MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori F32

Total Repeats: 762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017366	AAAGCG	2	12	288	299	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385215270
2	NC_017366	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	385215273
3	NC_017366	GCGATA	2	12	3727	3738	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385215275
4	NC_017366	GCTTGC	2	12	6032	6043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385215276
5	NC_017366	GAAACC	2	12	7576	7587	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385215277
6	NC_017366	AAACAC	2	12	18157	18168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017366	AGAAAA	2	12	18507	18518	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385215286
8	NC_017366	TTTCTT	2	12	22794	22805	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017366	TTTGTT	2	12	25832	25843	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017366	CCAAAA	2	12	31352	31363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385215296
11	NC_017366	CGCTTT	2	12	36707	36718	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385215301
12	NC_017366	AGCGGG	2	12	37658	37669	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385215302
13	NC_017366	CCCTAA	2	12	38252	38263	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385215303
14	NC_017366	CATGGA	2	12	40681	40692	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385215306
15	NC_017366	TTCTTT	2	12	44964	44975	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385215309
16	NC_017366	TTGGTG	2	12	47379	47390	0 %	50 %	50 %	0 %	385215312
17	NC_017366	ACAAAA	2	12	48303	48314	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385215313
18	NC_017366	ATTGAA	2	12	50186	50197	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385215315
19	NC_017366	AGATGA	2	12	52614	52625	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385215316
20	NC_017366	GGCACA	2	12	54871	54882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385215317
21	NC_017366	TGAGCA	2	12	56991	57002	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385215319
22	NC_017366	GAAAAT	2	12	57659	57670	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385215319
23	NC_017366	TAGAAA	2	12	59856	59867	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385215322
24	NC_017366	GTGCCT	2	12	60122	60133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385215322
25	NC_017366	GATTTT	2	12	60458	60469	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385215322
26	NC_017366	GTTTTT	2	12	64373	64384	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385215326
27	NC_017366	TAAAAA	2	12	67842	67853	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385215329
28	NC_017366	AAAAGA	2	12	73290	73301	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385215333
29	NC_017366	CCAACA	2	12	74141	74152	50 %	0 %	0 %	50 %	385215333
30	NC_017366	TTTTGT	2	12	74479	74490	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385215334
31	NC_017366	AAAGAG	2	12	74758	74769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385215334
32	NC_017366	AGAAAA	2	12	76157	76168	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385215337
33	NC_017366	AGCGGG	2	12	78251	78262	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385215343
34	NC_017366	ACGCCC	2	12	86014	86025	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385215352
35	NC_017366	AAGGGC	2	12	88732	88743	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385215355
36	NC_017366	CGCCCA	2	12	89268	89279	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385215355
37	NC_017366	AGGATA	2	12	90111	90122	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385215357
38	NC_017366	GGCATG	2	12	92137	92148	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385215360
39	NC_017366	ATATTG	2	12	93944	93955	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385215361
40	NC_017366	AACAGG	2	12	101748	101759	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385215367
41	NC_017366	TACAAA	2	12	104055	104066	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017366	AAAAAT	2	12	104224	104235	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385215370
43	NC_017366	ATTAGA	2	12	105729	105740	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385215372
44	NC_017366	GATTTT	2	12	107487	107498	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385215376
45	NC_017366	AAACTC	2	12	107604	107615	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385215376
46	NC_017366	TCAAAA	2	12	109093	109104	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385215377
47	NC_017366	GCGGTG	2	12	109792	109803	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385215378
48	NC_017366	TTAATT	2	12	110327	110338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385215378
49	NC_017366	CAATAT	2	12	112999	113010	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385215379
50	NC_017366	CATATT	2	12	118753	118764	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385215384
51	NC_017366	TTTTCT	2	12	124631	124642	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385215389
52	NC_017366	GCAAGC	2	12	125038	125049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385215389
53	NC_017366	CGCTCG	2	12	129661	129672	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385215394
54	NC_017366	TAGGCA	2	12	132198	132209	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385215395
55	NC_017366	TTCTAT	2	12	134477	134488	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385215397
56	NC_017366	GTTCTA	2	12	134872	134883	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385215397
57	NC_017366	TGAATT	2	12	136730	136741	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385215398
58	NC_017366	TTTCAA	2	12	136889	136900	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385215398
59	NC_017366	AGCAAA	2	12	140235	140246	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385215401
60	NC_017366	GTTTTA	2	12	141246	141257	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017366	TGGTTT	2	12	141760	141771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385215404
62	NC_017366	TCATGA	2	12	143009	143020	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385215405
63	NC_017366	AAAAAT	2	12	149539	149550	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385215411
64	NC_017366	ATCCTT	2	12	150233	150244	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385215412
65	NC_017366	ATTCAA	2	12	150625	150636	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385215413
66	NC_017366	TAGCGA	2	12	151681	151692	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385215414
67	NC_017366	ATCGCT	2	12	154785	154796	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385215416
68	NC_017366	TTCAAA	2	12	155094	155105	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385215417
69	NC_017366	GGCTTA	2	12	155433	155444	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385215417
70	NC_017366	ATCGCT	2	12	156492	156503	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385215417
71	NC_017366	TTTGGG	2	12	157073	157084	0 %	50 %	50 %	0 %	385215418
72	NC_017366	CCTAAA	2	12	158713	158724	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385215420
73	NC_017366	TTCTAT	2	12	159868	159879	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385215421
74	NC_017366	TTGTTT	2	12	162856	162867	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017366	CTTGGG	2	12	163517	163528	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385215427
76	NC_017366	ATTGGA	2	12	164890	164901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385215428
77	NC_017366	GATTTT	2	12	168807	168818	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385215433
78	NC_017366	GATGGC	2	12	172025	172036	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385215437
79	NC_017366	GATGGC	2	12	172133	172144	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385215437
80	NC_017366	CTTTCT	2	12	172277	172288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385215437
81	NC_017366	GCTCTC	2	12	176629	176640	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385215441
82	NC_017366	TAAAAA	2	12	177287	177298	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017366	TTCTAA	2	12	178945	178956	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385215444
84	NC_017366	TCAATA	2	12	180627	180638	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385215446
85	NC_017366	CATTTT	2	12	180736	180747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385215446
86	NC_017366	ATCGTT	2	12	181049	181060	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385215446
87	NC_017366	AATTTC	2	12	181395	181406	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385215447
88	NC_017366	TTCTTT	2	12	182592	182603	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385215449
89	NC_017366	ATTTTG	2	12	184007	184018	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385215451
90	NC_017366	CGCTTT	2	12	184485	184496	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385215451
91	NC_017366	GTTTAA	2	12	185269	185280	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385215452
92	NC_017366	AATGAA	2	12	188612	188623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385215455
93	NC_017366	CCGCTC	2	12	191020	191031	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385215457
94	NC_017366	GGTTTG	2	12	192627	192638	0 %	50 %	50 %	0 %	385215459
95	NC_017366	AGGCAT	2	12	194732	194743	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385215460
96	NC_017366	GCATTT	2	12	196445	196456	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385215462
97	NC_017366	TCAAAC	2	12	197012	197023	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385215463
98	NC_017366	TAAAGA	2	12	197174	197185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385215463
99	NC_017366	ATTACT	2	12	197668	197679	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017366	GGTATT	2	12	200972	200983	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385215466
101	NC_017366	TCTAAA	2	12	201202	201213	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385215466
102	NC_017366	TGGGCA	2	12	202271	202282	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385215467
103	NC_017366	TTCTAA	2	12	202750	202761	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385215468
104	NC_017366	ATTTTC	2	12	204695	204706	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385215468
105	NC_017366	TGGGGC	2	12	212107	212118	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385215478
106	NC_017366	CTGTAT	2	12	215550	215561	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385215482
107	NC_017366	AATTTT	2	12	216234	216245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385215482
108	NC_017366	ACTCAA	2	12	216711	216722	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017366	TATAAT	2	12	223534	223545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017366	ATTCTA	2	12	224229	224240	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385215489
111	NC_017366	CATAGC	2	12	225986	225997	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385215490
112	NC_017366	GTTTTG	2	12	226491	226502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385215490
113	NC_017366	TTATTT	2	12	228123	228134	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385215491
114	NC_017366	TAATTA	2	12	231000	231011	50 %	50 %	0 %	0 %	385215494
115	NC_017366	GCTAAA	2	12	234513	234524	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385215499
116	NC_017366	ATTAAA	2	12	237325	237336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017366	AGTGAG	2	12	238642	238653	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017366	CTTTTG	2	12	239117	239128	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017366	AATGCC	2	12	239257	239268	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385215503
120	NC_017366	AGGGCC	2	12	241897	241908	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385215504
121	NC_017366	GGTGAT	2	12	243514	243525	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385215505
122	NC_017366	CACGCC	2	12	244417	244428	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385215506
123	NC_017366	ATAACT	2	12	244543	244554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385215506
124	NC_017366	TGGTTT	2	12	244727	244738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385215506
125	NC_017366	TATTTT	2	12	244986	244997	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385215506
126	NC_017366	GCTAGG	2	12	247058	247069	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385215508
127	NC_017366	TCTTTA	2	12	253625	253636	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385215516
128	NC_017366	GTTTTT	2	12	259214	259225	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385215523
129	NC_017366	ATTTTA	2	12	260674	260685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017366	ATTGTC	2	12	262374	262385	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385215526
131	NC_017366	TCCCGC	2	12	264564	264575	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385215528
132	NC_017366	TCCCGC	2	12	265377	265388	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385215528
133	NC_017366	CAAAGC	2	12	266841	266852	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017366	ATACCA	2	12	268352	268363	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385215531
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141	NC_017366	TGAGCG	2	12	283404	283415	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385215544
142	NC_017366	AGCTTT	2	12	283552	283563	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385215544
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161	NC_017366	CTTTTT	2	12	331886	331897	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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209	NC_017366	ATTTTA	2	12	429318	429329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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225	NC_017366	TGATAT	2	12	451455	451466	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385215702
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229	NC_017366	ATTTCA	2	12	457653	457664	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
230	NC_017366	GAAAAT	2	12	460047	460058	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385215705
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233	NC_017366	GTGAGA	2	12	462233	462244	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385215706
234	NC_017366	CCCAAA	2	12	463533	463544	50 %	0 %	0 %	50 %	385215707
235	NC_017366	GAATTT	2	12	464055	464066	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385215707
236	NC_017366	ATTATA	2	12	465044	465055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
237	NC_017366	AAGTCA	2	12	465296	465307	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385215708
238	NC_017366	ATATTG	2	12	468503	468514	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385215709
239	NC_017366	CTAACG	2	12	471767	471778	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385215711
240	NC_017366	GCGCGA	2	12	485128	485139	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385215723
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242	NC_017366	TCTTTT	2	12	487495	487506	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
243	NC_017366	ATTGAT	2	12	489173	489184	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385215727
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342	NC_017366	TTTTAT	2	12	697177	697188	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
343	NC_017366	TGGAAT	2	12	699118	699129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385215904
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349	NC_017366	CACGCA	2	12	705759	705770	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385215910
350	NC_017366	TTTTCA	2	12	708569	708580	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385215913
351	NC_017366	TAATGG	2	12	710197	710208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385215915
352	NC_017366	ATTTTT	2	12	712962	712973	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385215918
353	NC_017366	GATTTT	2	12	714918	714929	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385215918
354	NC_017366	GCTTTA	2	12	715793	715804	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385215919
355	NC_017366	TGGTAA	2	12	717734	717745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385215920
356	NC_017366	GCCAAT	2	12	718698	718709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385215921
357	NC_017366	TCAAAA	2	12	719143	719154	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385215921
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359	NC_017366	GCATTC	2	12	720378	720389	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385215923
360	NC_017366	TTTTGC	2	12	721384	721395	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385215924
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373	NC_017366	AATCTT	2	12	737049	737060	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385215937
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375	NC_017366	CTTTTT	2	12	738592	738603	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385215939
376	NC_017366	TCTTTA	2	12	738753	738764	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385215939
377	NC_017366	AGCGAT	2	12	741159	741170	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385215941
378	NC_017366	CTTTTT	2	12	742803	742814	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385215943
379	NC_017366	TATGGC	2	12	745947	745958	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385215946
380	NC_017366	TTTCTT	2	12	749964	749975	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385215951
381	NC_017366	CTTTAT	2	12	750159	750170	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385215951
382	NC_017366	AAATTA	2	12	752391	752402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
383	NC_017366	AAGCCA	2	12	755155	755166	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385215956
384	NC_017366	AGCTTG	2	12	757288	757299	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385215957
385	NC_017366	CATTCA	2	12	758747	758758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385215958
386	NC_017366	TACCAT	2	12	759910	759921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385215959
387	NC_017366	CTTCCA	2	12	762085	762096	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385215962
388	NC_017366	CTTTTT	2	12	763862	763873	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385215965
389	NC_017366	TATCGC	2	12	769678	769689	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385215970
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400	NC_017366	TTTTCC	2	12	792398	792409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385215995
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402	NC_017366	GCATTG	2	12	797901	797912	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385216002
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422	NC_017366	TGATTT	2	12	849432	849443	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385216052
423	NC_017366	ATTTTG	2	12	849665	849676	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385216052
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444	NC_017366	ATAACT	2	12	902734	902745	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385216107
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446	NC_017366	AGCGGT	2	12	903365	903376	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385216108
447	NC_017366	ATTTTT	2	12	904684	904695	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_017366	TGCATA	2	12	906859	906870	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385216109
449	NC_017366	TGCTCC	2	12	913999	914010	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385216114
450	NC_017366	ATTTGC	2	12	919046	919057	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385216118
451	NC_017366	CTCTTT	2	12	919515	919526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385216118
452	NC_017366	TTTAAA	2	12	921573	921584	50 %	50 %	0 %	0 %	385216120
453	NC_017366	AGATAA	2	12	923227	923238	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385216121
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456	NC_017366	CTAATA	2	12	926941	926952	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385216126
457	NC_017366	GCGTTT	2	12	928033	928044	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
458	NC_017366	TGATTT	2	12	928342	928353	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385216128
459	NC_017366	GATTTT	2	12	928645	928656	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385216128
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461	NC_017366	AGCCAA	2	12	932655	932666	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385216131
462	NC_017366	ACTCGC	2	12	933274	933285	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385216132
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465	NC_017366	AGAAAA	2	12	939386	939397	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385216136
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467	NC_017366	AAAACA	2	12	940784	940795	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385216137
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