MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori 83 chromosome

Total Repeats: 1123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017375	TAAAA	2	10	1603	1612	80 %	20 %	0 %	0 %	385224645
2	NC_017375	GATTA	2	10	2250	2259	40 %	40 %	20 %	0 %	385224646
3	NC_017375	ATTAA	2	10	2927	2936	60 %	40 %	0 %	0 %	385224647
4	NC_017375	TTTTA	2	10	4915	4924	20 %	80 %	0 %	0 %	385224650
5	NC_017375	GTTGA	2	10	5843	5852	20 %	40 %	40 %	0 %	385224651
6	NC_017375	TTTGA	2	10	6221	6230	20 %	60 %	20 %	0 %	385224651
7	NC_017375	TTTCT	2	10	8382	8391	0 %	80 %	0 %	20 %	385224653
8	NC_017375	TTGAA	2	10	11883	11892	40 %	40 %	20 %	0 %	385224656
9	NC_017375	TTTTG	2	10	11899	11908	0 %	80 %	20 %	0 %	385224656
10	NC_017375	TGGTG	2	10	12734	12743	0 %	40 %	60 %	0 %	385224657
11	NC_017375	CAAAA	2	10	18596	18605	80 %	0 %	0 %	20 %	385224662
12	NC_017375	TGAAA	2	10	20940	20949	60 %	20 %	20 %	0 %	385224664
13	NC_017375	CCATG	2	10	23163	23172	20 %	20 %	20 %	40 %	385224667
14	NC_017375	CTCTT	2	10	23193	23202	0 %	60 %	0 %	40 %	385224667
15	NC_017375	AAATC	2	10	25816	25825	60 %	20 %	0 %	20 %	385224668
16	NC_017375	TTTAC	2	10	26049	26058	20 %	60 %	0 %	20 %	385224669
17	NC_017375	ATTTT	2	10	27505	27514	20 %	80 %	0 %	0 %	385224670
18	NC_017375	GATTT	2	10	28765	28774	20 %	60 %	20 %	0 %	385224670
19	NC_017375	ATTTG	2	10	29613	29622	20 %	60 %	20 %	0 %	385224671
20	NC_017375	TTTTA	2	10	32300	32309	20 %	80 %	0 %	0 %	385224675
21	NC_017375	GGCGT	2	10	32322	32331	0 %	20 %	60 %	20 %	385224675
22	NC_017375	AGGGC	2	10	33849	33858	20 %	0 %	60 %	20 %	385224677
23	NC_017375	ATTGA	2	10	34513	34522	40 %	40 %	20 %	0 %	385224677
24	NC_017375	TTTTA	2	10	34819	34828	20 %	80 %	0 %	0 %	385224678
25	NC_017375	GCGCT	2	10	35271	35280	0 %	20 %	40 %	40 %	385224678
26	NC_017375	ATCTT	2	10	35754	35763	20 %	60 %	0 %	20 %	385224679
27	NC_017375	TAAAA	2	10	36488	36497	80 %	20 %	0 %	0 %	385224679
28	NC_017375	AAAAT	2	10	36922	36931	80 %	20 %	0 %	0 %	385224679
29	NC_017375	GTCTT	2	10	42296	42305	0 %	60 %	20 %	20 %	385224684
30	NC_017375	ATTTC	2	10	42549	42558	20 %	60 %	0 %	20 %	385224684
31	NC_017375	ATTTA	2	10	42918	42927	40 %	60 %	0 %	0 %	385224685
32	NC_017375	TGAAA	2	10	43095	43104	60 %	20 %	20 %	0 %	385224685
33	NC_017375	ATGCG	2	10	43200	43209	20 %	20 %	40 %	20 %	385224685
34	NC_017375	TGGCT	2	10	44602	44611	0 %	40 %	40 %	20 %	385224686
35	NC_017375	TTTGT	2	10	47760	47769	0 %	80 %	20 %	0 %	385224688
36	NC_017375	CTTAT	2	10	54935	54944	20 %	60 %	0 %	20 %	385224695
37	NC_017375	GCCAA	2	10	54948	54957	40 %	0 %	20 %	40 %	385224695
38	NC_017375	GCAAG	2	10	55873	55882	40 %	0 %	40 %	20 %	385224696
39	NC_017375	AAAAC	2	10	56524	56533	80 %	0 %	0 %	20 %	385224697
40	NC_017375	AAATG	2	10	59984	59993	60 %	20 %	20 %	0 %	385224699
41	NC_017375	GCTTG	2	10	60814	60823	0 %	40 %	40 %	20 %	385224701
42	NC_017375	AAAGA	2	10	61643	61652	80 %	0 %	20 %	0 %	385224702
43	NC_017375	AAAAT	2	10	64574	64583	80 %	20 %	0 %	0 %	385224704
44	NC_017375	TCTTT	2	10	65201	65210	0 %	80 %	0 %	20 %	385224705
45	NC_017375	AGAAA	2	10	65481	65490	80 %	0 %	20 %	0 %	385224705
46	NC_017375	TGAAA	2	10	67771	67780	60 %	20 %	20 %	0 %	385224708
47	NC_017375	TCAAA	2	10	68025	68034	60 %	20 %	0 %	20 %	385224708
48	NC_017375	TAAAA	2	10	71064	71073	80 %	20 %	0 %	0 %	385224709
49	NC_017375	TCAAA	2	10	71780	71789	60 %	20 %	0 %	20 %	385224709
50	NC_017375	TATCC	2	10	75729	75738	20 %	40 %	0 %	40 %	385224714
51	NC_017375	ATTGG	2	10	78306	78315	20 %	40 %	40 %	0 %	385224720
52	NC_017375	CAATA	2	10	78526	78535	60 %	20 %	0 %	20 %	385224721
53	NC_017375	TCAAA	2	10	79974	79983	60 %	20 %	0 %	20 %	385224722
54	NC_017375	ATTTT	2	10	81234	81243	20 %	80 %	0 %	0 %	385224723
55	NC_017375	GATTA	2	10	81715	81724	40 %	40 %	20 %	0 %	385224724
56	NC_017375	AAAAG	2	10	82129	82138	80 %	0 %	20 %	0 %	385224724
57	NC_017375	TGCTT	2	10	83374	83383	0 %	60 %	20 %	20 %	385224725
58	NC_017375	CCCCT	2	10	84970	84979	0 %	20 %	0 %	80 %	385224727
59	NC_017375	TGCCT	2	10	85496	85505	0 %	40 %	20 %	40 %	385224727
60	NC_017375	GTTTT	2	10	85919	85928	0 %	80 %	20 %	0 %	385224728
61	NC_017375	TTGCT	2	10	87356	87365	0 %	60 %	20 %	20 %	385224729
62	NC_017375	TGCTC	2	10	88150	88159	0 %	40 %	20 %	40 %	385224730
63	NC_017375	AGCGT	2	10	90490	90499	20 %	20 %	40 %	20 %	385224732
64	NC_017375	ACAAA	2	10	90997	91006	80 %	0 %	0 %	20 %	385224733
65	NC_017375	CAAAT	2	10	92026	92035	60 %	20 %	0 %	20 %	385224735
66	NC_017375	AGAAA	2	10	94417	94426	80 %	0 %	20 %	0 %	385224740
67	NC_017375	ATAAA	2	10	94896	94905	80 %	20 %	0 %	0 %	385224740
68	NC_017375	GTAGG	2	10	94917	94926	20 %	20 %	60 %	0 %	385224740
69	NC_017375	TTCAT	2	10	99616	99625	20 %	60 %	0 %	20 %	385224745
70	NC_017375	TTGTA	2	10	100749	100758	20 %	60 %	20 %	0 %	385224747
71	NC_017375	TCACT	2	10	102498	102507	20 %	40 %	0 %	40 %	385224750
72	NC_017375	TTATT	2	10	104900	104909	20 %	80 %	0 %	0 %	385224751
73	NC_017375	TCCTT	2	10	104941	104950	0 %	60 %	0 %	40 %	385224751
74	NC_017375	TTTTG	2	10	105993	106002	0 %	80 %	20 %	0 %	385224754
75	NC_017375	GGTGG	2	10	108420	108429	0 %	20 %	80 %	0 %	385224758
76	NC_017375	TCAAT	2	10	111595	111604	40 %	40 %	0 %	20 %	385224762
77	NC_017375	CTTCT	2	10	112445	112454	0 %	60 %	0 %	40 %	385224763
78	NC_017375	TCCAA	2	10	112934	112943	40 %	20 %	0 %	40 %	385224764
79	NC_017375	CAAAA	2	10	113251	113260	80 %	0 %	0 %	20 %	385224764
80	NC_017375	TTTTG	2	10	116231	116240	0 %	80 %	20 %	0 %	385224767
81	NC_017375	ACGCC	2	10	116537	116546	20 %	0 %	20 %	60 %	385224767
82	NC_017375	AAAGC	2	10	117303	117312	60 %	0 %	20 %	20 %	385224768
83	NC_017375	CAAGC	2	10	120957	120966	40 %	0 %	20 %	40 %	385224773
84	NC_017375	CAAAC	2	10	121039	121048	60 %	0 %	0 %	40 %	385224773
85	NC_017375	ATCTT	2	10	125310	125319	20 %	60 %	0 %	20 %	385224776
86	NC_017375	TGGCT	2	10	125851	125860	0 %	40 %	40 %	20 %	385224776
87	NC_017375	ATGCC	2	10	126273	126282	20 %	20 %	20 %	40 %	385224777
88	NC_017375	TTGAT	2	10	127316	127325	20 %	60 %	20 %	0 %	385224780
89	NC_017375	GGCGT	2	10	129130	129139	0 %	20 %	60 %	20 %	385224782
90	NC_017375	TGTTT	2	10	132212	132221	0 %	80 %	20 %	0 %	385224783
91	NC_017375	ATAAA	2	10	132270	132279	80 %	20 %	0 %	0 %	385224783
92	NC_017375	CTTTC	2	10	132667	132676	0 %	60 %	0 %	40 %	385224784
93	NC_017375	TTTGC	2	10	133375	133384	0 %	60 %	20 %	20 %	385224785
94	NC_017375	TGATT	2	10	135630	135639	20 %	60 %	20 %	0 %	385224788
95	NC_017375	CGGCA	2	10	139636	139645	20 %	0 %	40 %	40 %	385224793
96	NC_017375	AATTT	2	10	141669	141678	40 %	60 %	0 %	0 %	385224795
97	NC_017375	ACGAT	2	10	142117	142126	40 %	20 %	20 %	20 %	385224796
98	NC_017375	TTTTC	2	10	142312	142321	0 %	80 %	0 %	20 %	385224796
99	NC_017375	AATTG	2	10	143959	143968	40 %	40 %	20 %	0 %	385224797
100	NC_017375	TCGTT	2	10	145777	145786	0 %	60 %	20 %	20 %	385224798
101	NC_017375	TCTTT	2	10	149085	149094	0 %	80 %	0 %	20 %	385224801
102	NC_017375	AAAGC	2	10	151865	151874	60 %	0 %	20 %	20 %	385224803
103	NC_017375	TTTTG	2	10	153316	153325	0 %	80 %	20 %	0 %	385224805
104	NC_017375	CAAAT	2	10	153712	153721	60 %	20 %	0 %	20 %	385224805
105	NC_017375	ACCCT	2	10	155141	155150	20 %	20 %	0 %	60 %	385224806
106	NC_017375	ATGCC	2	10	155273	155282	20 %	20 %	20 %	40 %	385224806
107	NC_017375	TGATT	2	10	157277	157286	20 %	60 %	20 %	0 %	385224808
108	NC_017375	CTAAA	2	10	157764	157773	60 %	20 %	0 %	20 %	385224810
109	NC_017375	GAATT	2	10	157913	157922	40 %	40 %	20 %	0 %	385224810
110	NC_017375	GGATC	2	10	161789	161798	20 %	20 %	40 %	20 %	385224812
111	NC_017375	AGCTC	2	10	161809	161818	20 %	20 %	20 %	40 %	385224812
112	NC_017375	AAGCC	2	10	163697	163706	40 %	0 %	20 %	40 %	385224813
113	NC_017375	GTTTG	2	10	165003	165012	0 %	60 %	40 %	0 %	385224814
114	NC_017375	GTTTG	2	10	166454	166463	0 %	60 %	40 %	0 %	385224815
115	NC_017375	TTGAT	2	10	166919	166928	20 %	60 %	20 %	0 %	385224815
116	NC_017375	CGCTG	2	10	168018	168027	0 %	20 %	40 %	40 %	385224816
117	NC_017375	TTTGA	2	10	168165	168174	20 %	60 %	20 %	0 %	385224816
118	NC_017375	GACTT	2	10	168699	168708	20 %	40 %	20 %	20 %	385224816
119	NC_017375	ATCTC	2	10	169450	169459	20 %	40 %	0 %	40 %	385224816
120	NC_017375	CGCTT	2	10	169608	169617	0 %	40 %	20 %	40 %	385224816
121	NC_017375	TGCGT	2	10	172000	172009	0 %	40 %	40 %	20 %	385224818
122	NC_017375	GAAAA	2	10	172161	172170	80 %	0 %	20 %	0 %	385224818
123	NC_017375	GAAAA	2	10	172479	172488	80 %	0 %	20 %	0 %	385224818
124	NC_017375	ATTTT	2	10	175443	175452	20 %	80 %	0 %	0 %	385224825
125	NC_017375	ATGTT	2	10	175525	175534	20 %	60 %	20 %	0 %	385224825
126	NC_017375	AAAAG	2	10	175937	175946	80 %	0 %	20 %	0 %	385224825
127	NC_017375	CGCTG	2	10	177564	177573	0 %	20 %	40 %	40 %	385224828
128	NC_017375	AAATC	2	10	178193	178202	60 %	20 %	0 %	20 %	385224828
129	NC_017375	AAAAT	2	10	179665	179674	80 %	20 %	0 %	0 %	385224829
130	NC_017375	TTTTC	2	10	182015	182024	0 %	80 %	0 %	20 %	385224832
131	NC_017375	GTAAA	2	10	182567	182576	60 %	20 %	20 %	0 %	385224833
132	NC_017375	TTCTT	2	10	183971	183980	0 %	80 %	0 %	20 %	385224834
133	NC_017375	TCTTT	2	10	184465	184474	0 %	80 %	0 %	20 %	385224835
134	NC_017375	TTTTG	2	10	185629	185638	0 %	80 %	20 %	0 %	385224836
135	NC_017375	GCGAT	2	10	186422	186431	20 %	20 %	40 %	20 %	385224836
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