MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori India7 chromosome

Total Repeats: 1360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017372	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	385219876
2	NC_017372	TGAAT	2	10	2057	2066	40 %	40 %	20 %	0 %	385219877
3	NC_017372	GAAAC	2	10	4650	4659	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017372	ATTTT	2	10	4893	4902	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017372	TTTTA	2	10	4926	4935	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017372	TTTGA	2	10	6192	6201	20 %	60 %	20 %	0 %	385219880
7	NC_017372	AAATT	2	10	7317	7326	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017372	TTTCT	2	10	8406	8415	0 %	80 %	0 %	20 %	385219881
9	NC_017372	TTTTG	2	10	11943	11952	0 %	80 %	20 %	0 %	385219884
10	NC_017372	TGGTG	2	10	12783	12792	0 %	40 %	60 %	0 %	385219885
11	NC_017372	GCTTT	2	10	13609	13618	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017372	CAAAA	2	10	18664	18673	80 %	0 %	0 %	20 %	385219890
13	NC_017372	AAGCT	2	10	19567	19576	40 %	20 %	20 %	20 %	385219891
14	NC_017372	GCTGT	2	10	21030	21039	0 %	40 %	40 %	20 %	385219892
15	NC_017372	AAAAG	2	10	23067	23076	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017372	CCATG	2	10	23250	23259	20 %	20 %	20 %	40 %	385219895
17	NC_017372	CTCTT	2	10	23280	23289	0 %	60 %	0 %	40 %	385219895
18	NC_017372	CAAGC	2	10	27893	27902	40 %	0 %	20 %	40 %	385219897
19	NC_017372	GCTGG	2	10	28266	28275	0 %	20 %	60 %	20 %	385219897
20	NC_017372	TGGGT	2	10	28330	28339	0 %	40 %	60 %	0 %	385219897
21	NC_017372	TTTTA	2	10	28823	28832	20 %	80 %	0 %	0 %	385219898
22	NC_017372	TTTTC	2	10	30418	30427	0 %	80 %	0 %	20 %	385219900
23	NC_017372	TGATT	2	10	31800	31809	20 %	60 %	20 %	0 %	385219901
24	NC_017372	GTGGG	2	10	33710	33719	0 %	20 %	80 %	0 %	385219903
25	NC_017372	AGCCT	2	10	39114	39123	20 %	20 %	20 %	40 %	385219910
26	NC_017372	AAATT	2	10	42542	42551	60 %	40 %	0 %	0 %	385219912
27	NC_017372	TAAAA	2	10	45000	45009	80 %	20 %	0 %	0 %	385219915
28	NC_017372	TCCCA	2	10	46012	46021	20 %	20 %	0 %	60 %	385219916
29	NC_017372	GCTCC	2	10	46333	46342	0 %	20 %	20 %	60 %	385219916
30	NC_017372	AAAAT	2	10	46512	46521	80 %	20 %	0 %	0 %	385219916
31	NC_017372	TCGCA	2	10	46870	46879	20 %	20 %	20 %	40 %	385219916
32	NC_017372	TGCCT	2	10	49125	49134	0 %	40 %	20 %	40 %	385219918
33	NC_017372	ATTAA	2	10	49607	49616	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017372	TGAAA	2	10	49955	49964	60 %	20 %	20 %	0 %	385219921
35	NC_017372	TCAAA	2	10	50209	50218	60 %	20 %	0 %	20 %	385219921
36	NC_017372	CAGCA	2	10	51156	51165	40 %	0 %	20 %	40 %	385219922
37	NC_017372	TAAAA	2	10	53248	53257	80 %	20 %	0 %	0 %	385219922
38	NC_017372	TCAAA	2	10	53964	53973	60 %	20 %	0 %	20 %	385219922
39	NC_017372	TTAAA	2	10	54987	54996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017372	ACAAA	2	10	55015	55024	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017372	ATCGC	2	10	56008	56017	20 %	20 %	20 %	40 %	385219924
42	NC_017372	AAAGA	2	10	56527	56536	80 %	0 %	20 %	0 %	385219925
43	NC_017372	GAAAA	2	10	56900	56909	80 %	0 %	20 %	0 %	385219925
44	NC_017372	AAAAG	2	10	57921	57930	80 %	0 %	20 %	0 %	385219925
45	NC_017372	TCTAC	2	10	59878	59887	20 %	40 %	0 %	40 %	385219928
46	NC_017372	TCAAT	2	10	66200	66209	40 %	40 %	0 %	20 %	385219934
47	NC_017372	CTTCT	2	10	67043	67052	0 %	60 %	0 %	40 %	385219935
48	NC_017372	TGCCT	2	10	67120	67129	0 %	40 %	20 %	40 %	385219935
49	NC_017372	TCCAA	2	10	67532	67541	40 %	20 %	0 %	40 %	385219936
50	NC_017372	CAATG	2	10	68367	68376	40 %	20 %	20 %	20 %	385219938
51	NC_017372	TTTTA	2	10	70784	70793	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017372	TTTTG	2	10	70815	70824	0 %	80 %	20 %	0 %	385219940
53	NC_017372	ACGCC	2	10	71121	71130	20 %	0 %	20 %	60 %	385219940
54	NC_017372	AAAGC	2	10	71887	71896	60 %	0 %	20 %	20 %	385219941
55	NC_017372	GTGGC	2	10	75099	75108	0 %	20 %	60 %	20 %	385219946
56	NC_017372	TTTGT	2	10	76264	76273	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017372	ATCTT	2	10	80185	80194	20 %	60 %	0 %	20 %	385219949
58	NC_017372	TGGCT	2	10	80726	80735	0 %	40 %	40 %	20 %	385219949
59	NC_017372	ATGCC	2	10	81398	81407	20 %	20 %	20 %	40 %	385219951
60	NC_017372	TTGAT	2	10	82444	82453	20 %	60 %	20 %	0 %	385219953
61	NC_017372	ATCCA	2	10	83211	83220	40 %	20 %	0 %	40 %	385219954
62	NC_017372	GGCGT	2	10	84258	84267	0 %	20 %	60 %	20 %	385219955
63	NC_017372	TAAGA	2	10	87453	87462	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017372	TAAAA	2	10	87524	87533	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017372	CTTTC	2	10	87794	87803	0 %	60 %	0 %	40 %	385219957
66	NC_017372	ATTTT	2	10	90031	90040	20 %	80 %	0 %	0 %	385219959
67	NC_017372	TTTGA	2	10	90587	90596	20 %	60 %	20 %	0 %	385219960
68	NC_017372	TCTTT	2	10	90798	90807	0 %	80 %	0 %	20 %	385219960
69	NC_017372	GGCTT	2	10	91915	91924	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017372	ATAAA	2	10	93916	93925	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017372	GAATT	2	10	98700	98709	40 %	40 %	20 %	0 %	385219966
72	NC_017372	TCGTT	2	10	100605	100614	0 %	60 %	20 %	20 %	385219967
73	NC_017372	TAAAG	2	10	100952	100961	60 %	20 %	20 %	0 %	385219968
74	NC_017372	TTTTC	2	10	101058	101067	0 %	80 %	0 %	20 %	385219968
75	NC_017372	TAAAA	2	10	103309	103318	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017372	TCTTT	2	10	103917	103926	0 %	80 %	0 %	20 %	385219971
77	NC_017372	AAAGC	2	10	106686	106695	60 %	0 %	20 %	20 %	385219973
78	NC_017372	GAATG	2	10	107913	107922	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017372	TTTTG	2	10	108822	108831	0 %	80 %	20 %	0 %	385219976
80	NC_017372	CAAAT	2	10	109218	109227	60 %	20 %	0 %	20 %	385219976
81	NC_017372	ACCCT	2	10	110648	110657	20 %	20 %	0 %	60 %	385219977
82	NC_017372	ATGCC	2	10	110780	110789	20 %	20 %	20 %	40 %	385219977
83	NC_017372	TTAAT	2	10	112166	112175	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017372	TGATT	2	10	112775	112784	20 %	60 %	20 %	0 %	385219979
85	NC_017372	CTAAA	2	10	113248	113257	60 %	20 %	0 %	20 %	385219981
86	NC_017372	GATCG	2	10	117274	117283	20 %	20 %	40 %	20 %	385219983
87	NC_017372	AGCTC	2	10	117293	117302	20 %	20 %	20 %	40 %	385219983
88	NC_017372	AAGCC	2	10	119181	119190	40 %	0 %	20 %	40 %	385219984
89	NC_017372	TTTGA	2	10	122230	122239	20 %	60 %	20 %	0 %	385219986
90	NC_017372	GACTT	2	10	122764	122773	20 %	40 %	20 %	20 %	385219986
91	NC_017372	ATCTC	2	10	123515	123524	20 %	40 %	0 %	40 %	385219986
92	NC_017372	CGCTT	2	10	123673	123682	0 %	40 %	20 %	40 %	385219986
93	NC_017372	TTTGT	2	10	124026	124035	0 %	80 %	20 %	0 %	385219987
94	NC_017372	GAAAA	2	10	126220	126229	80 %	0 %	20 %	0 %	385219989
95	NC_017372	CGTTT	2	10	126487	126496	0 %	60 %	20 %	20 %	385219989
96	NC_017372	GAAAA	2	10	126538	126547	80 %	0 %	20 %	0 %	385219989
97	NC_017372	TTTTC	2	10	128367	128376	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017372	ATTTT	2	10	129492	129501	20 %	80 %	0 %	0 %	385219994
99	NC_017372	ATGTT	2	10	129574	129583	20 %	60 %	20 %	0 %	385219994
100	NC_017372	AGATT	2	10	130937	130946	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017372	AAATC	2	10	131981	131990	60 %	20 %	0 %	20 %	385219996
102	NC_017372	AAAAT	2	10	133453	133462	80 %	20 %	0 %	0 %	385219997
103	NC_017372	TTTTC	2	10	135800	135809	0 %	80 %	0 %	20 %	385220001
104	NC_017372	TTCTT	2	10	137756	137765	0 %	80 %	0 %	20 %	385220003
105	NC_017372	TCTTT	2	10	138249	138258	0 %	80 %	0 %	20 %	385220004
106	NC_017372	ACTTG	2	10	138462	138471	20 %	40 %	20 %	20 %	385220004
107	NC_017372	TTTTG	2	10	139423	139432	0 %	80 %	20 %	0 %	385220005
108	NC_017372	GCGAT	2	10	140216	140225	20 %	20 %	40 %	20 %	385220005
109	NC_017372	GCTTG	2	10	140472	140481	0 %	40 %	40 %	20 %	385220005
110	NC_017372	GTCCA	2	10	141077	141086	20 %	20 %	20 %	40 %	385220006
111	NC_017372	TTTTG	2	10	141125	141134	0 %	80 %	20 %	0 %	385220006
112	NC_017372	CCAAA	2	10	142965	142974	60 %	0 %	0 %	40 %	385220007
113	NC_017372	ACGCC	2	10	146487	146496	20 %	0 %	20 %	60 %	385220009
114	NC_017372	TTATT	2	10	148383	148392	20 %	80 %	0 %	0 %	385220013
115	NC_017372	GCGTT	2	10	148741	148750	0 %	40 %	40 %	20 %	385220015
116	NC_017372	ATTTG	2	10	149717	149726	20 %	60 %	20 %	0 %	385220016
117	NC_017372	CAAAT	2	10	151613	151622	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017372	AAAAC	2	10	152337	152346	80 %	0 %	0 %	20 %	385220019
119	NC_017372	GGGGA	2	10	152437	152446	20 %	0 %	80 %	0 %	385220019
120	NC_017372	AGATT	2	10	154236	154245	40 %	40 %	20 %	0 %	385220021
121	NC_017372	AAGCC	2	10	155575	155584	40 %	0 %	20 %	40 %	385220024
122	NC_017372	TAAAA	2	10	156578	156587	80 %	20 %	0 %	0 %	385220025
123	NC_017372	CCTTT	2	10	156906	156915	0 %	60 %	0 %	40 %	385220025
124	NC_017372	GGCAT	2	10	157375	157384	20 %	20 %	40 %	20 %	385220025
125	NC_017372	ATTTT	2	10	157611	157620	20 %	80 %	0 %	0 %	385220026
126	NC_017372	GGGTG	2	10	157967	157976	0 %	20 %	80 %	0 %	385220026
127	NC_017372	AAAAC	2	10	158872	158881	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017372	ATTCA	2	10	159106	159115	40 %	40 %	0 %	20 %	385220027
129	NC_017372	GTTGT	2	10	159859	159868	0 %	60 %	40 %	0 %	385220028
130	NC_017372	ATCTT	2	10	162508	162517	20 %	60 %	0 %	20 %	385220030
131	NC_017372	AAAGC	2	10	164513	164522	60 %	0 %	20 %	20 %	385220033
132	NC_017372	ATTTG	2	10	171883	171892	20 %	60 %	20 %	0 %	385220041
133	NC_017372	AATTG	2	10	172039	172048	40 %	40 %	20 %	0 %	385220042
134	NC_017372	AAATC	2	10	172122	172131	60 %	20 %	0 %	20 %	385220042
135	NC_017372	CTTAA	2	10	173886	173895	40 %	40 %	0 %	20 %	385220046
136	NC_017372	TCTTT	2	10	175447	175456	0 %	80 %	0 %	20 %	385220048
137	NC_017372	TTCAA	2	10	175642	175651	40 %	40 %	0 %	20 %	385220049
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