MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Puno120 plasmid pHPPN120

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017377	CGA	2	6	489	494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385229300
2	NC_017377	CAA	2	6	651	656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229300
3	NC_017377	ACA	2	6	883	888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229300
4	NC_017377	AAG	2	6	1247	1252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
5	NC_017377	AGA	2	6	1284	1289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
6	NC_017377	CAA	2	6	1312	1317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229300
7	NC_017377	GAA	2	6	1480	1485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
8	NC_017377	CAA	2	6	1518	1523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229300
9	NC_017377	GAA	2	6	1542	1547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
10	NC_017377	AGA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
11	NC_017377	AGC	2	6	1797	1802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385229301
12	NC_017377	AAG	2	6	2279	2284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229302
13	NC_017377	GTT	2	6	2392	2397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229302
14	NC_017377	TTG	2	6	2481	2486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229302
15	NC_017377	CTG	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385229302
16	NC_017377	CTT	2	6	2822	2827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229302
17	NC_017377	GTT	2	6	4189	4194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229303
18	NC_017377	TTA	2	6	4293	4298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229303
19	NC_017377	TTG	2	6	4324	4329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229303
20	NC_017377	ATG	2	6	4855	4860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229304
21	NC_017377	TTA	2	6	4875	4880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229304
22	NC_017377	GTT	2	6	5230	5235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229305
23	NC_017377	CAA	2	6	5560	5565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229306
24	NC_017377	GAA	2	6	6397	6402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229307
25	NC_017377	CAC	2	6	6431	6436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229307
26	NC_017377	ACC	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229307
27	NC_017377	TAA	2	6	6528	6533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229307
28	NC_017377	ATT	2	6	6684	6689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229307
29	NC_017377	ACA	2	6	6713	6718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229307
30	NC_017377	ATT	2	6	6739	6744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229307
31	NC_017377	CAA	2	6	6888	6893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229307
32	NC_017377	CTT	2	6	6914	6919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229307
33	NC_017377	ACA	2	6	7409	7414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229307
34	NC_017377	AAC	2	6	7468	7473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229307
35	NC_017377	CAA	2	6	7494	7499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229307
36	NC_017377	ACT	2	6	7515	7520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229307
37	NC_017377	AGA	2	6	7560	7565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229307
38	NC_017377	TGA	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229307
39	NC_017377	AAC	2	6	7684	7689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229307
40	NC_017377	TGA	2	6	7910	7915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229308
41	NC_017377	CAC	2	6	7947	7952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229308
42	NC_017377	AAT	2	6	8240	8245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229308
43	NC_017377	GAA	2	6	8313	8318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229308
44	NC_017377	CAT	2	6	8516	8521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229308
45	NC_017377	TGC	2	6	8564	8569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385229308
46	NC_017377	ACC	2	6	8739	8744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229309
47	NC_017377	TGA	2	6	8869	8874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229309
48	NC_017377	TGA	2	6	8992	8997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229309
49	NC_017377	TGG	2	6	9004	9009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385229309
50	NC_017377	CAA	2	6	9048	9053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229309
51	NC_017377	CAT	2	6	9130	9135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229309
52	NC_017377	TCA	2	6	9243	9248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229309
53	NC_017377	TAC	2	6	9272	9277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229309
54	NC_017377	AAC	2	6	9296	9301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229309
55	NC_017377	CAC	2	6	9458	9463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229310
56	NC_017377	CTT	2	6	9573	9578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229310
57	NC_017377	TAT	2	6	9579	9584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229310
58	NC_017377	CAT	2	6	9886	9891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229310
59	NC_017377	CCA	2	6	9937	9942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229310
60	NC_017377	ATA	2	6	10342	10347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229310
61	NC_017377	ACA	2	6	10373	10378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229310
62	NC_017377	TTG	2	6	10507	10512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229310
63	NC_017377	ATC	2	6	10597	10602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229310
64	NC_017377	CAT	2	6	10773	10778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229310
65	NC_017377	AAT	2	6	10806	10811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229310
66	NC_017377	GTT	2	6	11297	11302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229312
67	NC_017377	TTA	2	6	11401	11406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229312
68	NC_017377	TTG	2	6	11432	11437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229312
69	NC_017377	ATG	2	6	11963	11968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229313
70	NC_017377	TTA	2	6	11983	11988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229313
71	NC_017377	GTT	2	6	12338	12343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229314

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.