MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica7 plasmid unnamed

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017373	AG	3	6	616	621	50 %	0 %	50 %	0 %	385221475
2	NC_017373	AT	3	6	1891	1896	50 %	50 %	0 %	0 %	385221476
3	NC_017373	AC	3	6	2139	2144	50 %	0 %	0 %	50 %	385221476
4	NC_017373	AG	3	6	2699	2704	50 %	0 %	50 %	0 %	385221477
5	NC_017373	TG	3	6	2889	2894	0 %	50 %	50 %	0 %	385221477
6	NC_017373	AG	4	8	3996	4003	50 %	0 %	50 %	0 %	385221478
7	NC_017373	AG	3	6	4060	4065	50 %	0 %	50 %	0 %	385221478
8	NC_017373	AG	3	6	4100	4105	50 %	0 %	50 %	0 %	385221478
9	NC_017373	GA	3	6	4217	4222	50 %	0 %	50 %	0 %	385221478
10	NC_017373	AT	3	6	4470	4475	50 %	50 %	0 %	0 %	385221479
11	NC_017373	AG	4	8	4893	4900	50 %	0 %	50 %	0 %	385221480
12	NC_017373	TA	3	6	6536	6541	50 %	50 %	0 %	0 %	385221482
13	NC_017373	AT	3	6	6621	6626	50 %	50 %	0 %	0 %	385221482
14	NC_017373	CT	3	6	6824	6829	0 %	50 %	0 %	50 %	385221482
15	NC_017373	AC	3	6	7202	7207	50 %	0 %	0 %	50 %	385221482
16	NC_017373	AC	3	6	7261	7266	50 %	0 %	0 %	50 %	385221482
17	NC_017373	AC	3	6	7290	7295	50 %	0 %	0 %	50 %	385221482
18	NC_017373	CA	3	6	8405	8410	50 %	0 %	0 %	50 %	385221483
19	NC_017373	CT	3	6	8595	8600	0 %	50 %	0 %	50 %	385221483
20	NC_017373	GT	3	6	9155	9160	0 %	50 %	50 %	0 %	385221484
21	NC_017373	AT	3	6	9403	9408	50 %	50 %	0 %	0 %	385221484
22	NC_017373	TA	3	6	10158	10163	50 %	50 %	0 %	0 %	385221486
23	NC_017373	TA	3	6	10694	10699	50 %	50 %	0 %	0 %	385221486
24	NC_017373	TA	3	6	10936	10941	50 %	50 %	0 %	0 %	385221487
25	NC_017373	TC	3	6	11129	11134	0 %	50 %	0 %	50 %	385221487
26	NC_017373	AG	3	6	11413	11418	50 %	0 %	50 %	0 %	385221487
27	NC_017373	CA	3	6	11719	11724	50 %	0 %	0 %	50 %	385221487
28	NC_017373	AT	4	8	13116	13123	50 %	50 %	0 %	0 %	385221489
29	NC_017373	AT	3	6	13164	13169	50 %	50 %	0 %	0 %	385221489
30	NC_017373	TA	3	6	13220	13225	50 %	50 %	0 %	0 %	385221489
31	NC_017373	AT	3	6	13428	13433	50 %	50 %	0 %	0 %	385221489
32	NC_017373	TA	3	6	13786	13791	50 %	50 %	0 %	0 %	385221489
33	NC_017373	AT	3	6	14100	14105	50 %	50 %	0 %	0 %	385221489
34	NC_017373	CA	3	6	15054	15059	50 %	0 %	0 %	50 %	385221491
35	NC_017373	TC	3	6	15195	15200	0 %	50 %	0 %	50 %	385221491
36	NC_017373	CT	3	6	15915	15920	0 %	50 %	0 %	50 %	385221492
37	NC_017373	CT	3	6	16255	16260	0 %	50 %	0 %	50 %	385221492
38	NC_017373	AT	3	6	16284	16289	50 %	50 %	0 %	0 %	385221492
39	NC_017373	CG	3	6	17861	17866	0 %	0 %	50 %	50 %	385221493
40	NC_017373	CA	3	6	18895	18900	50 %	0 %	0 %	50 %	385221494
41	NC_017373	CT	3	6	19085	19090	0 %	50 %	0 %	50 %	385221494
42	NC_017373	GT	3	6	19645	19650	0 %	50 %	50 %	0 %	385221495
43	NC_017373	AT	3	6	19893	19898	50 %	50 %	0 %	0 %	385221495
44	NC_017373	TG	3	6	20564	20569	0 %	50 %	50 %	0 %	385221496
45	NC_017373	CT	3	6	20590	20595	0 %	50 %	0 %	50 %	385221496
46	NC_017373	CT	3	6	20707	20712	0 %	50 %	0 %	50 %	385221496
47	NC_017373	CT	3	6	20740	20745	0 %	50 %	0 %	50 %	385221496
48	NC_017373	TG	3	6	21265	21270	0 %	50 %	50 %	0 %	385221496
49	NC_017373	GT	3	6	21761	21766	0 %	50 %	50 %	0 %	385221496
50	NC_017373	AG	4	8	21914	21921	50 %	0 %	50 %	0 %	385221496
51	NC_017373	AG	3	6	22266	22271	50 %	0 %	50 %	0 %	385221497
52	NC_017373	AT	3	6	22462	22467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017373	AG	3	6	23017	23022	50 %	0 %	50 %	0 %	385221499
54	NC_017373	TA	3	6	23481	23486	50 %	50 %	0 %	0 %	385221500
55	NC_017373	CT	3	6	23535	23540	0 %	50 %	0 %	50 %	385221500
56	NC_017373	TA	3	6	23857	23862	50 %	50 %	0 %	0 %	385221500
57	NC_017373	GC	4	8	25474	25481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017373	TG	3	6	25757	25762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017373	AG	4	8	25816	25823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.