MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori F16

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017368	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017368	AAACAC	2	12	18136	18147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017368	TTTCTT	2	12	22784	22795	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017368	TTTGTT	2	12	25715	25726	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017368	AGAAAA	2	12	73301	73312	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017368	GATGTG	2	12	74356	74367	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017368	GTTTTA	2	12	144742	144753	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017368	TTGTTT	2	12	166375	166386	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017368	TAAAAA	2	12	180900	180911	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017368	ATTCTT	2	12	198022	198033	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017368	ACTCAA	2	12	217223	217234	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017368	TATAAT	2	12	224045	224056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017368	ATTAAA	2	12	238055	238066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017368	AGTGAG	2	12	239365	239376	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017368	ATTTTA	2	12	261420	261431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017368	CAAAGC	2	12	267587	267598	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017368	GATTTA	2	12	328527	328538	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017368	AAAATA	2	12	438159	438170	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017368	TAAAAA	2	12	452315	452326	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017368	TATTTT	2	12	487740	487751	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017368	AGTTTT	2	12	526151	526162	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017368	AAGCTA	2	12	535673	535684	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017368	ATTTTC	2	12	692093	692104	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017368	AAGAAA	2	12	699061	699072	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017368	AATGAG	2	12	699097	699108	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017368	AAAAAT	2	12	706055	706066	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017368	GCTTTG	2	12	764724	764735	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017368	TTTGAT	2	12	792204	792215	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017368	TTAAAA	2	12	799314	799325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017368	TTTAAA	2	12	832298	832309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017368	TCCAAA	2	12	880784	880795	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017368	AAAAAG	2	12	918179	918190	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017368	AAAAAG	2	12	918359	918370	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017368	AAAAAG	2	12	918506	918517	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017368	ATTATA	2	12	942112	942123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017368	TAAAAT	2	12	942137	942148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017368	ATTGAA	2	12	949507	949518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017368	TTAAAA	2	12	998325	998336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017368	AAAGAG	2	12	1027085	1027096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017368	ACAAAA	2	12	1114249	1114260	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017368	AACGCT	2	12	1147572	1147583	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017368	ATCCTT	2	12	1194623	1194634	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017368	TTGTAT	2	12	1197044	1197055	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017368	ACTTAA	2	12	1214299	1214310	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017368	TCTATT	2	12	1220484	1220495	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017368	TCAAAT	2	12	1220643	1220654	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017368	CCCTAA	2	12	1230402	1230413	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017368	TCATTT	2	12	1237415	1237426	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017368	AAACTT	2	12	1237438	1237449	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017368	ATTTTT	2	12	1269339	1269350	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017368	TAAAAA	2	12	1297447	1297458	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017368	AGTTTT	2	12	1360931	1360942	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017368	AAAGAG	2	12	1373193	1373204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017368	GTTTTA	2	12	1384871	1384882	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017368	TAAAAA	2	12	1385697	1385708	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017368	AAGCCA	2	12	1385832	1385843	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017368	TGATGG	2	12	1385968	1385979	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017368	ATGGTG	2	12	1386018	1386029	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017368	CTAAGT	2	12	1397000	1397011	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017368	TTTGAG	2	12	1399143	1399154	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.