MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori SNT49 chromosome

Total Repeats: 304

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017376	AC	3	6	4676	4681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017376	TC	3	6	4975	4980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017376	GA	9	18	7313	7330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017376	TA	3	6	9822	9827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017376	CA	3	6	16723	16728	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017376	AG	3	6	25546	25551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017376	TA	3	6	27154	27159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017376	GA	3	6	30376	30381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017376	TC	3	6	30760	30765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017376	TC	3	6	30791	30796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017376	CT	3	6	30883	30888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017376	AG	3	6	40123	40128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017376	GT	3	6	43807	43812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017376	AG	4	8	43921	43928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017376	TC	3	6	55731	55736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017376	AG	3	6	56235	56240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017376	CT	3	6	56934	56939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017376	AG	3	6	56960	56965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017376	TC	3	6	57100	57105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017376	GC	3	6	57809	57814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017376	GA	4	8	58439	58446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017376	GA	4	8	61363	61370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017376	TA	3	6	61396	61401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017376	TA	4	8	62015	62022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017376	AG	3	6	62190	62195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017376	TC	4	8	65701	65708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017376	CA	3	6	66279	66284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017376	TA	3	6	78694	78699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017376	TA	3	6	93098	93103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017376	GT	3	6	93783	93788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017376	CT	3	6	94579	94584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017376	AG	3	6	101229	101234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017376	TA	3	6	101442	101447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017376	GC	3	6	101503	101508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017376	GT	3	6	101919	101924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017376	CA	4	8	102088	102095	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017376	AG	3	6	102326	102331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017376	AG	3	6	106861	106866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017376	CA	3	6	113142	113147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017376	TA	5	10	113201	113210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017376	TC	3	6	115134	115139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017376	AG	4	8	115201	115208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017376	AG	3	6	119588	119593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017376	AG	3	6	127867	127872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017376	TA	3	6	131413	131418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017376	TA	3	6	141694	141699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017376	CT	3	6	146938	146943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017376	AT	4	8	155031	155038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017376	CA	3	6	166836	166841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017376	CT	3	6	167513	167518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017376	AG	3	6	167801	167806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017376	TA	3	6	167849	167854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017376	CA	3	6	197115	197120	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017376	TC	3	6	199141	199146	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017376	AC	3	6	208560	208565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017376	AG	3	6	211258	211263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017376	AT	3	6	211949	211954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017376	GA	3	6	212600	212605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017376	AT	3	6	215940	215945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017376	GA	3	6	215946	215951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017376	AG	3	6	221170	221175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017376	TC	3	6	221706	221711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017376	TC	3	6	222617	222622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017376	TG	3	6	236392	236397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017376	TC	3	6	238232	238237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017376	TC	3	6	238768	238773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017376	CT	3	6	238863	238868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017376	TC	3	6	239243	239248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017376	TC	3	6	239596	239601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017376	GC	3	6	244258	244263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017376	TG	3	6	259134	259139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017376	AG	3	6	259149	259154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017376	CT	3	6	261953	261958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017376	GT	3	6	266664	266669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017376	AG	3	6	266721	266726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017376	GA	3	6	267365	267370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017376	CT	3	6	267975	267980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017376	AG	3	6	335604	335609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017376	AG	3	6	366226	366231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017376	TG	3	6	374363	374368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017376	AG	3	6	374591	374596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017376	GC	3	6	401701	401706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017376	TA	3	6	405696	405701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017376	AT	3	6	407679	407684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017376	AG	3	6	409363	409368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017376	AG	3	6	410813	410818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017376	GA	4	8	418769	418776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017376	TA	3	6	437232	437237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017376	GA	3	6	439747	439752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017376	GA	3	6	439993	439998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017376	CT	4	8	458847	458854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017376	AG	3	6	458987	458992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017376	AT	3	6	459139	459144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017376	GA	3	6	459206	459211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017376	TA	3	6	471942	471947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017376	GC	3	6	472034	472039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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98	NC_017376	AT	4	8	486610	486617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017376	GA	3	6	521795	521800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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102	NC_017376	AG	3	6	531542	531547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017376	TC	3	6	531858	531863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017376	GA	4	8	532219	532226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017376	AG	3	6	532554	532559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017376	GT	3	6	532579	532584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_017376	AT	3	6	538672	538677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017376	AG	3	6	538741	538746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017376	CA	3	6	539349	539354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017376	AT	3	6	541786	541791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017376	AT	3	6	545789	545794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017376	GA	3	6	555256	555261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017376	AG	4	8	555531	555538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017376	AG	3	6	557130	557135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017376	TC	3	6	558715	558720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017376	GA	3	6	558790	558795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017376	AG	3	6	559148	559153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017376	AC	3	6	559367	559372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017376	GA	3	6	560008	560013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017376	TA	3	6	560464	560469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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123	NC_017376	CA	3	6	571085	571090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017376	AT	3	6	571462	571467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017376	AC	4	8	571482	571489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017376	GT	3	6	571751	571756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017376	TG	3	6	575575	575580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017376	GA	3	6	576937	576942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017376	AC	3	6	583034	583039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017376	TA	3	6	586923	586928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017376	TA	3	6	590225	590230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017376	AT	3	6	591423	591428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017376	TA	3	6	592362	592367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017376	AT	3	6	621267	621272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017376	AG	3	6	662182	662187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017376	TA	3	6	691157	691162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017376	TA	3	6	706689	706694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017376	AG	3	6	707882	707887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017376	GC	3	6	709259	709264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017376	AG	3	6	710255	710260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017376	AG	3	6	710717	710722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017376	CT	3	6	711150	711155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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144	NC_017376	AC	4	8	717147	717154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017376	TC	4	8	717608	717615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017376	TG	3	6	718024	718029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017376	TA	3	6	718041	718046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_017376	GC	3	6	727931	727936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017376	TA	3	6	731971	731976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017376	AT	3	6	749775	749780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017376	AG	3	6	755726	755731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017376	CT	8	16	766935	766950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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304	NC_017376	TC	4	8	1605548	1605555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.