MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori 83 chromosome

Total Repeats: 813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017375	TTGCAA	2	12	869	880	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385224644
2	NC_017375	CCGCAG	2	12	1045	1056	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385224645
3	NC_017375	ATTATA	2	12	1797	1808	50 %	50 %	0 %	0 %	385224646
4	NC_017375	AAAAAG	2	12	5142	5153	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017375	GCTTGC	2	12	6252	6263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385224651
6	NC_017375	GGTGAA	2	12	6578	6589	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385224651
7	NC_017375	CCGTTC	2	12	6933	6944	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385224651
8	NC_017375	GAAACC	2	12	7718	7729	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385224653
9	NC_017375	AAACAC	2	12	18281	18292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017375	AGAAAA	2	12	18631	18642	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385224662
11	NC_017375	AGTTTT	2	12	20332	20343	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385224663
12	NC_017375	GATAAA	2	12	22187	22198	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385224665
13	NC_017375	TTTCTT	2	12	22925	22936	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017375	TTATTG	2	12	24467	24478	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385224667
15	NC_017375	TTTGTT	2	12	25841	25852	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385224668
16	NC_017375	ATGCAA	2	12	27228	27239	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385224670
17	NC_017375	CCAAAA	2	12	31360	31371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385224674
18	NC_017375	CTTTAA	2	12	36271	36282	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385224679
19	NC_017375	ACCTTA	2	12	37263	37274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385224679
20	NC_017375	TCAAAT	2	12	39966	39977	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385224681
21	NC_017375	TGTGTC	2	12	40453	40464	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385224682
22	NC_017375	TTTTAT	2	12	45423	45434	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385224686
23	NC_017375	TTCTTT	2	12	46092	46103	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385224687
24	NC_017375	TTTTTA	2	12	46612	46623	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385224687
25	NC_017375	TTAGGG	2	12	47801	47812	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385224688
26	NC_017375	TTGGTG	2	12	48507	48518	0 %	50 %	50 %	0 %	385224690
27	NC_017375	ACAAAA	2	12	49431	49442	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385224691
28	NC_017375	ATTGAA	2	12	51314	51325	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385224693
29	NC_017375	TGAATG	2	12	55147	55158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385224695
30	NC_017375	GGCACA	2	12	55976	55987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385224696
31	NC_017375	TGAGCA	2	12	57988	57999	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385224698
32	NC_017375	GAAAAT	2	12	58656	58667	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385224698
33	NC_017375	GTGCCT	2	12	61131	61142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385224701
34	NC_017375	GATTTT	2	12	61467	61478	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385224701
35	NC_017375	ATGAAA	2	12	64061	64072	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385224704
36	NC_017375	GTTTTT	2	12	65382	65393	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385224705
37	NC_017375	TAAAAA	2	12	68852	68863	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385224708
38	NC_017375	CCACAC	2	12	70607	70618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385224709
39	NC_017375	AGATAA	2	12	73474	73485	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017375	AGAAAA	2	12	73537	73548	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017375	GATGTG	2	12	75026	75037	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385224714
42	NC_017375	AGCCAA	2	12	75104	75115	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385224714
43	NC_017375	AAAAGA	2	12	76134	76145	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385224715
44	NC_017375	CCAACA	2	12	76980	76991	50 %	0 %	0 %	50 %	385224717
45	NC_017375	TTTTGT	2	12	77317	77328	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385224718
46	NC_017375	AAAGAG	2	12	77596	77607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385224718
47	NC_017375	GCAAGG	2	12	85965	85976	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385224728
48	NC_017375	CTTGTG	2	12	86499	86510	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385224729
49	NC_017375	TTCTAA	2	12	87316	87327	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385224729
50	NC_017375	TTTTCA	2	12	88690	88701	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385224730
51	NC_017375	TAATCA	2	12	90355	90366	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385224732
52	NC_017375	AGATAA	2	12	90805	90816	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385224733
53	NC_017375	CGCTTA	2	12	91718	91729	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385224735
54	NC_017375	CACTCC	2	12	96804	96815	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	385224742
55	NC_017375	AAGGGA	2	12	97278	97289	50 %	0 %	50 %	0 %	385224742
56	NC_017375	CCACAA	2	12	97877	97888	50 %	0 %	0 %	50 %	385224743
57	NC_017375	TTATTG	2	12	99098	99109	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385224744
58	NC_017375	AGTTTT	2	12	99651	99662	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385224745
59	NC_017375	ATTTTG	2	12	100638	100649	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385224747
60	NC_017375	ACGCCC	2	12	116275	116286	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385224767
61	NC_017375	TAAGGG	2	12	118994	119005	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385224770
62	NC_017375	CGCTAA	2	12	119357	119368	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385224770
63	NC_017375	CGCCCA	2	12	119531	119542	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385224770
64	NC_017375	GGCATG	2	12	122349	122360	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385224774
65	NC_017375	CTAACA	2	12	123145	123156	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385224774
66	NC_017375	GCAACG	2	12	123391	123402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385224774
67	NC_017375	AACAGG	2	12	132095	132106	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385224783
68	NC_017375	TACAAA	2	12	134406	134417	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017375	ATTAGA	2	12	136284	136295	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385224788
70	NC_017375	GATTTT	2	12	138058	138069	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385224792
71	NC_017375	AAACTC	2	12	138175	138186	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385224792
72	NC_017375	TCAAAA	2	12	139670	139681	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385224793
73	NC_017375	GCGGTG	2	12	140369	140380	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385224794
74	NC_017375	ATAAAA	2	12	148475	148486	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017375	CATATT	2	12	149332	149343	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385224801
76	NC_017375	AGCGTT	2	12	150195	150206	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385224801
77	NC_017375	TTTTCT	2	12	155192	155203	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385224806
78	NC_017375	CGCTCG	2	12	160223	160234	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385224811
79	NC_017375	TAGGCA	2	12	162760	162771	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385224812
80	NC_017375	TTCTAT	2	12	165044	165055	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385224814
81	NC_017375	TTCTAT	2	12	166495	166506	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385224815
82	NC_017375	GTTCTA	2	12	166827	166838	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385224815
83	NC_017375	TGAATT	2	12	168680	168691	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385224816
84	NC_017375	TTTCAA	2	12	168839	168850	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385224816
85	NC_017375	AGCAAA	2	12	172189	172200	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385224818
86	NC_017375	GTTTTA	2	12	173200	173211	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017375	TGGTTT	2	12	173714	173725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385224821
88	NC_017375	TCATGA	2	12	174971	174982	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385224823
89	NC_017375	AAAAAT	2	12	181509	181520	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385224831
90	NC_017375	ATCCTT	2	12	182203	182214	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385224832
91	NC_017375	ATTCAA	2	12	182595	182606	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385224833
92	NC_017375	TTGGCT	2	12	182803	182814	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385224833
93	NC_017375	TAGCGA	2	12	183651	183662	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385224834
94	NC_017375	TATCGC	2	12	186756	186767	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385224836
95	NC_017375	TGGTTT	2	12	187867	187878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385224837
96	NC_017375	ATCGCT	2	12	188463	188474	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385224837
97	NC_017375	CCTAAA	2	12	190686	190697	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385224839
98	NC_017375	TTCTAT	2	12	191846	191857	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385224840
99	NC_017375	TTGTTT	2	12	194834	194845	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017375	CTTGGG	2	12	195495	195506	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385224846
101	NC_017375	GATTTT	2	12	200786	200797	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385224852
102	NC_017375	TTATAA	2	12	203784	203795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017375	GATGGC	2	12	204017	204028	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385224856
104	NC_017375	GATGGC	2	12	204125	204136	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385224856
105	NC_017375	CTTTCT	2	12	204269	204280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385224856
106	NC_017375	CCGCTC	2	12	206269	206280	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385224858
107	NC_017375	GCTCTC	2	12	208699	208710	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385224860
108	NC_017375	TAAAAA	2	12	209354	209365	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017375	TTCTAA	2	12	211079	211090	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385224863
110	NC_017375	TCAATA	2	12	212757	212768	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385224865
111	NC_017375	CATTTT	2	12	212866	212877	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385224865
112	NC_017375	ATCGTT	2	12	213179	213190	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385224865
113	NC_017375	AATTTC	2	12	213525	213536	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385224866
114	NC_017375	TAAAAT	2	12	214897	214908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385224869
115	NC_017375	TTCTTT	2	12	215307	215318	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385224869
116	NC_017375	TGAGAA	2	12	215836	215847	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385224870
117	NC_017375	ATTTTG	2	12	216707	216718	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385224872
118	NC_017375	CGCTTT	2	12	217185	217196	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385224872
119	NC_017375	GTTTAA	2	12	217969	217980	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385224873
120	NC_017375	CCGCTC	2	12	220636	220647	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385224876
121	NC_017375	GGTTTG	2	12	222243	222254	0 %	50 %	50 %	0 %	385224878
122	NC_017375	AGGCAT	2	12	224348	224359	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385224879
123	NC_017375	GCATTT	2	12	226061	226072	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385224881
124	NC_017375	TCAAAC	2	12	226628	226639	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385224882
125	NC_017375	ATAAAG	2	12	226795	226806	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385224882
126	NC_017375	ATTCTT	2	12	227119	227130	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017375	GGTATT	2	12	230515	230526	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385224885
128	NC_017375	TCTAAA	2	12	230745	230756	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385224885
129	NC_017375	TGGGCA	2	12	231814	231825	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385224886
130	NC_017375	TTCTAA	2	12	232293	232304	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385224887
131	NC_017375	ATTTTC	2	12	234238	234249	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385224887
132	NC_017375	TGGGGC	2	12	241649	241660	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385224897
133	NC_017375	ACTCAA	2	12	246312	246323	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017375	AAAGAT	2	12	250973	250984	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385224907
135	NC_017375	TATAAT	2	12	253074	253085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017375	ATTCTA	2	12	253973	253984	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385224909
137	NC_017375	CATAGC	2	12	255729	255740	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385224910
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140	NC_017375	TAATTA	2	12	260746	260757	50 %	50 %	0 %	0 %	385224914
141	NC_017375	AGGCTA	2	12	264260	264271	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385224918
142	NC_017375	ATTAAA	2	12	267080	267091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017375	AGTGAG	2	12	268375	268386	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017375	AATGCC	2	12	268916	268927	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385224922
145	NC_017375	GCTGTA	2	12	271489	271500	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385224924
146	NC_017375	GGGCCA	2	12	271562	271573	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385224924
147	NC_017375	GGTGAT	2	12	271717	271728	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385224924
148	NC_017375	TCAATA	2	12	272140	272151	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385224925
149	NC_017375	TATTTT	2	12	273183	273194	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385224925
150	NC_017375	GCTAGG	2	12	275256	275267	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385224927
151	NC_017375	TGGAGG	2	12	275804	275815	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385224928
152	NC_017375	GTTTTT	2	12	287248	287259	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385224941
153	NC_017375	ATTTTA	2	12	288708	288719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017375	ATTGTC	2	12	290413	290424	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385224944
155	NC_017375	TCCCGC	2	12	292598	292609	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385224946
156	NC_017375	TCCCGC	2	12	293411	293422	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385224946
157	NC_017375	CAAAGC	2	12	294878	294889	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_017375	TGAGCG	2	12	301259	301270	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385224954
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162	NC_017375	GATTTT	2	12	315845	315856	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385224969
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183	NC_017375	ATTGGA	2	12	354720	354731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385225002
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188	NC_017375	GATTTA	2	12	362656	362667	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
189	NC_017375	CCAAAA	2	12	364437	364448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385225014
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197	NC_017375	TTGCGC	2	12	373994	374005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385225026
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220	NC_017375	GTTAGC	2	12	411866	411877	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385225065
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225	NC_017375	ATAGCG	2	12	422556	422567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385225076
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227	NC_017375	GTTTAG	2	12	434862	434873	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385225091
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229	NC_017375	CAATAT	2	12	436297	436308	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385225093
230	NC_017375	TTGAAA	2	12	438233	438244	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385225095
231	NC_017375	GCGTTT	2	12	440523	440534	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385225098
232	NC_017375	GGTGAT	2	12	440699	440710	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385225098
233	NC_017375	CAAGAG	2	12	441924	441935	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385225100
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235	NC_017375	GCTTTT	2	12	447378	447389	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385225104
236	NC_017375	TGGTTA	2	12	448864	448875	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385225105
237	NC_017375	TGAAGT	2	12	449144	449155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385225105
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239	NC_017375	AAATTC	2	12	450761	450772	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385225106
240	NC_017375	AGCTCA	2	12	452475	452486	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385225107
241	NC_017375	TTTATC	2	12	454605	454616	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385225109
242	NC_017375	ATTGCG	2	12	455301	455312	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385225110
243	NC_017375	GAATGC	2	12	456132	456143	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385225111
244	NC_017375	AAATTA	2	12	462929	462940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385225119
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343	NC_017375	TGGAAG	2	12	656915	656926	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385225325
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350	NC_017375	TGGCTC	2	12	663913	663924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385225330
351	NC_017375	TTCCCA	2	12	666589	666600	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385225333
352	NC_017375	TAAAGA	2	12	668917	668928	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385225335
353	NC_017375	AGCCAT	2	12	673106	673117	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385225341
354	NC_017375	AGAAAA	2	12	676247	676258	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385225344
355	NC_017375	TATCGC	2	12	677892	677903	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385225346
356	NC_017375	TTTAAA	2	12	681150	681161	50 %	50 %	0 %	0 %	385225349
357	NC_017375	GAACAT	2	12	682107	682118	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385225350
358	NC_017375	GCATTG	2	12	683012	683023	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385225350
359	NC_017375	CATAGC	2	12	684385	684396	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385225352
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380	NC_017375	TTTCTT	2	12	707033	707044	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385225370
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385	NC_017375	TGCGTG	2	12	715310	715321	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385225379
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387	NC_017375	TTTCGT	2	12	721096	721107	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385225385
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403	NC_017375	GATAAG	2	12	751322	751333	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385225410
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430	NC_017375	AGCCTA	2	12	825590	825601	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385225476
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448	NC_017375	ATGGCT	2	12	852760	852771	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385225508
449	NC_017375	AGAAAA	2	12	859775	859786	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385225514
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457	NC_017375	AGTTTT	2	12	874372	874383	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385225530
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459	NC_017375	TTACAA	2	12	877446	877457	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
460	NC_017375	AGAAAA	2	12	877921	877932	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385225533
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463	NC_017375	TGATTT	2	12	887664	887675	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385225539
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