MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 83 chromosome

Total Repeats: 238

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017375	AG	7	14	7283	7296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017375	CA	3	6	16646	16651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017375	TC	3	6	29409	29414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017375	TC	3	6	73330	73335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017375	GC	3	6	76222	76227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017375	AG	3	6	77954	77959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017375	CA	3	6	80127	80132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017375	AT	3	6	81569	81574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017375	AT	3	6	81645	81650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017375	TG	3	6	85722	85727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017375	GT	3	6	89402	89407	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017375	CA	3	6	89411	89416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017375	TG	3	6	89457	89462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017375	TA	3	6	89850	89855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017375	AG	3	6	113384	113389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017375	TA	6	12	119716	119727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017375	TC	3	6	121561	121566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017375	AG	3	6	126046	126051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017375	AG	3	6	126073	126078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017375	AG	3	6	134433	134438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017375	TA	3	6	137942	137947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017375	TC	3	6	138965	138970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017375	GT	3	6	140043	140048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017375	AG	3	6	148413	148418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017375	TA	3	6	165804	165809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017375	AG	3	6	175374	175379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017375	TA	3	6	175413	175418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017375	CT	3	6	176378	176383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017375	GC	3	6	179869	179874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017375	TG	3	6	181585	181590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017375	GA	3	6	181692	181697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017375	CA	3	6	204906	204911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017375	CA	3	6	205329	205334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017375	TC	3	6	207187	207192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017375	AC	3	6	216501	216506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017375	GA	3	6	222235	222240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017375	AG	3	6	227207	227212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017375	AG	3	6	227357	227362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017375	AG	3	6	227420	227425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017375	GC	3	6	227429	227434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017375	GC	3	6	250186	250191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017375	AT	3	6	253043	253048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017375	CT	3	6	268432	268437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017375	GT	3	6	272046	272051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017375	AT	3	6	304100	304105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017375	AG	3	6	341395	341400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017375	AG	3	6	371935	371940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017375	CT	3	6	380641	380646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017375	AG	3	6	380672	380677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017375	TC	4	8	382598	382605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017375	AC	3	6	398536	398541	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017375	AT	3	6	417431	417436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017375	AG	3	6	419115	419120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017375	AG	3	6	420577	420582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017375	GA	4	8	428741	428748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017375	GA	3	6	444976	444981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017375	AT	3	6	468897	468902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017375	TA	3	6	481718	481723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017375	GC	3	6	481810	481815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017375	AT	4	8	496155	496162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017375	CT	3	6	497726	497731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017375	AG	3	6	499451	499456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017375	GT	3	6	507971	507976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017375	GT	4	8	508049	508056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017375	AG	3	6	512659	512664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017375	CT	4	8	562602	562609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017375	AT	3	6	565545	565550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017375	TG	3	6	576794	576799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017375	GA	3	6	584225	584230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017375	GA	3	6	592037	592042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017375	GA	3	6	594704	594709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017375	GA	3	6	603429	603434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017375	GA	3	6	607871	607876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017375	CG	3	6	623557	623562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017375	TA	3	6	644377	644382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017375	TA	3	6	653297	653302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017375	CT	3	6	662891	662896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017375	TA	3	6	665585	665590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017375	GA	4	8	686401	686408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017375	CA	3	6	709240	709245	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017375	TA	3	6	727108	727113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017375	TA	3	6	727160	727165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017375	TG	3	6	728076	728081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017375	AT	3	6	730127	730132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017375	TG	3	6	730159	730164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017375	CA	3	6	735886	735891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017375	AG	3	6	752472	752477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017375	CT	4	8	769516	769523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017375	GA	3	6	783647	783652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017375	AT	3	6	812480	812485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017375	GA	3	6	814234	814239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017375	GT	3	6	842229	842234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017375	TA	3	6	843659	843664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017375	TG	3	6	847753	847758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017375	TC	4	8	848038	848045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017375	AG	3	6	854726	854731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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98	NC_017375	AG	3	6	860277	860282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017375	AG	3	6	870925	870930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017375	TC	3	6	871237	871242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017375	CA	3	6	872386	872391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017375	CT	3	6	873237	873242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017375	CT	3	6	873260	873265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017375	TC	4	8	874835	874842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017375	TG	3	6	888444	888449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017375	AT	3	6	888645	888650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_017375	TG	3	6	906695	906700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017375	TC	5	10	906756	906765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017375	CT	3	6	907245	907250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017375	CT	3	6	935346	935351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017375	AT	3	6	935405	935410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017375	TA	3	6	936271	936276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017375	AG	3	6	937709	937714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017375	GA	3	6	939073	939078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017375	TG	3	6	939168	939173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017375	GC	3	6	939307	939312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017375	CA	3	6	944787	944792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017375	TA	3	6	961597	961602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017375	CT	3	6	978678	978683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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122	NC_017375	GC	3	6	989701	989706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017375	AG	3	6	997823	997828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017375	AG	3	6	998351	998356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017375	AC	3	6	998544	998549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017375	CT	3	6	998759	998764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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131	NC_017375	TC	3	6	1013751	1013756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017375	AG	4	8	1016247	1016254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017375	AG	4	8	1016257	1016264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017375	CT	3	6	1028874	1028879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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136	NC_017375	CT	3	6	1035604	1035609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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141	NC_017375	AT	3	6	1037710	1037715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_017375	GA	3	6	1039591	1039596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017375	GT	3	6	1121354	1121359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017375	TG	3	6	1129355	1129360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.