MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 83 chromosome

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017375	AAAAAG	2	12	5142	5153	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017375	AAACAC	2	12	18281	18292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017375	TTTCTT	2	12	22925	22936	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017375	AGATAA	2	12	73474	73485	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017375	AGAAAA	2	12	73537	73548	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017375	TACAAA	2	12	134406	134417	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017375	ATAAAA	2	12	148475	148486	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017375	GTTTTA	2	12	173200	173211	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017375	TTGTTT	2	12	194834	194845	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017375	TTATAA	2	12	203784	203795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017375	TAAAAA	2	12	209354	209365	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017375	ATTCTT	2	12	227119	227130	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017375	ACTCAA	2	12	246312	246323	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017375	TATAAT	2	12	253074	253085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017375	ATTAAA	2	12	267080	267091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017375	AGTGAG	2	12	268375	268386	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017375	ATTTTA	2	12	288708	288719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017375	CAAAGC	2	12	294878	294889	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017375	GATTTA	2	12	362656	362667	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017375	AAAATA	2	12	474185	474196	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017375	TAAAAA	2	12	487952	487963	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017375	ATTTGA	2	12	522534	522545	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017375	CAAATT	2	12	644280	644291	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017375	CGCCAA	2	12	656235	656246	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017375	AAGAAA	2	12	718050	718061	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017375	AAAAAT	3	18	725064	725081	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017375	AAGATT	2	12	751043	751054	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017375	ATTTTA	2	12	812051	812062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017375	TTAAAA	2	12	819139	819150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017375	TTTAAA	2	12	852267	852278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017375	TTACAA	2	12	877446	877457	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017375	TCCAAA	2	12	900813	900824	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017375	ATTAAA	2	12	914582	914593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017375	AAAAAG	2	12	937884	937895	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017375	TCGCGC	2	12	940177	940188	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017375	ATTATA	2	12	961473	961484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017375	ATTGAA	2	12	968879	968890	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017375	ATTTTT	2	12	993397	993408	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017375	TTTTAA	2	12	1082559	1082570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017375	ATTTGA	2	12	1107268	1107279	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017375	GCCATA	2	12	1163618	1163629	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017375	AACGCT	2	12	1163801	1163812	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017375	ATCCTT	2	12	1212474	1212485	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017375	TTGTAT	2	12	1214895	1214906	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017375	ACTTAA	2	12	1231917	1231928	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017375	AAACTT	2	12	1255476	1255487	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017375	AAAAAG	2	12	1271195	1271206	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017375	ATTTTT	2	12	1287629	1287640	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017375	TAAAAA	2	12	1315716	1315727	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017375	AGTTTT	2	12	1377785	1377796	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017375	AGCGGG	2	12	1391232	1391243	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017375	GTTTTA	2	12	1401328	1401339	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017375	TAAAAA	2	12	1402154	1402165	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017375	CTAAGT	2	12	1413486	1413497	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017375	ATAGGG	2	12	1415534	1415545	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017375	CTCTTT	2	12	1415557	1415568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017375	AAAATT	2	12	1452630	1452641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017375	TTTTTA	2	12	1513544	1513555	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017375	AAATTA	2	12	1550665	1550676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.