MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Gambia94/24 chromosome

Total Repeats: 811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017371	TTGTAA	2	12	867	878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385218268
2	NC_017371	ATTATA	2	12	1794	1805	50 %	50 %	0 %	0 %	385218270
3	NC_017371	CGCTTG	2	12	6519	6530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385218274
4	NC_017371	GAAACC	2	12	7951	7962	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385218276
5	NC_017371	ATTATA	2	12	9971	9982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017371	ATTTGA	2	12	13153	13164	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385218280
7	NC_017371	AAACAC	2	12	18529	18540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017371	AGAAAA	2	12	18879	18890	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385218285
9	NC_017371	GTTTGG	2	12	21502	21513	0 %	50 %	50 %	0 %	385218288
10	NC_017371	TTAGCG	2	12	24632	24643	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385218289
11	NC_017371	TATCAA	2	12	30365	30376	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385218295
12	NC_017371	TCCCTA	2	12	30827	30838	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385218295
13	NC_017371	TCTTAT	2	12	31064	31075	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385218295
14	NC_017371	AAGGCT	2	12	32294	32305	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385218296
15	NC_017371	GCGTGG	2	12	33096	33107	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385218298
16	NC_017371	TAATGA	2	12	33232	33243	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385218298
17	NC_017371	TTGAAT	2	12	34295	34306	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385218298
18	NC_017371	TAAGGA	2	12	34594	34605	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385218298
19	NC_017371	GCTAGG	2	12	36102	36113	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385218301
20	NC_017371	TTCTAC	2	12	37594	37605	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385218302
21	NC_017371	CAAAAT	2	12	41550	41561	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385218307
22	NC_017371	GACCGT	2	12	44935	44946	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385218311
23	NC_017371	AGACTT	2	12	45249	45260	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017371	CGCAAA	2	12	46101	46112	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385218312
25	NC_017371	TTTTCA	2	12	49870	49881	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385218315
26	NC_017371	GGCTAG	2	12	50344	50355	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385218316
27	NC_017371	CTTTTT	2	12	54951	54962	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385218321
28	NC_017371	TAAAAA	2	12	58674	58685	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385218322
29	NC_017371	CCACGC	2	12	60429	60440	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385218323
30	NC_017371	CTAAAG	2	12	61716	61727	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385218323
31	NC_017371	AATTTT	2	12	63676	63687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218326
32	NC_017371	GAAAAC	2	12	64266	64277	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017371	GATGTG	2	12	65214	65225	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017371	AGCCAA	2	12	65292	65303	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017371	AAAAGA	2	12	66314	66325	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017371	CCAACA	2	12	67159	67170	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017371	TTTTGT	2	12	67497	67508	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385218327
38	NC_017371	AAAGAG	2	12	67776	67787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218327
39	NC_017371	ACAGAA	2	12	69656	69667	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385218329
40	NC_017371	AGCGGG	2	12	71457	71468	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017371	AAGGGC	2	12	82015	82026	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385218343
42	NC_017371	CAACGA	2	12	84348	84359	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385218345
43	NC_017371	GGCATG	2	12	85874	85885	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385218346
44	NC_017371	ACACCG	2	12	86829	86840	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385218346
45	NC_017371	ATATTG	2	12	87687	87698	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385218348
46	NC_017371	TTGTTT	2	12	95773	95784	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385218356
47	NC_017371	GGCTTT	2	12	97025	97036	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385218358
48	NC_017371	TACAAA	2	12	98061	98072	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017371	CAAGCA	2	12	99636	99647	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385218360
50	NC_017371	ATTAGA	2	12	99936	99947	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385218360
51	NC_017371	GATTTT	2	12	101696	101707	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385218362
52	NC_017371	AAACTC	2	12	101813	101824	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385218362
53	NC_017371	TCAAAA	2	12	103125	103136	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385218363
54	NC_017371	TATCGT	2	12	103704	103715	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385218364
55	NC_017371	GCGGTG	2	12	103823	103834	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385218364
56	NC_017371	TTAATT	2	12	104358	104369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218364
57	NC_017371	CAATAT	2	12	107036	107047	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385218365
58	NC_017371	CCTAAA	2	12	111748	111759	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385218369
59	NC_017371	TTTTCT	2	12	119433	119444	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385218375
60	NC_017371	ATTGCC	2	12	123533	123544	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385218379
61	NC_017371	CGCTCG	2	12	124440	124451	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385218380
62	NC_017371	TAGGCA	2	12	126978	126989	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385218381
63	NC_017371	CTTCTA	2	12	129316	129327	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385218383
64	NC_017371	TGAATT	2	12	131550	131561	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385218384
65	NC_017371	TTTCAA	2	12	131709	131720	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385218384
66	NC_017371	AAAAGC	2	12	135056	135067	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385218387
67	NC_017371	GGTTTT	2	12	136069	136080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017371	TGGTTT	2	12	136583	136594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218390
69	NC_017371	TCATGA	2	12	137976	137987	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385218391
70	NC_017371	TTTCAT	2	12	140830	140841	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385218393
71	NC_017371	ACGCTC	2	12	141563	141574	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385218394
72	NC_017371	AAAAAT	2	12	144519	144530	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385218396
73	NC_017371	CAAACA	2	12	148082	148093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017371	ACGATT	2	12	149182	149193	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385218401
75	NC_017371	TTAGCG	2	12	149551	149562	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385218401
76	NC_017371	TATCGC	2	12	149763	149774	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385218401
77	NC_017371	TTTTAG	2	12	150878	150889	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385218402
78	NC_017371	ATCGCT	2	12	151471	151482	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385218402
79	NC_017371	ATTGAG	2	12	152118	152129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218403
80	NC_017371	TTCTAT	2	12	154854	154865	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385218405
81	NC_017371	TTTTAG	2	12	155216	155227	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385218405
82	NC_017371	TTGTTT	2	12	157842	157853	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385218410
83	NC_017371	TTGGGT	2	12	163812	163823	0 %	50 %	50 %	0 %	385218417
84	NC_017371	GATTTT	2	12	164325	164336	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385218418
85	NC_017371	CATGCT	2	12	165306	165317	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385218420
86	NC_017371	ATGGCG	2	12	167571	167582	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385218422
87	NC_017371	CTTTCT	2	12	167822	167833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218422
88	NC_017371	TTTCAC	2	12	168909	168920	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017371	CCGCTC	2	12	169736	169747	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385218424
90	NC_017371	AACCCA	2	12	170888	170899	50 %	0 %	0 %	50 %	385218425
91	NC_017371	TAAAAA	2	12	172819	172830	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017371	TAGTGG	2	12	174117	174128	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385218430
93	NC_017371	ATCGTT	2	12	176781	176792	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385218432
94	NC_017371	AATTTC	2	12	177132	177143	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385218433
95	NC_017371	ACTTCT	2	12	178222	178233	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385218433
96	NC_017371	TTCTTT	2	12	179066	179077	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385218434
97	NC_017371	ATTTTG	2	12	180455	180466	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385218437
98	NC_017371	ACTTAT	2	12	181030	181041	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385218437
99	NC_017371	GTTTAA	2	12	181717	181728	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385218438
100	NC_017371	TGGTTA	2	12	184391	184402	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385218440
101	NC_017371	ATTTTT	2	12	184439	184450	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385218440
102	NC_017371	CCGCTC	2	12	184972	184983	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385218441
103	NC_017371	GAGATA	2	12	186556	186567	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017371	TGGTAG	2	12	186622	186633	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385218443
105	NC_017371	GAAAAA	2	12	188610	188621	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385218444
106	NC_017371	AGGCAT	2	12	188699	188710	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385218444
107	NC_017371	GCATTT	2	12	190411	190422	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385218446
108	NC_017371	GGCGAG	2	12	190451	190462	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385218446
109	NC_017371	ATAAAG	2	12	191142	191153	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385218447
110	NC_017371	TTAAAG	2	12	194018	194029	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385218449
111	NC_017371	GGTATT	2	12	194920	194931	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385218450
112	NC_017371	TCTAAA	2	12	195150	195161	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385218450
113	NC_017371	TGGGCA	2	12	196219	196230	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385218451
114	NC_017371	ATTTTC	2	12	198643	198654	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385218452
115	NC_017371	TGGTTT	2	12	202396	202407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017371	CGCTAT	2	12	202765	202776	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385218457
117	NC_017371	TTTCTT	2	12	203230	203241	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385218457
118	NC_017371	TAGGTT	2	12	204091	204102	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385218458
119	NC_017371	TTCTAG	2	12	205503	205514	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385218460
120	NC_017371	TTCTTT	2	12	206597	206608	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385218462
121	NC_017371	CATAAA	2	12	208376	208387	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385218465
122	NC_017371	TTCTAA	2	12	208461	208472	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385218465
123	NC_017371	AACGAT	2	12	210246	210257	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385218469
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128	NC_017371	TGGGGC	2	12	222077	222088	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385218486
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131	NC_017371	AAAAAC	2	12	234469	234480	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017371	ATTCTA	2	12	234780	234791	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385218498
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136	NC_017371	ACTTTA	2	12	241599	241610	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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138	NC_017371	CCCTAA	2	12	249323	249334	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017371	AATGCC	2	12	249530	249541	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385218511
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147	NC_017371	TCCCGC	2	12	275025	275036	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385218538
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217	NC_017371	CTTGCA	2	12	400405	400416	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385218657
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221	NC_017371	TTTCGT	2	12	404725	404736	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385218660
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230	NC_017371	TGAAAA	2	12	423286	423297	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385218684
231	NC_017371	AATTTA	2	12	427798	427809	50 %	50 %	0 %	0 %	385218688
232	NC_017371	AAAATC	2	12	429517	429528	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385218690
233	NC_017371	AAATTC	2	12	430163	430174	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385218690
234	NC_017371	TTATGG	2	12	435850	435861	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385218695
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353	NC_017371	TGGGGG	2	12	690616	690627	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	385218922
354	NC_017371	GAAATT	2	12	691824	691835	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385218924
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360	NC_017371	ATTACC	2	12	696571	696582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218929
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459	NC_017371	GCTCAA	2	12	926672	926683	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385219138
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