MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori SNT49 chromosome

Total Repeats: 603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017376	TAAA	2	8	4699	4706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017376	TTTG	2	8	7485	7492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017376	AGCG	2	8	7582	7589	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017376	ATAA	2	8	9698	9705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017376	ATTC	2	8	9901	9908	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017376	TTAA	2	8	13716	13723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017376	ATCA	2	8	22766	22773	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017376	GATT	2	8	25237	25244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017376	TAAG	2	8	25275	25282	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017376	ATTA	2	8	25333	25340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017376	TTGC	2	8	25642	25649	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017376	CGCT	2	8	25661	25668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017376	GAGT	2	8	29894	29901	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017376	TGCT	2	8	29948	29955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017376	CAAT	2	8	30067	30074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017376	TAAA	2	8	30568	30575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017376	GGTT	2	8	31459	31466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017376	CAAA	2	8	43732	43739	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017376	ATCT	2	8	43945	43952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017376	CTGT	2	8	44006	44013	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017376	TTGA	2	8	49771	49778	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017376	TTTA	2	8	54909	54916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017376	CAAG	2	8	56459	56466	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017376	AAAG	2	8	56757	56764	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017376	AGCG	2	8	57453	57460	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017376	GAAA	2	8	57721	57728	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017376	CATT	2	8	58227	58234	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017376	CAAA	2	8	59616	59623	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017376	ATAA	2	8	61420	61427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017376	AAAG	2	8	61846	61853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017376	CTTA	2	8	62165	62172	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017376	CAAT	2	8	65388	65395	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017376	TTCT	3	12	65716	65727	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017376	TTGT	2	8	66583	66590	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017376	CATA	2	8	66986	66993	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017376	GATT	2	8	67177	67184	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017376	ATGG	2	8	81011	81018	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017376	TCTT	2	8	93544	93551	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017376	AATC	2	8	93942	93949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017376	CACT	2	8	94335	94342	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017376	CCTA	2	8	94411	94418	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017376	TTTA	2	8	101601	101608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017376	ACGC	2	8	103280	103287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017376	AAAT	2	8	109462	109469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017376	TAGA	2	8	111526	111533	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017376	CCAC	2	8	113080	113087	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_017376	ATTT	2	8	113235	113242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017376	CGTT	2	8	117326	117333	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017376	AAAG	2	8	119624	119631	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017376	TCAA	2	8	125725	125732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017376	GGTG	2	8	127659	127666	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017376	TCCC	2	8	127729	127736	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_017376	AAAG	2	8	130286	130293	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017376	TTTC	2	8	130556	130563	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017376	TTCA	2	8	133266	133273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017376	TGAT	2	8	134910	134917	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017376	ATCA	2	8	135006	135013	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017376	AACA	2	8	146233	146240	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017376	AAGC	2	8	146996	147003	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017376	CCGC	2	8	147019	147026	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_017376	CTTT	2	8	148923	148930	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017376	AAAT	2	8	148933	148940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017376	ATTT	2	8	150465	150472	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017376	TGAA	2	8	153455	153462	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017376	TCAT	2	8	155140	155147	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017376	CATT	2	8	159748	159755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017376	GTTA	2	8	162345	162352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017376	AAAG	2	8	165252	165259	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017376	AAAG	2	8	165747	165754	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017376	GAAG	2	8	165804	165811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017376	AATC	2	8	166980	166987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017376	CTTG	2	8	167594	167601	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017376	GTGG	2	8	167602	167609	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017376	TAAA	2	8	168762	168769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017376	ATTT	2	8	172067	172074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017376	TCTT	2	8	173511	173518	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017376	TAAG	2	8	177428	177435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017376	TTTG	2	8	187084	187091	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017376	TTAA	2	8	195878	195885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017376	ATTT	2	8	195904	195911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017376	AAAT	2	8	197096	197103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017376	TCAA	2	8	197314	197321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017376	CACT	2	8	208106	208113	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017376	AATA	2	8	208225	208232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017376	TTTA	2	8	211083	211090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017376	GCGT	2	8	211093	211100	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017376	TTGA	2	8	211199	211206	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017376	AAAC	2	8	212804	212811	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017376	GATT	2	8	215818	215825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017376	TTTC	2	8	220838	220845	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017376	CATT	2	8	221016	221023	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017376	TTTG	2	8	221035	221042	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017376	GTGG	2	8	221214	221221	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017376	TCTT	2	8	221446	221453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017376	TGCT	2	8	222056	222063	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017376	TTGC	2	8	222474	222481	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017376	TTTG	2	8	222638	222645	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017376	TCCT	2	8	222871	222878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017376	TTCA	2	8	222905	222912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017376	TGCA	2	8	222925	222932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017376	ACGA	2	8	231618	231625	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017376	TAAG	2	8	233300	233307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017376	TTAG	2	8	236338	236345	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017376	TTTG	2	8	237421	237428	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017376	TTTC	2	8	237599	237606	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017376	TCCT	2	8	238012	238019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017376	GTGG	2	8	238035	238042	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017376	ACTT	2	8	238386	238393	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017376	AAAT	2	8	238567	238574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017376	AATG	2	8	238795	238802	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017376	TTTG	2	8	238901	238908	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017376	TGTT	2	8	239169	239176	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017376	GTTT	2	8	242798	242805	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017376	AATG	2	8	246240	246247	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017376	CTTA	2	8	247171	247178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017376	TGTT	2	8	247180	247187	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017376	TTAT	2	8	255811	255818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017376	GAAA	2	8	265359	265366	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017376	CTGC	2	8	267105	267112	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017376	TTAA	2	8	267285	267292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017376	TTGG	2	8	267544	267551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017376	GTTT	2	8	268029	268036	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017376	TTTA	2	8	268274	268281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017376	AACA	2	8	272978	272985	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017376	GATT	2	8	273153	273160	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017376	TAAT	2	8	289447	289454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017376	AACA	2	8	341974	341981	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017376	ATGA	2	8	350296	350303	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017376	TCAG	2	8	350319	350326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017376	AATA	2	8	356770	356777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017376	CATT	2	8	359486	359493	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017376	CAAC	2	8	359638	359645	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017376	TGAG	2	8	359707	359714	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017376	TTGG	2	8	362422	362429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017376	TTGG	2	8	364806	364813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017376	AAAT	2	8	370958	370965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017376	TTAA	2	8	375547	375554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017376	AATC	2	8	375586	375593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017376	TGAA	2	8	379887	379894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017376	CTAA	2	8	379895	379902	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017376	TTGA	2	8	388625	388632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017376	CAAT	2	8	388722	388729	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017376	TTAA	2	8	401196	401203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017376	TTAT	2	8	401620	401627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017376	CTTG	2	8	401672	401679	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017376	TGAT	2	8	401725	401732	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017376	GAAG	2	8	401919	401926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017376	GAAA	2	8	402066	402073	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017376	AGCG	2	8	402548	402555	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017376	AGCG	2	8	402596	402603	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_017376	TTAT	2	8	405724	405731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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