MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Puno120 plasmid pHPPN120

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017377	ACG	2	6	102	107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017377	TAA	2	6	261	266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017377	CGA	2	6	489	494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385229300
4	NC_017377	CAA	2	6	651	656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229300
5	NC_017377	ACA	2	6	883	888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229300
6	NC_017377	AAG	2	6	1247	1252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
7	NC_017377	AGA	2	6	1284	1289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
8	NC_017377	CAA	2	6	1312	1317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229300
9	NC_017377	GAA	2	6	1480	1485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
10	NC_017377	CAA	2	6	1518	1523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229300
11	NC_017377	GAA	2	6	1542	1547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
12	NC_017377	AGA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
13	NC_017377	ATT	2	6	1622	1627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017377	AGC	2	6	1797	1802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385229301
15	NC_017377	TAA	2	6	1882	1887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017377	AAT	2	6	1889	1894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017377	GTC	2	6	1996	2001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017377	TTC	2	6	2043	2048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017377	CAA	2	6	2113	2118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017377	AAG	2	6	2279	2284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229302
21	NC_017377	GTT	2	6	2392	2397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229302
22	NC_017377	TTG	2	6	2481	2486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229302
23	NC_017377	CTG	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385229302
24	NC_017377	CTT	2	6	2822	2827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229302
25	NC_017377	GTT	2	6	2925	2930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017377	CTT	2	6	2963	2968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017377	CTA	2	6	3026	3031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017377	ATG	2	6	3058	3063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017377	TGT	2	6	3149	3154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017377	TTG	2	6	3160	3165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017377	TAG	2	6	3239	3244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017377	GTT	2	6	3246	3251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017377	GTT	3	9	3273	3281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017377	TGT	2	6	3325	3330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017377	TCA	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017377	ATT	2	6	3446	3451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017377	TTG	2	6	3472	3477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017377	TAT	2	6	3550	3555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017377	TGT	2	6	3657	3662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017377	TGT	2	6	3677	3682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017377	TAG	2	6	3770	3775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017377	TGT	2	6	3867	3872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017377	CAT	2	6	3939	3944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017377	GTT	2	6	4189	4194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229303
45	NC_017377	TTA	2	6	4293	4298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229303
46	NC_017377	TTG	2	6	4324	4329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229303
47	NC_017377	GTT	2	6	4649	4654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017377	ATG	2	6	4855	4860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229304
49	NC_017377	TTA	2	6	4875	4880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229304
50	NC_017377	GTT	2	6	5230	5235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229305
51	NC_017377	TTC	2	6	5246	5251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017377	ATC	2	6	5294	5299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017377	ATT	2	6	5341	5346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017377	CTT	2	6	5394	5399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017377	CAA	2	6	5560	5565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229306
56	NC_017377	GTT	2	6	5731	5736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017377	TTA	2	6	5738	5743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017377	TAA	2	6	6006	6011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017377	GGA	2	6	6099	6104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017377	AGG	2	6	6126	6131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017377	TTA	2	6	6267	6272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017377	GAA	2	6	6397	6402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229307
63	NC_017377	CAC	2	6	6431	6436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229307
64	NC_017377	ACC	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229307
65	NC_017377	TAA	2	6	6528	6533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229307
66	NC_017377	ATT	2	6	6684	6689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229307
67	NC_017377	ACA	2	6	6713	6718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229307
68	NC_017377	ATT	2	6	6739	6744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229307
69	NC_017377	CAA	2	6	6888	6893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229307
70	NC_017377	CTT	2	6	6914	6919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229307
71	NC_017377	ACA	2	6	7409	7414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229307
72	NC_017377	AAC	2	6	7468	7473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229307
73	NC_017377	CAA	2	6	7494	7499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229307
74	NC_017377	ACT	2	6	7515	7520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229307
75	NC_017377	AGA	2	6	7560	7565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229307
76	NC_017377	TGA	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229307
77	NC_017377	AAC	2	6	7684	7689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229307
78	NC_017377	TGA	2	6	7910	7915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229308
79	NC_017377	CAC	2	6	7947	7952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229308
80	NC_017377	AAT	2	6	8240	8245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229308
81	NC_017377	GAA	2	6	8313	8318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229308
82	NC_017377	CAT	2	6	8516	8521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229308
83	NC_017377	TGC	2	6	8564	8569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385229308
84	NC_017377	GAA	2	6	8625	8630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017377	TAC	2	6	8644	8649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017377	ACC	2	6	8739	8744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229309
87	NC_017377	TGA	2	6	8869	8874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229309
88	NC_017377	TGA	2	6	8992	8997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229309
89	NC_017377	TGG	2	6	9004	9009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385229309
90	NC_017377	CAA	2	6	9048	9053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229309
91	NC_017377	CAT	2	6	9130	9135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229309
92	NC_017377	TCA	2	6	9243	9248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229309
93	NC_017377	TAC	2	6	9272	9277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229309
94	NC_017377	AAC	2	6	9296	9301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229309
95	NC_017377	CAC	2	6	9458	9463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229310
96	NC_017377	CTT	2	6	9573	9578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229310
97	NC_017377	TAT	2	6	9579	9584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229310
98	NC_017377	CAT	2	6	9886	9891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229310
99	NC_017377	CCA	2	6	9937	9942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229310
100	NC_017377	ATA	2	6	10342	10347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229310
101	NC_017377	ACA	2	6	10373	10378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229310
102	NC_017377	TTG	2	6	10507	10512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229310
103	NC_017377	ATC	2	6	10597	10602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229310
104	NC_017377	CAT	2	6	10773	10778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229310
105	NC_017377	AAT	2	6	10806	10811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229310
106	NC_017377	GTC	2	6	11010	11015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017377	TTC	2	6	11057	11062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017377	TTA	2	6	11096	11101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017377	TAA	2	6	11117	11122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017377	GTT	2	6	11297	11302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229312
111	NC_017377	TTA	2	6	11401	11406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229312
112	NC_017377	TTG	2	6	11432	11437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229312
113	NC_017377	GTT	2	6	11757	11762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017377	ATG	2	6	11963	11968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229313
115	NC_017377	TTA	2	6	11983	11988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229313
116	NC_017377	GTT	2	6	12338	12343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229314
117	NC_017377	TTC	2	6	12354	12359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017377	ATC	2	6	12402	12407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017377	ATT	2	6	12449	12454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017377	CTT	2	6	12502	12507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017377	CAA	2	6	12668	12673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.