MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori India7 chromosome

Total Repeats: 756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017372	AAAGCG	2	12	288	299	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385219874
2	NC_017372	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	385219877
3	NC_017372	GCGATA	2	12	3727	3738	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385219879
4	NC_017372	GCTTGC	2	12	6223	6234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385219880
5	NC_017372	CCGTTC	2	12	6919	6930	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385219880
6	NC_017372	GAAACC	2	12	7742	7753	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385219881
7	NC_017372	AAATGC	2	12	7979	7990	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385219881
8	NC_017372	AGAAAA	2	12	18699	18710	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385219890
9	NC_017372	AGTTTT	2	12	20400	20411	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385219891
10	NC_017372	GATAAA	2	12	22254	22265	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385219893
11	NC_017372	CAATTC	2	12	26680	26691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385219896
12	NC_017372	TATCAA	2	12	29854	29865	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385219900
13	NC_017372	GCGTGG	2	12	32552	32563	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385219903
14	NC_017372	TTGGAT	2	12	32662	32673	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385219903
15	NC_017372	TAATGA	2	12	32697	32708	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385219903
16	NC_017372	TTGAAT	2	12	33748	33759	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385219903
17	NC_017372	TAAGGA	2	12	34047	34058	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385219903
18	NC_017372	TAGGGG	2	12	35554	35565	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385219906
19	NC_017372	AAAGAA	2	12	37066	37077	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385219907
20	NC_017372	AAAGAA	2	12	38626	38637	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385219909
21	NC_017372	CAAAAT	2	12	40972	40983	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385219911
22	NC_017372	CGCAAA	2	12	45065	45076	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385219915
23	NC_017372	GTTTGA	2	12	48156	48167	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385219917
24	NC_017372	GGCTAG	2	12	49308	49319	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385219919
25	NC_017372	TAAAAA	2	12	51036	51047	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385219921
26	NC_017372	GATGTG	2	12	56500	56511	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385219925
27	NC_017372	AGCCAA	2	12	56578	56589	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385219925
28	NC_017372	AAAAGA	2	12	57624	57635	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385219925
29	NC_017372	CCAACA	2	12	58472	58483	50 %	0 %	0 %	50 %	385219925
30	NC_017372	TTTTGT	2	12	58810	58821	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385219926
31	NC_017372	AAAGAG	2	12	59089	59100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385219926
32	NC_017372	AGAAAA	2	12	60926	60937	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385219928
33	NC_017372	GAAAAA	2	12	62602	62613	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385219931
34	NC_017372	AGCGGG	2	12	63079	63090	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385219931
35	NC_017372	ACGCCC	2	12	70859	70870	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385219940
36	NC_017372	AAGGGC	2	12	73596	73607	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385219943
37	NC_017372	CGCCCA	2	12	74132	74143	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385219943
38	NC_017372	AGGATA	2	12	74979	74990	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385219946
39	NC_017372	AGCGTG	2	12	75152	75163	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385219946
40	NC_017372	GCAACG	2	12	78063	78074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385219947
41	NC_017372	ATATTG	2	12	79030	79041	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385219949
42	NC_017372	AACAGG	2	12	87222	87233	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385219956
43	NC_017372	GGCTTT	2	12	88498	88509	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385219958
44	NC_017372	AAAAAT	2	12	89739	89750	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385219959
45	NC_017372	ATTAGA	2	12	91243	91254	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385219960
46	NC_017372	GCTAAA	2	12	92708	92719	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385219961
47	NC_017372	GATTTT	2	12	93007	93018	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385219962
48	NC_017372	AAACTC	2	12	93124	93135	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385219962
49	NC_017372	TCAAAA	2	12	94411	94422	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385219963
50	NC_017372	GCGGTG	2	12	95111	95122	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385219964
51	NC_017372	TTAAGG	2	12	96658	96669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385219965
52	NC_017372	CAATAT	2	12	98318	98329	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385219965
53	NC_017372	CATATT	2	12	104164	104175	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385219971
54	NC_017372	ATGGGA	2	12	107708	107719	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385219974
55	NC_017372	GGAGCG	2	12	109198	109209	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385219976
56	NC_017372	TTTTCT	2	12	110699	110710	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385219977
57	NC_017372	GCAAGC	2	12	111106	111117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385219977
58	NC_017372	CTTATC	2	12	113873	113884	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385219981
59	NC_017372	AAAGCC	2	12	117832	117843	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385219983
60	NC_017372	TAGGCA	2	12	118244	118255	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385219983
61	NC_017372	TTCTAT	2	12	120517	120528	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385219985
62	NC_017372	GTTCTA	2	12	120891	120902	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385219985
63	NC_017372	CTAAGG	2	12	122211	122222	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385219986
64	NC_017372	TGAATT	2	12	122745	122756	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385219986
65	NC_017372	TTTCAA	2	12	122904	122915	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385219986
66	NC_017372	AGCAAA	2	12	126248	126259	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385219989
67	NC_017372	TCATGA	2	12	129028	129039	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385219993
68	NC_017372	AAAAAT	2	12	135297	135308	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385219999
69	NC_017372	TAAAAT	2	12	135497	135508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385220000
70	NC_017372	CAAATC	2	12	136383	136394	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385220002
71	NC_017372	TAGCGA	2	12	137436	137447	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385220003
72	NC_017372	TTAGCG	2	12	140338	140349	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385220005
73	NC_017372	TATCGC	2	12	140550	140561	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385220005
74	NC_017372	TGGGGT	2	12	141198	141209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385220006
75	NC_017372	ATCGCT	2	12	142259	142270	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385220006
76	NC_017372	AACCTA	2	12	144480	144491	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385220008
77	NC_017372	TTCTAT	2	12	145642	145653	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385220009
78	NC_017372	TTGTTT	2	12	148630	148641	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385220014
79	NC_017372	CTTGGG	2	12	149292	149303	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385220016
80	NC_017372	TTGGGT	2	12	154067	154078	0 %	50 %	50 %	0 %	385220021
81	NC_017372	GATTTT	2	12	154581	154592	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385220022
82	NC_017372	AATTAA	2	12	154840	154851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385220022
83	NC_017372	GATGGC	2	12	157899	157910	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385220026
84	NC_017372	CTTTCT	2	12	158043	158054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385220026
85	NC_017372	CCGCTC	2	12	159798	159809	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385220028
86	NC_017372	GCTCTC	2	12	162225	162236	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385220030
87	NC_017372	TAGTGG	2	12	163992	164003	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385220033
88	NC_017372	ATCGTT	2	12	166653	166664	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385220035
89	NC_017372	AATTTC	2	12	167004	167015	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385220036
90	NC_017372	TAAAAT	2	12	168529	168540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385220037
91	NC_017372	TTCTTT	2	12	168939	168950	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385220037
92	NC_017372	ATTTTG	2	12	170339	170350	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385220040
93	NC_017372	CGCTTT	2	12	170817	170828	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385220040
94	NC_017372	ACTTAT	2	12	170914	170925	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385220040
95	NC_017372	GTTTAA	2	12	171601	171612	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385220041
96	NC_017372	AGTTTC	2	12	175695	175706	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385220049
97	NC_017372	ATTCTA	2	12	181701	181712	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385220055
98	NC_017372	CATAGC	2	12	183457	183468	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385220056
99	NC_017372	GTTTTG	2	12	183962	183973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385220056
100	NC_017372	TGTTTT	2	12	195008	195019	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385220068
101	NC_017372	AATGCC	2	12	195338	195349	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385220069
102	NC_017372	AGGGCC	2	12	197975	197986	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385220070
103	NC_017372	GGTGAT	2	12	199579	199590	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385220071
104	NC_017372	TCAATA	2	12	200008	200019	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385220072
105	NC_017372	CACGCC	2	12	200488	200499	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385220072
106	NC_017372	GCTAGG	2	12	203114	203125	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385220074
107	NC_017372	TAAGGC	2	12	205525	205536	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385220078
108	NC_017372	TCTTTA	2	12	209503	209514	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385220082
109	NC_017372	GTTTTT	2	12	215141	215152	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385220089
110	NC_017372	CGCTAC	2	12	215873	215884	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385220090
111	NC_017372	TCCCGC	2	12	220508	220519	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385220094
112	NC_017372	TCCCGC	2	12	221321	221332	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385220094
113	NC_017372	GAAAAG	2	12	227334	227345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385220099
114	NC_017372	AAAAAG	2	12	227645	227656	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385220100
115	NC_017372	TGAGCG	2	12	229177	229188	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385220102
116	NC_017372	GGGGCT	2	12	234597	234608	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385220107
117	NC_017372	ATGGAA	2	12	235173	235184	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385220107
118	NC_017372	GAAAAG	2	12	235266	235277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385220107
119	NC_017372	TGAGCG	2	12	239150	239161	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385220110
120	NC_017372	AGCTTT	2	12	239298	239309	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385220110
121	NC_017372	GATTTT	2	12	243832	243843	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385220117
122	NC_017372	ATTAGA	2	12	243954	243965	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385220117
123	NC_017372	TAAAGA	2	12	245271	245282	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385220118
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125	NC_017372	AAATCA	2	12	246735	246746	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385220121
126	NC_017372	GCGTTA	2	12	248491	248502	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385220122
127	NC_017372	AGCGAG	2	12	257906	257917	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385220129
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131	NC_017372	TATGGA	2	12	262469	262480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385220132
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138	NC_017372	GGCATG	2	12	277358	277369	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385220141
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142	NC_017372	AAAAAT	2	12	284695	284706	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385220148
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149	NC_017372	GCAATC	2	12	297406	297417	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385220164
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232	NC_017372	ACTGGG	2	12	475110	475121	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385220338
233	NC_017372	TGGGCA	2	12	476095	476106	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385220339
234	NC_017372	TTTTTC	2	12	476976	476987	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385220341
235	NC_017372	AAAAGA	2	12	477430	477441	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385220341
236	NC_017372	CTAAAA	2	12	484371	484382	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385220348
237	NC_017372	GCGCTA	2	12	487857	487868	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385220352
238	NC_017372	CGCTAT	2	12	489271	489282	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385220353
239	NC_017372	GGCTTT	2	12	490135	490146	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385220353
240	NC_017372	CAGCCC	2	12	495182	495193	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385220360
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242	NC_017372	CCGCTC	2	12	499030	499041	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385220364
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245	NC_017372	AATAGG	2	12	506678	506689	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385220373
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260	NC_017372	CAAGTT	2	12	533208	533219	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385220400
261	NC_017372	CCAAAG	2	12	533443	533454	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385220400
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263	NC_017372	CATCGT	2	12	535062	535073	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385220401
264	NC_017372	TTTTTC	2	12	535297	535308	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385220401
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341	NC_017372	CTTTAG	2	12	687525	687536	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385220538
342	NC_017372	TTATGG	2	12	689012	689023	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385220539
343	NC_017372	ATTTGC	2	12	697550	697561	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385220549
344	NC_017372	CTCATC	2	12	705563	705574	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385220555
345	NC_017372	TGGATT	2	12	706283	706294	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385220556
346	NC_017372	TTGGAA	2	12	708015	708026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385220557
347	NC_017372	AGCGTC	2	12	709237	709248	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385220559
348	NC_017372	CAAGCG	2	12	712799	712810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385220563
349	NC_017372	CAATTT	2	12	713743	713754	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385220563
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452	NC_017372	TTTGGG	2	12	949667	949678	0 %	50 %	50 %	0 %	385220766
453	NC_017372	TCTCAC	2	12	951061	951072	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385220768
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460	NC_017372	ATATTA	2	12	963906	963917	50 %	50 %	0 %	0 %	385220772
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