MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori India7 chromosome

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017372	AAACAC	2	12	18349	18360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017372	TTTCTT	2	12	22999	23010	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017372	ACTTAG	2	12	44225	44236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017372	AGAAAA	2	12	55764	55775	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017372	TACAAA	2	12	89533	89544	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017372	AATGAT	2	12	96381	96392	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017372	GTTTTA	2	12	127259	127270	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017372	TATTTG	2	12	130888	130899	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017372	TAAAAA	2	12	162883	162894	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017372	CTTAAT	2	12	169715	169726	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017372	AGCACT	2	12	176276	176287	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017372	ATTAAA	2	12	193764	193775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017372	CAAAAA	2	12	199895	199906	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017372	ATTTTA	2	12	216601	216612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017372	AAAATA	2	12	397534	397545	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017372	TAAAAA	2	12	411724	411735	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017372	TATTTT	2	12	436741	436752	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017372	ACAAAA	2	12	525517	525528	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017372	TATCAA	2	12	550929	550940	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017372	AAAAAG	2	12	553456	553467	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017372	AAGCCG	2	12	572170	572181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017372	TGAAGA	2	12	584476	584487	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017372	GAAAAA	2	12	584561	584572	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017372	TAAAAT	2	12	603291	603302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017372	CTCATT	2	12	642467	642478	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017372	GCTTTG	2	12	717599	717610	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017372	TTTGAT	2	12	745876	745887	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017372	AAAAAC	2	12	755194	755205	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017372	CTTTTT	2	12	755628	755639	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017372	TTAAAA	2	12	801952	801963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017372	AATTAA	2	12	823151	823162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017372	ATGCCC	2	12	832216	832227	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017372	TTTAAA	2	12	834867	834878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017372	ATTTTA	2	12	854718	854729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017372	TTACAA	2	12	860459	860470	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017372	ATGGAT	2	12	871880	871891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017372	ATTAAA	2	12	898738	898749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017372	AAAATA	2	12	919660	919671	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017372	TGCATT	2	12	927139	927150	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017372	ATTATA	2	12	948071	948082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017372	TTAAAA	2	12	948175	948186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017372	ATTGAA	2	12	955649	955660	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017372	ATAAAA	2	12	965479	965490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017372	TCAAAT	2	12	978535	978546	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017372	ATTTTT	2	12	980602	980613	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017372	TTTTTC	2	12	1003860	1003871	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017372	TTAAAA	2	12	1005426	1005437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017372	CTAGCC	2	12	1026753	1026764	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017372	TTGATT	2	12	1028874	1028885	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017372	ACTTAG	2	12	1029583	1029594	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017372	AAAGCC	2	12	1055889	1055900	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017372	GCCGTT	2	12	1093802	1093813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017372	ACAAAA	2	12	1124001	1124012	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017372	CTATGT	2	12	1153584	1153595	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017372	AAATTA	2	12	1159916	1159927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017372	AAAAAT	2	12	1192678	1192689	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017372	AAAATT	2	12	1209948	1209959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017372	ATCCTT	2	12	1268356	1268367	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017372	TTGTAT	2	12	1270777	1270788	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017372	ACTTAA	2	12	1287818	1287829	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017372	AAACTT	2	12	1311279	1311290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017372	GTTTTA	2	12	1326355	1326366	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017372	ATTTTT	2	12	1343043	1343054	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017372	AACTCA	2	12	1368058	1368069	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017372	ATAAAA	2	12	1371779	1371790	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017372	AAGAAA	2	12	1402704	1402715	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017372	GTTTTA	2	12	1455901	1455912	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017372	TTTTTC	2	12	1466683	1466694	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017372	TTTTTA	2	12	1477694	1477705	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017372	AGAAAA	2	12	1509517	1509528	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017372	AAAAGA	2	12	1512616	1512627	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017372	TAAACA	2	12	1588865	1588876	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017372	ACTTAG	2	12	1597497	1597508	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017372	CTAAAA	2	12	1609383	1609394	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017372	CACATG	2	12	1624772	1624783	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.