MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Gambia94/24 chromosome

Total Repeats: 1390

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017371	TCATT	2	10	4912	4921	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017371	GTTTT	2	10	4924	4933	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017371	TTGAT	2	10	6490	6499	20 %	60 %	20 %	0 %	385218274
4	NC_017371	TTGCT	2	10	6607	6616	0 %	60 %	20 %	20 %	385218274
5	NC_017371	TTTTA	2	10	7670	7679	20 %	80 %	0 %	0 %	385218275
6	NC_017371	TTTCT	2	10	8615	8624	0 %	80 %	0 %	20 %	385218276
7	NC_017371	AATTT	2	10	9454	9463	40 %	60 %	0 %	0 %	385218276
8	NC_017371	TGCCA	2	10	12079	12088	20 %	20 %	20 %	40 %	385218279
9	NC_017371	TTTTG	2	10	12135	12144	0 %	80 %	20 %	0 %	385218279
10	NC_017371	TGGTG	2	10	12974	12983	0 %	40 %	60 %	0 %	385218280
11	NC_017371	GCTTT	2	10	13800	13809	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017371	CCATG	2	10	23685	23694	20 %	20 %	20 %	40 %	385218289
13	NC_017371	CTCTT	2	10	23715	23724	0 %	60 %	0 %	40 %	385218289
14	NC_017371	TTGAT	2	10	25201	25210	20 %	60 %	20 %	0 %	385218289
15	NC_017371	GTTTG	2	10	25923	25932	0 %	60 %	40 %	0 %	385218290
16	NC_017371	TTTTA	2	10	27581	27590	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017371	CAAGC	2	10	28390	28399	40 %	0 %	20 %	40 %	385218292
18	NC_017371	GCTGG	2	10	28763	28772	0 %	20 %	60 %	20 %	385218292
19	NC_017371	TGGGT	2	10	28827	28836	0 %	40 %	60 %	0 %	385218292
20	NC_017371	TTTTA	2	10	29313	29322	20 %	80 %	0 %	0 %	385218293
21	NC_017371	TCAAA	2	10	31148	31157	60 %	20 %	0 %	20 %	385218295
22	NC_017371	TCATA	2	10	31793	31802	40 %	40 %	0 %	20 %	385218295
23	NC_017371	TGATT	2	10	32374	32383	20 %	60 %	20 %	0 %	385218296
24	NC_017371	GTGGG	2	10	34257	34266	0 %	20 %	80 %	0 %	385218298
25	NC_017371	ATCAA	2	10	36389	36398	60 %	20 %	0 %	20 %	385218301
26	NC_017371	ATTTT	2	10	37053	37062	20 %	80 %	0 %	0 %	385218302
27	NC_017371	TTTTG	2	10	38885	38894	0 %	80 %	20 %	0 %	385218305
28	NC_017371	TGAGT	2	10	40905	40914	20 %	40 %	40 %	0 %	385218307
29	NC_017371	AAGCC	2	10	41290	41299	40 %	0 %	20 %	40 %	385218307
30	NC_017371	AGAAA	2	10	42620	42629	80 %	0 %	20 %	0 %	385218308
31	NC_017371	GCTGG	2	10	43265	43274	0 %	20 %	60 %	20 %	385218308
32	NC_017371	TTACT	2	10	43472	43481	20 %	60 %	0 %	20 %	385218309
33	NC_017371	TCTTT	2	10	45028	45037	0 %	80 %	0 %	20 %	385218311
34	NC_017371	TAAAA	2	10	46036	46045	80 %	20 %	0 %	0 %	385218312
35	NC_017371	GCTCC	2	10	47369	47378	0 %	20 %	20 %	60 %	385218313
36	NC_017371	AAAAT	2	10	47548	47557	80 %	20 %	0 %	0 %	385218313
37	NC_017371	TCGCA	2	10	47906	47915	20 %	20 %	20 %	40 %	385218313
38	NC_017371	TGATT	2	10	48560	48569	20 %	60 %	20 %	0 %	385218313
39	NC_017371	CAATA	2	10	49474	49483	60 %	20 %	0 %	20 %	385218314
40	NC_017371	TGCCT	2	10	50162	50171	0 %	40 %	20 %	40 %	385218315
41	NC_017371	GATTG	2	10	50646	50655	20 %	40 %	40 %	0 %	385218316
42	NC_017371	TTAGC	2	10	51094	51103	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017371	TAAAA	2	10	51893	51902	80 %	20 %	0 %	0 %	385218317
44	NC_017371	ATTTC	2	10	51968	51977	20 %	60 %	0 %	20 %	385218317
45	NC_017371	GATAA	2	10	53453	53462	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017371	CCAAA	2	10	54779	54788	60 %	0 %	0 %	40 %	385218321
47	NC_017371	TAAAA	2	10	56830	56839	80 %	20 %	0 %	0 %	385218321
48	NC_017371	ATCAA	2	10	56861	56870	60 %	20 %	0 %	20 %	385218321
49	NC_017371	TGAAA	2	10	57593	57602	60 %	20 %	20 %	0 %	385218322
50	NC_017371	TCAAA	2	10	57847	57856	60 %	20 %	0 %	20 %	385218322
51	NC_017371	TAAAA	2	10	60886	60895	80 %	20 %	0 %	0 %	385218323
52	NC_017371	CAACA	2	10	61255	61264	60 %	0 %	0 %	40 %	385218323
53	NC_017371	TCAAA	2	10	61602	61611	60 %	20 %	0 %	20 %	385218323
54	NC_017371	AACGA	2	10	62606	62615	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017371	TTAAA	2	10	62618	62627	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017371	ACAAA	2	10	62646	62655	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017371	ATATA	2	10	62963	62972	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017371	GATAC	2	10	67133	67142	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017371	GGTGG	2	10	71378	71387	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017371	ATACC	2	10	72050	72059	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017371	ATCGC	2	10	72319	72328	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017371	TTTCT	2	10	75106	75115	0 %	80 %	0 %	20 %	385218336
63	NC_017371	CTTGG	2	10	75369	75378	0 %	40 %	40 %	20 %	385218336
64	NC_017371	CTTCT	2	10	75423	75432	0 %	60 %	0 %	40 %	385218336
65	NC_017371	TGCCT	2	10	75500	75509	0 %	40 %	20 %	40 %	385218336
66	NC_017371	TCCAA	2	10	75912	75921	40 %	20 %	0 %	40 %	385218337
67	NC_017371	CAAAA	2	10	76229	76238	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017371	TTTTG	2	10	79242	79251	0 %	80 %	20 %	0 %	385218340
69	NC_017371	ACGCC	2	10	79548	79557	20 %	0 %	20 %	60 %	385218340
70	NC_017371	AAAGC	2	10	80313	80322	60 %	0 %	20 %	20 %	385218341
71	NC_017371	TTACA	2	10	81095	81104	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017371	ACGAT	2	10	81558	81567	40 %	20 %	20 %	20 %	385218343
73	NC_017371	TAAAA	2	10	82763	82772	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017371	TTTTG	2	10	85193	85202	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017371	GATTT	2	10	85204	85213	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017371	CCTCA	2	10	87743	87752	20 %	20 %	0 %	60 %	385218348
77	NC_017371	TTTTC	2	10	88689	88698	0 %	80 %	0 %	20 %	385218348
78	NC_017371	ATGCC	2	10	89826	89835	20 %	20 %	20 %	40 %	385218350
79	NC_017371	TTGAT	2	10	90913	90922	20 %	60 %	20 %	0 %	385218353
80	NC_017371	GGCGT	2	10	92727	92736	0 %	20 %	60 %	20 %	385218355
81	NC_017371	CAATT	2	10	95313	95322	40 %	40 %	0 %	20 %	385218356
82	NC_017371	TAAGA	2	10	95937	95946	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017371	ATTAT	2	10	95993	96002	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017371	TTCCA	2	10	96079	96088	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017371	CTTTC	2	10	96321	96330	0 %	60 %	0 %	40 %	385218357
86	NC_017371	TGATT	2	10	99282	99291	20 %	60 %	20 %	0 %	385218360
87	NC_017371	GGCTT	2	10	100604	100613	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017371	ATAAA	2	10	102604	102613	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017371	TAGTA	2	10	105202	105211	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017371	ACGAT	2	10	105577	105586	40 %	20 %	20 %	20 %	385218365
91	NC_017371	AATTG	2	10	107419	107428	40 %	40 %	20 %	0 %	385218366
92	NC_017371	TCGTT	2	10	109320	109329	0 %	60 %	20 %	20 %	385218367
93	NC_017371	GTGGG	2	10	109642	109651	0 %	20 %	80 %	0 %	385218368
94	NC_017371	AAAGC	2	10	115401	115410	60 %	0 %	20 %	20 %	385218372
95	NC_017371	AATGG	2	10	116423	116432	40 %	20 %	40 %	0 %	385218373
96	NC_017371	GAATG	2	10	116629	116638	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017371	CAAAT	2	10	117953	117962	60 %	20 %	0 %	20 %	385218374
98	NC_017371	CGTTT	2	10	118586	118595	0 %	60 %	20 %	20 %	385218374
99	NC_017371	ACCCT	2	10	119382	119391	20 %	20 %	0 %	60 %	385218375
100	NC_017371	ATGCC	2	10	119514	119523	20 %	20 %	20 %	40 %	385218375
101	NC_017371	ATTTA	2	10	120902	120911	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017371	TGATT	2	10	121508	121517	20 %	60 %	20 %	0 %	385218377
103	NC_017371	GATCG	2	10	126008	126017	20 %	20 %	40 %	20 %	385218381
104	NC_017371	AGCTC	2	10	126027	126036	20 %	20 %	20 %	40 %	385218381
105	NC_017371	AAGCC	2	10	127912	127921	40 %	0 %	20 %	40 %	385218382
106	NC_017371	CCATA	2	10	128790	128799	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_017371	TGATC	2	10	129968	129977	20 %	40 %	20 %	20 %	385218383
108	NC_017371	TTTGA	2	10	131035	131044	20 %	60 %	20 %	0 %	385218384
109	NC_017371	ATCTC	2	10	132320	132329	20 %	40 %	0 %	40 %	385218384
110	NC_017371	TGCGT	2	10	134870	134879	0 %	40 %	40 %	20 %	385218387
111	NC_017371	GAAAA	2	10	135031	135040	80 %	0 %	20 %	0 %	385218387
112	NC_017371	ATTTT	2	10	137575	137584	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017371	ATTTT	2	10	138453	138462	20 %	80 %	0 %	0 %	385218392
114	NC_017371	ATGTT	2	10	138535	138544	20 %	60 %	20 %	0 %	385218392
115	NC_017371	AAAAG	2	10	138947	138956	80 %	0 %	20 %	0 %	385218392
116	NC_017371	TTTTA	2	10	139607	139616	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017371	AAATC	2	10	140992	141001	60 %	20 %	0 %	20 %	385218393
118	NC_017371	AAAAT	2	10	142464	142473	80 %	20 %	0 %	0 %	385218394
119	NC_017371	TTTTC	2	10	145019	145028	0 %	80 %	0 %	20 %	385218397
120	NC_017371	TTCTT	2	10	146975	146984	0 %	80 %	0 %	20 %	385218399
121	NC_017371	TCTTT	2	10	147469	147478	0 %	80 %	0 %	20 %	385218400
122	NC_017371	GTTTT	2	10	148635	148644	0 %	80 %	20 %	0 %	385218401
123	NC_017371	AATTC	2	10	149270	149279	40 %	40 %	0 %	20 %	385218401
124	NC_017371	GCGAT	2	10	149429	149438	20 %	20 %	40 %	20 %	385218401
125	NC_017371	GCTTG	2	10	149685	149694	0 %	40 %	40 %	20 %	385218401
126	NC_017371	GTTTT	2	10	150336	150345	0 %	80 %	20 %	0 %	385218402
127	NC_017371	CCAAA	2	10	152177	152186	60 %	0 %	0 %	40 %	385218403
128	NC_017371	TAAAA	2	10	153780	153789	80 %	20 %	0 %	0 %	385218404
129	NC_017371	ACGCC	2	10	155699	155708	20 %	0 %	20 %	60 %	385218405
130	NC_017371	ATTTG	2	10	158938	158947	20 %	60 %	20 %	0 %	385218412
131	NC_017371	GTTTT	2	10	161191	161200	0 %	80 %	20 %	0 %	385218414
132	NC_017371	CAAAT	2	10	161358	161367	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017371	AAAAC	2	10	162082	162091	80 %	0 %	0 %	20 %	385218415
134	NC_017371	AGATT	2	10	163981	163990	40 %	40 %	20 %	0 %	385218417
135	NC_017371	ATTCA	2	10	169044	169053	40 %	40 %	0 %	20 %	385218423
136	NC_017371	ATCTT	2	10	172444	172453	20 %	60 %	0 %	20 %	385218426
137	NC_017371	TAAAA	2	10	173059	173068	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017371	AAAAC	2	10	173090	173099	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017371	AAAGC	2	10	174638	174647	60 %	0 %	20 %	20 %	385218430
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