MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica7 plasmid unnamed

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017373	ACAA	2	8	1115	1122	75 %	0 %	0 %	25 %	385221475
2	NC_017373	CAAC	2	8	1319	1326	50 %	0 %	0 %	50 %	385221475
3	NC_017373	AACA	2	8	2211	2218	75 %	0 %	0 %	25 %	385221476
4	NC_017373	AAAG	2	8	2472	2479	75 %	0 %	25 %	0 %	385221477
5	NC_017373	CAAA	2	8	3131	3138	75 %	0 %	0 %	25 %	385221477
6	NC_017373	ACAA	2	8	3400	3407	75 %	0 %	0 %	25 %	385221477
7	NC_017373	AGAA	2	8	3943	3950	75 %	0 %	25 %	0 %	385221478
8	NC_017373	AGAA	2	8	4044	4051	75 %	0 %	25 %	0 %	385221478
9	NC_017373	AGAA	2	8	4257	4264	75 %	0 %	25 %	0 %	385221478
10	NC_017373	TACA	2	8	4381	4388	50 %	25 %	0 %	25 %	385221479
11	NC_017373	ACAA	2	8	4589	4596	75 %	0 %	0 %	25 %	385221479
12	NC_017373	AATC	2	8	4614	4621	50 %	25 %	0 %	25 %	385221479
13	NC_017373	CCTG	2	8	4959	4966	0 %	25 %	25 %	50 %	385221480
14	NC_017373	CATG	2	8	5265	5272	25 %	25 %	25 %	25 %	385221480
15	NC_017373	GAAA	2	8	5367	5374	75 %	0 %	25 %	0 %	385221480
16	NC_017373	GAAA	2	8	5491	5498	75 %	0 %	25 %	0 %	385221481
17	NC_017373	ATCA	2	8	5671	5678	50 %	25 %	0 %	25 %	385221481
18	NC_017373	CTTG	2	8	5697	5704	0 %	50 %	25 %	25 %	385221481
19	NC_017373	TATG	2	8	6509	6516	25 %	50 %	25 %	0 %	385221482
20	NC_017373	TTTG	2	8	6715	6722	0 %	75 %	25 %	0 %	385221482
21	NC_017373	GTAA	2	8	6939	6946	50 %	25 %	25 %	0 %	385221482
22	NC_017373	TATT	2	8	7243	7250	25 %	75 %	0 %	0 %	385221482
23	NC_017373	TCTT	2	8	8819	8826	0 %	75 %	0 %	25 %	385221483
24	NC_017373	TACA	2	8	10135	10142	50 %	25 %	0 %	25 %	385221486
25	NC_017373	TTAG	2	8	10280	10287	25 %	50 %	25 %	0 %	385221486
26	NC_017373	ATAG	2	8	11407	11414	50 %	25 %	25 %	0 %	385221487
27	NC_017373	ATGC	2	8	11465	11472	25 %	25 %	25 %	25 %	385221487
28	NC_017373	ATAA	2	8	12447	12454	75 %	25 %	0 %	0 %	385221488
29	NC_017373	CAAT	2	8	12532	12539	50 %	25 %	0 %	25 %	385221488
30	NC_017373	ACTG	2	8	12890	12897	25 %	25 %	25 %	25 %	385221488
31	NC_017373	CTCA	2	8	12950	12957	25 %	25 %	0 %	50 %	385221488
32	NC_017373	TTGC	2	8	13314	13321	0 %	50 %	25 %	25 %	385221489
33	NC_017373	ATTT	2	8	13403	13410	25 %	75 %	0 %	0 %	385221489
34	NC_017373	AAAT	2	8	13542	13549	75 %	25 %	0 %	0 %	385221489
35	NC_017373	CAAC	2	8	13702	13709	50 %	0 %	0 %	50 %	385221489
36	NC_017373	ATAA	2	8	13954	13961	75 %	25 %	0 %	0 %	385221489
37	NC_017373	GAAC	2	8	14005	14012	50 %	0 %	25 %	25 %	385221489
38	NC_017373	AATT	2	8	14568	14575	50 %	50 %	0 %	0 %	385221490
39	NC_017373	TCTA	2	8	14859	14866	25 %	50 %	0 %	25 %	385221491
40	NC_017373	TTTA	2	8	14923	14930	25 %	75 %	0 %	0 %	385221491
41	NC_017373	CAAA	2	8	15123	15130	75 %	0 %	0 %	25 %	385221491
42	NC_017373	TACC	2	8	15406	15413	25 %	25 %	0 %	50 %	385221491
43	NC_017373	CTTG	2	8	16012	16019	0 %	50 %	25 %	25 %	385221492
44	NC_017373	CGCT	2	8	16146	16153	0 %	25 %	25 %	50 %	385221492
45	NC_017373	ACTC	2	8	16295	16302	25 %	25 %	0 %	50 %	385221492
46	NC_017373	GATT	2	8	16371	16378	25 %	50 %	25 %	0 %	385221492
47	NC_017373	AAAT	2	8	16484	16491	75 %	25 %	0 %	0 %	385221492
48	NC_017373	ACCC	2	8	16526	16533	25 %	0 %	0 %	75 %	385221492
49	NC_017373	GGTC	2	8	16550	16557	0 %	25 %	50 %	25 %	385221492
50	NC_017373	TTAT	2	8	16884	16891	25 %	75 %	0 %	0 %	385221492
51	NC_017373	TAAC	2	8	17023	17030	50 %	25 %	0 %	25 %	385221492
52	NC_017373	ATTT	2	8	17513	17520	25 %	75 %	0 %	0 %	385221493
53	NC_017373	TCTA	2	8	17656	17663	25 %	50 %	0 %	25 %	385221493
54	NC_017373	ACTT	2	8	17880	17887	25 %	50 %	0 %	25 %	385221493
55	NC_017373	TTAA	2	8	17981	17988	50 %	50 %	0 %	0 %	385221493
56	NC_017373	TCTT	2	8	19309	19316	0 %	75 %	0 %	25 %	385221494
57	NC_017373	CTTG	2	8	20327	20334	0 %	50 %	25 %	25 %	385221496
58	NC_017373	TTTC	2	8	20477	20484	0 %	75 %	0 %	25 %	385221496
59	NC_017373	TTGG	2	8	20843	20850	0 %	50 %	50 %	0 %	385221496
60	NC_017373	TTTC	2	8	20909	20916	0 %	75 %	0 %	25 %	385221496
61	NC_017373	TGAG	2	8	21908	21915	25 %	25 %	50 %	0 %	385221496
62	NC_017373	TTAG	2	8	21932	21939	25 %	50 %	25 %	0 %	385221496
63	NC_017373	TAAC	2	8	22050	22057	50 %	25 %	0 %	25 %	385221496
64	NC_017373	TTTG	2	8	22366	22373	0 %	75 %	25 %	0 %	385221497
65	NC_017373	AAGA	2	8	22694	22701	75 %	0 %	25 %	0 %	385221498
66	NC_017373	CAAC	2	8	24577	24584	50 %	0 %	0 %	50 %	385221501
67	NC_017373	ACTC	2	8	24778	24785	25 %	25 %	0 %	50 %	385221502
68	NC_017373	ACCA	2	8	24831	24838	50 %	0 %	0 %	50 %	385221502
69	NC_017373	CTAT	2	8	24877	24884	25 %	50 %	0 %	25 %	385221502

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.