MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 2017 chromosome

Total Repeats: 471

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017374	GTTT	2	8	4967	4974	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017374	GTTT	2	8	5350	5357	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017374	ATAA	2	8	7572	7579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017374	TATT	2	8	7771	7778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017374	ATTG	2	8	9778	9785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017374	GCAA	2	8	9969	9976	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017374	TGCT	2	8	10173	10180	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017374	GGCC	2	8	10436	10443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017374	TATT	2	8	10551	10558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017374	TTAA	2	8	11603	11610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017374	AATC	2	8	20662	20669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017374	TTTA	2	8	20927	20934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017374	TTTG	2	8	20991	20998	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017374	TAAG	2	8	23280	23287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017374	GAAT	2	8	26766	26773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017374	TGGC	2	8	26988	26995	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017374	GGTT	2	8	29653	29660	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017374	GCTT	2	8	42105	42112	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017374	CTGT	2	8	42219	42226	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017374	TAGC	2	8	48377	48384	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017374	TTTA	2	8	57251	57258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017374	ACTG	2	8	58247	58254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017374	TTTA	2	8	73176	73183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017374	TAGA	2	8	75038	75045	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017374	TTTC	2	8	78912	78919	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017374	TTTG	2	8	84403	84410	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017374	TATT	2	8	84583	84590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017374	TCAA	2	8	89719	89726	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017374	AAAC	2	8	89903	89910	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017374	ATTT	2	8	91644	91651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017374	GGTG	2	8	91683	91690	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017374	TCCC	2	8	91753	91760	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_017374	TTCA	2	8	97268	97275	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017374	TTTA	2	8	97295	97302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017374	GATC	2	8	98902	98909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017374	ATCA	2	8	105514	105521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017374	CCAT	2	8	110540	110547	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017374	GCTT	2	8	110629	110636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017374	AAGC	2	8	111097	111104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017374	CGCT	2	8	111121	111128	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017374	CTTT	2	8	113022	113029	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017374	AAAT	2	8	113032	113039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017374	ATTT	2	8	114563	114570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017374	TCAT	2	8	119258	119265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017374	GTTA	2	8	122930	122937	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017374	GTTA	2	8	125673	125680	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017374	AAAG	2	8	125851	125858	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017374	AAAG	2	8	128579	128586	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017374	ATTT	2	8	129040	129047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017374	AAAG	2	8	129073	129080	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017374	GAAG	2	8	129130	129137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017374	GTCA	2	8	130136	130143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017374	CTAT	2	8	131006	131013	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017374	CTTT	2	8	132178	132185	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017374	CAAT	2	8	132454	132461	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017374	TAAA	2	8	132604	132611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017374	ATCT	2	8	137137	137144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017374	TAAG	2	8	141035	141042	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017374	ACAA	2	8	151961	151968	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017374	ATTT	2	8	159906	159913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017374	CCCT	2	8	161174	161181	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_017374	AAAT	2	8	172329	172336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017374	ATAC	2	8	172373	172380	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017374	TCAA	2	8	175497	175504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017374	TCAA	2	8	175802	175809	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017374	GATT	2	8	178825	178832	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017374	CATT	2	8	184055	184062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017374	TTTG	2	8	184074	184081	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017374	TTGC	2	8	184122	184129	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017374	TCCT	2	8	185911	185918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017374	TTCA	2	8	185945	185952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017374	TGCA	2	8	185965	185972	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017374	TAAG	2	8	196308	196315	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017374	CAAC	2	8	199676	199683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017374	AAAC	2	8	199877	199884	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017374	GTTT	2	8	210399	210406	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017374	TTGA	2	8	210414	210421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017374	TTGC	2	8	217362	217369	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017374	ATCA	2	8	218566	218573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017374	ACAA	2	8	218622	218629	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017374	TATT	2	8	219297	219304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017374	ATTT	2	8	225270	225277	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017374	GAAA	2	8	227390	227397	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017374	TTTA	2	8	230301	230308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017374	ATCT	2	8	234729	234736	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017374	ATTT	2	8	245611	245618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017374	GAAC	2	8	247294	247301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017374	ACCC	2	8	247516	247523	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_017374	CAAG	2	8	248052	248059	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017374	TAAT	2	8	251611	251618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017374	ATCA	2	8	251650	251657	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017374	TACC	2	8	251892	251899	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017374	GCCA	2	8	260977	260984	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017374	ATTT	2	8	268438	268445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017374	ATTG	2	8	279061	279068	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017374	CATT	2	8	301200	301207	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017374	TTAA	2	8	305975	305982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017374	TCAG	2	8	313661	313668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017374	TTTA	2	8	322499	322506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017374	GACA	2	8	322563	322570	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017374	GCTT	2	8	322900	322907	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017374	TTGG	2	8	325962	325969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017374	GGTT	2	8	328231	328238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017374	AAGT	2	8	329573	329580	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017374	ACTT	2	8	329616	329623	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017374	AAAT	2	8	334378	334385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017374	TTTA	2	8	339162	339169	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017374	TGAA	2	8	343552	343559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017374	GCGG	2	8	355149	355156	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017374	TAAA	2	8	365402	365409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017374	TTAT	2	8	369911	369918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017374	TCAG	2	8	370476	370483	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017374	GTTT	2	8	382706	382713	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017374	TTTC	2	8	387049	387056	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017374	GAAA	2	8	388997	389004	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017374	AACA	2	8	389010	389017	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017374	CAAA	2	8	400948	400955	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017374	CCAA	2	8	401066	401073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017374	AAAT	2	8	402144	402151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017374	CAAT	2	8	402534	402541	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017374	AAAT	2	8	407896	407903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017374	AAGG	2	8	415236	415243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017374	TCAA	2	8	416857	416864	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017374	TCAA	2	8	419390	419397	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017374	CAAT	2	8	420768	420775	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017374	ACCC	2	8	424239	424246	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
127	NC_017374	TTTG	2	8	434694	434701	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017374	CACC	2	8	434785	434792	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
129	NC_017374	GTGG	2	8	435057	435064	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017374	TCTT	2	8	435281	435288	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017374	AATC	2	8	445201	445208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017374	AAAC	2	8	448990	448997	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017374	CAAC	2	8	461607	461614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017374	AGCG	2	8	466138	466145	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017374	ATTG	2	8	466461	466468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017374	AAAT	2	8	467713	467720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017374	CTTA	2	8	472124	472131	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017374	GAAT	2	8	481424	481431	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017374	TTGA	2	8	481587	481594	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017374	CTAA	2	8	487094	487101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017374	TTAG	2	8	487118	487125	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017374	TCAA	2	8	487279	487286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017374	CATT	2	8	487845	487852	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017374	TTTA	2	8	487899	487906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017374	ATTT	2	8	488065	488072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017374	TGAT	2	8	489713	489720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017374	TTAC	2	8	491931	491938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017374	CTAG	2	8	497156	497163	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017374	AACT	2	8	500563	500570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017374	ATAA	2	8	509602	509609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_017374	TTAA	2	8	1547531	1547538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.