MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica7 plasmid unnamed

Total Repeats: 252

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017373	TTA	2	6	60	65	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017373	CAA	2	6	210	215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221475
3	NC_017373	GAA	2	6	268	273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221475
4	NC_017373	AGA	2	6	291	296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221475
5	NC_017373	CAA	2	6	305	310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221475
6	NC_017373	ACC	2	6	322	327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385221475
7	NC_017373	ATT	2	6	555	560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221475
8	NC_017373	ACA	2	6	584	589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221475
9	NC_017373	CTT	2	6	785	790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221475
10	NC_017373	CAA	2	6	808	813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221475
11	NC_017373	CAA	2	6	1251	1256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221475
12	NC_017373	AAC	2	6	1276	1281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221475
13	NC_017373	CAA	2	6	1353	1358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221475
14	NC_017373	AGA	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221475
15	NC_017373	TGA	2	6	1476	1481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221475
16	NC_017373	CAA	2	6	1542	1547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221475
17	NC_017373	CTA	2	6	1841	1846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017373	TTG	3	9	1881	1889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221476
19	NC_017373	ATC	2	6	1903	1908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221476
20	NC_017373	TTG	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221476
21	NC_017373	TCA	2	6	2266	2271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221476
22	NC_017373	CTA	2	6	2356	2361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221477
23	NC_017373	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221477
24	NC_017373	CAA	2	6	2433	2438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221477
25	NC_017373	ACC	2	6	2465	2470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385221477
26	NC_017373	CAA	2	6	2565	2570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221477
27	NC_017373	TGA	3	9	2705	2713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221477
28	NC_017373	TGA	2	6	2734	2739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221477
29	NC_017373	ATG	2	6	2751	2756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221477
30	NC_017373	AGG	2	6	3152	3157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385221477
31	NC_017373	TCA	2	6	3209	3214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221477
32	NC_017373	TAA	2	6	3347	3352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221477
33	NC_017373	ATC	2	6	3381	3386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221477
34	NC_017373	GGT	2	6	3694	3699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017373	ATT	2	6	3749	3754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017373	AAC	2	6	4072	4077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221478
37	NC_017373	TAT	2	6	4195	4200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221478
38	NC_017373	CAA	2	6	4271	4276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221478
39	NC_017373	TAT	2	6	4364	4369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221479
40	NC_017373	ATT	2	6	4431	4436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221479
41	NC_017373	AGA	2	6	4449	4454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221479
42	NC_017373	CGT	2	6	4486	4491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385221479
43	NC_017373	AGA	2	6	4521	4526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221479
44	NC_017373	GAA	2	6	4597	4602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221479
45	NC_017373	TGA	2	6	4701	4706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221480
46	NC_017373	CAC	2	6	4738	4743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385221480
47	NC_017373	CAA	2	6	4761	4766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221480
48	NC_017373	AAT	2	6	5031	5036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221480
49	NC_017373	GAA	2	6	5104	5109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221480
50	NC_017373	TAG	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221480
51	NC_017373	ATT	2	6	5308	5313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221480
52	NC_017373	TGA	2	6	5652	5657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221481
53	NC_017373	TGA	2	6	5775	5780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221481
54	NC_017373	CAA	2	6	5831	5836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221481
55	NC_017373	CAT	2	6	5913	5918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221481
56	NC_017373	TCA	2	6	6026	6031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221481
57	NC_017373	TAC	2	6	6055	6060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221481
58	NC_017373	ATA	2	6	6405	6410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221482
59	NC_017373	AGT	2	6	6700	6705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221482
60	NC_017373	AAG	2	6	6803	6808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221482
61	NC_017373	TGT	2	6	6846	6851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221482
62	NC_017373	GAA	2	6	6891	6896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221482
63	NC_017373	AAT	2	6	6914	6919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221482
64	NC_017373	GTA	2	6	6956	6961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221482
65	NC_017373	AAC	2	6	7000	7005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221482
66	NC_017373	TCT	2	6	7065	7070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221482
67	NC_017373	AAT	2	6	7353	7358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221482
68	NC_017373	AGT	2	6	7398	7403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221482
69	NC_017373	TAA	2	6	7416	7421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221482
70	NC_017373	TGT	2	6	7539	7544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017373	ACC	2	6	7600	7605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017373	TGT	2	6	7890	7895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221483
73	NC_017373	AGA	2	6	7909	7914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221483
74	NC_017373	TTA	2	6	7947	7952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221483
75	NC_017373	CCT	2	6	8142	8147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385221483
76	NC_017373	CAT	2	6	8543	8548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221483
77	NC_017373	TCA	2	6	8560	8565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221483
78	NC_017373	TCA	3	9	8586	8594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221483
79	NC_017373	TTG	2	6	8729	8734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221483
80	NC_017373	GGT	2	6	8829	8834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221483
81	NC_017373	TTG	2	6	8861	8866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221483
82	NC_017373	TTG	2	6	8927	8932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221483
83	NC_017373	TAG	2	6	8938	8943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221483
84	NC_017373	TGA	2	6	9028	9033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221484
85	NC_017373	CAA	2	6	9112	9117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221484
86	NC_017373	ACA	2	6	9295	9300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221484
87	NC_017373	GAT	2	6	9391	9396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221484
88	NC_017373	CAA	3	9	9410	9418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221484
89	NC_017373	TAG	2	6	9453	9458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017373	AGT	2	6	9582	9587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017373	TAA	2	6	9677	9682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017373	AAT	2	6	9694	9699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017373	AAT	2	6	9716	9721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017373	GTT	2	6	9730	9735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017373	TAA	2	6	9820	9825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221485
96	NC_017373	TTA	2	6	9870	9875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221485
97	NC_017373	TTA	2	6	9891	9896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221485
98	NC_017373	TTC	2	6	9910	9915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221485
99	NC_017373	AGT	3	9	9920	9928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221485
100	NC_017373	TGT	3	9	9935	9943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221485
101	NC_017373	GGT	2	6	9944	9949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221485
102	NC_017373	TTC	2	6	9987	9992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221486
103	NC_017373	ATT	2	6	10010	10015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221486
104	NC_017373	TAA	2	6	10021	10026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221486
105	NC_017373	GTG	2	6	10152	10157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221486
106	NC_017373	TTG	2	6	10329	10334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221486
107	NC_017373	ATA	2	6	10401	10406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221486
108	NC_017373	ACA	2	6	10440	10445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221486
109	NC_017373	ATT	2	6	10449	10454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221486
110	NC_017373	AGA	2	6	10609	10614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221486
111	NC_017373	ATT	2	6	10827	10832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221486
112	NC_017373	TTA	2	6	10903	10908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221487
113	NC_017373	AGA	2	6	11079	11084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221487
114	NC_017373	CAA	2	6	11096	11101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221487
115	NC_017373	TGC	2	6	11289	11294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385221487
116	NC_017373	GAT	2	6	11350	11355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221487
117	NC_017373	GAA	2	6	11548	11553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221487
118	NC_017373	TGG	2	6	11643	11648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221487
119	NC_017373	AAG	2	6	11748	11753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221487
120	NC_017373	CAA	2	6	11854	11859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221487
121	NC_017373	AAT	3	9	11908	11916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221487
122	NC_017373	GAA	2	6	12360	12365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221488
123	NC_017373	TTG	2	6	12734	12739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221488
124	NC_017373	TAA	2	6	12749	12754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221488
125	NC_017373	GTT	2	6	12813	12818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221488
126	NC_017373	CAA	2	6	12873	12878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221488
127	NC_017373	ATG	2	6	12934	12939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221488
128	NC_017373	GGA	2	6	13005	13010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385221488
129	NC_017373	AAT	2	6	13069	13074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221489
130	NC_017373	CCA	2	6	13090	13095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385221489
131	NC_017373	TAC	2	6	13144	13149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221489
132	NC_017373	ATT	2	6	13282	13287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221489
133	NC_017373	CAA	2	6	13366	13371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221489
134	NC_017373	CAA	2	6	13419	13424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221489
135	NC_017373	CTA	2	6	13471	13476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221489
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171	NC_017373	TAA	2	6	17049	17054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017373	ATA	2	6	17146	17151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_017373	CTT	2	6	25630	25635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_017373	CTT	2	6	25652	25657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_017373	GGA	2	6	25809	25814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
252	NC_017373	AGG	2	6	25836	25841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.