MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori F30 plasmid pHPF30

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017369	TATG	2	8	727	734	25 %	50 %	25 %	0 %	385218262
2	NC_017369	AATG	2	8	1267	1274	50 %	25 %	25 %	0 %	385218262
3	NC_017369	TATT	2	8	1461	1468	25 %	75 %	0 %	0 %	385218262
4	NC_017369	CAAA	2	8	2111	2118	75 %	0 %	0 %	25 %	385218263
5	NC_017369	ATGA	2	8	2494	2501	50 %	25 %	25 %	0 %	385218263
6	NC_017369	TCAT	2	8	2578	2585	25 %	50 %	0 %	25 %	385218263
7	NC_017369	ATAA	2	8	2734	2741	75 %	25 %	0 %	0 %	385218263
8	NC_017369	TAAC	2	8	2753	2760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017369	TTTC	2	8	3415	3422	0 %	75 %	0 %	25 %	385218264
10	NC_017369	TGAG	2	8	4879	4886	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017369	TTAG	2	8	4903	4910	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017369	TAAC	2	8	5021	5028	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017369	ATTG	2	8	5052	5059	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017369	GATT	2	8	5509	5516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017369	AAGA	2	8	5704	5711	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017369	GAAT	2	8	6121	6128	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017369	TGAA	2	8	6162	6169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017369	TTAT	2	8	6821	6828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017369	GTGG	2	8	6958	6965	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017369	CTTG	2	8	7652	7659	0 %	50 %	25 %	25 %	385218265
21	NC_017369	CAAA	2	8	8443	8450	75 %	0 %	0 %	25 %	385218265
22	NC_017369	ATGC	2	8	8798	8805	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017369	GAAA	2	8	8835	8842	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017369	GAAG	2	8	8910	8917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017369	ATCA	2	8	9015	9022	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017369	CTTG	2	8	9041	9048	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.