MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Gambia94/24 chromosome

Total Repeats: 4873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017371	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	385218267
2	NC_017371	TTCT	2	8	259	266	0 %	75 %	0 %	25 %	385218267
3	NC_017371	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	385218268
4	NC_017371	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	385218269
5	NC_017371	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	385218269
6	NC_017371	CCTG	2	8	1809	1816	0 %	25 %	25 %	50 %	385218270
7	NC_017371	CCAA	2	8	1833	1840	50 %	0 %	0 %	50 %	385218270
8	NC_017371	TGAA	2	8	1873	1880	50 %	25 %	25 %	0 %	385218270
9	NC_017371	AATG	2	8	2063	2070	50 %	25 %	25 %	0 %	385218270
10	NC_017371	ATTC	2	8	2348	2355	25 %	50 %	0 %	25 %	385218270
11	NC_017371	CTTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	385218271
12	NC_017371	CAAA	2	8	3100	3107	75 %	0 %	0 %	25 %	385218271
13	NC_017371	GAAA	2	8	3321	3328	75 %	0 %	25 %	0 %	385218272
14	NC_017371	GAAA	2	8	3778	3785	75 %	0 %	25 %	0 %	385218272
15	NC_017371	ATAG	2	8	3832	3839	50 %	25 %	25 %	0 %	385218272
16	NC_017371	TAAC	2	8	5032	5039	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017371	ACTA	2	8	5052	5059	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017371	AAAG	2	8	5149	5156	75 %	0 %	25 %	0 %	385218273
19	NC_017371	AAAG	2	8	5164	5171	75 %	0 %	25 %	0 %	385218273
20	NC_017371	AAAG	2	8	5179	5186	75 %	0 %	25 %	0 %	385218273
21	NC_017371	AAAG	2	8	5194	5201	75 %	0 %	25 %	0 %	385218273
22	NC_017371	AAAG	2	8	5209	5216	75 %	0 %	25 %	0 %	385218273
23	NC_017371	AAAG	2	8	5224	5231	75 %	0 %	25 %	0 %	385218273
24	NC_017371	AAAG	2	8	5239	5246	75 %	0 %	25 %	0 %	385218273
25	NC_017371	AAAG	2	8	5373	5380	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017371	TCGC	2	8	5623	5630	0 %	25 %	25 %	50 %	385218274
27	NC_017371	TTGT	2	8	5976	5983	0 %	75 %	25 %	0 %	385218274
28	NC_017371	ATCG	2	8	7248	7255	25 %	25 %	25 %	25 %	385218274
29	NC_017371	CGTT	2	8	7283	7290	0 %	50 %	25 %	25 %	385218274
30	NC_017371	GTTT	2	8	7637	7644	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017371	TCGC	2	8	8320	8327	0 %	25 %	25 %	50 %	385218276
32	NC_017371	CGTT	2	8	8855	8862	0 %	50 %	25 %	25 %	385218276
33	NC_017371	TGTT	2	8	9494	9501	0 %	75 %	25 %	0 %	385218277
34	NC_017371	ATAA	2	8	9877	9884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017371	TATT	2	8	10066	10073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017371	GATA	2	8	10171	10178	50 %	25 %	25 %	0 %	385218278
37	NC_017371	TCAA	2	8	10278	10285	50 %	25 %	0 %	25 %	385218278
38	NC_017371	TAAA	2	8	10620	10627	75 %	25 %	0 %	0 %	385218278
39	NC_017371	ACAA	2	8	10860	10867	75 %	0 %	0 %	25 %	385218278
40	NC_017371	AAAG	2	8	11079	11086	75 %	0 %	25 %	0 %	385218278
41	NC_017371	TTTG	2	8	11098	11105	0 %	75 %	25 %	0 %	385218278
42	NC_017371	GCTC	2	8	11721	11728	0 %	25 %	25 %	50 %	385218278
43	NC_017371	GCAA	2	8	12264	12271	50 %	0 %	25 %	25 %	385218279
44	NC_017371	TGCT	2	8	12469	12476	0 %	50 %	25 %	25 %	385218279
45	NC_017371	GCCG	2	8	12733	12740	0 %	0 %	50 %	50 %	385218279
46	NC_017371	TATT	2	8	12847	12854	25 %	75 %	0 %	0 %	385218279
47	NC_017371	AGCA	2	8	13006	13013	50 %	0 %	25 %	25 %	385218280
48	NC_017371	GCAG	2	8	13169	13176	25 %	0 %	50 %	25 %	385218280
49	NC_017371	GTTT	2	8	13364	13371	0 %	75 %	25 %	0 %	385218280
50	NC_017371	TCTT	2	8	13751	13758	0 %	75 %	0 %	25 %	385218280
51	NC_017371	AGCG	2	8	14221	14228	25 %	0 %	50 %	25 %	385218282
52	NC_017371	GATT	2	8	14329	14336	25 %	50 %	25 %	0 %	385218282
53	NC_017371	CAAA	2	8	14498	14505	75 %	0 %	0 %	25 %	385218283
54	NC_017371	TTTA	2	8	15500	15507	25 %	75 %	0 %	0 %	385218283
55	NC_017371	CAGG	2	8	16658	16665	25 %	0 %	50 %	25 %	385218283
56	NC_017371	AGTT	2	8	16830	16837	25 %	50 %	25 %	0 %	385218283
57	NC_017371	GCTT	2	8	17681	17688	0 %	50 %	25 %	25 %	385218284
58	NC_017371	TGAT	2	8	17915	17922	25 %	50 %	25 %	0 %	385218284
59	NC_017371	GTTT	2	8	18456	18463	0 %	75 %	25 %	0 %	385218284
60	NC_017371	TGAT	2	8	18809	18816	25 %	50 %	25 %	0 %	385218285
61	NC_017371	AGCG	2	8	19356	19363	25 %	0 %	50 %	25 %	385218285
62	NC_017371	TAAA	2	8	20891	20898	75 %	25 %	0 %	0 %	385218287
63	NC_017371	GCGA	2	8	20900	20907	25 %	0 %	50 %	25 %	385218287
64	NC_017371	TAAA	2	8	21651	21658	75 %	25 %	0 %	0 %	385218288
65	NC_017371	CTTT	2	8	21757	21764	0 %	75 %	0 %	25 %	385218288
66	NC_017371	AAGT	2	8	22069	22076	50 %	25 %	25 %	0 %	385218288
67	NC_017371	CTTT	2	8	22834	22841	0 %	75 %	0 %	25 %	385218288
68	NC_017371	ATCA	2	8	22973	22980	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017371	AAAG	2	8	23151	23158	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017371	TTTA	2	8	23356	23363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017371	GTTT	2	8	24042	24049	0 %	75 %	25 %	0 %	385218289
72	NC_017371	ACTG	2	8	24339	24346	25 %	25 %	25 %	25 %	385218289
73	NC_017371	ATTG	2	8	25015	25022	25 %	50 %	25 %	0 %	385218289
74	NC_017371	ATAA	2	8	26940	26947	75 %	25 %	0 %	0 %	385218291
75	NC_017371	GCTC	2	8	28468	28475	0 %	25 %	25 %	50 %	385218292
76	NC_017371	ATGG	2	8	28916	28923	25 %	25 %	50 %	0 %	385218292
77	NC_017371	GAAT	2	8	29170	29177	50 %	25 %	25 %	0 %	385218293
78	NC_017371	TGGC	2	8	29393	29400	0 %	25 %	50 %	25 %	385218293
79	NC_017371	TTTA	2	8	29546	29553	25 %	75 %	0 %	0 %	385218293
80	NC_017371	GAGT	2	8	30399	30406	25 %	25 %	50 %	0 %	385218295
81	NC_017371	TGCT	2	8	30453	30460	0 %	50 %	25 %	25 %	385218295
82	NC_017371	AGCA	2	8	30570	30577	50 %	0 %	25 %	25 %	385218295
83	NC_017371	AGCA	2	8	31077	31084	50 %	0 %	25 %	25 %	385218295
84	NC_017371	CTTT	2	8	31228	31235	0 %	75 %	0 %	25 %	385218295
85	NC_017371	GGTT	2	8	32100	32107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017371	TTTA	2	8	32234	32241	25 %	75 %	0 %	0 %	385218296
87	NC_017371	GCGA	2	8	32432	32439	25 %	0 %	50 %	25 %	385218296
88	NC_017371	ACCC	2	8	32543	32550	25 %	0 %	0 %	75 %	385218297
89	NC_017371	CATC	2	8	32669	32676	25 %	25 %	0 %	50 %	385218297
90	NC_017371	TGAA	2	8	32823	32830	50 %	25 %	25 %	0 %	385218298
91	NC_017371	TCGT	2	8	33181	33188	0 %	50 %	25 %	25 %	385218298
92	NC_017371	TATT	2	8	33618	33625	25 %	75 %	0 %	0 %	385218298
93	NC_017371	CATG	2	8	33937	33944	25 %	25 %	25 %	25 %	385218298
94	NC_017371	CGCT	2	8	34053	34060	0 %	25 %	25 %	50 %	385218298
95	NC_017371	TCAT	2	8	34878	34885	25 %	50 %	0 %	25 %	385218298
96	NC_017371	GCTT	2	8	34952	34959	0 %	50 %	25 %	25 %	385218298
97	NC_017371	GAAA	2	8	35011	35018	75 %	0 %	25 %	0 %	385218298
98	NC_017371	ATGA	2	8	35292	35299	50 %	25 %	25 %	0 %	385218299
99	NC_017371	TTCT	2	8	36714	36721	0 %	75 %	0 %	25 %	385218302
100	NC_017371	CTTT	2	8	37043	37050	0 %	75 %	0 %	25 %	385218302
101	NC_017371	TTTA	2	8	37468	37475	25 %	75 %	0 %	0 %	385218302
102	NC_017371	CTCA	2	8	37532	37539	25 %	25 %	0 %	50 %	385218302
103	NC_017371	TAAA	2	8	37742	37749	75 %	25 %	0 %	0 %	385218302
104	NC_017371	GAAA	2	8	37872	37879	75 %	0 %	25 %	0 %	385218303
105	NC_017371	TTTG	2	8	38502	38509	0 %	75 %	25 %	0 %	385218304
106	NC_017371	TGAT	2	8	38607	38614	25 %	50 %	25 %	0 %	385218304
107	NC_017371	CGAA	2	8	38692	38699	50 %	0 %	25 %	25 %	385218305
108	NC_017371	TGAT	2	8	38992	38999	25 %	50 %	25 %	0 %	385218305
109	NC_017371	ACAA	2	8	39388	39395	75 %	0 %	0 %	25 %	385218305
110	NC_017371	AACC	2	8	39694	39701	50 %	0 %	0 %	50 %	385218306
111	NC_017371	ATTG	2	8	40392	40399	25 %	50 %	25 %	0 %	385218306
112	NC_017371	ATTG	2	8	40458	40465	25 %	50 %	25 %	0 %	385218306
113	NC_017371	ATCA	2	8	40567	40574	50 %	25 %	0 %	25 %	385218306
114	NC_017371	TCAA	2	8	40580	40587	50 %	25 %	0 %	25 %	385218306
115	NC_017371	TGTT	2	8	41354	41361	0 %	75 %	25 %	0 %	385218307
116	NC_017371	CTTT	2	8	41947	41954	0 %	75 %	0 %	25 %	385218307
117	NC_017371	AATA	2	8	42230	42237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017371	GAAA	2	8	42251	42258	75 %	0 %	25 %	0 %	385218308
119	NC_017371	GATC	2	8	42380	42387	25 %	25 %	25 %	25 %	385218308
120	NC_017371	TTTG	2	8	42782	42789	0 %	75 %	25 %	0 %	385218308
121	NC_017371	ATGA	2	8	43387	43394	50 %	25 %	25 %	0 %	385218308
122	NC_017371	AACG	2	8	43779	43786	50 %	0 %	25 %	25 %	385218309
123	NC_017371	CAAA	2	8	44226	44233	75 %	0 %	0 %	25 %	385218309
124	NC_017371	CAAA	2	8	44413	44420	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017371	GCTT	2	8	44566	44573	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017371	CTGT	2	8	44675	44682	0 %	50 %	25 %	25 %	385218310
127	NC_017371	TGAT	2	8	44871	44878	25 %	50 %	25 %	0 %	385218311
128	NC_017371	TTGA	2	8	45493	45500	25 %	50 %	25 %	0 %	385218312
129	NC_017371	CATT	2	8	45635	45642	25 %	50 %	0 %	25 %	385218312
130	NC_017371	CGCT	2	8	45648	45655	0 %	25 %	25 %	50 %	385218312
131	NC_017371	GTTT	2	8	46270	46277	0 %	75 %	25 %	0 %	385218312
132	NC_017371	CAAA	2	8	46766	46773	75 %	0 %	0 %	25 %	385218313
133	NC_017371	TCGC	2	8	47581	47588	0 %	25 %	25 %	50 %	385218313
134	NC_017371	GCAA	2	8	48245	48252	50 %	0 %	25 %	25 %	385218313
135	NC_017371	TTTA	2	8	48926	48933	25 %	75 %	0 %	0 %	385218314
136	NC_017371	CGAG	2	8	48939	48946	25 %	0 %	50 %	25 %	385218314
137	NC_017371	AGCT	2	8	49618	49625	25 %	25 %	25 %	25 %	385218315
138	NC_017371	CTTT	2	8	49904	49911	0 %	75 %	0 %	25 %	385218315
139	NC_017371	GATT	2	8	50090	50097	25 %	50 %	25 %	0 %	385218315
140	NC_017371	TTGC	2	8	50380	50387	0 %	50 %	25 %	25 %	385218316
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