MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori F32

Total Repeats: 198

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017366	TTTTA	2	10	4909	4918	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017366	AAATT	2	10	7167	7176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017366	AAGAA	2	10	7433	7442	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017366	GCTTT	2	10	13418	13427	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017366	AAAAG	2	10	22962	22971	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017366	AAATT	2	10	30116	30125	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017366	TTTTA	2	10	30268	30277	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017366	TCATT	2	10	36856	36865	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017366	CTTAT	2	10	53831	53840	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017366	GCCAA	2	10	53844	53853	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017366	TTAAA	2	10	71791	71800	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017366	ACAAA	2	10	71819	71828	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017366	AAAGA	2	10	72402	72411	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017366	TCTAC	2	10	75547	75556	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017366	TTTTA	2	10	85939	85948	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017366	TTACA	2	10	87824	87833	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017366	TAAGA	2	10	101964	101973	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017366	AAAGA	2	10	108432	108441	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017366	CCCTA	2	10	108508	108517	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_017366	AATTT	2	10	111092	111101	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017366	AAAAT	2	10	117791	117800	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017366	TTAAT	2	10	126098	126107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017366	CAAAT	2	10	165841	165850	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017366	TTTCT	2	10	186382	186391	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017366	TTTAA	2	10	189401	189410	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017366	CAAAA	2	10	189428	189437	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017366	TTTAA	2	10	192455	192464	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017366	AAACA	2	10	216739	216748	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017366	TGCTA	2	10	223635	223644	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017366	TTGGT	2	10	223876	223885	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017366	AAGCG	2	10	235413	235422	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017366	AAACC	2	10	235822	235831	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017366	CTTAA	2	10	242392	242401	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017366	AAATT	2	10	260714	260723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017366	CATTT	2	10	276388	276397	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017366	AAATA	2	10	288507	288516	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017366	TTTTA	2	10	294136	294145	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017366	TTATA	2	10	328416	328425	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017366	TGCTA	2	10	329114	329123	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017366	TTAAA	2	10	329148	329157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017366	TTTCT	2	10	331384	331393	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017366	AAGAC	2	10	331475	331484	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017366	AATTT	2	10	332157	332166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017366	CAATT	2	10	348383	348392	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017366	TATTT	2	10	365780	365789	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017366	AATGA	2	10	391125	391134	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017366	AATGA	2	10	391143	391152	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017366	AATGA	2	10	391161	391170	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017366	AATGA	2	10	391179	391188	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017366	AGTAA	2	10	391638	391647	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017366	AGTGA	2	10	391935	391944	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017366	AGATG	2	10	393411	393420	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017366	TTGAA	2	10	393643	393652	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017366	TAAAC	2	10	405498	405507	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017366	ACTTG	2	10	447823	447832	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017366	TTTTA	2	10	479143	479152	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017366	ATTCA	2	10	484841	484850	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017366	CTTTT	2	10	487139	487148	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017366	CTTTT	2	10	487156	487165	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017366	TTATA	2	10	498678	498687	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017366	AGTTT	2	10	505677	505686	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017366	TAACT	2	10	510009	510018	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017366	TACTA	2	10	524855	524864	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017366	CAATT	2	10	524972	524981	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017366	TAAAA	2	10	525181	525190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017366	ATAAA	2	10	525462	525471	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017366	GTTTT	2	10	533557	533566	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017366	ATTTA	2	10	551578	551587	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017366	GCTAT	2	10	573321	573330	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017366	TTGTA	2	10	577571	577580	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017366	AACGA	2	10	591670	591679	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017366	ACTCT	2	10	601603	601612	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017366	TAAGG	2	10	613273	613282	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017366	CGCTT	2	10	613385	613394	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017366	TTTAA	2	10	644574	644583	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017366	ACCAC	2	10	667769	667778	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
77	NC_017366	TTTAA	2	10	668354	668363	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017366	TTGAT	2	10	670794	670803	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017366	ATCTT	2	10	673751	673760	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017366	ATTCC	2	10	674652	674661	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_017366	TAGAA	2	10	683516	683525	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017366	ATTAA	2	10	683619	683628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017366	GTTTT	2	10	694047	694056	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017366	ATTTA	2	10	697254	697263	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017366	AAACA	2	10	701966	701975	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017366	CTTTT	2	10	703022	703031	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017366	TTGTG	2	10	743176	743185	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017366	GTTTT	2	10	743189	743198	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017366	ATTAA	2	10	747130	747139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017366	GTCAA	2	10	747286	747295	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017366	ATTTA	2	10	752897	752906	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017366	TATAG	2	10	754749	754758	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017366	ACAGC	2	10	795134	795143	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017366	TTTTA	2	10	808016	808025	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017366	TCTCA	2	10	817234	817243	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_017366	TTTTA	2	10	817268	817277	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017366	TTTAT	2	10	843702	843711	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017366	ATTAA	2	10	858768	858777	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017366	TTTTA	2	10	866205	866214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017366	ATAAA	2	10	866406	866415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017366	TTAAA	2	10	866487	866496	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017366	TTTTA	2	10	880791	880800	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017366	TTTAA	2	10	899875	899884	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017366	ATTTT	2	10	904600	904609	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017366	ATTTT	2	10	904663	904672	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017366	TAAAA	2	10	912967	912976	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017366	GGATA	2	10	914765	914774	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017366	TATTT	2	10	916036	916045	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017366	TATTT	2	10	923374	923383	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017366	TTTTA	2	10	927999	928008	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017366	TTATT	2	10	928101	928110	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017366	TTGTA	2	10	929479	929488	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017366	GCTTT	2	10	937094	937103	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017366	CAAAA	2	10	942412	942421	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017366	TCATT	2	10	942583	942592	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017366	ATTTT	2	10	950051	950060	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017366	ATTTT	3	15	950083	950097	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017366	CTTTA	2	10	961883	961892	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017366	TGATT	2	10	974583	974592	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017366	TGGTT	2	10	975764	975773	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017366	TTATT	2	10	996224	996233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017366	ATATT	2	10	1003735	1003744	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017366	TTAAC	2	10	1011694	1011703	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017366	GTTTT	2	10	1021728	1021737	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017366	TTATC	2	10	1024321	1024330	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017366	ATTTT	2	10	1041236	1041245	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017366	TATAA	2	10	1042633	1042642	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017366	GCTTT	2	10	1050484	1050493	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017366	ACAAA	2	10	1059109	1059118	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017366	AATCA	2	10	1082240	1082249	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017366	AACTA	2	10	1083577	1083586	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017366	TAAAA	2	10	1084606	1084615	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017366	AAATC	2	10	1114305	1114314	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017366	TAATC	2	10	1123080	1123089	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017366	AAAAC	2	10	1129550	1129559	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017366	GATTT	2	10	1148395	1148404	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017366	AATTT	2	10	1148431	1148440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017366	AAACA	2	10	1148874	1148883	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017366	AAAAC	2	10	1149038	1149047	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017366	CAAAA	2	10	1149154	1149163	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017366	CACGA	2	10	1149723	1149732	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017366	TTACC	2	10	1150521	1150530	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_017366	TTTTA	2	10	1150852	1150861	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017366	TTAAA	2	10	1158982	1158991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017366	AAAAG	2	10	1160573	1160582	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017366	TTAAT	2	10	1184518	1184527	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017366	TATTT	2	10	1184554	1184563	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_017366	ATTTA	2	10	1575929	1575938	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_017366	TTAAA	2	10	1577744	1577753	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.