MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori SNT49 chromosome

Total Repeats: 1296

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017376	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	385226255
2	NC_017376	TTTGT	2	10	2424	2433	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017376	GAAAC	2	10	4657	4666	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017376	TTTTA	2	10	4930	4939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017376	TTTGA	2	10	6236	6245	20 %	60 %	20 %	0 %	385226259
6	NC_017376	AAATT	2	10	7362	7371	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017376	CAAAG	2	10	7640	7649	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017376	TTTCT	2	10	8436	8445	0 %	80 %	0 %	20 %	385226260
9	NC_017376	TTTTG	2	10	11953	11962	0 %	80 %	20 %	0 %	385226263
10	NC_017376	GGGTT	2	10	12175	12184	0 %	40 %	60 %	0 %	385226263
11	NC_017376	TGGTG	2	10	12791	12800	0 %	40 %	60 %	0 %	385226264
12	NC_017376	GCTTT	2	10	13618	13627	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017376	GTTTT	2	10	16667	16676	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017376	AAAAG	2	10	23070	23079	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017376	CCATG	2	10	23253	23262	20 %	20 %	20 %	40 %	385226274
16	NC_017376	CTCTT	2	10	23283	23292	0 %	60 %	0 %	40 %	385226274
17	NC_017376	CAAGC	2	10	27899	27908	40 %	0 %	20 %	40 %	385226276
18	NC_017376	TTTTA	2	10	28829	28838	20 %	80 %	0 %	0 %	385226277
19	NC_017376	GTGGG	2	10	33634	33643	0 %	20 %	80 %	0 %	385226281
20	NC_017376	AAGCC	2	10	40643	40652	40 %	0 %	20 %	40 %	385226290
21	NC_017376	AGAAA	2	10	41958	41967	80 %	0 %	20 %	0 %	385226291
22	NC_017376	TACTC	2	10	42811	42820	20 %	40 %	0 %	40 %	385226292
23	NC_017376	TAAAA	2	10	44938	44947	80 %	20 %	0 %	0 %	385226293
24	NC_017376	TCCCA	2	10	45959	45968	20 %	20 %	0 %	60 %	385226294
25	NC_017376	TGCCT	2	10	49072	49081	0 %	40 %	20 %	40 %	385226296
26	NC_017376	TGAAA	2	10	50148	50157	60 %	20 %	20 %	0 %	385226298
27	NC_017376	TCAAA	2	10	50402	50411	60 %	20 %	0 %	20 %	385226298
28	NC_017376	TAAAA	2	10	53441	53450	80 %	20 %	0 %	0 %	385226299
29	NC_017376	TCAAA	2	10	54157	54166	60 %	20 %	0 %	20 %	385226299
30	NC_017376	TTAAA	2	10	55180	55189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017376	ACAAA	2	10	55209	55218	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017376	ATCGC	2	10	56119	56128	20 %	20 %	20 %	40 %	385226303
33	NC_017376	AAAGA	2	10	56643	56652	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017376	TATCC	2	10	57317	57326	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017376	AAAAG	2	10	58021	58030	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017376	ATTTT	2	10	61928	61937	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017376	AAGAA	2	10	63089	63098	80 %	0 %	20 %	0 %	385226310
38	NC_017376	CAAAG	2	10	63528	63537	60 %	0 %	20 %	20 %	385226310
39	NC_017376	CATCC	2	10	63853	63862	20 %	20 %	0 %	60 %	385226311
40	NC_017376	TTTTG	2	10	64601	64610	0 %	80 %	20 %	0 %	385226311
41	NC_017376	CTTTT	2	10	64727	64736	0 %	80 %	0 %	20 %	385226311
42	NC_017376	AATTC	2	10	65476	65485	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017376	TGGGC	2	10	65566	65575	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017376	GATTA	2	10	66132	66141	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017376	CCATA	2	10	66188	66197	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017376	GTTTT	2	10	66301	66310	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017376	TAAAA	2	10	67238	67247	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017376	TGCTT	2	10	67567	67576	0 %	60 %	20 %	20 %	385226312
49	NC_017376	ATTAT	2	10	67806	67815	40 %	60 %	0 %	0 %	385226312
50	NC_017376	GTTTT	2	10	68915	68924	0 %	80 %	20 %	0 %	385226313
51	NC_017376	TTTTA	2	10	70958	70967	20 %	80 %	0 %	0 %	385226314
52	NC_017376	AATTG	2	10	71063	71072	40 %	40 %	20 %	0 %	385226314
53	NC_017376	GAAAA	2	10	74780	74789	80 %	0 %	20 %	0 %	385226314
54	NC_017376	AGCAA	2	10	75247	75256	60 %	0 %	20 %	20 %	385226314
55	NC_017376	TGGCG	2	10	76499	76508	0 %	20 %	60 %	20 %	385226314
56	NC_017376	AACAA	2	10	77815	77824	80 %	0 %	0 %	20 %	385226314
57	NC_017376	ATAAC	2	10	78649	78658	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017376	GCCAA	2	10	79078	79087	40 %	0 %	20 %	40 %	385226315
59	NC_017376	AAAAT	2	10	79405	79414	80 %	20 %	0 %	0 %	385226315
60	NC_017376	TTTCA	2	10	81492	81501	20 %	60 %	0 %	20 %	385226318
61	NC_017376	TTTAG	2	10	81718	81727	20 %	60 %	20 %	0 %	385226318
62	NC_017376	AGTTG	2	10	82777	82786	20 %	40 %	40 %	0 %	385226318
63	NC_017376	GTATC	2	10	82836	82845	20 %	40 %	20 %	20 %	385226318
64	NC_017376	TTTAA	2	10	83860	83869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017376	GCTAC	2	10	83914	83923	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017376	AATTA	2	10	83995	84004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017376	ATTTT	2	10	85464	85473	20 %	80 %	0 %	0 %	385226321
68	NC_017376	TCAAA	2	10	85501	85510	60 %	20 %	0 %	20 %	385226321
69	NC_017376	AAAAT	2	10	86080	86089	80 %	20 %	0 %	0 %	385226322
70	NC_017376	TTTCA	2	10	86144	86153	20 %	60 %	0 %	20 %	385226322
71	NC_017376	CTAAG	2	10	87695	87704	40 %	20 %	20 %	20 %	385226325
72	NC_017376	TAGAT	2	10	88315	88324	40 %	40 %	20 %	0 %	385226326
73	NC_017376	CTTCA	2	10	90040	90049	20 %	40 %	0 %	40 %	385226329
74	NC_017376	TTTTG	2	10	90289	90298	0 %	80 %	20 %	0 %	385226330
75	NC_017376	TAATG	2	10	93327	93336	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017376	TAAAG	2	10	94378	94387	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017376	GTATT	2	10	95772	95781	20 %	60 %	20 %	0 %	385226333
78	NC_017376	TCATT	2	10	98078	98087	20 %	60 %	0 %	20 %	385226336
79	NC_017376	CAATA	2	10	99889	99898	60 %	20 %	0 %	20 %	385226337
80	NC_017376	TTAAA	2	10	100851	100860	60 %	40 %	0 %	0 %	385226338
81	NC_017376	TCAAT	2	10	105079	105088	40 %	40 %	0 %	20 %	385226341
82	NC_017376	CTTCT	2	10	105922	105931	0 %	60 %	0 %	40 %	385226342
83	NC_017376	TGCCT	2	10	105999	106008	0 %	40 %	20 %	40 %	385226342
84	NC_017376	TCCAA	2	10	106411	106420	40 %	20 %	0 %	40 %	385226343
85	NC_017376	CAAAA	2	10	106728	106737	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017376	CAATG	2	10	107247	107256	40 %	20 %	20 %	20 %	385226344
87	NC_017376	TTTTA	2	10	109662	109671	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017376	TTTTG	2	10	109693	109702	0 %	80 %	20 %	0 %	385226346
89	NC_017376	ACGCC	2	10	109999	110008	20 %	0 %	20 %	60 %	385226346
90	NC_017376	AAAGC	2	10	110765	110774	60 %	0 %	20 %	20 %	385226347
91	NC_017376	TTACA	2	10	111547	111556	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017376	TTTGT	2	10	115165	115174	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017376	ATCTT	2	10	118763	118772	20 %	60 %	0 %	20 %	385226353
94	NC_017376	TGGCT	2	10	119304	119313	0 %	40 %	40 %	20 %	385226353
95	NC_017376	ATTTC	2	10	119421	119430	20 %	60 %	0 %	20 %	385226353
96	NC_017376	ATTTT	2	10	119473	119482	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017376	ATGCC	2	10	119823	119832	20 %	20 %	20 %	40 %	385226354
98	NC_017376	TTGAT	2	10	120752	120761	20 %	60 %	20 %	0 %	385226356
99	NC_017376	GGCGT	2	10	122566	122575	0 %	20 %	60 %	20 %	385226358
100	NC_017376	ATAAA	2	10	125703	125712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017376	TAAGA	2	10	125745	125754	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017376	TAAAA	2	10	125816	125825	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017376	CTTTC	2	10	126100	126109	0 %	60 %	0 %	40 %	385226360
104	NC_017376	TTTGA	2	10	129102	129111	20 %	60 %	20 %	0 %	385226363
105	NC_017376	TCTTT	2	10	129313	129322	0 %	80 %	0 %	20 %	385226363
106	NC_017376	ATAAA	2	10	132438	132447	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017376	CGGCA	2	10	132899	132908	20 %	0 %	40 %	40 %	385226366
108	NC_017376	ACGAT	2	10	135384	135393	40 %	20 %	20 %	20 %	385226368
109	NC_017376	GAATT	2	10	137225	137234	40 %	40 %	20 %	0 %	385226369
110	NC_017376	TCGTT	2	10	139029	139038	0 %	60 %	20 %	20 %	385226370
111	NC_017376	CAATC	2	10	139805	139814	40 %	20 %	0 %	40 %	385226371
112	NC_017376	TCTTT	2	10	142346	142355	0 %	80 %	0 %	20 %	385226373
113	NC_017376	AAAGC	2	10	145119	145128	60 %	0 %	20 %	20 %	385226375
114	NC_017376	GAATG	2	10	146346	146355	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017376	CAAAT	2	10	147555	147564	60 %	20 %	0 %	20 %	385226378
116	NC_017376	ACCCT	2	10	148985	148994	20 %	20 %	0 %	60 %	385226379
117	NC_017376	ATGCC	2	10	149117	149126	20 %	20 %	20 %	40 %	385226379
118	NC_017376	TTAAT	2	10	150503	150512	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017376	TGATT	2	10	151112	151121	20 %	60 %	20 %	0 %	385226381
120	NC_017376	CTAAA	2	10	151581	151590	60 %	20 %	0 %	20 %	385226383
121	NC_017376	GAATT	2	10	151730	151739	40 %	40 %	20 %	0 %	385226383
122	NC_017376	GATCG	2	10	155608	155617	20 %	20 %	40 %	20 %	385226385
123	NC_017376	AGCTC	2	10	155627	155636	20 %	20 %	20 %	40 %	385226385
124	NC_017376	AGCCA	2	10	157516	157525	40 %	0 %	20 %	40 %	385226386
125	NC_017376	CGCTG	2	10	160459	160468	0 %	20 %	40 %	40 %	385226388
126	NC_017376	TTTGA	2	10	160606	160615	20 %	60 %	20 %	0 %	385226388
127	NC_017376	GACTT	2	10	161140	161149	20 %	40 %	20 %	20 %	385226388
128	NC_017376	ATCTC	2	10	161891	161900	20 %	40 %	0 %	40 %	385226388
129	NC_017376	CGCTT	2	10	162049	162058	0 %	40 %	20 %	40 %	385226388
130	NC_017376	TTTGT	2	10	162402	162411	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017376	TGCGT	2	10	164435	164444	0 %	40 %	40 %	20 %	385226390
132	NC_017376	GAAAA	2	10	164596	164605	80 %	0 %	20 %	0 %	385226390
133	NC_017376	CGTTT	2	10	164863	164872	0 %	60 %	20 %	20 %	385226390
134	NC_017376	GAAAA	2	10	164914	164923	80 %	0 %	20 %	0 %	385226390
135	NC_017376	ATTTT	2	10	167883	167892	20 %	80 %	0 %	0 %	385226395
136	NC_017376	ATGTT	2	10	167965	167974	20 %	60 %	20 %	0 %	385226395
137	NC_017376	AAATC	2	10	170385	170394	60 %	20 %	0 %	20 %	385226397
138	NC_017376	AAAAT	2	10	171857	171866	80 %	20 %	0 %	0 %	385226398
139	NC_017376	TTTTC	2	10	174206	174215	0 %	80 %	0 %	20 %	385226402
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