MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori F16

Total Repeats: 762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017368	TTGCAA	2	12	867	878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385216761
2	NC_017368	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017368	GCTTGC	2	12	6068	6079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385216766
4	NC_017368	GAAACC	2	12	7552	7563	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385216767
5	NC_017368	AAACAC	2	12	18136	18147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017368	AGAAAA	2	12	18486	18497	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385216776
7	NC_017368	GATAAA	2	12	22048	22059	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385216779
8	NC_017368	TTTCTT	2	12	22784	22795	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017368	TTTGTT	2	12	25715	25726	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017368	ATGCAA	2	12	27102	27113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385216783
11	NC_017368	CCAAAA	2	12	31223	31234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385216786
12	NC_017368	ACCTTA	2	12	37135	37146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385216791
13	NC_017368	CATGGA	2	12	41479	41490	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385216794
14	NC_017368	TTTTAT	2	12	45090	45101	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385216796
15	NC_017368	TTCTTT	2	12	45753	45764	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385216797
16	NC_017368	TTGGTG	2	12	48168	48179	0 %	50 %	50 %	0 %	385216800
17	NC_017368	ACAAAA	2	12	49092	49103	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385216801
18	NC_017368	ATTGAA	2	12	50975	50986	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385216803
19	NC_017368	GGCACA	2	12	55637	55648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385216806
20	NC_017368	TGAGCA	2	12	57762	57773	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385216808
21	NC_017368	GTGCCT	2	12	60901	60912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385216811
22	NC_017368	GATTTT	2	12	61237	61248	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385216811
23	NC_017368	ATGAAA	2	12	63831	63842	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385216814
24	NC_017368	GTTTTT	2	12	65146	65157	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385216815
25	NC_017368	GGCTAG	2	12	66319	66330	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385216817
26	NC_017368	TAAAAA	2	12	68612	68623	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385216819
27	NC_017368	AGAAAA	2	12	73301	73312	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017368	AAAGAT	2	12	73488	73499	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385216822
29	NC_017368	GATGTG	2	12	74356	74367	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017368	AGCCAA	2	12	74434	74445	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385216825
31	NC_017368	AAAAGA	2	12	75463	75474	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385216827
32	NC_017368	CCAACA	2	12	76314	76325	50 %	0 %	0 %	50 %	385216828
33	NC_017368	TTTTGT	2	12	76647	76658	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385216829
34	NC_017368	AAAGAG	2	12	76866	76877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385216829
35	NC_017368	GGACAA	2	12	80144	80155	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385216835
36	NC_017368	ACGCCC	2	12	88568	88579	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385216845
37	NC_017368	TAAGGG	2	12	91286	91297	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385216848
38	NC_017368	CGCTAA	2	12	91649	91660	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385216848
39	NC_017368	CGCCCA	2	12	91823	91834	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385216848
40	NC_017368	GGCATG	2	12	95007	95018	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385216852
41	NC_017368	GCAACG	2	12	96040	96051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385216852
42	NC_017368	AATATT	2	12	96819	96830	50 %	50 %	0 %	0 %	385216854
43	NC_017368	AACAGG	2	12	104625	104636	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385216860
44	NC_017368	ATTAGA	2	12	108638	108649	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385216864
45	NC_017368	GATTTT	2	12	110401	110412	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385216868
46	NC_017368	AAACTC	2	12	110518	110529	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385216868
47	NC_017368	TCAAAA	2	12	111998	112009	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385216869
48	NC_017368	GCGGTG	2	12	112697	112708	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385216870
49	NC_017368	TTAATT	2	12	113232	113243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385216870
50	NC_017368	CAATAT	2	12	115904	115915	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385216871
51	NC_017368	AGCGTT	2	12	122516	122527	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385216876
52	NC_017368	TTTTCT	2	12	128072	128083	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385216882
53	NC_017368	CGCTCG	2	12	133101	133112	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385216887
54	NC_017368	TAGGCA	2	12	135638	135649	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385216888
55	NC_017368	TTCTAT	2	12	137978	137989	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385216890
56	NC_017368	GTTCTA	2	12	138373	138384	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385216890
57	NC_017368	CTAAGG	2	12	139692	139703	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385216891
58	NC_017368	TGAATT	2	12	140226	140237	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385216891
59	NC_017368	TTTCAA	2	12	140385	140396	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385216891
60	NC_017368	AGCAAA	2	12	143731	143742	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385216894
61	NC_017368	GTTTTA	2	12	144742	144753	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017368	TGGTTT	2	12	145256	145267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385216897
63	NC_017368	TCATGA	2	12	146513	146524	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385216898
64	NC_017368	AAAAAT	2	12	153049	153060	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385216903
65	NC_017368	ATTCAA	2	12	154136	154147	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385216905
66	NC_017368	TAGCGA	2	12	155192	155203	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385216906
67	NC_017368	TTAGCG	2	12	158084	158095	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385216908
68	NC_017368	TATCGC	2	12	158296	158307	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385216908
69	NC_017368	ATCGCT	2	12	160004	160015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385216909
70	NC_017368	CCTAAA	2	12	162227	162238	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385216911
71	NC_017368	TTCTAT	2	12	163387	163398	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385216912
72	NC_017368	TTGTTT	2	12	166375	166386	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017368	CTTGGG	2	12	167036	167047	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385216918
74	NC_017368	TTGGGT	2	12	171815	171826	0 %	50 %	50 %	0 %	385216923
75	NC_017368	GATTTT	2	12	172327	172338	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385216924
76	NC_017368	GATGGC	2	12	175559	175570	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385216928
77	NC_017368	GATGGC	2	12	175667	175678	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385216928
78	NC_017368	CTTTCT	2	12	175811	175822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385216928
79	NC_017368	CCGCTC	2	12	177815	177826	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385216930
80	NC_017368	GCTCTC	2	12	180240	180251	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385216932
81	NC_017368	TAAAAA	2	12	180900	180911	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017368	TTCTAA	2	12	182579	182590	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385216935
83	NC_017368	TCAATA	2	12	184257	184268	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385216937
84	NC_017368	ATCGTT	2	12	184679	184690	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385216937
85	NC_017368	AATTTC	2	12	185025	185036	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385216938
86	NC_017368	TAAAAT	2	12	185810	185821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385216940
87	NC_017368	TTCTTT	2	12	186220	186231	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385216940
88	NC_017368	ATTTTG	2	12	187621	187632	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385216942
89	NC_017368	CGCTTT	2	12	188099	188110	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385216942
90	NC_017368	GTTTAA	2	12	188883	188894	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385216943
91	NC_017368	CCGCTC	2	12	191533	191544	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385216946
92	NC_017368	GGTTTG	2	12	193140	193151	0 %	50 %	50 %	0 %	385216948
93	NC_017368	GAAAAA	2	12	195156	195167	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385216949
94	NC_017368	AGGCAT	2	12	195245	195256	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385216949
95	NC_017368	GCATTT	2	12	196958	196969	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385216951
96	NC_017368	TCAAAC	2	12	197525	197536	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385216952
97	NC_017368	ATTCTT	2	12	198022	198033	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017368	GGTATT	2	12	201476	201487	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385216955
99	NC_017368	TCTAAA	2	12	201706	201717	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385216955
100	NC_017368	TGGGCA	2	12	202775	202786	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385216956
101	NC_017368	TTCTAA	2	12	203254	203265	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385216957
102	NC_017368	ATTTTC	2	12	205199	205210	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385216957
103	NC_017368	TGGGGC	2	12	212612	212623	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385216967
104	NC_017368	CTGTAT	2	12	216060	216071	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385216971
105	NC_017368	AATTTT	2	12	216743	216754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385216972
106	NC_017368	ACTCAA	2	12	217223	217234	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017368	TATAAT	2	12	224045	224056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017368	ATTCTA	2	12	224981	224992	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385216979
109	NC_017368	CATAGC	2	12	226722	226733	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385216980
110	NC_017368	GTTTTG	2	12	227227	227238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385216980
111	NC_017368	TTATTT	2	12	228859	228870	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385216981
112	NC_017368	TAATTA	2	12	231730	231741	50 %	50 %	0 %	0 %	385216984
113	NC_017368	GCTAAA	2	12	235239	235250	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385216989
114	NC_017368	ATTAAA	2	12	238055	238066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017368	AGTGAG	2	12	239365	239376	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017368	AATGCC	2	12	239986	239997	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385216993
117	NC_017368	AGGGCC	2	12	242629	242640	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385216994
118	NC_017368	GGTGAT	2	12	244237	244248	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385216995
119	NC_017368	TCAATA	2	12	244660	244671	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385216996
120	NC_017368	CACGCC	2	12	245140	245151	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385216996
121	NC_017368	TATTTT	2	12	245694	245705	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385216996
122	NC_017368	GCTAGG	2	12	247766	247777	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385216998
123	NC_017368	TGGAGG	2	12	248312	248323	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385216999
124	NC_017368	TCTTTA	2	12	254315	254326	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385217005
125	NC_017368	GTTTTT	2	12	259951	259962	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385217012
126	NC_017368	ATTTTA	2	12	261420	261431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017368	ATTGTC	2	12	263120	263131	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385217015
128	NC_017368	TCCCGC	2	12	265304	265315	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385217017
129	NC_017368	TCCCGC	2	12	266117	266128	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385217017
130	NC_017368	CAAAGC	2	12	267587	267598	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017368	AGTGGG	2	12	269312	269323	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385217020
132	NC_017368	TGAGCG	2	12	273968	273979	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385217025
133	NC_017368	GATTTT	2	12	280862	280873	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385217030
134	NC_017368	TGAGCG	2	12	284123	284134	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385217033
135	NC_017368	AGCTTT	2	12	284271	284282	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385217033
136	NC_017368	TTTGGT	2	12	284329	284340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385217033
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138	NC_017368	ATTAGA	2	12	288930	288941	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385217040
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140	NC_017368	GCGTTA	2	12	293466	293477	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385217045
141	NC_017368	AGCGAG	2	12	302670	302681	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385217052
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147	NC_017368	GTGAAT	2	12	316198	316209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385217065
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149	NC_017368	GAGCGG	2	12	318242	318253	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385217068
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151	NC_017368	GCTATG	2	12	318624	318635	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385217068
152	NC_017368	ATTGGA	2	12	320591	320602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385217070
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154	NC_017368	AAATGA	2	12	325924	325935	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385217077
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156	NC_017368	GATTTA	2	12	328527	328538	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017368	CCAAAA	2	12	330308	330319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385217082
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160	NC_017368	TTTCTT	2	12	335304	335315	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385217088
161	NC_017368	TCATTT	2	12	336195	336206	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385217088
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220	NC_017368	TTCTTT	2	12	454548	454559	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385217205
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233	NC_017368	ACTTTA	2	12	471143	471154	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385217222
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236	NC_017368	CTTTTT	2	12	476664	476675	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385217226
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342	NC_017368	GAATGC	2	12	677199	677210	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385217431
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345	NC_017368	CATTGG	2	12	678878	678889	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385217433
346	NC_017368	ATTACC	2	12	679842	679853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385217434
347	NC_017368	CTAAAG	2	12	681797	681808	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385217435
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