MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori 2017 chromosome

Total Repeats: 677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017374	CCGCAG	2	12	1087	1098	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385223051
2	NC_017374	ATTATA	2	12	1839	1850	50 %	50 %	0 %	0 %	385223052
3	NC_017374	GAAACC	2	12	5646	5657	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385223059
4	NC_017374	ATTTGA	2	12	10857	10868	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385223062
5	NC_017374	AGAAAA	2	12	16585	16596	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385223068
6	NC_017374	AGCTTT	2	12	18286	18297	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385223069
7	NC_017374	GTTTGG	2	12	19192	19203	0 %	50 %	50 %	0 %	385223071
8	NC_017374	GAATGG	2	12	19984	19995	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385223071
9	NC_017374	GATAAA	2	12	20160	20171	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385223071
10	NC_017374	TATCAA	2	12	27960	27971	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385223077
11	NC_017374	ACTTTT	2	12	28261	28272	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385223077
12	NC_017374	AAGGCT	2	12	29847	29858	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385223078
13	NC_017374	GCGTGG	2	12	30649	30660	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385223080
14	NC_017374	TAATGA	2	12	30785	30796	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385223080
15	NC_017374	TTGAAT	2	12	31848	31859	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385223080
16	NC_017374	TAAGGA	2	12	32147	32158	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385223080
17	NC_017374	TAGGGG	2	12	33663	33674	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385223083
18	NC_017374	TTCTAC	2	12	35147	35158	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385223084
19	NC_017374	AAAGAA	2	12	36763	36774	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385223087
20	NC_017374	CAAAAT	2	12	39103	39114	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385223089
21	NC_017374	CACTAC	2	12	42512	42523	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385223093
22	NC_017374	CGCAAA	2	12	43498	43509	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385223095
23	NC_017374	TTTTCA	2	12	47266	47277	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385223098
24	NC_017374	GGCTAG	2	12	47740	47751	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385223099
25	NC_017374	CTTTTT	2	12	49849	49860	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385223101
26	NC_017374	CCACGC	2	12	55326	55337	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385223103
27	NC_017374	CTAAAG	2	12	56613	56624	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385223103
28	NC_017374	GATGTG	2	12	59776	59787	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385223108
29	NC_017374	AGCCAA	2	12	59854	59865	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385223108
30	NC_017374	CCAACA	2	12	61726	61737	50 %	0 %	0 %	50 %	385223110
31	NC_017374	TTTTGT	2	12	62064	62075	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385223111
32	NC_017374	AAAGAG	2	12	62343	62354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385223111
33	NC_017374	ACAGAA	2	12	63620	63631	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385223112
34	NC_017374	AGCGGG	2	12	65416	65427	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385223116
35	NC_017374	ACGCCC	2	12	73249	73260	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385223124
36	NC_017374	AAGGGC	2	12	75979	75990	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385223128
37	NC_017374	CGCTAA	2	12	76341	76352	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385223128
38	NC_017374	CGCTCA	2	12	76515	76526	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385223128
39	NC_017374	AGTGGC	2	12	77611	77622	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385223131
40	NC_017374	GTGAGC	2	12	77824	77835	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385223131
41	NC_017374	CAACGA	2	12	78170	78181	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385223131
42	NC_017374	GGGGGT	2	12	78949	78960	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	385223132
43	NC_017374	GGCATG	2	12	79691	79702	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385223133
44	NC_017374	ACACCG	2	12	80625	80636	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385223133
45	NC_017374	ATATTG	2	12	81504	81515	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385223135
46	NC_017374	AACAGG	2	12	89493	89504	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385223142
47	NC_017374	TTGTTT	2	12	89575	89586	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385223142
48	NC_017374	GGCTTT	2	12	90828	90839	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385223144
49	NC_017374	CAAGCA	2	12	93442	93453	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385223146
50	NC_017374	ATTAGA	2	12	93742	93753	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385223146
51	NC_017374	CAAGAT	2	12	94080	94091	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385223147
52	NC_017374	GATTTT	2	12	95503	95514	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385223150
53	NC_017374	AAACTC	2	12	95620	95631	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385223150
54	NC_017374	TCAAAA	2	12	96935	96946	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385223151
55	NC_017374	TATCGT	2	12	97514	97525	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385223152
56	NC_017374	GCGGTG	2	12	97633	97644	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385223152
57	NC_017374	TTAATT	2	12	98168	98179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385223152
58	NC_017374	AATATT	2	12	100717	100728	50 %	50 %	0 %	0 %	385223154
59	NC_017374	TTTTCT	2	12	113134	113145	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385223166
60	NC_017374	TTGTCT	2	12	116326	116337	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385223170
61	NC_017374	ATTGCC	2	12	117237	117248	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385223170
62	NC_017374	CGCTCG	2	12	118157	118168	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385223171
63	NC_017374	TAGGCA	2	12	120695	120706	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385223172
64	NC_017374	TGAATT	2	12	124450	124461	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385223175
65	NC_017374	TTTCAA	2	12	124609	124620	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385223175
66	NC_017374	TCGCTA	2	12	126210	126221	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385223178
67	NC_017374	AGCAAA	2	12	127952	127963	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385223179
68	NC_017374	TGGTTT	2	12	129476	129487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385223182
69	NC_017374	TCATGA	2	12	130815	130826	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385223184
70	NC_017374	AAAAAT	2	12	137328	137339	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385223190
71	NC_017374	TTGGCT	2	12	138616	138627	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385223192
72	NC_017374	TAGCGA	2	12	139464	139475	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385223193
73	NC_017374	ACGATT	2	12	141924	141935	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385223195
74	NC_017374	TTAGCG	2	12	142293	142304	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385223195
75	NC_017374	TATCGC	2	12	142505	142516	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385223195
76	NC_017374	TTTTAG	2	12	143557	143568	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385223196
77	NC_017374	ATCGCT	2	12	144150	144161	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385223196
78	NC_017374	TTCTAT	2	12	147533	147544	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385223199
79	NC_017374	TTGGGT	2	12	156490	156501	0 %	50 %	50 %	0 %	385223210
80	NC_017374	GATTTT	2	12	157003	157014	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385223211
81	NC_017374	CATGCT	2	12	157983	157994	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385223213
82	NC_017374	CTTTCT	2	12	160469	160480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385223215
83	NC_017374	CCGCTC	2	12	162361	162372	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385223218
84	NC_017374	ATCGTT	2	12	169182	169193	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385223225
85	NC_017374	AATTTC	2	12	169533	169544	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385223226
86	NC_017374	TAAAAT	2	12	171057	171068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385223227
87	NC_017374	TTCTTT	2	12	171467	171478	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385223227
88	NC_017374	ATTTTG	2	12	172865	172876	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385223229
89	NC_017374	CGCTTT	2	12	173343	173354	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385223229
90	NC_017374	ACTTAT	2	12	173440	173451	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385223229
91	NC_017374	GTTTAA	2	12	174127	174138	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385223230
92	NC_017374	TGGTTA	2	12	176790	176801	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385223233
93	NC_017374	CCGCTC	2	12	177372	177383	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385223234
94	NC_017374	GAGATA	2	12	178956	178967	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385223236
95	NC_017374	TGGTAG	2	12	179022	179033	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385223237
96	NC_017374	TAAAAA	2	12	179527	179538	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385223237
97	NC_017374	GAAAAA	2	12	181010	181021	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385223238
98	NC_017374	AGGCAT	2	12	181099	181110	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385223238
99	NC_017374	GCATTT	2	12	182812	182823	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385223240
100	NC_017374	GGGCGA	2	12	182851	182862	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385223240
101	NC_017374	ATAAAG	2	12	183525	183536	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385223241
102	NC_017374	ATAAAG	2	12	183543	183554	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385223241
103	NC_017374	TTAAAG	2	12	186419	186430	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385223244
104	NC_017374	GGTATT	2	12	187321	187332	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385223245
105	NC_017374	TCTAAA	2	12	187551	187562	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385223245
106	NC_017374	TGGGCA	2	12	188615	188626	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385223246
107	NC_017374	ATTTTC	2	12	191039	191050	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385223247
108	NC_017374	TCGCTT	2	12	195088	195099	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385223252
109	NC_017374	TGGGGC	2	12	198441	198452	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385223257
110	NC_017374	AAATCC	2	12	200271	200282	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385223259
111	NC_017374	CTGTAT	2	12	202214	202225	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385223260
112	NC_017374	TTGTTT	2	12	202747	202758	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385223260
113	NC_017374	AATTTT	2	12	202934	202945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385223260
114	NC_017374	TCTTTG	2	12	204838	204849	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385223262
115	NC_017374	TATAAT	2	12	210237	210248	50 %	50 %	0 %	0 %	385223267
116	NC_017374	CATAGC	2	12	212673	212684	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385223269
117	NC_017374	GTTTTG	2	12	213178	213189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385223269
118	NC_017374	TAATTA	2	12	217697	217708	50 %	50 %	0 %	0 %	385223273
119	NC_017374	ACTTTA	2	12	217750	217761	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385223274
120	NC_017374	CCCTAA	2	12	225469	225480	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385223283
121	NC_017374	AATGCC	2	12	225674	225685	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385223284
122	NC_017374	GGTGAT	2	12	228366	228377	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385223287
123	NC_017374	TCAATA	2	12	228791	228802	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385223288
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125	NC_017374	GGCTAG	2	12	231898	231909	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385223290
126	NC_017374	TGGTGA	2	12	232161	232172	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385223291
127	NC_017374	TGGGGG	2	12	232447	232458	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	385223291
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234	NC_017374	ACTTTA	2	12	458571	458582	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385223519
235	NC_017374	TATATG	2	12	463307	463318	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385223527
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237	NC_017374	TGGTAT	2	12	464194	464205	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385223527
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332	NC_017374	ACCATT	2	12	670969	670980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385223725
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334	NC_017374	TGCGTG	2	12	676016	676027	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385223730
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338	NC_017374	TTGAAT	2	12	687051	687062	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385223738
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342	NC_017374	AAGAAA	2	12	705334	705345	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385223754
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345	NC_017374	CCGCTC	2	12	707304	707315	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385223755
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456	NC_017374	AATTCA	2	12	1011749	1011760	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385224075
457	NC_017374	CTTTTT	2	12	1013065	1013076	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385224076
458	NC_017374	TTAGCG	2	12	1013196	1013207	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385224076
459	NC_017374	AAAGCC	2	12	1015750	1015761	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385224079
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461	NC_017374	GCTTAG	2	12	1020408	1020419	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385224084
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