20 %	0 %	385227892
108	NC_017378	ATTTT	2	10	133661	133670	20 %	80 %	0 %	0 %	385227897
109	NC_017378	ATGTT	2	10	133743	133752	20 %	60 %	20 %	0 %	385227897
110	NC_017378	AAAAG	2	10	134155	134164	80 %	0 %	20 %	0 %	385227897
111	NC_017378	AAATC	2	10	136418	136427	60 %	20 %	0 %	20 %	385227900
112	NC_017378	AAAAT	2	10	137890	137899	80 %	20 %	0 %	0 %	385227901
113	NC_017378	TTTTC	2	10	140223	140232	0 %	80 %	0 %	20 %	385227905
114	NC_017378	GTAAA	2	10	140775	140784	60 %	20 %	20 %	0 %	385227906
115	NC_017378	CTTTT	2	10	142106	142115	0 %	80 %	0 %	20 %	385227907
116	NC_017378	TTCTT	2	10	142179	142188	0 %	80 %	0 %	20 %	385227907
117	NC_017378	TCTTT	2	10	142673	142682	0 %	80 %	0 %	20 %	385227908
118	NC_017378	TTTTG	2	10	143847	143856	0 %	80 %	20 %	0 %	385227909
119	NC_017378	AATTC	2	10	144481	144490	40 %	40 %	0 %	20 %	385227909
120	NC_017378	GCGAT	2	10	144640	144649	20 %	20 %	40 %	20 %	385227909
121	NC_017378	GCTTG	2	10	144896	144905	0 %	40 %	40 %	20 %	385227909
122	NC_017378	TTTTG	2	10	145555	145564	0 %	80 %	20 %	0 %	385227910
123	NC_017378	ACGCC	2	10	150917	150926	20 %	0 %	20 %	60 %	385227913
124	NC_017378	TTATT	2	10	152813	152822	20 %	80 %	0 %	0 %	385227917
125	NC_017378	GCGTT	2	10	153171	153180	0 %	40 %	40 %	20 %	385227919
126	NC_017378	ATTTG	2	10	154146	154155	20 %	60 %	20 %	0 %	385227920
127	NC_017378	CAAAT	2	10	156045	156054	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017378	AAAAC	2	10	156769	156778	80 %	0 %	0 %	20 %	385227923
129	NC_017378	AAGCC	2	10	160005	160014	40 %	0 %	20 %	40 %	385227928
130	NC_017378	ATTTT	2	10	162042	162051	20 %	80 %	0 %	0 %	385227930
131	NC_017378	GGGTG	2	10	162398	162407	0 %	20 %	80 %	0 %	385227930
132	NC_017378	CAAAA	2	10	163301	163310	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017378	ATTCA	2	10	163784	163793	40 %	40 %	0 %	20 %	385227931
134	NC_017378	CACTT	2	10	163988	163997	20 %	40 %	0 %	40 %	385227931
135	NC_017378	AAAAC	2	10	166121	166130	80 %	0 %	0 %	20 %	385227933
136	NC_017378	ATCTT	2	10	167186	167195	20 %	60 %	0 %	20 %	385227934
137	NC_017378	CGCAC	2	10	174975	174984	20 %	0 %	20 %	60 %	385227943
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