MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori F30 plasmid pHPF30

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017369	ATA	2	6	623	628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385218262
2	NC_017369	AGT	2	6	918	923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218262
3	NC_017369	TGT	2	6	1064	1069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218262
4	NC_017369	GAA	2	6	1109	1114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218262
5	NC_017369	GTA	2	6	1174	1179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218262
6	NC_017369	TCT	2	6	1283	1288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218262
7	NC_017369	AAT	2	6	1571	1576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385218262
8	NC_017369	TAA	2	6	1634	1639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385218262
9	NC_017369	TGT	2	6	1757	1762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218263
10	NC_017369	ATC	2	6	1803	1808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218263
11	NC_017369	ATC	2	6	1935	1940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218263
12	NC_017369	TAT	2	6	1952	1957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218263
13	NC_017369	ACA	2	6	1968	1973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385218263
14	NC_017369	TTC	2	6	2145	2150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218263
15	NC_017369	ATC	2	6	2172	2177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218263
16	NC_017369	CTA	2	6	2203	2208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218263
17	NC_017369	AAT	2	6	2382	2387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385218263
18	NC_017369	ATT	2	6	2409	2414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218263
19	NC_017369	GGT	2	6	2456	2461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385218263
20	NC_017369	TAA	2	6	2504	2509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385218263
21	NC_017369	TTC	2	6	2590	2595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218263
22	NC_017369	AAT	2	6	2673	2678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385218263
23	NC_017369	TGT	2	6	3093	3098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218264
24	NC_017369	AAG	2	6	3163	3168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218264
25	NC_017369	GTT	2	6	3276	3281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218264
26	NC_017369	TTG	2	6	3365	3370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218264
27	NC_017369	TAA	2	6	3491	3496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385218264
28	NC_017369	TGT	2	6	3499	3504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218264
29	NC_017369	CTG	2	6	3592	3597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385218264
30	NC_017369	CTT	2	6	3706	3711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218264
31	NC_017369	GTT	2	6	3809	3814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218264
32	NC_017369	CTT	2	6	3847	3852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218264
33	NC_017369	ATG	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218264
34	NC_017369	ATG	2	6	3942	3947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218264
35	NC_017369	TGT	2	6	4033	4038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218264
36	NC_017369	TTG	2	6	4044	4049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218264
37	NC_017369	GTT	3	9	4157	4165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218264
38	NC_017369	TCA	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218264
39	NC_017369	ATT	2	6	4330	4335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218264
40	NC_017369	TTG	2	6	4356	4361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218264
41	NC_017369	TAT	2	6	4434	4439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218264
42	NC_017369	TGT	2	6	4541	4546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218264
43	NC_017369	TGT	2	6	4561	4566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218264
44	NC_017369	ATT	2	6	7208	7213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218265
45	NC_017369	AGA	2	6	7214	7219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218265
46	NC_017369	CAA	2	6	7242	7247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385218265
47	NC_017369	AGA	2	6	7367	7372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218265
48	NC_017369	CAA	2	6	7381	7386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385218265
49	NC_017369	ACC	2	6	7398	7403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385218265
50	NC_017369	ACC	2	6	7455	7460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385218265
51	NC_017369	TAA	2	6	7475	7480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385218265
52	NC_017369	ATT	2	6	7631	7636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218265
53	NC_017369	ACA	2	6	7660	7665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385218265
54	NC_017369	CTT	2	6	7864	7869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218265
55	NC_017369	ACA	2	6	8359	8364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385218265
56	NC_017369	AGA	2	6	8510	8515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218265
57	NC_017369	CAA	3	9	8600	8608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385218265
58	NC_017369	CAA	2	6	8633	8638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385218265
59	NC_017369	GAA	2	6	8759	8764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218265

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.