MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori F32

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017366	AAACAC	2	12	18157	18168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017366	TTTCTT	2	12	22794	22805	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017366	TTTGTT	2	12	25832	25843	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017366	TACAAA	2	12	104055	104066	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017366	GTTTTA	2	12	141246	141257	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017366	TTGTTT	2	12	162856	162867	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017366	TAAAAA	2	12	177287	177298	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017366	ATTACT	2	12	197668	197679	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017366	ACTCAA	2	12	216711	216722	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017366	TATAAT	2	12	223534	223545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017366	ATTAAA	2	12	237325	237336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017366	AGTGAG	2	12	238642	238653	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017366	CTTTTG	2	12	239117	239128	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017366	ATTTTA	2	12	260674	260685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017366	CAAAGC	2	12	266841	266852	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017366	ACAAAA	2	12	331592	331603	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017366	CTTTTT	2	12	331886	331897	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017366	TATAGG	2	12	373805	373816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017366	CTTTAT	2	12	391210	391221	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017366	CAAGTT	2	12	391436	391447	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017366	CCTAAA	2	12	428249	428260	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017366	ATTTTA	2	12	429318	429329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017366	ATTTCA	2	12	457653	457664	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017366	ATTATA	2	12	465044	465055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017366	TCTTTT	2	12	487495	487506	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017366	TTTAAT	2	12	510150	510161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017366	TTTTTA	2	12	537286	537297	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017366	TTGTAA	2	12	549057	549068	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017366	TTTAAA	2	12	555106	555117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017366	TTTAAA	2	12	573411	573422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017366	ATTTTA	2	12	606469	606480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017366	TAAAAT	2	12	613565	613576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017366	CAAAGC	3	18	641026	641043	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017366	TTTTAT	2	12	697177	697188	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017366	CTCATT	2	12	702988	702999	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017366	AAATTA	2	12	752391	752402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017366	ATTTTT	2	12	904684	904695	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017366	GCGTTT	2	12	928033	928044	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017366	TATTTT	2	12	950113	950124	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017366	TCAATC	2	12	977142	977153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017366	TTTTAG	2	12	1033805	1033816	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017366	TAGCCA	2	12	1041321	1041332	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017366	CCCCAT	2	12	1042621	1042632	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017366	TAAACA	2	12	1067226	1067237	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017366	AAACCA	2	12	1082207	1082218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017366	ACAAAA	2	12	1119147	1119158	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017366	AATACC	2	12	1148800	1148811	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017366	AATGAA	2	12	1151046	1151057	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017366	AACGCT	2	12	1152496	1152507	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017366	ATCCTT	2	12	1199418	1199429	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017366	TTGTAT	2	12	1201839	1201850	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017366	ACTTAA	2	12	1218828	1218839	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017366	TCATTT	2	12	1241096	1241107	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017366	AAACTT	2	12	1241119	1241130	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017366	AAAAAG	2	12	1256583	1256594	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017366	ATTTTT	2	12	1272896	1272907	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017366	AACTTG	2	12	1370889	1370900	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017366	TTAAAT	2	12	1371089	1371100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017366	ATAAAG	2	12	1371115	1371126	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017366	AGCGGG	2	12	1375937	1375948	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017366	GTTTTA	2	12	1386036	1386047	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017366	TAAAAA	2	12	1386861	1386872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017366	AAGCCA	2	12	1387012	1387023	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017366	ATGGTG	2	12	1387198	1387209	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017366	CTAAGT	2	12	1398126	1398137	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017366	TTTGAG	2	12	1400232	1400243	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017366	AATGAA	2	12	1402539	1402550	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017366	CAAAAT	2	12	1487261	1487272	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017366	AGCATG	2	12	1524103	1524114	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.