MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori 2017 chromosome

Total Repeats: 1056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017374	GATTA	2	10	2292	2301	40 %	40 %	20 %	0 %	385223052
2	NC_017374	TTTTA	2	10	5383	5392	20 %	80 %	0 %	0 %	385223058
3	NC_017374	TTTCT	2	10	6310	6319	0 %	80 %	0 %	20 %	385223059
4	NC_017374	AATTT	2	10	7149	7158	40 %	60 %	0 %	0 %	385223059
5	NC_017374	AAAGG	2	10	8784	8793	60 %	0 %	40 %	0 %	385223061
6	NC_017374	TGGTG	2	10	10678	10687	0 %	40 %	60 %	0 %	385223062
7	NC_017374	CTGTA	2	10	21185	21194	20 %	40 %	20 %	20 %	385223072
8	NC_017374	CCATG	2	10	21255	21264	20 %	20 %	20 %	40 %	385223072
9	NC_017374	CTCTT	2	10	21285	21294	0 %	60 %	0 %	40 %	385223072
10	NC_017374	TTGAT	2	10	22768	22777	20 %	60 %	20 %	0 %	385223072
11	NC_017374	CAAGC	2	10	25980	25989	40 %	0 %	20 %	40 %	385223075
12	NC_017374	TAGCG	2	10	27570	27579	20 %	20 %	40 %	20 %	385223076
13	NC_017374	TGATT	2	10	29927	29936	20 %	60 %	20 %	0 %	385223078
14	NC_017374	GTGGG	2	10	31810	31819	0 %	20 %	80 %	0 %	385223080
15	NC_017374	ATCAA	2	10	33942	33951	60 %	20 %	0 %	20 %	385223083
16	NC_017374	TTTTG	2	10	36438	36447	0 %	80 %	20 %	0 %	385223087
17	NC_017374	TGAGT	2	10	38458	38467	20 %	40 %	40 %	0 %	385223089
18	NC_017374	CAAAA	2	10	38561	38570	80 %	0 %	0 %	20 %	385223089
19	NC_017374	AAGCC	2	10	38843	38852	40 %	0 %	20 %	40 %	385223089
20	NC_017374	CAAAC	2	10	39484	39493	60 %	0 %	0 %	40 %	385223089
21	NC_017374	AGAAA	2	10	40169	40178	80 %	0 %	20 %	0 %	385223090
22	NC_017374	TCGCT	2	10	41992	42001	0 %	40 %	20 %	40 %	385223092
23	NC_017374	TAAAA	2	10	43433	43442	80 %	20 %	0 %	0 %	385223095
24	NC_017374	GCGAT	2	10	43964	43973	20 %	20 %	40 %	20 %	385223096
25	NC_017374	GCTCC	2	10	44766	44775	0 %	20 %	20 %	60 %	385223096
26	NC_017374	ATGAA	2	10	44948	44957	60 %	20 %	20 %	0 %	385223096
27	NC_017374	TCGCA	2	10	45303	45312	20 %	20 %	20 %	40 %	385223096
28	NC_017374	CAATA	2	10	46871	46880	60 %	20 %	0 %	20 %	385223097
29	NC_017374	AGGCT	2	10	47183	47192	20 %	20 %	40 %	20 %	385223098
30	NC_017374	TGCCT	2	10	47558	47567	0 %	40 %	20 %	40 %	385223098
31	NC_017374	GATTG	2	10	48042	48051	20 %	40 %	40 %	0 %	385223099
32	NC_017374	GCTTT	2	10	48098	48107	0 %	60 %	20 %	20 %	385223099
33	NC_017374	AAATA	2	10	49344	49353	80 %	20 %	0 %	0 %	385223100
34	NC_017374	ATATT	2	10	49510	49519	40 %	60 %	0 %	0 %	385223100
35	NC_017374	CCAAA	2	10	49677	49686	60 %	0 %	0 %	40 %	385223101
36	NC_017374	TAAAA	2	10	51728	51737	80 %	20 %	0 %	0 %	385223101
37	NC_017374	ATCAA	2	10	51759	51768	60 %	20 %	0 %	20 %	385223101
38	NC_017374	TGAAA	2	10	52490	52499	60 %	20 %	20 %	0 %	385223102
39	NC_017374	TCAAA	2	10	52744	52753	60 %	20 %	0 %	20 %	385223102
40	NC_017374	TCGTT	2	10	53554	53563	0 %	60 %	20 %	20 %	385223102
41	NC_017374	TAAAA	2	10	55783	55792	80 %	20 %	0 %	0 %	385223103
42	NC_017374	TCAAA	2	10	56499	56508	60 %	20 %	0 %	20 %	385223103
43	NC_017374	GGTGG	2	10	65337	65346	0 %	20 %	80 %	0 %	385223116
44	NC_017374	CTTGG	2	10	69334	69343	0 %	40 %	40 %	20 %	385223120
45	NC_017374	TGCCT	2	10	69465	69474	0 %	40 %	20 %	40 %	385223120
46	NC_017374	TCCAA	2	10	69877	69886	40 %	20 %	0 %	40 %	385223121
47	NC_017374	TTTTG	2	10	73205	73214	0 %	80 %	20 %	0 %	385223124
48	NC_017374	ACGCC	2	10	73511	73520	20 %	0 %	20 %	60 %	385223124
49	NC_017374	AAAGC	2	10	74277	74286	60 %	0 %	20 %	20 %	385223125
50	NC_017374	TTTTG	2	10	79019	79028	0 %	80 %	20 %	0 %	385223132
51	NC_017374	GATTT	2	10	79030	79039	20 %	60 %	20 %	0 %	385223132
52	NC_017374	TTTTC	2	10	82496	82505	0 %	80 %	0 %	20 %	385223136
53	NC_017374	CCATA	2	10	82824	82833	40 %	20 %	0 %	40 %	385223136
54	NC_017374	TGGCT	2	10	83190	83199	0 %	40 %	40 %	20 %	385223136
55	NC_017374	ATGCC	2	10	83632	83641	20 %	20 %	20 %	40 %	385223137
56	NC_017374	TTGAT	2	10	84718	84727	20 %	60 %	20 %	0 %	385223139
57	NC_017374	GGCGT	2	10	86532	86541	0 %	20 %	60 %	20 %	385223141
58	NC_017374	CTTTC	2	10	90124	90133	0 %	60 %	0 %	40 %	385223143
59	NC_017374	CGAGA	2	10	92144	92153	40 %	0 %	40 %	20 %	385223145
60	NC_017374	TGATT	2	10	93088	93097	20 %	60 %	20 %	0 %	385223146
61	NC_017374	GGCTT	2	10	94412	94421	0 %	40 %	40 %	20 %	385223148
62	NC_017374	ACGAT	2	10	99371	99380	40 %	20 %	20 %	20 %	385223154
63	NC_017374	TTTTC	2	10	99566	99575	0 %	80 %	0 %	20 %	385223154
64	NC_017374	AATTG	2	10	101099	101108	40 %	40 %	20 %	0 %	385223155
65	NC_017374	TCGTT	2	10	103001	103010	0 %	60 %	20 %	20 %	385223156
66	NC_017374	GTGGG	2	10	103323	103332	0 %	20 %	80 %	0 %	385223157
67	NC_017374	TTAGA	2	10	104014	104023	40 %	40 %	20 %	0 %	385223158
68	NC_017374	CAAGC	2	10	105118	105127	40 %	0 %	20 %	40 %	385223159
69	NC_017374	AAAGC	2	10	109098	109107	60 %	0 %	20 %	20 %	385223162
70	NC_017374	CAAAT	2	10	111655	111664	60 %	20 %	0 %	20 %	385223165
71	NC_017374	CGTTT	2	10	112288	112297	0 %	60 %	20 %	20 %	385223165
72	NC_017374	ACCCT	2	10	113083	113092	20 %	20 %	0 %	60 %	385223166
73	NC_017374	ATGCC	2	10	113215	113224	20 %	20 %	20 %	40 %	385223166
74	NC_017374	TGATT	2	10	115210	115219	20 %	60 %	20 %	0 %	385223168
75	NC_017374	GATCG	2	10	119725	119734	20 %	20 %	40 %	20 %	385223172
76	NC_017374	AGCTC	2	10	119744	119753	20 %	20 %	20 %	40 %	385223172
77	NC_017374	AAGCC	2	10	121632	121641	40 %	0 %	20 %	40 %	385223173
78	NC_017374	TTGAT	2	10	122697	122706	20 %	60 %	20 %	0 %	385223174
79	NC_017374	TTTGA	2	10	123935	123944	20 %	60 %	20 %	0 %	385223175
80	NC_017374	ATCTC	2	10	125220	125229	20 %	40 %	0 %	40 %	385223175
81	NC_017374	TTTGT	2	10	125730	125739	0 %	80 %	20 %	0 %	385223176
82	NC_017374	TGCGT	2	10	127763	127772	0 %	40 %	40 %	20 %	385223179
83	NC_017374	ATTTT	2	10	131291	131300	20 %	80 %	0 %	0 %	385223185
84	NC_017374	ATGTT	2	10	131373	131382	20 %	60 %	20 %	0 %	385223186
85	NC_017374	AAAAG	2	10	131785	131794	80 %	0 %	20 %	0 %	385223186
86	NC_017374	AAATC	2	10	133800	133809	60 %	20 %	0 %	20 %	385223187
87	NC_017374	AAAAT	2	10	135272	135281	80 %	20 %	0 %	0 %	385223188
88	NC_017374	TTTTC	2	10	137828	137837	0 %	80 %	0 %	20 %	385223191
89	NC_017374	TTCTT	2	10	139784	139793	0 %	80 %	0 %	20 %	385223193
90	NC_017374	TCTTT	2	10	140278	140287	0 %	80 %	0 %	20 %	385223194
91	NC_017374	GTTTT	2	10	141440	141449	0 %	80 %	20 %	0 %	385223195
92	NC_017374	AATTC	2	10	142012	142021	40 %	40 %	0 %	20 %	385223195
93	NC_017374	GCGAT	2	10	142171	142180	20 %	20 %	40 %	20 %	385223195
94	NC_017374	GCTTG	2	10	142427	142436	0 %	40 %	40 %	20 %	385223195
95	NC_017374	TTTTG	2	10	143079	143088	0 %	80 %	20 %	0 %	385223196
96	NC_017374	ACGCC	2	10	148378	148387	20 %	0 %	20 %	60 %	385223199
97	NC_017374	GCGTT	2	10	150641	150650	0 %	40 %	40 %	20 %	385223204
98	NC_017374	ATTTG	2	10	151618	151627	20 %	60 %	20 %	0 %	385223205
99	NC_017374	GGATT	2	10	154200	154209	20 %	40 %	40 %	0 %	385223208
100	NC_017374	AGATT	2	10	156659	156668	40 %	40 %	20 %	0 %	385223210
101	NC_017374	AAGCC	2	10	157996	158005	40 %	0 %	20 %	40 %	385223213
102	NC_017374	TGGCG	2	10	158670	158679	0 %	20 %	60 %	20 %	385223213
103	NC_017374	GTTTT	2	10	159752	159761	0 %	80 %	20 %	0 %	385223214
104	NC_017374	ATTTT	2	10	160037	160046	20 %	80 %	0 %	0 %	385223215
105	NC_017374	ATTCA	2	10	161669	161678	40 %	40 %	0 %	20 %	385223217
106	NC_017374	CACTT	2	10	161873	161882	20 %	40 %	0 %	40 %	385223217
107	NC_017374	ATCTT	2	10	165068	165077	20 %	60 %	0 %	20 %	385223220
108	NC_017374	TTTAA	2	10	169735	169744	40 %	60 %	0 %	0 %	385223226
109	NC_017374	CCGCA	2	10	172923	172932	20 %	0 %	20 %	60 %	385223229
110	NC_017374	TGGGG	2	10	173632	173641	0 %	20 %	80 %	0 %	385223230
111	NC_017374	ATTTG	2	10	174409	174418	20 %	60 %	20 %	0 %	385223230
112	NC_017374	AATTG	2	10	174565	174574	40 %	40 %	20 %	0 %	385223231
113	NC_017374	AAATG	2	10	176158	176167	60 %	20 %	20 %	0 %	385223233
114	NC_017374	TGTAA	2	10	176948	176957	40 %	40 %	20 %	0 %	385223234
115	NC_017374	AAAAT	2	10	177728	177737	80 %	20 %	0 %	0 %	385223235
116	NC_017374	ATAAA	2	10	178444	178453	80 %	20 %	0 %	0 %	385223235
117	NC_017374	AAAAG	2	10	179599	179608	80 %	0 %	20 %	0 %	385223237
118	NC_017374	GCATT	2	10	184296	184305	20 %	40 %	20 %	20 %	385223242
119	NC_017374	AGAGG	2	10	185339	185348	40 %	0 %	60 %	0 %	385223243
120	NC_017374	TTCAA	2	10	187119	187128	40 %	40 %	0 %	20 %	385223245
121	NC_017374	TCATT	2	10	192720	192729	20 %	60 %	0 %	20 %	385223249
122	NC_017374	TCATG	2	10	193495	193504	20 %	40 %	20 %	20 %	385223250
123	NC_017374	CTATT	2	10	193605	193614	20 %	60 %	0 %	20 %	385223251
124	NC_017374	TTTTC	2	10	194666	194675	0 %	80 %	0 %	20 %	385223252
125	NC_017374	TATTT	2	10	198426	198435	20 %	80 %	0 %	0 %	385223257
126	NC_017374	TTTCA	2	10	199089	199098	20 %	60 %	0 %	20 %	385223258
127	NC_017374	CTTTT	2	10	200084	200093	0 %	80 %	0 %	20 %	385223259
128	NC_017374	TGGGG	2	10	206177	206186	0 %	20 %	80 %	0 %	385223264
129	NC_017374	GATCA	2	10	208083	208092	40 %	20 %	20 %	20 %	385223265
130	NC_017374	ATTCT	2	10	208610	208619	20 %	60 %	0 %	20 %	385223265
131	NC_017374	GCAAA	2	10	211567	211576	60 %	0 %	20 %	20 %	385223268
132	NC_017374	TGCTT	2	10	211606	211615	0 %	60 %	20 %	20 %	385223268
133	NC_017374	CTAAG	2	10	211947	211956	40 %	20 %	20 %	20 %	385223269
134	NC_017374	CCACC	2	10	215287	215296	20 %	0 %	0 %	80 %	385223270
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