MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica7 plasmid unnamed

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017373	A	6	6	262	267	100 %	0 %	0 %	0 %	385221475
2	NC_017373	A	6	6	570	575	100 %	0 %	0 %	0 %	385221475
3	NC_017373	A	6	6	1015	1020	100 %	0 %	0 %	0 %	385221475
4	NC_017373	A	6	6	1402	1407	100 %	0 %	0 %	0 %	385221475
5	NC_017373	C	6	6	1432	1437	0 %	0 %	0 %	100 %	385221475
6	NC_017373	A	6	6	2164	2169	100 %	0 %	0 %	0 %	385221476
7	NC_017373	A	7	7	2236	2242	100 %	0 %	0 %	0 %	385221476
8	NC_017373	T	7	7	2273	2279	0 %	100 %	0 %	0 %	385221476
9	NC_017373	T	7	7	2390	2396	0 %	100 %	0 %	0 %	385221477
10	NC_017373	A	6	6	2487	2492	100 %	0 %	0 %	0 %	385221477
11	NC_017373	C	6	6	2774	2779	0 %	0 %	0 %	100 %	385221477
12	NC_017373	A	6	6	3016	3021	100 %	0 %	0 %	0 %	385221477
13	NC_017373	A	7	7	3068	3074	100 %	0 %	0 %	0 %	385221477
14	NC_017373	A	6	6	3214	3219	100 %	0 %	0 %	0 %	385221477
15	NC_017373	A	6	6	3795	3800	100 %	0 %	0 %	0 %	385221478
16	NC_017373	A	6	6	4140	4145	100 %	0 %	0 %	0 %	385221478
17	NC_017373	A	7	7	4148	4154	100 %	0 %	0 %	0 %	385221478
18	NC_017373	A	6	6	4263	4268	100 %	0 %	0 %	0 %	385221478
19	NC_017373	A	6	6	4275	4280	100 %	0 %	0 %	0 %	385221478
20	NC_017373	A	7	7	4306	4312	100 %	0 %	0 %	0 %	385221479
21	NC_017373	A	6	6	4480	4485	100 %	0 %	0 %	0 %	385221479
22	NC_017373	A	7	7	4535	4541	100 %	0 %	0 %	0 %	385221479
23	NC_017373	A	6	6	5011	5016	100 %	0 %	0 %	0 %	385221480
24	NC_017373	A	6	6	5108	5113	100 %	0 %	0 %	0 %	385221480
25	NC_017373	A	6	6	5115	5120	100 %	0 %	0 %	0 %	385221480
26	NC_017373	A	6	6	5324	5329	100 %	0 %	0 %	0 %	385221480
27	NC_017373	A	6	6	5398	5403	100 %	0 %	0 %	0 %	385221480
28	NC_017373	A	6	6	5496	5501	100 %	0 %	0 %	0 %	385221481
29	NC_017373	A	7	7	5630	5636	100 %	0 %	0 %	0 %	385221481
30	NC_017373	A	6	6	5797	5802	100 %	0 %	0 %	0 %	385221481
31	NC_017373	A	6	6	6370	6375	100 %	0 %	0 %	0 %	385221482
32	NC_017373	A	6	6	6761	6766	100 %	0 %	0 %	0 %	385221482
33	NC_017373	T	7	7	6873	6879	0 %	100 %	0 %	0 %	385221482
34	NC_017373	A	6	6	6905	6910	100 %	0 %	0 %	0 %	385221482
35	NC_017373	A	7	7	7192	7198	100 %	0 %	0 %	0 %	385221482
36	NC_017373	T	6	6	8080	8085	0 %	100 %	0 %	0 %	385221483
37	NC_017373	T	7	7	8225	8231	0 %	100 %	0 %	0 %	385221483
38	NC_017373	T	6	6	8278	8283	0 %	100 %	0 %	0 %	385221483
39	NC_017373	G	6	6	8520	8525	0 %	0 %	100 %	0 %	385221483
40	NC_017373	T	6	6	8807	8812	0 %	100 %	0 %	0 %	385221483
41	NC_017373	A	7	7	8903	8909	100 %	0 %	0 %	0 %	385221483
42	NC_017373	A	7	7	9020	9026	100 %	0 %	0 %	0 %	385221484
43	NC_017373	T	7	7	9057	9063	0 %	100 %	0 %	0 %	385221484
44	NC_017373	T	6	6	9130	9135	0 %	100 %	0 %	0 %	385221484
45	NC_017373	A	6	6	9776	9781	100 %	0 %	0 %	0 %	385221485
46	NC_017373	A	7	7	9793	9799	100 %	0 %	0 %	0 %	385221485
47	NC_017373	A	7	7	9808	9814	100 %	0 %	0 %	0 %	385221485
48	NC_017373	A	6	6	9971	9976	100 %	0 %	0 %	0 %	385221486
49	NC_017373	T	6	6	10500	10505	0 %	100 %	0 %	0 %	385221486
50	NC_017373	A	6	6	10837	10842	100 %	0 %	0 %	0 %	385221486
51	NC_017373	A	7	7	11236	11242	100 %	0 %	0 %	0 %	385221487
52	NC_017373	A	6	6	11254	11259	100 %	0 %	0 %	0 %	385221487
53	NC_017373	A	7	7	11694	11700	100 %	0 %	0 %	0 %	385221487
54	NC_017373	A	6	6	11943	11948	100 %	0 %	0 %	0 %	385221487
55	NC_017373	T	7	7	12093	12099	0 %	100 %	0 %	0 %	385221487
56	NC_017373	T	6	6	12102	12107	0 %	100 %	0 %	0 %	385221487
57	NC_017373	A	8	8	12110	12117	100 %	0 %	0 %	0 %	385221487
58	NC_017373	A	6	6	12371	12376	100 %	0 %	0 %	0 %	385221488
59	NC_017373	A	6	6	12428	12433	100 %	0 %	0 %	0 %	385221488
60	NC_017373	A	6	6	12540	12545	100 %	0 %	0 %	0 %	385221488
61	NC_017373	T	6	6	12574	12579	0 %	100 %	0 %	0 %	385221488
62	NC_017373	A	6	6	12706	12711	100 %	0 %	0 %	0 %	385221488
63	NC_017373	A	7	7	13156	13162	100 %	0 %	0 %	0 %	385221489
64	NC_017373	A	6	6	13256	13261	100 %	0 %	0 %	0 %	385221489
65	NC_017373	A	6	6	13294	13299	100 %	0 %	0 %	0 %	385221489
66	NC_017373	A	6	6	13500	13505	100 %	0 %	0 %	0 %	385221489
67	NC_017373	T	6	6	13620	13625	0 %	100 %	0 %	0 %	385221489
68	NC_017373	A	8	8	13650	13657	100 %	0 %	0 %	0 %	385221489
69	NC_017373	A	7	7	13716	13722	100 %	0 %	0 %	0 %	385221489
70	NC_017373	T	6	6	13746	13751	0 %	100 %	0 %	0 %	385221489
71	NC_017373	T	6	6	13767	13772	0 %	100 %	0 %	0 %	385221489
72	NC_017373	A	6	6	13994	13999	100 %	0 %	0 %	0 %	385221489
73	NC_017373	T	6	6	14444	14449	0 %	100 %	0 %	0 %	385221490
74	NC_017373	A	7	7	14478	14484	100 %	0 %	0 %	0 %	385221490
75	NC_017373	T	6	6	14963	14968	0 %	100 %	0 %	0 %	385221491
76	NC_017373	A	6	6	14970	14975	100 %	0 %	0 %	0 %	385221491
77	NC_017373	T	6	6	14987	14992	0 %	100 %	0 %	0 %	385221491
78	NC_017373	T	6	6	15266	15271	0 %	100 %	0 %	0 %	385221491
79	NC_017373	T	6	6	15446	15451	0 %	100 %	0 %	0 %	385221491
80	NC_017373	T	7	7	15667	15673	0 %	100 %	0 %	0 %	385221492
81	NC_017373	A	7	7	16061	16067	100 %	0 %	0 %	0 %	385221492
82	NC_017373	T	7	7	16139	16145	0 %	100 %	0 %	0 %	385221492
83	NC_017373	T	7	7	16590	16596	0 %	100 %	0 %	0 %	385221492
84	NC_017373	A	7	7	16616	16622	100 %	0 %	0 %	0 %	385221492
85	NC_017373	A	6	6	17352	17357	100 %	0 %	0 %	0 %	385221493
86	NC_017373	A	6	6	17597	17602	100 %	0 %	0 %	0 %	385221493
87	NC_017373	T	6	6	18570	18575	0 %	100 %	0 %	0 %	385221494
88	NC_017373	T	7	7	18715	18721	0 %	100 %	0 %	0 %	385221494
89	NC_017373	T	6	6	18768	18773	0 %	100 %	0 %	0 %	385221494
90	NC_017373	G	6	6	19010	19015	0 %	0 %	100 %	0 %	385221494
91	NC_017373	T	6	6	19297	19302	0 %	100 %	0 %	0 %	385221494
92	NC_017373	A	7	7	19393	19399	100 %	0 %	0 %	0 %	385221494
93	NC_017373	A	7	7	19510	19516	100 %	0 %	0 %	0 %	385221495
94	NC_017373	T	7	7	19547	19553	0 %	100 %	0 %	0 %	385221495
95	NC_017373	T	6	6	19620	19625	0 %	100 %	0 %	0 %	385221495
96	NC_017373	T	6	6	20118	20123	0 %	100 %	0 %	0 %	385221496
97	NC_017373	T	6	6	20816	20821	0 %	100 %	0 %	0 %	385221496
98	NC_017373	T	6	6	21033	21038	0 %	100 %	0 %	0 %	385221496
99	NC_017373	A	6	6	21458	21463	100 %	0 %	0 %	0 %	385221496
100	NC_017373	T	6	6	21798	21803	0 %	100 %	0 %	0 %	385221496
101	NC_017373	T	6	6	22226	22231	0 %	100 %	0 %	0 %	385221497
102	NC_017373	T	7	7	22299	22305	0 %	100 %	0 %	0 %	385221497
103	NC_017373	A	6	6	22863	22868	100 %	0 %	0 %	0 %	385221499
104	NC_017373	A	6	6	22887	22892	100 %	0 %	0 %	0 %	385221499
105	NC_017373	A	6	6	22907	22912	100 %	0 %	0 %	0 %	385221499
106	NC_017373	A	6	6	22972	22977	100 %	0 %	0 %	0 %	385221499
107	NC_017373	T	6	6	23501	23506	0 %	100 %	0 %	0 %	385221500
108	NC_017373	T	6	6	23542	23547	0 %	100 %	0 %	0 %	385221500
109	NC_017373	A	6	6	23948	23953	100 %	0 %	0 %	0 %	385221500
110	NC_017373	T	6	6	24025	24030	0 %	100 %	0 %	0 %	385221500
111	NC_017373	A	6	6	24768	24773	100 %	0 %	0 %	0 %	385221502
112	NC_017373	T	6	6	24971	24976	0 %	100 %	0 %	0 %	385221502
113	NC_017373	A	8	8	25175	25182	100 %	0 %	0 %	0 %	385221503

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.