MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori F30

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017365	AAACAC	2	12	18221	18232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017365	TTTCTT	2	12	22857	22868	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017365	TTTGTT	2	12	25788	25799	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017365	TTTTTA	2	12	100015	100026	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017365	ATAAAA	2	12	100194	100205	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017365	TAGGCT	2	12	110171	110182	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017365	CTTTTT	2	12	144204	144215	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017365	CAATAA	2	12	149878	149889	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017365	AAGTTT	2	12	159313	159324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017365	TTAAGT	2	12	181614	181625	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017365	ATACAA	2	12	199247	199258	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017365	TAAGGA	2	12	201667	201678	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017365	AGCGTT	2	12	248960	248971	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017365	TTTGTT	3	18	252644	252661	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017365	GTTTTG	2	12	252721	252732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017365	GGTATT	2	12	252781	252792	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017365	AGCTTT	2	12	273092	273103	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017365	TATAAT	2	12	313786	313797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017365	TATAGG	2	12	358127	358138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017365	ACCCAT	2	12	395751	395762	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017365	ATTTTA	2	12	413850	413861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017365	AAAAAT	2	12	420881	420892	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017365	TTCAAT	2	12	445334	445345	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017365	ATTTTA	2	12	452713	452724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017365	ATTATA	2	12	452736	452747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017365	TCTTTT	2	12	476425	476436	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017365	AGTTTT	2	12	529052	529063	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017365	TTAATT	2	12	647710	647721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017365	TTTTAT	2	12	681832	681843	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017365	GCTTTG	2	12	760891	760902	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017365	ATTTTA	2	12	788334	788345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017365	TTAAAA	2	12	795437	795448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017365	TTTAAA	2	12	828483	828494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017365	TTACAA	2	12	853645	853656	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017365	TTTAAG	2	12	873157	873168	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017365	ATTAAA	2	12	890892	890903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017365	CTAATA	2	12	916686	916697	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017365	AAAAGA	2	12	932071	932082	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017365	TATTTT	2	12	940108	940119	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017365	TAAATC	2	12	1051729	1051740	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017365	GCTTTG	2	12	1112710	1112721	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017365	TAAAAT	2	12	1118872	1118883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017365	TTTTAA	2	12	1142035	1142046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017365	ATTATA	2	12	1156047	1156058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017365	TTGAGT	2	12	1162849	1162860	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017365	ATTTTT	2	12	1202252	1202263	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017365	TTATAA	2	12	1207834	1207845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017365	AAACAA	2	12	1216780	1216791	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017365	CTGGAG	2	12	1237031	1237042	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017365	GTTTTT	2	12	1239334	1239345	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017365	ATAAAA	2	12	1255412	1255423	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017365	GTTTTA	2	12	1278858	1278869	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017365	TTATCT	2	12	1317346	1317357	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017365	TGTATT	2	12	1317645	1317656	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017365	AGTTTT	2	12	1353351	1353362	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017365	GTTTTA	2	12	1374707	1374718	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017365	TAAAAA	2	12	1375533	1375544	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017365	AAGCCA	2	12	1375685	1375696	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017365	ATGGTG	2	12	1375871	1375882	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017365	CTAAGT	2	12	1385470	1385481	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017365	ATAGGG	2	12	1387473	1387484	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017365	CCCCAA	2	12	1404864	1404875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017365	AAGTTT	2	12	1567281	1567292	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.