MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori F16

Total Repeats: 1295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017368	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	385216762
2	NC_017368	CCCTA	2	10	2399	2408	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_017368	TTTGT	2	10	2428	2437	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017368	ATTAA	2	10	2929	2938	60 %	40 %	0 %	0 %	385216764
5	NC_017368	TTTTA	2	10	4902	4911	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017368	GTTGA	2	10	5662	5671	20 %	40 %	40 %	0 %	385216766
7	NC_017368	TTTCT	2	10	8216	8225	0 %	80 %	0 %	20 %	385216767
8	NC_017368	TTGAA	2	10	11716	11725	40 %	40 %	20 %	0 %	385216770
9	NC_017368	TTTTG	2	10	11732	11741	0 %	80 %	20 %	0 %	385216770
10	NC_017368	TGGTG	2	10	12569	12578	0 %	40 %	60 %	0 %	385216771
11	NC_017368	GCTTT	2	10	13396	13405	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017368	CAAAA	2	10	18451	18460	80 %	0 %	0 %	20 %	385216776
13	NC_017368	AAGCT	2	10	19354	19363	40 %	20 %	20 %	20 %	385216777
14	NC_017368	CATCA	2	10	19827	19836	40 %	20 %	0 %	40 %	385216777
15	NC_017368	TGAAA	2	10	20795	20804	60 %	20 %	20 %	0 %	385216778
16	NC_017368	GCATG	2	10	22705	22714	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017368	AAAAG	2	10	22852	22861	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017368	CCATG	2	10	23039	23048	20 %	20 %	20 %	40 %	385216780
19	NC_017368	AAATC	2	10	25690	25699	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017368	TTTAC	2	10	25923	25932	20 %	60 %	0 %	20 %	385216782
21	NC_017368	ATTTT	2	10	27379	27388	20 %	80 %	0 %	0 %	385216783
22	NC_017368	GATTT	2	10	28639	28648	20 %	60 %	20 %	0 %	385216783
23	NC_017368	ATTTG	2	10	29487	29496	20 %	60 %	20 %	0 %	385216784
24	NC_017368	AAATT	2	10	29995	30004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017368	TTTTA	2	10	32163	32172	20 %	80 %	0 %	0 %	385216787
26	NC_017368	GGCGT	2	10	32185	32194	0 %	20 %	60 %	20 %	385216787
27	NC_017368	GATTT	2	10	33362	33371	20 %	60 %	20 %	0 %	385216788
28	NC_017368	AGGGC	2	10	33712	33721	20 %	0 %	60 %	20 %	385216789
29	NC_017368	ATTGA	2	10	34376	34385	40 %	40 %	20 %	0 %	385216789
30	NC_017368	TTTTA	2	10	34682	34691	20 %	80 %	0 %	0 %	385216790
31	NC_017368	GCGCT	2	10	35134	35143	0 %	20 %	40 %	40 %	385216790
32	NC_017368	ATCTT	2	10	35626	35635	20 %	60 %	0 %	20 %	385216791
33	NC_017368	TAAAA	2	10	36360	36369	80 %	20 %	0 %	0 %	385216791
34	NC_017368	AAAAT	2	10	36794	36803	80 %	20 %	0 %	0 %	385216791
35	NC_017368	GTCTT	2	10	41963	41972	0 %	60 %	20 %	20 %	385216794
36	NC_017368	ATTTC	2	10	42216	42225	20 %	60 %	0 %	20 %	385216794
37	NC_017368	AAGAT	2	10	42342	42351	60 %	20 %	20 %	0 %	385216794
38	NC_017368	ATTTA	2	10	42585	42594	40 %	60 %	0 %	0 %	385216795
39	NC_017368	TGAAA	2	10	42762	42771	60 %	20 %	20 %	0 %	385216795
40	NC_017368	ATGCG	2	10	42867	42876	20 %	20 %	40 %	20 %	385216795
41	NC_017368	TGGCT	2	10	44269	44278	0 %	40 %	40 %	20 %	385216796
42	NC_017368	TTTAG	2	10	44624	44633	20 %	60 %	20 %	0 %	385216796
43	NC_017368	ATCAA	2	10	46755	46764	60 %	20 %	0 %	20 %	385216798
44	NC_017368	TTTGT	2	10	47421	47430	0 %	80 %	20 %	0 %	385216798
45	NC_017368	AATTG	2	10	51696	51705	40 %	40 %	20 %	0 %	385216804
46	NC_017368	CTTAT	2	10	54595	54604	20 %	60 %	0 %	20 %	385216805
47	NC_017368	GCCAA	2	10	54608	54617	40 %	0 %	20 %	40 %	385216805
48	NC_017368	GCAAG	2	10	55534	55543	40 %	0 %	40 %	20 %	385216806
49	NC_017368	AAACC	2	10	55782	55791	60 %	0 %	0 %	40 %	385216806
50	NC_017368	AAAAC	2	10	56185	56194	80 %	0 %	0 %	20 %	385216807
51	NC_017368	AAATG	2	10	59754	59763	60 %	20 %	20 %	0 %	385216809
52	NC_017368	TTGGC	2	10	60586	60595	0 %	40 %	40 %	20 %	385216811
53	NC_017368	AAAGA	2	10	61413	61422	80 %	0 %	20 %	0 %	385216812
54	NC_017368	ATTCA	2	10	61642	61651	40 %	40 %	0 %	20 %	385216812
55	NC_017368	AAAAT	2	10	64338	64347	80 %	20 %	0 %	0 %	385216814
56	NC_017368	TCTTT	2	10	64965	64974	0 %	80 %	0 %	20 %	385216815
57	NC_017368	AGAAA	2	10	65245	65254	80 %	0 %	20 %	0 %	385216815
58	NC_017368	AGGCT	2	10	65760	65769	20 %	20 %	40 %	20 %	385216816
59	NC_017368	TGCCT	2	10	66135	66144	0 %	40 %	20 %	40 %	385216816
60	NC_017368	TGAAA	2	10	67531	67540	60 %	20 %	20 %	0 %	385216819
61	NC_017368	TCGCC	2	10	70528	70537	0 %	20 %	20 %	60 %	385216820
62	NC_017368	TAAAA	2	10	70824	70833	80 %	20 %	0 %	0 %	385216820
63	NC_017368	TCAAA	2	10	71540	71549	60 %	20 %	0 %	20 %	385216820
64	NC_017368	TTAAA	2	10	72563	72572	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017368	ACAAA	2	10	72580	72589	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017368	TATCC	2	10	75058	75067	20 %	40 %	0 %	40 %	385216826
67	NC_017368	TCATA	2	10	75613	75622	40 %	40 %	0 %	20 %	385216827
68	NC_017368	CAATA	2	10	77795	77804	60 %	20 %	0 %	20 %	385216831
69	NC_017368	TGAGT	2	10	78667	78676	20 %	40 %	40 %	0 %	385216831
70	NC_017368	GGTGG	2	10	80689	80698	0 %	20 %	80 %	0 %	385216836
71	NC_017368	GTCAG	2	10	81323	81332	20 %	20 %	40 %	20 %	385216836
72	NC_017368	TCAAT	2	10	83869	83878	40 %	40 %	0 %	20 %	385216840
73	NC_017368	CTTCT	2	10	84717	84726	0 %	60 %	0 %	40 %	385216841
74	NC_017368	TGCCT	2	10	84794	84803	0 %	40 %	20 %	40 %	385216841
75	NC_017368	TCCAA	2	10	85206	85215	40 %	20 %	0 %	40 %	385216842
76	NC_017368	CAAAA	2	10	85523	85532	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017368	TTTTG	2	10	88524	88533	0 %	80 %	20 %	0 %	385216845
78	NC_017368	ACGCC	2	10	88830	88839	20 %	0 %	20 %	60 %	385216845
79	NC_017368	AAAGC	2	10	89596	89605	60 %	0 %	20 %	20 %	385216846
80	NC_017368	TTACA	2	10	90378	90387	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017368	CAAGC	2	10	93642	93651	40 %	0 %	20 %	40 %	385216850
82	NC_017368	ATCTT	2	10	97975	97984	20 %	60 %	0 %	20 %	385216854
83	NC_017368	TGGCT	2	10	98516	98525	0 %	40 %	40 %	20 %	385216854
84	NC_017368	ATGCC	2	10	98925	98934	20 %	20 %	20 %	40 %	385216855
85	NC_017368	TTGAT	2	10	99843	99852	20 %	60 %	20 %	0 %	385216857
86	NC_017368	GGCGT	2	10	101657	101666	0 %	20 %	60 %	20 %	385216859
87	NC_017368	CTTTC	2	10	105194	105203	0 %	60 %	0 %	40 %	385216861
88	NC_017368	GAAAT	2	10	107141	107150	60 %	20 %	20 %	0 %	385216863
89	NC_017368	TTTGA	2	10	107982	107991	20 %	60 %	20 %	0 %	385216864
90	NC_017368	GGCTT	2	10	109306	109315	0 %	40 %	40 %	20 %	385216866
91	NC_017368	CGGCA	2	10	111964	111973	20 %	0 %	40 %	40 %	385216869
92	NC_017368	AATTT	2	10	113997	114006	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017368	ACGAT	2	10	114445	114454	40 %	20 %	20 %	20 %	385216871
94	NC_017368	TTTTC	2	10	114640	114649	0 %	80 %	0 %	20 %	385216871
95	NC_017368	AATTG	2	10	116287	116296	40 %	40 %	20 %	0 %	385216872
96	NC_017368	TCGTT	2	10	118098	118107	0 %	60 %	20 %	20 %	385216873
97	NC_017368	CAAAA	2	10	120689	120698	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017368	TCTTT	2	10	121406	121415	0 %	80 %	0 %	20 %	385216876
99	NC_017368	CCACC	2	10	123348	123357	20 %	0 %	0 %	80 %	385216878
100	NC_017368	AAAGC	2	10	124163	124172	60 %	0 %	20 %	20 %	385216878
101	NC_017368	GAATG	2	10	125385	125394	40 %	20 %	40 %	0 %	385216880
102	NC_017368	TTTTG	2	10	126196	126205	0 %	80 %	20 %	0 %	385216881
103	NC_017368	CAAAT	2	10	126592	126601	60 %	20 %	0 %	20 %	385216881
104	NC_017368	ACCCT	2	10	128021	128030	20 %	20 %	0 %	60 %	385216882
105	NC_017368	TTAAT	2	10	129539	129548	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017368	TGATT	2	10	130157	130166	20 %	60 %	20 %	0 %	385216884
107	NC_017368	CTAAA	2	10	130642	130651	60 %	20 %	0 %	20 %	385216886
108	NC_017368	GAATT	2	10	130791	130800	40 %	40 %	20 %	0 %	385216886
109	NC_017368	GGATC	2	10	134667	134676	20 %	20 %	40 %	20 %	385216888
110	NC_017368	AGCTC	2	10	134687	134696	20 %	20 %	20 %	40 %	385216888
111	NC_017368	AAGCC	2	10	136575	136584	40 %	0 %	20 %	40 %	385216889
112	NC_017368	GGTTT	2	10	137936	137945	0 %	60 %	40 %	0 %	385216890
113	NC_017368	TTGAT	2	10	138465	138474	20 %	60 %	20 %	0 %	385216890
114	NC_017368	TTTGA	2	10	139711	139720	20 %	60 %	20 %	0 %	385216891
115	NC_017368	GACTT	2	10	140245	140254	20 %	40 %	20 %	20 %	385216891
116	NC_017368	ATCTC	2	10	140996	141005	20 %	40 %	0 %	40 %	385216891
117	NC_017368	CGCTT	2	10	141154	141163	0 %	40 %	20 %	40 %	385216891
118	NC_017368	TGCGT	2	10	143542	143551	0 %	40 %	40 %	20 %	385216894
119	NC_017368	GAAAA	2	10	143703	143712	80 %	0 %	20 %	0 %	385216894
120	NC_017368	GAAAA	2	10	144021	144030	80 %	0 %	20 %	0 %	385216894
121	NC_017368	ATTTT	2	10	146995	147004	20 %	80 %	0 %	0 %	385216899
122	NC_017368	ATGTT	2	10	147077	147086	20 %	60 %	20 %	0 %	385216899
123	NC_017368	AAAAG	2	10	147489	147498	80 %	0 %	20 %	0 %	385216899
124	NC_017368	CGCTG	2	10	149104	149113	0 %	20 %	40 %	40 %	385216900
125	NC_017368	AAATC	2	10	149733	149742	60 %	20 %	0 %	20 %	385216900
126	NC_017368	AAAAT	2	10	151205	151214	80 %	20 %	0 %	0 %	385216901
127	NC_017368	GTAAA	2	10	154108	154117	60 %	20 %	20 %	0 %	385216905
128	NC_017368	TTCTT	2	10	155512	155521	0 %	80 %	0 %	20 %	385216906
129	NC_017368	TCTTT	2	10	156006	156015	0 %	80 %	0 %	20 %	385216907
130	NC_017368	TTTTG	2	10	157169	157178	0 %	80 %	20 %	0 %	385216908
131	NC_017368	GCGAT	2	10	157962	157971	20 %	20 %	40 %	20 %	385216908
132	NC_017368	GCTTG	2	10	158218	158227	0 %	40 %	40 %	20 %	385216908
133	NC_017368	TTTTG	2	10	158870	158879	0 %	80 %	20 %	0 %	385216909
134	NC_017368	CCAAA	2	10	160710	160719	60 %	0 %	0 %	40 %	385216910
135	NC_017368	ACGCC	2	10	164232	164241	20 %	0 %	20 %	60 %	385216912
136	NC_017368	TTATT	2	10	166128	166137	20 %	80 %	0 %	0 %	385216916
137	NC_017368	GCGTT	2	10	166486	166495	0 %	40 %	40 %	20 %	385216917
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397	NC_017368	TGGTG	2	10	462747	462756	0 %	40 %	60 %	0 %	385217213
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