MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori India7 chromosome

Total Repeats: 4164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017372	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	385219874
2	NC_017372	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	385219875
3	NC_017372	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	385219876
4	NC_017372	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	385219877
5	NC_017372	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	385219877
6	NC_017372	TTAT	2	8	1856	1863	25 %	75 %	0 %	0 %	385219877
7	NC_017372	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	385219877
8	NC_017372	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	385219877
9	NC_017372	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	385219878
10	NC_017372	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	385219879
11	NC_017372	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	385219879
12	NC_017372	ATGA	2	8	3471	3478	50 %	25 %	25 %	0 %	385219879
13	NC_017372	AGAA	2	8	3779	3786	75 %	0 %	25 %	0 %	385219879
14	NC_017372	GCTT	2	8	5328	5335	0 %	50 %	25 %	25 %	385219880
15	NC_017372	CATT	2	8	5399	5406	25 %	50 %	0 %	25 %	385219880
16	NC_017372	CGTG	2	8	5976	5983	0 %	25 %	50 %	25 %	385219880
17	NC_017372	GCTT	2	8	6519	6526	0 %	50 %	25 %	25 %	385219880
18	NC_017372	TTTG	2	8	6677	6684	0 %	75 %	25 %	0 %	385219880
19	NC_017372	TGGT	2	8	6876	6883	0 %	50 %	50 %	0 %	385219880
20	NC_017372	ATCG	2	8	7059	7066	25 %	25 %	25 %	25 %	385219880
21	NC_017372	ATTG	2	8	7071	7078	25 %	50 %	25 %	0 %	385219880
22	NC_017372	CGTT	2	8	7094	7101	0 %	50 %	25 %	25 %	385219880
23	NC_017372	TTCA	2	8	7870	7877	25 %	50 %	0 %	25 %	385219881
24	NC_017372	TCTT	2	8	8164	8171	0 %	75 %	0 %	25 %	385219881
25	NC_017372	TTTG	2	8	10906	10913	0 %	75 %	25 %	0 %	385219883
26	NC_017372	GTTT	2	8	11002	11009	0 %	75 %	25 %	0 %	385219883
27	NC_017372	CTTT	2	8	11534	11541	0 %	75 %	0 %	25 %	385219883
28	NC_017372	ATTG	2	8	11881	11888	25 %	50 %	25 %	0 %	385219884
29	NC_017372	GCAA	2	8	12072	12079	50 %	0 %	25 %	25 %	385219884
30	NC_017372	TGCT	2	8	12277	12284	0 %	50 %	25 %	25 %	385219884
31	NC_017372	GCCA	2	8	12517	12524	25 %	0 %	25 %	50 %	385219884
32	NC_017372	TGCA	2	8	12760	12767	25 %	25 %	25 %	25 %	385219885
33	NC_017372	AGCA	2	8	12815	12822	50 %	0 %	25 %	25 %	385219885
34	NC_017372	TCTT	2	8	13560	13567	0 %	75 %	0 %	25 %	385219885
35	NC_017372	AGCG	2	8	14030	14037	25 %	0 %	50 %	25 %	385219887
36	NC_017372	GATT	2	8	14138	14145	25 %	50 %	25 %	0 %	385219887
37	NC_017372	CAAA	2	8	14307	14314	75 %	0 %	0 %	25 %	385219888
38	NC_017372	ATGC	2	8	14722	14729	25 %	25 %	25 %	25 %	385219888
39	NC_017372	GAGC	2	8	15027	15034	25 %	0 %	50 %	25 %	385219888
40	NC_017372	TTTA	2	8	15309	15316	25 %	75 %	0 %	0 %	385219888
41	NC_017372	CAGG	2	8	16467	16474	25 %	0 %	50 %	25 %	385219888
42	NC_017372	TGAT	2	8	16511	16518	25 %	50 %	25 %	0 %	385219888
43	NC_017372	GCTT	2	8	17506	17513	0 %	50 %	25 %	25 %	385219889
44	NC_017372	ATCT	2	8	18063	18070	25 %	50 %	0 %	25 %	385219889
45	NC_017372	GTTT	2	8	18281	18288	0 %	75 %	25 %	0 %	385219889
46	NC_017372	TTGA	2	8	18628	18635	25 %	50 %	25 %	0 %	385219890
47	NC_017372	TGCT	2	8	19004	19011	0 %	50 %	25 %	25 %	385219890
48	NC_017372	AGCG	2	8	19176	19183	25 %	0 %	50 %	25 %	385219890
49	NC_017372	TAAA	2	8	20682	20689	75 %	25 %	0 %	0 %	385219892
50	NC_017372	GCGA	2	8	20691	20698	25 %	0 %	50 %	25 %	385219892
51	NC_017372	AGGC	2	8	21123	21130	25 %	0 %	50 %	25 %	385219892
52	NC_017372	TGAT	2	8	21280	21287	25 %	50 %	25 %	0 %	385219893
53	NC_017372	TAAA	2	8	21441	21448	75 %	25 %	0 %	0 %	385219893
54	NC_017372	CTTT	2	8	21547	21554	0 %	75 %	0 %	25 %	385219893
55	NC_017372	AAGT	2	8	21859	21866	50 %	25 %	25 %	0 %	385219893
56	NC_017372	GCTT	2	8	21986	21993	0 %	50 %	25 %	25 %	385219893
57	NC_017372	CTTT	2	8	22618	22625	0 %	75 %	0 %	25 %	385219893
58	NC_017372	GTTG	2	8	22872	22879	0 %	50 %	50 %	0 %	385219894
59	NC_017372	GTTT	2	8	23607	23614	0 %	75 %	25 %	0 %	385219895
60	NC_017372	TTCC	2	8	24405	24412	0 %	50 %	0 %	50 %	385219895
61	NC_017372	TCCC	2	8	24750	24757	0 %	25 %	0 %	75 %	385219895
62	NC_017372	ATAA	2	8	26443	26450	75 %	25 %	0 %	0 %	385219896
63	NC_017372	GACA	2	8	26995	27002	50 %	0 %	25 %	25 %	385219896
64	NC_017372	AAGG	2	8	27837	27844	50 %	0 %	50 %	0 %	385219897
65	NC_017372	GCTC	2	8	27971	27978	0 %	25 %	25 %	50 %	385219897
66	NC_017372	ATGG	2	8	28419	28426	25 %	25 %	50 %	0 %	385219897
67	NC_017372	GAAT	2	8	28680	28687	50 %	25 %	25 %	0 %	385219898
68	NC_017372	TGGC	2	8	28903	28910	0 %	25 %	50 %	25 %	385219898
69	NC_017372	TTTA	2	8	29056	29063	25 %	75 %	0 %	0 %	385219898
70	NC_017372	TGCT	2	8	29942	29949	0 %	50 %	25 %	25 %	385219900
71	NC_017372	AGCA	2	8	30059	30066	50 %	0 %	25 %	25 %	385219900
72	NC_017372	CAAT	2	8	30073	30080	50 %	25 %	0 %	25 %	385219900
73	NC_017372	TTGA	2	8	30593	30600	25 %	50 %	25 %	0 %	385219900
74	NC_017372	AAAT	2	8	30911	30918	75 %	25 %	0 %	0 %	385219900
75	NC_017372	GTTT	2	8	31000	31007	0 %	75 %	25 %	0 %	385219900
76	NC_017372	TTTA	2	8	31660	31667	25 %	75 %	0 %	0 %	385219901
77	NC_017372	GCGA	2	8	31858	31865	25 %	0 %	50 %	25 %	385219901
78	NC_017372	ACCC	2	8	31999	32006	25 %	0 %	0 %	75 %	385219902
79	NC_017372	CATC	2	8	32125	32132	25 %	25 %	0 %	50 %	385219902
80	NC_017372	TCAA	2	8	32267	32274	50 %	25 %	0 %	25 %	385219903
81	NC_017372	CATG	2	8	33390	33397	25 %	25 %	25 %	25 %	385219903
82	NC_017372	GAAA	2	8	33498	33505	75 %	0 %	25 %	0 %	385219903
83	NC_017372	CGCT	2	8	33506	33513	0 %	25 %	25 %	50 %	385219903
84	NC_017372	TTGC	2	8	33894	33901	0 %	50 %	25 %	25 %	385219903
85	NC_017372	GCTT	2	8	34405	34412	0 %	50 %	25 %	25 %	385219903
86	NC_017372	GAAA	2	8	34437	34444	75 %	0 %	25 %	0 %	385219903
87	NC_017372	GAAA	2	8	34464	34471	75 %	0 %	25 %	0 %	385219903
88	NC_017372	ATGA	2	8	34745	34752	50 %	25 %	25 %	0 %	385219904
89	NC_017372	GGGC	2	8	34845	34852	0 %	0 %	75 %	25 %	385219905
90	NC_017372	TTGT	2	8	36340	36347	0 %	75 %	25 %	0 %	385219907
91	NC_017372	CTTT	2	8	36487	36494	0 %	75 %	0 %	25 %	385219907
92	NC_017372	AATA	2	8	37164	37171	75 %	25 %	0 %	0 %	385219907
93	NC_017372	TAAA	2	8	37186	37193	75 %	25 %	0 %	0 %	385219907
94	NC_017372	GAAA	2	8	37315	37322	75 %	0 %	25 %	0 %	385219908
95	NC_017372	GTTC	2	8	37643	37650	0 %	50 %	25 %	25 %	385219908
96	NC_017372	ATGA	2	8	37892	37899	50 %	25 %	25 %	0 %	385219908
97	NC_017372	TTTG	2	8	37945	37952	0 %	75 %	25 %	0 %	385219908
98	NC_017372	TGAT	2	8	38429	38436	25 %	50 %	25 %	0 %	385219909
99	NC_017372	CCAA	2	8	39185	39192	50 %	0 %	0 %	50 %	385219910
100	NC_017372	CAAA	2	8	39400	39407	75 %	0 %	0 %	25 %	385219910
101	NC_017372	ATTG	2	8	39814	39821	25 %	50 %	25 %	0 %	385219910
102	NC_017372	ATCA	2	8	39989	39996	50 %	25 %	0 %	25 %	385219910
103	NC_017372	TCAA	2	8	40002	40009	50 %	25 %	0 %	25 %	385219910
104	NC_017372	TGTT	2	8	40776	40783	0 %	75 %	25 %	0 %	385219911
105	NC_017372	TGAA	2	8	40905	40912	50 %	25 %	25 %	0 %	385219911
106	NC_017372	AAAC	2	8	41244	41251	75 %	0 %	0 %	25 %	385219911
107	NC_017372	CTTT	2	8	41369	41376	0 %	75 %	0 %	25 %	385219911
108	NC_017372	TTGT	2	8	42289	42296	0 %	75 %	25 %	0 %	385219912
109	NC_017372	CACC	2	8	42375	42382	25 %	0 %	0 %	75 %	385219912
110	NC_017372	GCGT	2	8	42420	42427	0 %	25 %	50 %	25 %	385219912
111	NC_017372	ATGA	2	8	42780	42787	50 %	25 %	25 %	0 %	385219912
112	NC_017372	TATT	2	8	42897	42904	25 %	75 %	0 %	0 %	385219913
113	NC_017372	AAAG	2	8	43137	43144	75 %	0 %	25 %	0 %	385219913
114	NC_017372	AACG	2	8	43172	43179	50 %	0 %	25 %	25 %	385219913
115	NC_017372	CAAA	2	8	43619	43626	75 %	0 %	0 %	25 %	385219913
116	NC_017372	AAAC	2	8	44471	44478	75 %	0 %	0 %	25 %	385219915
117	NC_017372	CATT	2	8	44599	44606	25 %	50 %	0 %	25 %	385219915
118	NC_017372	CGCT	2	8	44612	44619	0 %	25 %	25 %	50 %	385219915
119	NC_017372	GTTT	2	8	45234	45241	0 %	75 %	25 %	0 %	385219915
120	NC_017372	CAAA	2	8	45730	45737	75 %	0 %	0 %	25 %	385219916
121	NC_017372	CGCT	2	8	46078	46085	0 %	25 %	25 %	50 %	385219916
122	NC_017372	AGGG	2	8	46556	46563	25 %	0 %	75 %	0 %	385219916
123	NC_017372	GCAA	2	8	47209	47216	50 %	0 %	25 %	25 %	385219916
124	NC_017372	TAAA	2	8	47478	47485	75 %	25 %	0 %	0 %	385219916
125	NC_017372	TTTA	2	8	47890	47897	25 %	75 %	0 %	0 %	385219917
126	NC_017372	AGCG	2	8	47901	47908	25 %	0 %	50 %	25 %	385219917
127	NC_017372	ACCA	2	8	48793	48800	50 %	0 %	0 %	50 %	385219918
128	NC_017372	CTTT	2	8	48867	48874	0 %	75 %	0 %	25 %	385219918
129	NC_017372	GATT	2	8	49053	49060	25 %	50 %	25 %	0 %	385219918
130	NC_017372	AAAC	2	8	49703	49710	75 %	0 %	0 %	25 %	385219921
131	NC_017372	AGCC	2	8	49903	49910	25 %	0 %	25 %	50 %	385219921
132	NC_017372	CAAG	2	8	50382	50389	50 %	0 %	25 %	25 %	385219921
133	NC_017372	AAGA	2	8	50424	50431	75 %	0 %	25 %	0 %	385219921
134	NC_017372	TCGC	2	8	50949	50956	0 %	25 %	25 %	50 %	385219921
135	NC_017372	ATTT	2	8	51146	51153	25 %	75 %	0 %	0 %	385219922
136	NC_017372	TCGT	2	8	51481	51488	0 %	50 %	25 %	25 %	385219922
137	NC_017372	GTTA	2	8	51775	51782	25 %	50 %	25 %	0 %	385219922
138	NC_017372	TCTG	2	8	52441	52448	0 %	50 %	25 %	25 %	385219922
139	NC_017372	TTTG	2	8	53310	53317	0 %	75 %	25 %	0 %	385219922
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