MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori F57

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017367	TTTGT	2	10	2426	2435	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017367	TTAAA	2	10	4700	4709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017367	TTTTA	2	10	4929	4938	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017367	AAATT	2	10	7416	7425	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017367	ATTTT	2	10	7633	7642	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017367	GCTTT	2	10	13671	13680	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017367	AAATT	2	10	30256	30265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017367	GCCAA	2	10	57491	57500	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017367	TTAAA	2	10	73127	73136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017367	ACAAA	2	10	73156	73165	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017367	CAAAA	2	10	84407	84416	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017367	TTACA	2	10	89254	89263	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017367	TAAGA	2	10	103635	103644	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017367	TAAAA	2	10	103706	103715	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017367	ATTAA	2	10	127809	127818	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017367	TTTTG	2	10	136102	136111	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017367	AAATT	2	10	142814	142823	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017367	GTAGG	2	10	145405	145414	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017367	ATCTA	2	10	152084	152093	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017367	CAAAT	2	10	177815	177824	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017367	AAATT	2	10	183690	183699	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017367	CAAAA	2	10	185084	185093	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017367	AAAAG	2	10	195477	195486	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017367	AAATC	2	10	198794	198803	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017367	CAAAA	2	10	198812	198821	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017367	TTTAA	2	10	201838	201847	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017367	AATGA	2	10	217609	217618	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017367	TTAAG	2	10	219322	219331	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017367	AAACA	2	10	226099	226108	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017367	TGCTA	2	10	232975	232984	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017367	TTGGT	2	10	233215	233224	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017367	AAGCG	2	10	244774	244783	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017367	AAACC	2	10	245181	245190	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017367	ATATT	2	10	267091	267100	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017367	AAATT	2	10	269805	269814	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017367	ATTTA	2	10	300936	300945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017367	TGTAG	2	10	301014	301023	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017367	CATTT	2	10	324779	324788	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017367	AAATA	2	10	336896	336905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017367	TTATA	2	10	378816	378825	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017367	AAGTT	2	10	385570	385579	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017367	TGTGT	2	10	393761	393770	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017367	TGGGG	2	10	393784	393793	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017367	AGTTA	2	10	425052	425061	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017367	TAAAG	2	10	476287	476296	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017367	TTAAT	2	10	477907	477916	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017367	TCTTG	2	10	482670	482679	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017367	ATAAA	2	10	488068	488077	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017367	AAAAT	2	10	488102	488111	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017367	GTTTT	2	10	496161	496170	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017367	TAACA	2	10	508913	508922	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017367	TACAA	2	10	508925	508934	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017367	AATAA	2	10	510302	510311	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017367	TAAAA	2	10	510396	510405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017367	AAAAT	2	10	515022	515031	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017367	AGTTT	2	10	533494	533503	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017367	ATTAA	2	10	534513	534522	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017367	TAACT	2	10	537830	537839	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017367	AGGCT	2	10	547181	547190	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017367	TTCAA	2	10	552704	552713	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017367	TAAAA	2	10	552910	552919	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017367	ATTTA	2	10	578698	578707	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017367	AAATA	2	10	581653	581662	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017367	ATTTG	2	10	581875	581884	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017367	TTGTA	2	10	605503	605512	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017367	TAAGG	2	10	641135	641144	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017367	ATTTT	2	10	641362	641371	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017367	ATTTG	2	10	647280	647289	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017367	TTTAA	2	10	672308	672317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017367	TTTAA	2	10	695913	695922	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017367	TTTCC	2	10	742197	742206	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_017367	CTTAT	2	10	744156	744165	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017367	TAAAT	2	10	747390	747399	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017367	AACAA	2	10	750439	750448	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017367	AAAAC	2	10	753217	753226	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017367	TAAAA	2	10	753228	753237	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017367	CATTA	2	10	758434	758443	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017367	TTCTA	2	10	763760	763769	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017367	GGAAT	2	10	772666	772675	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017367	ATCAA	2	10	776508	776517	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017367	ATTAA	2	10	778951	778960	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017367	GTCAA	2	10	779102	779111	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017367	ATTTA	2	10	784713	784722	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017367	TATAG	2	10	786569	786578	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017367	AAAAG	2	10	806734	806743	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017367	TTTTA	2	10	839112	839121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017367	AAATT	2	10	843759	843768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017367	TCTCA	2	10	848307	848316	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017367	TTTTA	2	10	848341	848350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017367	TTGGC	2	10	868299	868308	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017367	CTTTA	2	10	875368	875377	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017367	TTTTA	2	10	897768	897777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017367	ATAAA	2	10	897973	897982	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017367	TTAAA	2	10	898053	898062	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017367	TTTAA	2	10	929414	929423	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017367	ATTTT	2	10	934119	934128	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017367	ATTTT	2	10	934182	934191	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017367	CTAAA	2	10	941024	941033	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017367	TATAA	2	10	943481	943490	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017367	ATTGA	2	10	957551	957560	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017367	TAAAA	2	10	957972	957981	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017367	TCGTA	2	10	960629	960638	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017367	TAAAA	2	10	964100	964109	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017367	TCAAG	2	10	995154	995163	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017367	ATCTC	2	10	1029848	1029857	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017367	GTTTT	2	10	1030348	1030357	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017367	TATTT	2	10	1032941	1032950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017367	TTAGT	2	10	1040935	1040944	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017367	TTCAA	2	10	1053732	1053741	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017367	CTCAT	2	10	1053962	1053971	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_017367	TCACT	2	10	1055441	1055450	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017367	TACTT	2	10	1055739	1055748	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017367	TAAAT	2	10	1056099	1056108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017367	TAAAT	2	10	1056116	1056125	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017367	TAAAT	2	10	1056133	1056142	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017367	TAAAT	2	10	1056150	1056159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017367	TAAAT	2	10	1056167	1056176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017367	TAAAT	2	10	1056184	1056193	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017367	TAAAT	2	10	1056201	1056210	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017367	TAAAT	2	10	1056218	1056227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017367	TAAAT	2	10	1056235	1056244	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017367	TAAAT	2	10	1056252	1056261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017367	TAAAT	2	10	1056285	1056294	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017367	AAAAT	2	10	1079348	1079357	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017367	AATTG	2	10	1096688	1096697	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017367	ATAAA	2	10	1100775	1100784	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017367	TAAAA	2	10	1111727	1111736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017367	CACAC	2	10	1121370	1121379	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_017367	TGAAA	2	10	1126050	1126059	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017367	AAATC	2	10	1141452	1141461	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017367	AAAAC	2	10	1146298	1146307	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017367	TAGCG	2	10	1149476	1149485	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017367	AAAAC	2	10	1156696	1156705	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017367	GATTT	2	10	1175445	1175454	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017367	AAACA	2	10	1175922	1175931	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017367	CACGA	2	10	1176718	1176727	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017367	TTACC	2	10	1177516	1177525	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017367	TTAAA	2	10	1185999	1186008	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017367	AAAAG	2	10	1187590	1187599	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017367	TATTT	2	10	1196454	1196463	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017367	TTAAT	2	10	1214035	1214044	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017367	TATTT	2	10	1214071	1214080	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017367	TTGTG	2	10	1214103	1214112	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017367	AAATC	2	10	1220131	1220140	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017367	CAATC	2	10	1228939	1228948	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_017367	CAATC	2	10	1230375	1230384	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_017367	AATCC	2	10	1247670	1247679	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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167	NC_017367	CTCAT	2	10	1399952	1399961	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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195	NC_017367	AATCA	2	10	1555888	1555897	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
196	NC_017367	CTTTT	2	10	1589514	1589523	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
197	NC_017367	TTTTG	2	10	1602750	1602759	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
198	NC_017367	ATAAA	2	10	1602845	1602854	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_017367	ATTTA	2	10	1606098	1606107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_017367	TTAAA	2	10	1607929	1607938	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.