MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Gambia94/24 chromosome

Total Repeats: 347

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017371	CA	3	6	16886	16891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017371	GT	3	6	25704	25709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017371	TA	3	6	27646	27651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017371	AG	3	6	40770	40775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017371	CT	3	6	45207	45212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017371	TC	3	6	45225	45230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017371	AG	3	6	45281	45286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017371	TC	3	6	63171	63176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017371	TC	3	6	64049	64054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017371	CG	3	6	64703	64708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017371	AG	3	6	64835	64840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017371	GC	3	6	65347	65352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017371	GC	3	6	65418	65423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017371	CT	3	6	65523	65528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017371	AG	4	8	65952	65959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017371	GC	3	6	66402	66407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017371	GT	3	6	67239	67244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017371	GT	3	6	71406	71411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017371	GC	3	6	72493	72498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017371	AG	3	6	76363	76368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017371	TA	3	6	81489	81494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017371	TA	5	10	82741	82750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017371	TC	3	6	85078	85083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017371	GA	3	6	98008	98013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017371	AG	3	6	98088	98093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017371	AT	3	6	100349	100354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017371	TA	3	6	101580	101585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017371	GT	3	6	103498	103503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017371	AT	3	6	108449	108454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017371	TG	3	6	108472	108477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017371	CT	3	6	139389	139394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017371	TC	3	6	139697	139702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017371	CT	3	6	168335	168340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017371	TC	3	6	170654	170659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017371	TA	3	6	179844	179849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017371	AC	3	6	180249	180254	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017371	TG	3	6	182704	182709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017371	CT	3	6	182896	182901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017371	GT	3	6	182938	182943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017371	GA	3	6	186570	186575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017371	AG	3	6	191806	191811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017371	CT	3	6	191841	191846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017371	AC	3	6	202483	202488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017371	AC	3	6	202496	202501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017371	TA	3	6	223196	223201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017371	AT	3	6	234063	234068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017371	AG	3	6	241297	241302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017371	GA	3	6	246466	246471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017371	CT	3	6	249156	249161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017371	TC	3	6	249309	249314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017371	GT	3	6	254114	254119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017371	TA	3	6	260324	260329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017371	GA	3	6	286988	286993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017371	AG	3	6	287382	287387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017371	AG	3	6	298193	298198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017371	AG	3	6	324442	324447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017371	AG	3	6	328219	328224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017371	AT	3	6	328261	328266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017371	AC	3	6	338342	338347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017371	TA	3	6	348340	348345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017371	TA	3	6	355366	355371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017371	AG	3	6	355424	355429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017371	AC	3	6	379176	379181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017371	TG	3	6	391753	391758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017371	TA	3	6	396369	396374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017371	AT	3	6	398331	398336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017371	AG	3	6	400023	400028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017371	GA	4	8	410019	410026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017371	GT	3	6	432630	432635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017371	AG	3	6	438887	438892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017371	AG	3	6	439013	439018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017371	AT	3	6	448471	448476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017371	TA	3	6	461321	461326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017371	GC	3	6	461413	461418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017371	CT	3	6	482425	482430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017371	AG	3	6	489616	489621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017371	GA	3	6	494750	494755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017371	TG	3	6	498553	498558	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017371	AG	3	6	511651	511656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017371	AT	3	6	537078	537083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017371	GA	3	6	546968	546973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017371	AG	3	6	547244	547249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017371	GA	3	6	548848	548853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017371	AG	3	6	548872	548877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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86	NC_017371	TG	3	6	550813	550818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017371	GA	3	6	550961	550966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017371	CT	3	6	561214	561219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017371	GT	3	6	562935	562940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017371	TC	3	6	567405	567410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017371	TA	3	6	578283	578288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017371	CA	3	6	582976	582981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017371	GC	3	6	583083	583088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017371	TA	3	6	591504	591509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017371	CT	4	8	608284	608291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017371	AT	3	6	610046	610051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017371	GT	3	6	615710	615715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017371	GT	3	6	615911	615916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017371	TG	3	6	618281	618286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017371	AT	3	6	626569	626574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017371	TA	3	6	626701	626706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017371	TA	3	6	637871	637876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017371	TC	3	6	638135	638140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017371	AG	3	6	652262	652267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017371	TA	3	6	664856	664861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017371	CG	3	6	664942	664947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017371	TC	3	6	684836	684841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017371	TA	3	6	697332	697337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017371	GA	3	6	713530	713535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017371	CT	3	6	714121	714126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017371	AC	3	6	714519	714524	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017371	TA	3	6	721469	721474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017371	AT	3	6	722352	722357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017371	AG	3	6	722540	722545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017371	TA	3	6	722661	722666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017371	AG	3	6	723029	723034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017371	TG	3	6	723210	723215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017371	TG	3	6	723816	723821	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017371	AG	3	6	740802	740807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017371	TC	3	6	740869	740874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017371	TA	3	6	741196	741201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017371	CT	3	6	741264	741269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017371	CT	3	6	746915	746920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017371	TA	3	6	747001	747006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017371	AG	3	6	751786	751791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017371	AT	3	6	758501	758506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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128	NC_017371	CT	3	6	760537	760542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017371	TC	3	6	763068	763073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017371	GA	9	18	765133	765150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017371	TC	3	6	772215	772220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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133	NC_017371	AG	3	6	783240	783245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017371	CT	7	14	783955	783968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017371	CT	3	6	784290	784295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017371	AG	3	6	793116	793121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017371	GA	3	6	804954	804959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017371	TC	3	6	833459	833464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017371	GC	3	6	846908	846913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017371	TA	3	6	847083	847088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017371	GC	3	6	847394	847399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017371	TC	3	6	891233	891238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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145	NC_017371	AT	3	6	929333	929338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017371	AG	3	6	931973	931978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017371	GA	3	6	932024	932029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017371	AG	3	6	932198	932203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017371	AG	3	6	935600	935605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017371	GC	3	6	948976	948981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017371	GT	3	6	950428	950433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017371	TA	3	6	956471	956476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017371	AT	3	6	956745	956750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.